Top Banner
Kinetika reaksi enzimatis Shinta Rosalia Dewi, M.Sc
23

Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

May 19, 2018

Download

Documents

ngokien
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Kinetika reaksienzimatis

Shinta Rosalia Dewi, M.Sc

Page 2: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Enzim : protein yg mengkatalisis prosesbiokimia dalam sel hayati yang spesifikproduksi biomassa atau metabolit, produkpangan, pakan, dll

• Reaksi enzimatis :

Sistem homogen atau heterogen

Satu substrat atau lebih

Page 3: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Dasar kinetika reaksi enzimatis

• Michaelis –Mentenlaju awal reaksienzimatis dapat ditentukan berdasarkanfungsi terhadap konsentrasi substrat danparameter yg berpengaruh dalam enzim

• Henri pembentukan kompleks enzimsubstrat reversibel selama reaksipembentukan produk dari substrat lajureaksi berbanding lurus dengan konsentrasikompleks

Page 4: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Reaksi reversibelk k

kE S ES E P

d[S]v k [E][S] k [ES]

dt

d[ES]v k [E][S] [k k ][ES]

dt

laju pembentukan (kekanan) = laju penguraian (kekiri)

k [E][S] [k k ][ES]

k [E][S] [k k ][ES]

k k[E][S] [ES]

k

1 2

1

1 1

1 1 2

1 1 2

1 1 2

1 2

1

0

k kKm

k

1 2

1

Page 5: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

T

T

T

T

T

T

max T

max

[E][S] [ES]Km

[E ] [E] [ES]

[E ] [ES] [S] [ES]Km

[E ][S] [ES][S] [ES]Km

[E ][S] [ES] Km [S]

[E ][S][ES]

Km [S]

[E ][S]v k [ES] k

Km [S]

v k [E ]

v [S]v

Km [S]

2 2

2

Page 6: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Kinetika reaksi Michaelis-Menten :

maxv [S]v

Km [S]

Page 7: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Kinetika reaksi homogen : penentuan Km

• Persamaan Lineweaver dan Burk

max

max max max

max max

v [S]v

Km [S]

Km [S] Km [S]

v v [S] v [S] v [S]

Km

v v [S] V

1

1 1 1

Page 8: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Persamaan Eadie Hofstee

max

max

max

max

max

v [S]v

Km [S]

v Kmv sehingga v =v

Km [S]

[S]

vv = Km v

[S]

vv Km v

[S]

1

1

Page 9: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Persamaan Hanes

max

max max

max max

max max

v [S]v

Km [S]

Km(Lineweaver Burk)

v v [S] v

Km[S] [S] [S]

v v [S] v

[S] Km[S]

v v v

1 1 1

1 1 1

1

Page 10: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi

• Kompetitif : inhibitor berkompetisi dengansubstrat untuk berinteraksi dengan sisi aktifenzim

• uncompetitive: inhibitor menghambat kerjaenzim di sisi yg berbeda dari interaksisubstrat-enzim terikat pada ES

• Non- kompetitif : inhibitor menghambat di sisiberbeda, tidak menghasilkan produkterikat pada E atau ES

Page 11: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi

• Oleh produk produk yang dihasilkan dapatmenghambat kerja enzim kompetitif atautidak kompetitif

• Oleh substrat substrat menghambat kerjaenzim (konsentrasi substrat terlalu tinggi) membentuk kompleks tidak kompetitif

Page 12: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi kompetitif

Page 13: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi kompetitifk k

k

ki

max

max max

E S ES E P

E I EI

[ET] [ES] [E] [EI]

v [S]v

[I]Km [S]

Ki

Km [I]

v v v Ki [S]

[I]K 'm Km

Ki

1 2

1

1

1 1 11

1

Page 14: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi uncompetitive

Page 15: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi uncompetitive

k k i

k

max

E S I ES I ESI

ES E P

[ET] [ES] [E] [ESI]

v[S]

[I]

Kiv

Km[S]

[I]

Ki

1 1

1

1

1

max max

Km [I]

v v [S] v Ki

KmK 'm

[I]

Ki

1 1 11

1

Page 16: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi non-kompetitif

Page 17: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Inhibisi non-kompetitif

k k

k

ki

ki

max

max max

E S ES E P

E I EI

ES I ESI

[ET] [ES] [E] [ESI]

v [S]v

[I]Km [S]

Ki

Km [I]

v v [S] v Ki

1 2

1

1

1

1 1 11

Page 18: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Faktor yang mempengaruhi reaksienzimatis

• pH perubahan struktur, ionisasi, pengikatanenzim

pH mempengaruhi muatan

Muatan mempengaruhi struktur enzim

Selanjutnya akan mempengaruhi reaksi ES

Page 19: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Suhu

k=Ae-E/RT

• Pereaksi kimia

Page 20: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Penentuan aktivitas enzim

• pH Stat pengukuran jumlah asam (H+) yang ditambahkan ke cairan pereaksi volume asam/basa terhadap waktu

• Spektrofotometri pengukuran enzimdengan spektrofotometer pada panjanggelombang tertentu

Page 21: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

Contoh soal

• Kinetika enzim glukoamilase ditentukan padasuatu reaktor tertutup pada suhu 40oC berdasarkan glukosa yang terbentuk (µmol/L). Bila volume cairan dalam reaktor 500 ml danlarutan enzim yang digunakan 500 µL mengandung 4g/L.

Page 22: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• Bagaimana bentuk kinetika hidrolisis maltosaoleh enzim glukoamilase?

• Glukosa sebagai produk juga berfungsi sebagaiinhibitor. Kinetika penghambatannya ditunjukkanpd tabel di bawah. Tentukan model kinetikapenghambatan

Waktu(menit)

Konsentrasi awal maltosa (mM)

50 100 150 200

2 95 110 130 140

5 230 290 320 340

10 440 570 640 670

15 700 860 960 1.000

30 1.400 1.700 1.900 2.000

Page 23: Kinetika reaksi enzimatis kinetika reaksi enzimatis •Michaelis –Menten laju awal reaksi enzimatis dapat ditentukan berdasarkan fungsi terhadap konsentrasi substrat dan parameter

• TRK meeting 5.xlsx

Glukosa(mM)

Konsentrasi substrat maltosa (mM)

50 100 150 200

0 5,8 7,2 8 8,4

2,5 5,2 6,9 7.6 8,1

5 4,8 6,4 7,3 7,9

10 4,1 5,8 6,7 7,4