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NHLH1 - R R R R R A T A K Y R T A H A T R E R I R V E A F N L A F A E L R K L L P T L P - - - - - - - P D K K L S K I E I L R L A I C Y I S Y L N H V L D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - NHLH2 - R R R R R A T A K Y R S A H A T R E R I R V E A F N L A F A E L R K L L P T L P - - - - - - - P D K K L S K I E I L R L A I C Y I S Y L N H V L D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - FIGLA - T E N L Q L V L E R R R V A N A K E R E R I K N L N R G F A R L K A L V P F L P - - - - - - - Q S R K P S K V D I L K G A T E Y I Q V L S D L L E G A K D S K - - - - - - - - - - - - - - - - ASCL1 - - - L P Q Q Q P A A V A R R N E R E R N R V K L V N L G F A T L R E H V P N G A - - - - - - - A N K K M S K V E T L R S A V E Y I R A L Q Q L L D E H D A V S - - - - - - - - - - - - - - - - ASCL2 - - - E T G G G A A A V A R R N E R E R N R V K L V N L G F Q A L R Q H V P H G G - - - - - - - A S K K L S K V E T L R S A V E Y I R A L Q R L L A E H D A V R - - - - - - - - - - - - - - - - ASCL4 - - - 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- - - - - - - - - - - - - - - TCF3 - E Q K A E R E K E R R V A N N A R E R L R V R D I N E A F K E L G R M C Q L H L - - - - - - N S E K P Q T K L L I L H Q A V S V I L N L E Q Q V R E R N L N P - - - - - - - - - - - - - - - - TAL1 - T D G P H T K V V R R I F T N S R E R W R Q Q N V N G A F A E L R K L I P T H P - - - - - - - P D K K L S K N E I L R L A M K Y I N F L A K L L N D Q E E E G - - - - - - - - - - - - - - - - TAL2 - - - - - - - - M T R K I F T N T R E R W R Q Q N V N S A F A K L R K L I P T H P - - - - - - - P D K K L S K N E T L R L A M R Y I N F L V K V L G E Q S L Q Q - - - - - - - - - - - - - - - - LYL1 - E G H Q P Q K V A R R V F T N S R E R W R Q Q N V N G A F A E L R K L L P T H P - - - - - - - P D R K L S K N E V L R L A M K Y I G F L V R L L R D Q A A A L - - - - - - - - - - - - - - - - MSC - G S A A E C K Q S Q R N A A N A R E R A R M R V L S K A F S R L K T S L P W V P - - - - - - - P D T K L S K L D T L R L A S S Y I A H L R Q L L Q E D R Y E N - - - - - - - - - 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- SCX - G G R P G R E P R Q R H T A N A R E R D R T N S V N T A F T A L R T L I P T E P - - - - - - - A D R K L S K I E T L R L A S S Y I S H L G N V L L A G E A C G - - - - - - - - - - - - - - - - TCF15 - G A G P V V V V R Q R Q A A N A R E R D R T Q S V N T A F T A L R T L I P T E P - - - - - - - V D R K L S K I E T V R L A S S Y I A H L A N V L L L G D S A D - - - - - - - - - - - - - - - - TWIST1 - P Q S Y E E L Q T Q R V M A N V R E R Q R T Q S L N E A F A A L R K I I P T L P - - - - - - - - S D K L S K I Q T L K L A A R Y I D F L Y Q V L Q S D E L D S - - - - - - - - - - - - - - - - TWIST2 - A Q S F E E L Q S Q R I L A N V R E R Q R T Q S L N E A F A A L R K I I P T L P - - - - - - - - S D K L S K I Q T L K L A A R Y I D F L Y Q V L Q S D E M D N - - - - - - - - - - - - - - - - FERD3L - K R K R V I T Y A Q R Q A A N I R E R K R M F N L N E A F D Q L R R K V P T F A - - - - - - - Y E K R L S R I E T L R L A I V Y I S F M T E L L E S C E K K E - - - - - - - - - - - - - - - - PTF1A - V R S E A E L Q Q L R Q A A N V R E R R R M Q S I N D A F E G L R S H I P T L P - - - - - - - Y E K R L S K V D T L R L A I G Y I N F L S E L V Q A D L P L R - - - - - - - - - - - - - - - - ATOH1 - K Q V N G V Q K Q R R L A A N A R E R R R M H G L N H A F D Q L R N V I P S F N - - - - - - - N D K K L S K Y E T L Q M A Q I Y I N A L S E L L Q T P S G G E - - - - - - - - - - - - - - - - ATOH7 - A G R L E S A A R R R L A A N A R E R R R M Q G L N T A F D R L R R V V P Q W G - - - - - - - Q D K K L S K Y E T L Q M A L S Y I M A L T R I L A E A E R F G - - - - - - - - - - - - - - - - BHLHA9 - R A R P V R S K A R R M A A N V R E R K R I L D Y N E A F N A L R R A L R H D L - - - - - - - G G K R L S K I A T L R R A I H R I A A L S L V L R A S P A P R - - - - - - - - - - - - - - - - BHLHA15 - G G R R D S S I Q R R L E S N E R E R Q R M H K L N N A F Q A L R E V I P H V R - - - - - - - A D K K L S K I E T L T L A K N Y I K S L T A T I L T M S S S R - - - - - - - - - - - - - - - - NEUROD6 - K L R L E R V K F R R Q E A N A R E R N R M H G L N D A L D N L R K V V P C Y S - 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- - G P S V R K L S K I A T L L L A R N Y I L M L T S S L E E M K R L V - - - - - - - - - - - - - - - - OLIG1 - D A K E E Q Q Q Q L R R K I N S R E R K R M Q D L N L A M D A L R E V I L P Y S A A H C Q G A P G R K L S K I A T L L L A R N Y I L L L G S S L Q E L R R A L - - - - - - - - - - - - - - - - MESP2 - R A R T G P A G G Q R Q S A S E R E K L R M R T L A R A L H E L R R F L P P S L - - - - - A P A G Q S L T K I E T L R L A I R Y I G H L S A V L G L S E E S L - - - - - - - - - - - - - - - - MESP1 - A R S S R L G S G Q R Q S A S E R E K L R M R T L A R A L H E L R R F L P P S V - - - - - A P A G Q S L T K I E T L R L A I R Y I G H L S A V L G L S E E S L - - - - - - - - - - - - - - - - MSGN1 - G T K V R M S V Q R R R K A S E R E K L R M R T L A D A L H T L R N Y L P P V Y - - - - - S Q R G Q P L T K I Q T L K Y T I K Y I G E L T D L L N R G R E P R - - - - - - - - - - - - - - - - 1.59
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- R R R R R A T A K Y R T A H A T R E R I R V E A F N L A ...humantfs.ccbr.utoronto.ca/Alignments/bHLH.pdf · nhlh1 - r r r r r a t a k y r t a h a t r e r i r v e a f n l a f a e

