Top Banner
Skrytá diverzita volně žijících protistních organismů Pavel Škaloud katedra botaniky PřF UK
57

Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Jan 17, 2020

Download

Documents

dariahiddleston
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Skrytá

diverzita

volně

žijících protistních

organismů

Pavel Škaloudkatedra botaniky PřF UK

Page 2: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?

Eukaryotické

organismy s

jednoduchou organizací

stélky (jednobuněčné, koloniální

či vláknité). Nemají

rozlišená

pletiva.

Page 3: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?

I chaluhy jsou protista.

Macrocystis

Page 4: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?

Historicky byly tyto organismy řazeny do říše Protista, nyní

je již

tento pohled překonán

Page 5: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Drtivou většinu eukaryotní

diverzity

na naší

planetě

tvoří právě

protistní

organismy.

Page 6: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Plantae

Rhodophyta Glaucophyta Chlorophyta

Page 7: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Unikonts

choanoflagellata Dictyostelides Lobosea

Page 8: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Excavata

EuglenophytaKinetoplastida

Trichomonadida

Page 9: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Chromalveolata

Bacillariophyceae

Phaeophyceae Dinophyta

Oomycota Cilliates

Page 10: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co jsou to protista?•

Rhizaria

Foraminifera

Euglyphids

Radiolaria

Chlorarachniophyta

Page 11: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Mořský fytoplankton –

1025

buněk:

10 000 000

000

000

000

000

000

000

buněk

Velikost a početnost protist

Page 12: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Mořský fytoplankton –

1025

buněk•

Průměrná

velikost jedné

buňky fytoplanktonu –

2 μm

Řada buněk –

20 000 000

000

000

000

km

10 000 000

000

xtam a zpět

Velikost a početnost protist

Page 13: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Mořský fytoplankton –

1025

buněk•

Průměrná

velikost jedné

buňky fytoplanktonu –

2 μm

Deska o šířce 30 cm a tloušťce 8 cm (150 000 x 40 000 buněk)

Velikost a početnost protist

Page 14: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Ohromná

dynamika:•

Mořský fytoplankton –

1025

buněk•

Každá

buňka se dělí

v průměru 1x za den,

stejný počet buněk denně

sežrán zooplanktonem

Velikost a početnost protist

Page 15: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Primární

produkce, řasy se podílí

na celé

polovině

produkce O2

Mořský fytoplankton -

40 % celkové

pp, z toho rozsivky 20-25 %

Globální

význam protist

Page 16: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Emiliania huxleyi – nejhojnější

eukaryot

na planetě, white

tides

Globální

význam protist

Page 17: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Emiliania huxleyi –

kokolity•

Výrazné

ovlivnění

globálního klimatu na Zemi

Vápence (Dover

cliffs)

Ca + 2HCO3 ---> CaCO3 + H2 O + CO2

Globální

význam protist

Page 18: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Emiliania huxleyi–

acidifikace

moří: oxid uhličitý snižuje pH

mořské

vody, čímž

se mění

rovnovážný stav jeho tří

rozpustných forem ve prospěch CO2

(nevyužitelný pro emilianii)

Globální

význam protist

Page 19: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Emiliania huxleyi–

dimethylsulfid: kondenzační

jádra v mracích, ochlazování

planety

Globální

význam protist

Page 20: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Symbiotické

interakce–

změny životního stylu, zvýšení

fitness, speciační

události

Globální

význam protist

Page 21: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Protista jako geologická

síla–

Křída –

z mořských mikroorganismů

(foraminifera, kokolity),

Silicity –

nahromadění

schránek protist

(rozsivky, mřížovci): křemenec, diatomit, buližník,

Globální

význam protist

Page 22: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Produce

toxinů

(obrněnky –

red

tides)•

CFP (ciguatera

fish

poisoning)

Nejrozšířenější

onemocnění

způsobené mořskými toxiny (50000 onemocnění

ročně)

Kumulace v mořských tropických rybách–

Gastrointestinální

potíže: průjem, zvracení

Neurologické

projevy: teplotní

změny–

Kardiologické

potíže: arytmie, zástava srdce

Mortalita: 0,1 –

12 %

Význam protist

Page 23: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

významní

parazité

člověka

Trypanosoma

Trichomonas

Plasmodium Giardia

Význam protist

Page 24: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Parazité

zemědělských plodin

Trypanosoma

Význam protist

Plíseň

bramborová

Page 25: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Potraviny

Význam protist

Page 26: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

hnědé

řasy –

algináty

(potravinářství, kosmetika, stavební

materiály, ....)

