DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
BIO210 MikrobiologiBIO210 Mikrobiologi
Dr. Dwi SuryantoProf. Dr. Erman MunirNunuk Priyani, M.Sc.
Dr. Dwi SuryantoProf. Dr. Erman MunirNunuk Priyani, M.Sc.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY Kuliah 2.
PENGAMATAN MIKROBA
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
• Karena berukuran kecil, mikroba biasa diamati denganmikroskop
• Mikroskop yang digunakan Leuwenhoek dan Hookeberupa mikroskop sederhana dengan hanya menggunakan 1lensa
• Lensa kombinasi digunakan oleh Joseph Jackson Lister(ayah Joseph Lister) 1830
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
• Compound Light Microscopy (Mikroskop Cahaya),untuk melihat benda-benda kecil dengan medan terang.
• Darkfield Microscope, untuk mengamati mikroba yangtidak dapat dilihat dengan mikroskop cahaya biasa, tidakdapat diwarnai dengan metode standard, atau mengalamidistorsi setelah pewarnaan. Kondensor mikroskop inimenggunakan kondensor medan gelap yang tidakmemungkinkan cahaya ditransmisi melewati spesimenterus ke lensa objektif.
A. Mikroskop
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
• Phase-Contrast Microscopy, memungkinkan eksaminasistruktur internal secara rinci dari mikroba hidup.Menggunakan kondensor khusus.
• Differential Interference Contrast Microscopy,mikroskop ini memungkinkan melihat objek menjadi 3dimensi. Cahaya dipecah dan direkombinasi denganprisma khusus.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Mikroskop cahaya
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Jenis gambaran yang dihasilkan mikroskop cahaya. (a) struktur dalam terlihat dengan iluminasi medan terang (brightfield illumination). (b) Mikroskop fase kontras memberikan perbedaan yang besar struktur
internal. (c) dengan mikroskop medan gelap tepi sel terlihat terang. (d) differential interference contrast microskopy menghasilkan penampakan
tiga dimensi sel dan inklusinya.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
• Fluorescence Microscopy, menggunakan bahan fluoresensehingga memberi warna, menggunakan cahaya uv ataumendekati uv. Jika objek secara alami tidak berfluoresen,objek dapat diwarnai dengan bahan fluoresen yangdisebut fluorochrome. Contoh auramine O memberiwarna kuning dengan uv, sangat diserap Mycobacteriumtuberculosis; fluorescein isothiocyanate (FITC) memberiwarna kuning terang, diserap oleh Bacillus anthracis.Teknik khusus dalam mikroskop ini yang disebut teknikantibodi-fluoresen atau immunofluoresen, menggunakanreaksi antigen-antibodi.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
(a) Dasar immunofluoresen. Suatu zat warna bergabung dengan antibodi spesifik untuk bakteri. (b) Dalam teknik antibodi-fluoresen, struktur tempat
melekatnya antibodi khusus terlihat terang.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
• Electron Microscopy, terdapat 2 jenis transmissionelectron microscopy (TEM) dan scanning electronmicrocopy (SEM). Perbedaan keduanya terletak padapenggunaan. TEM digunakan untuk melihat preparatirisan ultra tipis, preparat dapat diwarnai. Pada SEMspesimen tidak perlu disayat tipis dengan hasilpengamatan 3 dimensi. Kedua mikroskop dapatmemperbesar bayangan objek pengamatan sampaipuluhan ribu kali, sesuatu hal yang tidak bisa dilakukandengan mikroskop cahaya biasa. Lensa pada mikroskopini berupa medan listrik.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
A B
(a) Transmission electron microscope, (b) Scanning electron microscope
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
B. Penyiapan Spesimen Untuk Pengamatan Mikroskop Cahaya
Preparat gantung. Preparat gantung dibuat denganmeneteskan suspensi spesimen hidup di tengah gelaspenutup, kemudian tepinya diberi petroleum jeliseperti vaselin. Gelas penutup diletakkan terbalikpada gelas benda khusus yang cekung kemudiandibalik.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Cara pembuatan preparat gantung
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Pewarnaan sederhana. Pewarnaan dengan menggunakanhanya satu zat warna basa air atau basa alkohol. Kadang-kadang diberi mordant untuk menguatkan zat warna yangdiberikan. Zat warna yang biasa digunakan misalnya birumetilena, karbolfuhsin, gentian violet, dan safranin.
Penyiapan usapan dan cara pewarnaan. (a) Suspensi mikroba disebar tipis pada kaca benda dan dikeringanginkan. (b) Lapisan tipis difiksasi dengan api.
(c) Lapisan terfiksasi diberi warna, kemudian (d) dibilas.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Pewarnaan diferensial. Teknik pewarnaan inimenyebabkan bagian sel terwarnai berbeda.
a. Pewarnaan Gram, teknik ini dikembangkan pertama kalioleh Hans Christian Gram tahun 1884. Berdasarkanpewarnaan ini bakteri terbagi menjadi: gram-positif dangram-negatif.
b. Pewarnaan tahan asam, pewarnaan ini sering digunakanuntuk genus Mycobacterium dan Noocardia
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Cara pewarnaan Gram
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Pewarnaan khusus. Pewarnaan ini digunakan untuk melihatbagian-bagian khusus dari sel bakteri.
a. Pewarnaan negatif untuk kapsul, Banyak bakteri yangmempunyai kapsul di bagian luar sel.
b. Pewarnaan endospora, endospora tidak dapat diwarnaidengan cara pewarnaan biasa, sebab zat warna tidak bisamenembus spora
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
Pewarnaan negatif untuk kapsul dan pewarnaan endospora dan flagella. (a) Tinta India memberikan latar belakang hitam, sehingga kapsul terlihat terang mengeliling
sel. (b) Endospora terlihat terang di tengah sel berbentuk batang atau oval. (c) Flagella terlihat tebal seperti benang pada sel.
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY
DE
PAR
TME
NT
OF
BIO
LOG
YFA
CU
LTY
OF
MA
THE
MA
TIC
SA
ND
NA
TUR
AL
SCIE
NC
ES
NO
RTH
SUM
ATR
AU
NIV
ER
SITY