Jan 17, 2020

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Page 1: - R R R R R A T A K Y R T A H A T R E R I R V E A F N L A ...humantfs.ccbr.utoronto.ca/Alignments/bHLH.pdf · nhlh1 - r r r r r a t a k y r t a h a t r e r i r v e a f n l a f a e

NHLH1 - R R R R R A T A K Y R T A H A T R E R I R V E A F N L A F A E L R K L L P T L P - - - - - - - P D K K L S K I E I L R L A I C Y I S Y L N H V L D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -NHLH2 - R R R R R A T A K Y R S A H A T R E R I R V E A F N L A F A E L R K L L P T L P - - - - - - - P D K K L S K I E I L R L A I C Y I S Y L N H V L D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

FIGLA - T E N L Q L V L E R R R V A N A K E R E R I K N L N R G F A R L K A L V P F L P - - - - - - - Q S R K P S K V D I L K G A T E Y I Q V L S D L L E G A K D S K - - - - - - - - - - - - - - - -ASCL1 - - - L P Q Q Q P A A V A R R N E R E R N R V K L V N L G F A T L R E H V P N G A - - - - - - - A N K K M S K V E T L R S A V E Y I R A L Q Q L L D E H D A V S - - - - - - - - - - - - - - - -

ASCL2 - - - E T G G G A A A V A R R N E R E R N R V K L V N L G F Q A L R Q H V P H G G - - - - - - - A S K K L S K V E T L R S A V E Y I R A L Q R L L A E H D A V R - - - - - - - - - - - - - - - -ASCL4 - - - D S A F E P A F L R K R N E R E R Q R V R C V N E G Y A R L R D H L P R E L - - - - - - - A D K R L S K V E T L R A A I D Y I K H L Q E L L E R Q A W G L - - - - - - - - - - - - - - - -

ASCL3 - - C E Y S Y G P A F T R K R N E R E R Q R V K C V N E G Y A Q L R H H L P E E Y - - - - - - - L E K R L S K V E T L R A A I K Y I N Y L Q S L L Y P D K A E T - - - - - - - - - - - - - - - -ASCL5 - - - E Y P F E P A F I Q K R N E R E R Q R V K C V N E G Y A R L R G H L P G A L - - - - - - - A E K R L S K V E T L R A A I R Y I K Y L Q E L L S S A P D G S - - - - - - - - - - - - - - - -