Význam protist

Page 27: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Bionafta –

zapomeňme na kukuřici, budeme jezdit na řasy!

Význam protist

Page 28: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Bionafta –

zapomeňme na kukuřici, budeme jezdit na řasy!

Význam protist

Page 29: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Velkoplošné

kultivace zelených řas (chlorofyl, astaxanthin)

Význam protist

Page 30: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

nanotechnologie

rozsivky jako senzory a miniaturní

transformátory

Význam protist

Page 31: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

kriminalistika –

forensní

limnologie

Význam protist

Page 32: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Aplikace biologických konstručních

mechanismů

Dubai harbour

Význam protist

Page 33: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Význam protist•

Nutnost a zároveň

problém: stanovení

hranic mezi druhy a jejich přesná

determinace.

Page 34: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

20 000 (Finlay)

600 000 (Encyclopaedia

Britannica)

1 300 000 (Foissner)

2 000 000

(Adl)

Accumulation

curves: Podíl dosud nepopsaných druhů

84-90 % !!!

Druhové

bohatství

protist

Page 35: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Kolik druhů

protist

skutečně

žije na Zemi?•

V současnosti popsáno cca 213 000 druhů

20 000 (Finlay)

600 000 (Encyclopaedia

Britannica)

1 300 000 (Foissner)

2 000 000

(Adl)

Accumulation

curves: Podíl dosud nepopsaných druhů

84-90 % !!!

Druhové

bohatství

protist

Page 36: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

454 sekvenování

jaká

je reálná

diverzita

protist

(mořský bentos)?

Druhové

bohatství

protist

Page 37: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Paramecium

aurelia

– P. pimaurelia, biaurelia, triaurelia............P. quadecaurelia

Skrytá

diverzita

protist

Page 38: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Paramecium

aurelia

Skrytá

diverzita

protist

Page 39: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Sellaphora

pupula

6 „fenodémů“

žijících pospolu v 1 jezírku

Skrytá

diverzita

protist

Page 40: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Čemu odpovídá

variabilita rodů

a druhů

rozsivek?

Skrytá

diverzita

protist

Page 41: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Základní

otázka: jak určit hranice mezi druhy a jak spolehlivě

jednotlivé

druhy určit?

Micrasterias americana Micrasterias crux-melitensis

Page 42: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Tradiční

morfologický druhový koncept „Chorellales“

Page 43: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Tradiční

morfologický druhový koncept

Micractinium

Brachionus

Page 44: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Biologický druhový koncept

Sellaphora pupulaA B C D

A

B

C

D

Křížící

pokusy:

kmeny A-B a C-D představují

separátní

biologické

druhy

Page 45: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Biologický druhový koncept

ALE –

občasné

mezidruhové

křížení, problém alopatrických

populací

Page 46: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Biologický druhový koncept

nepoužitelný u asexuálních organismů

Chlorella Klebsormidium

Page 47: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Fylogenetický druhový koncept

Page 48: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Fylogenetický druhový koncept

rbcL psaA

Page 49: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Koncepty druhů•

Fylogenetický druhový koncept

syngeny

u vířníka

Paramecium:

shodné

sekvence, reprodukční

izolace

A B C D

A

B

C

D

Page 50: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

modelový rod –

Paraphysomonas (Chrysophyceae)

Biogeografie protist

Page 51: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

abundance

paraphysomonád

v 0,1cm2

povrchového sedimentu z lokality Priest

Potvs.

jejich globální

četnost

Biogeografie protist

Page 52: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

silná

formulace:“všechno je všude, ale mnoho druhů

je extrémně

vzácných”- evoluční

(speciace), floristické

či ochranářské

konsekvenceslabá

formulace:“environment selects

prostředí

vybírá”-

nulová

role historie v mikrobiální

biogeografii

Neutrální

teorie ubikvitního

rozšíření

eukaryotických

mikroorganismů

Biogeografie protist

Page 53: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Co na to molekulární

data?

Micromonaspusilla

Biogeografie protist

Page 54: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Rozsivky –

u některých druhů

jasná

biogeografie (Skeletonema)

Biogeografie protist

Page 55: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Je všechno všude?

Biogeografie dokonce i u bakterií

Sulfolobus

Page 56: Skrytá diverzita volně žijících protistních organismůbiogeografie (Skeletonema) Biogeografie protist. Je všechno všude? Biogeografie dokonce i u bakterií ...

Ochrana protistů?

V přírodě

důležité

ekologické

role

Biotechnologický potenciál

Evoluční

historie

Estetické

hledisko

třetina protistů

omezené

rozšíření