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LA DEGRADAZIONE DELLE PROTEINE • Proteine di membrana o da sistemi con membrana--> VIA LISOSOMIALE Prot. citoplasmatiche--> VIA UBIQUITINA/PROTEASOMA ENZIMI LISOSOMIALI (idrolasi acide- pH 4.8): Degradano macromolecole in monomeri. LSD (Lysosomial Storage Diseases)
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Feb 17, 2019

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Lam Huong
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LA DEGRADAZIONE DELLE PROTEINE

•  Proteine di membrana o da sistemi con membrana--> VIA LISOSOMIALE •  Prot. citoplasmatiche--> VIA UBIQUITINA/PROTEASOMA

ENZIMI LISOSOMIALI (idrolasi acide- pH 4.8): Degradano macromolecole in monomeri.

LSD (Lysosomial Storage Diseases)

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IL BLOCCO DELLA ATTIVITA’ DEL PROTEASOMA PROVOCA EFFETTI ASPECIFICI E SPECIFICI

•  degradazione generalizzata delle proteine

•  produzione di peptidi antigenici da presentare sulla superficie cellulare legati al complesso MHC

•  degradazione specifica di fattori coinvolti nel ciclo cellulare - cicline (mitosi)

- proteine controllo replicazione (sintesi DNA)

LA VIA CITOSOLICA COMPRENDE DUE COMPONENTI PRINCIPALI: - Ubiquitina (segnale di degradazione) - Proteasoma (proteasi di degradazione)

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LE PROTEINE VANNO INCONTRO AD UN CONTROLLO DI QUALITA’

UBIQUITIN!

Aaron Ciechanover Avran Hershko Irwin Rose

2004 Nobel Chimica

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L’ubiquitina è una proteina di 76 aminoacidi presente negli eucarioti. E’ molto conservata dal lievito ai mammiferi.

Ha una struttura rigida tranne che al C-terminale dove porta un

tetrapeptide mobile che termina con Gly76

La aggiunta di residui di ubiquitina (reversibile) indirizza le proteine verso la degradazione nel proteasoma

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(1) Formazione legame tioestere Ubq-E1

(richiede ATP)

(2) Trasferimento tioestere ad E2

(3) Formazione legame

amidico con ε-NH2 substrato

COME AVVIENE IL LEGAME TRA UBIQUITINA E PROTEINA BERSAGLIO?

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LA FORMAZIONE DELLE CATENE DI POLI-UBIQUITINA AVVIENE PER REAZIONE CON UN RESIDUO DI LISINA

CONSERVATA (Lys48)

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Il sistema ubiquitina comprende diverse attività enzimatiche

E1= enzima che attiva Ubq (UBA)

E2= enzima che trasporta Ubq (UBC)

E3= Ubq ligasi

E4= fattore di assemblaggio

SOLO LE PROTEINE MODIFICATE CON POLI-UBIQUITINA

VENGONO DEGRADATE NEL PROTEASOMA

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Il sistema ubiquitina è un sistema a cascata

E1= 1 tipo (UBA)

E2= 13-20 tipi (UBC)

E3= Ubq ligasi- Specificità di substrato Molte famiglie: Hect -->p53 RING-finger --> possiede Cys-His conservate Multi-subunità: APC= anaphase promoting complex and SCF=Skp1/cullin F-box protein

HECT

RING

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IL PROTEASOMA E’ UN COMPLESSO DI MOLTE SUBUNITA’ ORGANIZZATE IN ANELLI EPTAMERICI

ALFA

BETA

ALFA

ARCHEOBATTERI

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NEGLI EUCARIOTI:

26S --> Subunità catalitiche (20S) proteasi Subunità regolative (19S) ATPasi unfoldasi

IL PROTEASOMA E’ UNA IDROLASI

Idrolasi a nucleofilo N-terminale (treonina). Anche altre attività proteolitiche (proteasi a serina) Ampia specificità Sintetizzata come zimogeno (nella maggior parte dei casi).

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STADI DELLA DEGRADAZIONE PROTEICA SUL PROTEASOMA

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ALCUNI ESEMPI DEL RUOLO BIOLOGICO DEL SISTEMA

UBIQUITINA PROTEASOMA

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LE CICLINE SONO PROTEINE CHE REGOLANO IL CICLO CELLULARE

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APC (anaphase promoting complex) è una UBIQUITINA LIGASI specifica per la ciclina M

INGRESSO IN ANAFASE

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UBIQUITINA ED APOPTOSI

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PRODUZIONE DI PEPTIDI ANTIGENICI

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LA SCELTA TRA FOLDING E DEGRADAZIONE E’ MEDIATA DA FATTORI SPECIFICI

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Questi fattori posseggono siti di legame sia alle chaperonine che al

proteasoma (e/o attività ubiquitina ligasi)

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SE IL CONTROLLO DI QUALITA’ NON FUNZIONA………

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LA VIA UBIQUITINA-PROTEASOMA OFFRE ANCHE MOLTE POSSIBILITA’ REGOLATIVE

CICLO CELLULARE RISPOSTA INFIAMMATORIA PRESENTAZIONE ANTIGENI

ALTERAZIONI: TUMORI, MALATTIE EREDITARIE

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IL SISTEMA UBIQUITINA E’ ANCORA PIU’ COMPLESSO…………