ID2 - - - - - - - - - - - - K T P V D D P M S L L Y N M N D C Y S K L K E L V P S I P - - - - - - - Q N K K V S K M E I L Q H V I D Y I L D L Q I A L D S H P T I V - - - - - - - - - - - - - - - -ID3 - - - - - - - - - - - - G P A A E E P L S L L D D M N H C Y S R L R E L V P G V P - - - - - - - R G T Q L S Q V E I L Q R V I D Y I L D L Q V V L A E P A P G P - - - - - - - - - - - - - - - -

ID4 - - - - - - - - - - - - A A A D E P A L C L Q C D M N D C Y S R L R R L V P T I P - - - - - - - P N K K V S K V E I L Q H V I D Y I L D L Q L A L E T H P A L L - - - - - - - - - - - - - - - -ID1 - - - - - - - - - - - - L L D E Q Q V N V L L Y D M N G C Y S R L K E L V P T L P - - - - - - - Q N R K V S K V E I L Q H V I D Y I R D L Q L E L N S E S E V G - - - - - - - - - - - - - - - -

MYF6 - C K R K S A P T D R R K A A T L R E R R R L K K I N E A F E A L K R R T V A N P - - - - - - - - N Q R L P K V E I L R S A I S Y I E R L Q D L L H R L D Q Q E - - - - - - - - - - - - - - - -MYOG - C K R K S V S V D R R R A A T L R E K R R L K K V N E A F E A L K R S T L L N P - - - - - - - - N Q R L P K V E I L R S A I Q Y I E R L Q A L L S S L N Q E E - - - - - - - - - - - - - - - -

MYF5 - C K R K S T T M D R R K A A T M R E R R R L K K V N Q A F E T L K R C T T T N P - - - - - - - - N Q R L P K V E I L R N A I R Y I E S L Q E L L R E Q V E N Y - - - - - - - - - - - - - - - -MYOD1 - C K R K T T N A D R R K A A T M R E R R R L S K V N E A F E T L K R C T S S N P - - - - - - - - N Q R L P K V E I L R N A I R Y I E G L Q A L L R D Q D A A P - - - - - - - - - - - - - - - -

MLX - A Y K E S Y K D R R R R A H T Q A E Q K R R D A I K R G Y D D L Q T I V P T C Q Q Q - D F S I G S Q K L S K A I V L Q K T I D Y I Q F L H K E K K K Q E E E V - - - - - - - - - - - - - - - -MLXIP - P K N V A A L K N R Q M K H I S A E Q K R R F N I K M C F D M L N S L I S N N - - - - - - - - - S K L T S H A I T L Q K T V E Y I T K L Q Q E R G Q M Q E E A - - - - - - - - - - - - - - - -

MLXIPL - R P D S N K T E N R R I T H I S A E Q K R R F N I K L G F D T L H G L V S T L S A - - - - - Q P S L K V S K A T T L Q K T A E Y I L M L Q Q E R A G L Q E E A - - - - - - - - - - - - - - - -TCFL5 - S G P Q G G R S Q R R E R H N R M E R D R R R R I R I C C D E L N L L V P F C N - - - - - - A - - - E T D K A T T L Q W T T A F L K Y I Q E R H G D S L K K V - - - - - - - - - - - - - - - -

CCDC169-SOHLH2- - - - E F E K N K K I S L L H S S K E K L R R E R I K Y C C E Q L R T L L P Y V K G - - - - - - - - R K N D A A S V L E A T V D Y V K Y I R E K I S P A V M A Q - - - - - - - - - - - - - - - -SOHLH2 - - - E F E K N K K I S L L H S S K E K L R R E R I K Y C C E Q L R T L L P Y V K G - - - - - - - - R K N D A A S V L E A T V D Y V K Y I R E K I S P A V M A Q - - - - - - - - - - - - - - - -

SOHLH1 - - - V A E G P S S C L R R N V I S E R E R R K R M S L S C E R L R A L L P Q F D G - - - - - - - - R R E D M A S V L E M S V Q F L R L A S A L - G P S Q E Q H - - - - - - - - - - - - - - - -MYC_1 - R S S D T E E N V K R R T H N V L E R Q R R N E L K R S F F A L R D Q I P E L E - - - - - - - N N E K A P K V V I L K K A T A Y I L S V Q A E E Q K L I S E E - - - - - - - - - - - - - - - -

