A. Karuza, M. Celussi, E. Crevatin, S. Fonda Umani, C. Solidoro e P. Del Negro Segnali di cambiamento nelle classi dimensionali più piccole: dai virus ai batteri Dipartimento di Oceanografia Biologica Dipartimento di Oceanografia Biologica - - BiO BiO Convegno "Variazioni temporali e tendenze nelle caratteristiche meteorologiche ed oceanografiche dell'Adriatico settentrionale: la situazione nel golfo di Trieste “ Trieste, 2-3 dicembre 2010
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A. Karuza, M. Celussi, E. Crevatin, S. Fonda Umani, C. Solidoro e P. Del Negro
Segnali di cambiamento nelle classi dimensionali più piccole:
dai virus ai batteri
Dipartimento di Oceanografia Biologica Dipartimento di Oceanografia Biologica -- BiOBiO
Convegno "Variazioni temporali e tendenze nelle caratteristiche meteorologiche ed oceanografiche dell'Adriatico settentrionale: la
situazione nel golfo di Trieste “Trieste, 2-3 dicembre 2010
Chi sono?
Ambienti costieri;Acque superficiali
Ambienti profondi;Condizioni estreme
PROCARIOTI
Euviria ViroidiaDeoxyriboviraRibovira
Akamara
?
Perché studiarli?
“MICROBIAL LOOP”
O2, CO2, altri gas
CH4DMS
sostanzaorganica
POM
aggregatiDOM
C, N, P, S, Fe,...
SEDIMENTAZIONE....... .. ..
Campionamento...
Come si studiano?
• batteri: 1993 –
• virus: 2000 - 2010
Frequenza mensile o bimensile Serie temporale
Quote: superficie, 5m, 10 m e 15 m
...analisi
1 10 μm
Sybr Green I (Noble & Fuhrman, 1998) DAPI (Porter & Feig, 1980)
Shifts in the mean for integrato HPProbability = 0.05, cutoff length = 12, Huber parameter = 1
0,E+00
1,E+09
2,E+09
3,E+09
4,E+09
5,E+09
6,E+09
gen -93gen-94gen-95gen -96gen-97gen -98gen -99gen-00gen -01gen-02gen-03gen -04gen-05gen-06gen -07gen-08gen -09gen -10gen-11
Jun 2001 Mar 2006 Dec 2008 Jun 1995Sep 1997 May 1998
• distribuzione verticale pressoché omogenea (ANOVA) valore integrato
Microphytoplankton (Fonda Umani et al., 2004)
• indice di correlazione lineare di Spearman: **p<0.01; ***p<0.005
virus batteri ciano salinità temperatura
virus n.s. n.s. ** n.s.
batteri n.s. *** *** ***
ciano n.s. *** *** ***
Quali sono i fattori determinanti?
• no relazione tra le abbondanze dei virus con i procarioti!
• bin-average
0
50
100
150
200
250
30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40Salinity
Viru
s ab
unda
nce
(*10
8 viru
ses
L-1
)
0m 5m 10m 15m
• massimi tassi di proliferazione dei virus sono stati osservati in condizioni di crescita ottimali dell’ospite; le abbondanze batteriche totali e la frazione metabolicamente attiva sono risultati particolarmente elevati nelle condizioni di non-limitazione da nutrienti (Larato et al., 2010).
•Del Negro P, Crevatin E, Larato C, Ferrari C, Totti, C, Pompei M, Giani M, Berto D, Fonda Umani S (2005). Mucilage microcosms. Sci Tot Environ 353: 258-269.
•Fonda Umani S, Beran A, Parlato S, Virgilio D, Zollet T, De Olazabal A, Lazzarini B, Cabrini M (2004). Noctiluca scintillans (Macartney) in the Northern Adriatic Sea: long-term dynamics, relationships withtemperature and eutrophication, and role in the food web. J Plankton Res 26: 1-17.
•Karuza (2001) Variazioni stagionali dei tassi di crescita e di mortalità nel Golfo di Trieste e le loro relazioni con la comparsa delle mucillagini. Tesi di Laurea in Scienze Biologiche, Università Degli Studi di Trieste.
•Karuza A, Del Negro P, Crevatin E, Fonda Umani S, (2010). Viral Production in the Gulf of Trieste (Northern Adriatic Sea): Preliminary results using different methodological approaches. J Exp Mar Biol Ecol 383: 96-104.
•Karuza A, Del Negro P, Paoli A, Comisso S, Fonda Umani S (2004) Highly active bacteria in the surfacewaters of the Gulf of Trieste (Northern Adriatic Sea). Rapp Comm Int Mar Medit 37: 277.
•Larato C, Celussi M, Virgilio D, Karuza A, Falconi C, Vittor C, Del Negro P, Fonda Umani S (2010) Production and utilization of organic matter in different P-availability conditions: a mesocosm experiment in the Northern Adriatic Sea. J Exp Mar Biol Ecol 391:131-142.
•Paoli A, Del Negro P, Fonda Umani S (2006a). Temporal variability in bacterioplanktonic abundance in coastal waters of the Northern Adriatic Sea. Chem Ecol 22(S1): S93-S103.
•Paoli A, Karuza A, De Vittor C, Del Negro P, Fonda Umani S (2006b). Daily variations of highly activebacteria in the Norhern Adriatic Sea. J Plankton Res 27: 1-11.