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Prof. Dr. Peter Maaß Zentrum für Technomathematik Universität Bremen / FB 03 Postfach 33 04 40 D-28334 Bremen Tel.-Nr. (0421) 218-63801 E-Mail [email protected] Poster Award für Theodore Alexandrov Die internationale Konferenz zu Intelligenten Systemen und Molekularbiologie (ISMB) ist die weltweit größ- te Konferenz zu diesem Fachgebiet. Vom 11. bis 13. Juli 2010 fanden sich rund 2000 Teilnehmer in Boston, MA, USA, zu Fachvorträgen, Workshops und einer umfas- senden Poster-Session ein. Die Beiträge dieser Konfe- renz werden durch eine Kommission bewertet, die anschließend in unterschied- lichen Kategorien Auszeich- nungen verleiht. Von den etwa 750 eingereichten Pos- ter wurden drei ausgezeich- net, darunter auch jenes von Theodore Alexandrov, Zen- trum für Technomathematik (ZeTeM) und den beiden Co- Autoren Peter Maaß (Ze- TeM) und Herbert Thiele (Bruker Daltonik GmbH). Das Poster präsentiert eine neue Pipeline für die räumliche Segmentierung von MALDI- Imaging Daten. Diese Pipeline verwendet Clusterverfahren für aufbearbeitete Spektren. Die Grundidee ist, räumliche Beziehungen zwischen den Spektren zu benutzen, um die Variabilität zwischen den Pixeln zu reduzieren. Die einzelnen Schritte der Pipeline sind: Vorverarbeitung der Spektren, Auswahl relevanter Massen, Entrauschen der zu diesen Massen korrespondierenden Bilder mit Bildverarbeitungstechniken (lokal beschränktes, kantenerhaltendes Entrauschen) und statistisches Clustering. Die erzeugten Segmentie- rungsbilder weisen hinsichtlich Glattheit, Detailinformationen und Übereinstimmung mit anatomischen und histologischen Strukturen eine hohe Qualität auf. Für das Poster siehe www.math.uni-bremen.de/zetem/news . ++++ ZeTeM – News Nr. 05/10 ++++
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Poster Award für Theodore Alexandrov - uni …...(ISMB) ist die weltweit größ-te Konferenz zu diesem Fachgebiet. Vom 11. bis 13. Juli 2010 fanden sich rund 2000 Teilnehmer in Boston,

Apr 08, 2020

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Page 1: Poster Award für Theodore Alexandrov - uni …...(ISMB) ist die weltweit größ-te Konferenz zu diesem Fachgebiet. Vom 11. bis 13. Juli 2010 fanden sich rund 2000 Teilnehmer in Boston,

Prof. Dr. Peter MaaßZentrum für TechnomathematikUniversität Bremen / FB 03Postfach 33 04 40D-28334 BremenTel.-Nr. (0421) 218-63801E-Mail [email protected]

Poster Award für Theodore Alexandrov

Die internationale Konferenz zu Intelligenten Systemen und Molekularbiologie (ISMB) ist die weltweit größ-te Konferenz zu diesem Fachgebiet. Vom 11. bis 13. Juli 2010 fanden sich rund 2000 Teilnehmer in Boston, MA, USA, zu Fachvorträgen, Workshops und einer umfas-senden Poster-Session ein.

Die Beiträge dieser Konfe-renz werden durch eine Kommission bewertet, die anschließend in unterschied-lichen Kategorien Auszeich-nungen verleiht. Von den etwa 750 eingereichten Pos-ter wurden drei ausgezeich-net, darunter auch jenes von Theodore Alexandrov, Zen-trum für Technomathematik (ZeTeM) und den beiden Co-Autoren Peter Maaß (Ze-TeM) und Herbert Thiele (Bruker Daltonik GmbH).

Das Poster präsentiert eine neue Pipeline für die räumliche Segmentierung von MALDI-Imaging Daten. Diese Pipeline verwendet Clusterverfahren für aufbearbeitete Spektren. Die Grundidee ist, räumliche Beziehungen zwischen den Spektren zu benutzen, um die Variabilität zwischen den Pixeln zu reduzieren. Die einzelnen Schritte der Pipeline sind: Vorverarbeitung der Spektren, Auswahl relevanter Massen, Entrauschen der zu diesen Massen korrespondierenden Bilder mit Bildverarbeitungstechniken (lokal beschränktes, kantenerhaltendes Entrauschen) und statistisches Clustering. Die erzeugten Segmentie-rungsbilder weisen hinsichtlich Glattheit, Detailinformationen und Übereinstimmung mit anatomischen und histologischen Strukturen eine hohe Qualität auf.

Für das Poster siehe www.math.uni­bremen.de/zetem/news.

+ + ++ Z e T e M – N e ws N r . 05 / 1 0 ++ + +