MYCL1 - V S S D T E D V T K R K N H N F L E R K R R N D L R S R F L A L R D Q V P T L A - - - - - - - S C S K A P K V V I L S K A L E Y L Q A L V G A E K R M A T E K - - - - - - - - - - - - - - - -MYCN - R N S D S E D S E R R R N H N I L E R Q R R N D L R S S F L T L R D H V P E L V - - - - - - - K N E K A A K V V I L K K A T E Y V H S L Q A E E H Q L L L E K - - - - - - - - - - - - - - - -MNT - Q K K R P G G I G T R E V H N K L E K N R R A H L K E C F E T L K R N I P N V D - - - - - - - - D K K T S N L S V L R T A L R Y I Q S L K R K E K E Y E H E M - - - - - - - - - - - - - - - -

MXD3 - P Q A P G A Q D S G R S V H N E L E K R R R A Q L K R C L E R L K Q Q M P L G A - - - - - - - D C A R Y T T L S L L R R A R M H I Q K L E D Q E Q R A R Q L K - - - - - - - - - - - - - - - -MXD4 - A G L V R K A P N N R S S H N E L E K H R R A K L R L Y L E Q L K Q L V P L G P - - - - - - - D S T R H T T L S L L K R A K V H I K K L E E Q D R R A L S I K - - - - - - - - - - - - - - - -

MXD1 - N K S K K N N S S S R S T H N E M E K N R R A H L R L C L E K L K G L V P L G P - - - - - - - E S S R H T T L S L L T K A K L H I K K L E D C D R K A V H Q I - - - - - - - - - - - - - - - -MXI1 - S G S S N T S T A N R S T H N E L E K N R R A H L R L C L E R L K V L I P L G P - - - - - - - D C T R H T T L G L L N K A K A H I K K L E E A E R K S Q H Q L - - - - - - - - - - - - - - - -

MAX - Q P R F Q S A A D K R A H H N A L E R K R R D H I K D S F H S L R D S V P S L Q - - - - - - - G E K L Y F L F W K L C T P V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -MYC_2 - - - - - - - - E Q K L I S E E D L L R K R R E Q L K H K L E Q L R N S C A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

NCOA1 - - - H K R K G S P C D T L A S S T E K R R R E Q E N K Y L E E L A E L L S A N I S D I D - - S L S V K P D K C K I L K K T V D Q I Q L M K R M E Q E K S T T D - - - - - - - - - - - - - - - -NCOA3 - - - - - - - D T P G Q G L T C S G E K R R R E Q E S K Y I E E L A E L I S A N L S D I D - - N F N V K P D K C A I L K E T V R Q I R Q I K E Q G K T I S N D D - - - - - - - - - - - - - - - -

NCOA2|ENSP00000399968 R K R K E C P D Q L G P S P K R N T E K R N R E Q E N K Y I E E L A E L I F A N F N D I D - - N F N F K P D K C A I L K E T V K Q I R Q I K E Q E K A A A A N I D E V Q K S D V S S T G Q G V ISIM2 - - - - - - - - - - M K E K S K N A A K T R R E K E N G E F Y E L A K L L P L P S A - - - - - - I T S Q L D K A S I I R L T T S Y L K M R A V F P E G L G D A - - - - - - - - - - - - - - - - -

SIM1 - - - - - - - - - - M K E K S K N A A R T R R E K E N S E F Y E L A K L L P L P S A - - - - - - I T S Q L D K A S I I R L T T S Y L K M R V V F P E G L G E - - - - - - - - - - - - - - - - - -HIF1A - D K K K I S S E R R K E K S R D A A R S R R S K E S E V F Y E L A H Q L P L P H N - - - - - - V S S H L D K A S V M R L T I S Y L R V R K L L D A G D L D - - - - - - - - - - - - - - - - - -

EPAS1 - E K K R S S S E R R K E K S R D A A R C R R S K E T E V F Y E L A H E L P L P H S - - - - - - V S S H L D K A S I M R L A I S F L R T H K L L S S V C S E N E - - - - - - - - - - - - - - - -HIF3A - Q D H R S T T E L R K E K S R D A A R S R R S Q E T E V L Y Q L A H T L P F A R G - - - - - - V S A H L D K A S I M R L T I S Y L R M H R L C A A G E W N Q V - - - - - - - - - - - - - - - -

NPAS1 - P S G P C L Q A Q R K E K S R N A A R S R R G K E N L E F F E L A K L L P L P G A - - - - - - I S S Q L D K A S I V R L S V T Y L R L R R F A A L G A P P - - - - - - - - - - - - - - - - - -NPAS3 - S R R E R L Q A L R K E K S R D A A R S R R G K E N F E F Y E L A K L L P L P A A - - - - - - I T S Q L D K A S I I R L T I S Y L K M R D F A N Q G D P P W - - - - - - - - - - - - - - - - -

NPAS4 - - - - - - - - - - M Y R S T K G A S K A R R D Q I N A E I R N L K E L L P L A E A - - - - - - D K V R L S Y L H I M S L A C I Y T R K G V F F A G G T P L - - - - - - - - - - - - - - - - - -AHR - - - - - - - - I P A E G I K S N P S K R H R D R L N T E L D R L A S L L P F P Q D - - - - - - V I N K L D K L S V L R L S V S Y L R A K S F F D V A L K S S - - - - - - - - - - - - - - - - -

PDCD6 - - - - - K Q R P A V G A E K S N P S K R H R D R L N A E L D H L A S L L P F P P D - - - - - - I I S K L D K L S V L R L S V S Y L R V K S F F Q V V Q E Q - - - - - - - - - - - - - - - - - -HELT - - D K L K E R K R T P V S H K V I E K R R R D R I N R C L N E L G K T V P M A L A K - - - - Q S S G K L E K A E I L E M T V Q Y L R A L H S A D F - - - P R G R E K - - - - - - - - - - - - -

BHLHE40 - - R S E D S K E T Y K L P H R L I E K K R R D R I N E C I A Q L K D L L P E H L K L - - - - T T L G H L E K A V V L E L T L K H V K A L T N L I D Q Q Q Q K I - - - - - - - - - - - - - - - -BHLHE41 - - K R D D T K D T Y K L P H R L I E K K R R D R I N E C I A Q L K D L L P E H L K L - - - - T T L G H L E K A V V L E L T L K H L K A L T A L T E Q Q H Q K I - - - - - - - - - - - - - - - -

HES6 - E D G W E T R G D R K A R K P L V E K K R R A R I N E S L Q E L R L L L A G A E - - - - - - - V Q A K L E N A E V L E L T V R R V Q G V L R G R A R E R E Q - - - - - - - - - - - - - - - - -HES7 - - D R A E N R D G P K M L K P L V E K R R R D R I N R S L E E L R L L L L E R T R D Q N - - L R N P K L E K A E I L E F A V G Y L R E - - - - R S R V E P P G V P R - - - - - - - - - - - - -

HES3 - - - - - - - - - - - - - - - - - M E K K R R A R I N V S L E Q L K S L L E K H Y S H - Q - - I R K R K L E K A D I L E L S V K Y M R S L Q N S L Q G L W P V P - - - - - - - - - - - - - - - -HES5 - V E L L S P K E K N R L R K P V V E K M R R D R I N S S I E Q L K L L L E Q E F A R - H - - Q P N S K L E K A D I L E M A V S Y L K H S K A F V A A A G P K S - - - - - - - - - - - - - - - -

HES2 - R R A G D A A E L R K S L K P L L E K R R R A R I N Q S L S Q L K G L I L P L L G R E N - - S N C S K L E K A D V L E M T V R F L Q E L P A S - - - S W P T A A P L - - - - - - - - - - - - -HES1 - D K P K T A S E H R K S S K P I M E K R R R A R I N E S L S Q L K T L I L D A L K K D S - - S R H S K L E K A D I L E M T V K H L R N L Q R A - - - Q M T A A L S T - - - - - - - - - - - - -HES4 - D K P R S A A E H R K S S K P V M E K R R R A R I N E S L A Q L K T L I L D A L R K E S - - S R H S K L E K A D I L E M T V R H L R S L R R V - - - Q V T A A L S A - - - - - - - - - - - - -

HEYL - T P S S S Q M Q A R K K H R G I I E K R R R D R I N S S L S E L R R L V P T A F E K - - - - Q G S S K L E K A E V L Q M T V D H L K M L H A T G G - - - T G F F D A - - - - - - - - - - - - -HEY1 - P T T S S Q I L A R K R R R G I I E K R R R D R I N N S L S E L R R L V P S A F E K Q V M E Q G S A K L E K A E I L Q M T V D H L K M L H T A G G - - - K G Y F D A - - - - - - - - - - - - -HEY2 - P T T T S Q I M A R K K R R G I I E K R R R D R I N N S L S E L R R L V P T A F E K - - - - Q G S A K L E K A E I L Q M T V D H L K M L Q A T G G - - - K G Y F D A - - - - - - - - - - - - -

ARNTL2 - K R K G S D S D P S Q E A H S Q T E K R R R D K M N N L I E E L S A M I P Q C N - - - - - - P M A R K L D K L T V L R M A V Q H L R S L K G L T N S Y V G S N - - - - - - - - - - - - - - - -ARNTL - T E H Q G R I K N A R E A H S Q I E K R R R D K M N S F I D E L A S L V P T C N - - - - - - A M S R K L D K L T V L R M A V Q H M K T L R G A T N P Y T E A N - - - - - - - - - - - - - - - -

ARNT - Q S S A D K E R L A R E N H S E I E R R R R N K M T A Y I T E L S D M V P T C S - - - - - - A L A R K P D K L T I L R M A V S H M K S L R G T G N T S T D G S - - - - - - - - - - - - - - - -ARNT2 - E D G E G P S K F S R E N H S E I E R R R R N K M T Q Y I T E L S D M V P T C S - - - - - - A L A R K P D K L T I L R M A V S H M K S M R G T G N K S T D G A - - - - - - - - - - - - - - - -

CLOCK - V E E D D K D K A K R V S R N K S E K K R R D Q F N V L I K E L G S M L P G N A - - - - - - - - - R K M D K S T V L Q K S I D F L R K H K E I T A Q S D A S E - - - - - - - - - - - - - - - -NPAS2 - M D E D E K D R A K R A S R N K S E K K R R D Q F N V L I K E L S S M L P G N T - - - - - - - - - R K M D K T T V L E K V I G F L Q K H N E V S A Q T E I C - - - - - - - - - - - - - - - - -

USF1 - A P R T T R D E K R R A Q H N E V E R R R R D K I N N W I V Q L S K I I P D C S M E - - - - S T K S G Q S K G G I L S K A C D Y I Q E L R Q S N H R L S E E L - - - - - - - - - - - - - - - -USF2 - G T R T P R D E R R R A Q H N E V E R R R R D K I N N W I V Q L S K I I P D C N A D - - - - N S K T G A S K G G I L S K A C D Y I R E L R Q T N Q R M Q E T F - - - - - - - - - - - - - - - -

KIAA2018 - P T K K Q H R K K N R E T H N A V E R H R K K K I N A G I N R I G E L I P C S P - - - - - - - - A L K Q S K N M I L D Q A F K Y I T E L K R Q N D E L L L N G - - - - - - - - - - - - - - - -TFEB - S R A L A K E R Q K K D N H N L I E R R R R F N I N D R I K E L G M L I P K A N - - - - - - D L D V R W N K G T I L K A S V D Y I R R M Q K D L Q K S R E L E - - - - - - - - - - - - - - - -TFEC - T R A L A K E R Q K K D N H N L I E R R R R Y N I N Y R I K E L G T L I P K S N - - - - - - D P D M R W N K G T I L K A S V E Y I K W L Q K E Q Q R A R E L E - - - - - - - - - - - - - - - -

TFE3 - A K A L L K E R Q K K D N H N L I E R R R R F N I N D R I K E L G T L I P K S S - - - - - - D P E M R W N K G T I L K A S V D Y I R K L Q K E Q Q R S K D L E - - - - - - - - - - - - - - - -MITF - A R A L A K E R Q K K D N H N L I E R R R R F N I N D R I K E L G T L I P K S N - - - - - - D P D M R W N K G T I L K A S V D Y I R K L Q R E Q Q R A K E L E - - - - - - - - - - - - - - - -SREBF1 - P A S A Q S R G E K R T A H N A I E K R Y R S S I N D K I I E L K D L V V G T E - - - - - - - - - A K L N K S A V L R K A I D Y I R F L Q H S N Q K L K Q E N - - - - - - - - - - - - - - - -SREBF2 - Q L E P P K E G E R R T T H N I I E K R Y R S S I N D K I I E L K D L V M G T D - - - - - - - - - A K M H K S G V L R K A I D Y I K Y L Q Q V N H K L R Q E N - - - - - - - - - - - - - - - -

TFAP4 - T Q R D Q E R R I R R E I A N S N E R R R M Q S I N A G F Q S L K T L I P H T D - - - - - - - - G E K L S K A A I L Q Q T A E Y I F S L E Q E K T R L L Q Q N - - - - - - - - - - - - - - - -ATOH8 - S E I K A L Q Q T R R L L A N A R E R T R V H T I S A A F E A L R K Q V P C Y S - - - - - - - Y G Q K L S K L A I L R I A C N Y I L S L A R L A D L D Y S A D - - - - - - - - - - - - - - - -TCF4 - E Q K A E R E K E R R M A N N A R E R L R V R D I N E A F K E L G R M V Q L H L - - - - - - K S D K P Q T K L L I L H Q A V A V I L S L E Q Q V R E R N L N P - - - - - - - - - - - - - - - -

TCF12 - E Q K I E R E K E R R M A N N A R E R L R V R D I N E A F K E L G R M C Q L H L - - - - - - K S E K P Q T K L L I L H Q A V A V I L S L E Q Q V R E R N L N P - - - - - - - - - - - - - - - -TCF3 - E Q K A E R E K E R R V A N N A R E R L R V R D I N E A F K E L G R M C Q L H L - - - - - - N S E K P Q T K L L I L H Q A V S V I L N L E Q Q V R E R N L N P - - - - - - - - - - - - - - - -

TAL1 - T D G P H T K V V R R I F T N S R E R W R Q Q N V N G A F A E L R K L I P T H P - - - - - - - P D K K L S K N E I L R L A M K Y I N F L A K L L N D Q E E E G - - - - - - - - - - - - - - - -TAL2 - - - - - - - - M T R K I F T N T R E R W R Q Q N V N S A F A K L R K L I P T H P - - - - - - - P D K K L S K N E T L R L A M R Y I N F L V K V L G E Q S L Q Q - - - - - - - - - - - - - - - -LYL1 - E G H Q P Q K V A R R V F T N S R E R W R Q Q N V N G A F A E L R K L L P T H P - - - - - - - P D R K L S K N E V L R L A M K Y I G F L V R L L R D Q A A A L - - - - - - - - - - - - - - - -

MSC - G S A A E C K Q S Q R N A A N A R E R A R M R V L S K A F S R L K T S L P W V P - - - - - - - P D T K L S K L D T L R L A S S Y I A H L R Q L L Q E D R Y E N - - - - - - - - - - - - - - - -TCF21 - G V S Q E G K Q V Q R N A A N A R E R A R M R V L S K A F S R L K T T L P W V P - - - - - - - P D T K L S K L D T L R L A S S Y I A H L R Q I L A N D K Y E N - - - - - - - - - - - - - - - -

TCF23 - - - L A L G R S E A S P E N A A R E R S R V R T L R Q A F L A L Q A A L P A V P - - - - - - - P D T K L S K L D V L V L A A S Y I A H L T R T L G H E L P G P - - - - - - - - - - - - - - - -TCF24 - - G S R S G S G R P A A A N A A R E R S R V Q T L R H A F L E L Q R T L P S V P - - - - - - - P D T K L S K L D V L L L A T T Y I A H L T R S L Q D D A E A P - - - - - - - - - - - - - - - -HAND1 - E A L G G R L G R R K G S G P K K E R R R T E S I N S A F A E L R E C I P N V P - - - - - - - A D T K L S K I K T L R L A T S Y I A Y L M D V L A K D A Q S G - - - - - - - - - - - - - - - -

HAND2 - G L G G P R P V K R R G T A N R K E R R R T Q S I N S A F A E L R E C I P N V P - - - - - - - A D T K L S K I K T L R L A T S Y I A Y L M D L L A K D D Q N G - - - - - - - - - - - - - - - -SCX - G G R P G R E P R Q R H T A N A R E R D R T N S V N T A F T A L R T L I P T E P - - - - - - - A D R K L S K I E T L R L A S S Y I S H L G N V L L A G E A C G - - - - - - - - - - - - - - - -TCF15 - G A G P V V V V R Q R Q A A N A R E R D R T Q S V N T A F T A L R T L I P T E P - - - - - - - V D R K L S K I E T V R L A S S Y I A H L A N V L L L G D S A D - - - - - - - - - - - - - - - -

TWIST1 - P Q S Y E E L Q T Q R V M A N V R E R Q R T Q S L N E A F A A L R K I I P T L P - - - - - - - - S D K L S K I Q T L K L A A R Y I D F L Y Q V L Q S D E L D S - - - - - - - - - - - - - - - -TWIST2 - A Q S F E E L Q S Q R I L A N V R E R Q R T Q S L N E A F A A L R K I I P T L P - - - - - - - - S D K L S K I Q T L K L A A R Y I D F L Y Q V L Q S D E M D N - - - - - - - - - - - - - - - -FERD3L - K R K R V I T Y A Q R Q A A N I R E R K R M F N L N E A F D Q L R R K V P T F A - - - - - - - Y E K R L S R I E T L R L A I V Y I S F M T E L L E S C E K K E - - - - - - - - - - - - - - - -PTF1A - V R S E A E L Q Q L R Q A A N V R E R R R M Q S I N D A F E G L R S H I P T L P - - - - - - - Y E K R L S K V D T L R L A I G Y I N F L S E L V Q A D L P L R - - - - - - - - - - - - - - - -

ATOH1 - K Q V N G V Q K Q R R L A A N A R E R R R M H G L N H A F D Q L R N V I P S F N - - - - - - - N D K K L S K Y E T L Q M A Q I Y I N A L S E L L Q T P S G G E - - - - - - - - - - - - - - - -ATOH7 - A G R L E S A A R R R L A A N A R E R R R M Q G L N T A F D R L R R V V P Q W G - - - - - - - Q D K K L S K Y E T L Q M A L S Y I M A L T R I L A E A E R F G - - - - - - - - - - - - - - - -

BHLHA9 - R A R P V R S K A R R M A A N V R E R K R I L D Y N E A F N A L R R A L R H D L - - - - - - - G G K R L S K I A T L R R A I H R I A A L S L V L R A S P A P R - - - - - - - - - - - - - - - -BHLHA15 - G G R R D S S I Q R R L E S N E R E R Q R M H K L N N A F Q A L R E V I P H V R - - - - - - - A D K K L S K I E T L T L A K N Y I K S L T A T I L T M S S S R - - - - - - - - - - - - - - - -

NEUROD6 - K L R L E R V K F R R Q E A N A R E R N R M H G L N D A L D N L R K V V P C Y S - - - - - - - K T Q K L S K I E T L R L A K N Y I W A L S E I L R I G K R P D - - - - - - - - - - - - - - - -NEUROD1 - K A R L E R F K L R R M K A N A R E R N R M H G L N A A L D N L R K V V P C Y S - - - - - - - K T Q K L S K I E T L R L A K N Y I W A L S E I L R S G K S P D - - - - - - - - - - - - - - - -

NEUROD4 - K A R L E R F R A R R V K A N A R E R T R M H G L N D A L D N L R R V M P C Y S - - - - - - - K T Q K L S K I E T L R L A R N Y I W A L S E V L E T G Q T P E - - - - - - - - - - - - - - - -NEUROD2 - K A R L E R S K L R R Q K A N A R E R N R M H D L N A A L D N L R K V V P C Y S - - - - - - - K T Q K L S K I E T L R L A K N Y I W A L S E I L R S G K R P D - - - - - - - - - - - - - - - -

NEUROG2 - E T V Q R I K K T R R L K A N N R E R N R M H N L N A A L D A L R E V L P T F P - - - - - - - E D A K L T K I E T L R F A H N Y I W A L T E T L R L A D H C G - - - - - - - - - - - - - - - -NEUROG1 - A L L H S L R R S R R V K A N D R E R N R M H N L N A A L D A L R S V L P S F P - - - - - - - D D T K L T K I E T L R F A Y N Y I W A L A E T L R L A D Q G L - - - - - - - - - - - - - - - -NEUROG3 - L A L S K Q R R S R R K K A N D R E R N R M H N L N S A L D A L R G V L P T F P - - - - - - - D D A K L T K I E T L R F A H N Y I W A L T Q T L R I A D H S L - - - - - - - - - - - - - - - -

BHLHE22 - S K K S K E Q K A L R L N I N A R E R R R M H D L N D A L D E L R A V I P Y A H - - - - - S P S V R K L S K I A T L L L A K N Y I L M Q A Q A L E E M R R L - - - - - - - - - - - - - - - - -BHLHE23 - R R R P R E Q R S L R L S I N A R E R R R M H D L N D A L D G L R A V I P Y A H - - - - - S P S V R K L S K I A T L L L A K N Y I L M Q A Q A L D E M R R L - - - - - - - - - - - - - - - - -

OLIG2 - Q M T E P E L Q Q L R L K I N S R E R K R M H D L N I A M D G L R E V M P Y A H - - - - - G P S V R K L S K I A T L L L A R N Y I L M L T N S L E E M K R L V - - - - - - - - - - - - - - - -OLIG3 - Q L S E Q D L Q Q L R L K I N G R E R K R M H D L N L A M D G L R E V M P Y A H - - - - - G P S V R K L S K I A T L L L A R N Y I L M L T S S L E E M K R L V - - - - - - - - - - - - - - - -OLIG1 - D A K E E Q Q Q Q L R R K I N S R E R K R M Q D L N L A M D A L R E V I L P Y S A A H C Q G A P G R K L S K I A T L L L A R N Y I L L L G S S L Q E L R R A L - - - - - - - - - - - - - - - -

MESP2 - R A R T G P A G G Q R Q S A S E R E K L R M R T L A R A L H E L R R F L P P S L - - - - - A P A G Q S L T K I E T L R L A I R Y I G H L S A V L G L S E E S L - - - - - - - - - - - - - - - -MESP1 - A R S S R L G S G Q R Q S A S E R E K L R M R T L A R A L H E L R R F L P P S V - - - - - A P A G Q S L T K I E T L R L A I R Y I G H L S A V L G L S E E S L - - - - - - - - - - - - - - - -

MSGN1 - G T K V R M S V Q R R R K A S E R E K L R M R T L A D A L H T L R N Y L P P V Y - - - - - S Q R G Q P L T K I Q T L K Y T I K Y I G E L T D L L N R G R E P R - - - - - - - - - - - - - - - -

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