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NCKU Tainan 2 0 1 6 第一屆iGEM NCKU Tainan 成大校方提案企劃書
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iGEM NCKU Tainan Proposal

Jul 23, 2016

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Raymond Hou

2016 iGEM for NCKU
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Page 1: iGEM NCKU Tainan Proposal

NCKU Tainan

2 0 1 6

第一屆iGEM NCKU Tainan

成大校方提案企劃書

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目錄

About IGEM ———————P. 1

㈽劃緣起—————————P. 3

團隊願景—————————P. 5

計劃大綱—————————P. 7

經費預算、時程規劃————P. 8

其他團隊狀況———————P. 9

團隊現況———————— P. 11

訓練規劃———————— P. 12

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International Genetically Engineered Machine Competition ,簡稱 iGEM,是國際基

因⼯程機器設計競賽,此項合成⽣物學競賽每年由美國麻省理⼯學院

( Massachusetts Institute of Technology , MIT ) 主辦。

iGEM 是⼀項關於基因⼯程設計的競賽,也是關於全新領域 「 ⽣物合成 」 的國際性競賽。它融合了⽣物、⼯程、物理、計算機科學和其他多項領域的綜合性科學⼯程。⼤賽⽬的在於「促進跨學科領域研究與合作」,利⽤⼯程⼿段創造標准化的⽣物元件,並利⽤它們構建具有各種實⽤價值的微⽣物遺傳體,並解決社會問題,是合成⽣物學領域最⾼級別的國際性⼤學⽣競賽,曾多次被 Nature 等國際權威科學雜志報導。

About iGEM

2004年美國MIT出版的《Technology Review》將合成⽣物學列為將改變世界的⼗⼤

新技術之⼀。簡單地說,合成⽣物學通過設計和構建⾃然界中不存在的⼈⼯⽣物系統來解決能源、材料、健康和環保等問題。透過合成⽣物學設計的新元件,組裝出真正的⽣物系統,並令其在活體細胞中⼯作。iGEM⽬前的作品多樣:從彩虹⾊的細菌、發出⾹蕉或冬青氣味的細菌、到檢測砷離⼦的⽣物傳感器、有浮⼒的細菌,以及可以合成⾎紅素的⽣物⼯廠…等等。為⼀跨領域的研究學⾨,能與合成⽣物學結合的領域包括:分⼦⽣物學、基因⼯程、資訊科學、統計學、系統⽣物學、⼯程科學等。

合成⽣物學(Synthetic Biology)

01

更勝於傳統實驗室實習

相較於傳統實驗室實習,或者研究型比賽,通常為舊技術上的優化,iGEM強調多領域合作,並且直接於⽣活上實踐,為⼀全⽅位的長期計畫,不單只是競賽。

⼀個完整的iGEM涵蓋以下內容:

• ⽣物系統設計 (Biological System Design) • 電腦模擬 (Modeling) • 實際實驗操作 (Wet lab) • ⼈本實踐與外部合作 (Human Practice and Collaboration) • ⽣物安全探討 (Biosafety) • 網⾴設計 (Website) • 海報以及⼜頭報告 (Poster and Presentation)

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iGEM 2015 Around the World (282 Teams, 37 Countries)

Australia • Belgium • Brazil • Canada • Chile • China • Colombia • Czech_Republic • Denmark • Egypt • Finland • France • Germany • Honduras • Hong Kong • India •

Indonesia • Ireland • Israel • Italy • Japan • Kazakhstan • Lithuania • Republic Of Korea • Mexico • Netherlands • Norway • Pretoria • Poland • Slovenia • Spain • Sweden • Switzerland

• Taiwan • Turkey • United Kingdom • United States

iGEM 2015 Jamborees

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企劃緣起

隨著「合成⽣物學」的蓬勃發展,世界各地已針對此新領域進⾏⼤量研究並實

踐於社會的應⽤的應⽤上,我們相信透過參加iGEM競賽,能徹底發揚成功⼤學的三

⼤特⾊:理⼯背景、完整學院(有設計規劃學院、醫學院、⽣物科學院…等)、台

南⼈⽂底蘊,並藉iGEM結合國際化、創新創業的發展,向全台灣,甚至在全球舞台

上榮耀成功⼤學與台南市。

美國麻省理⼯學院在2004年發起了iGEM競賽,經驗⼗年的發展,已經在歐美

先進國家引起學術到業界的輻射效應。在此項比賽中,台灣現正處於起步階段,北

台灣陽明⼤學於2007開始參與iGEM,交通⼤學、台灣⼤學後來陸續加入。⽬前已在

合成⽣物學和iGEM上獲得不錯的成果(已有獲數⾯世界⾦牌與亞洲區冠軍)。然

⽽,台灣南部卻完全沒有看⾒任何⼀⽀隊伍參與︔因此,我們將由化⼯系吳意珣教

授(於廈⾨⼤學帶領過3屆iGEM團隊)的帶領下,成⽴台灣南部的第⼀⽀iGEM隊

伍,也是成⼤⾸創種⼦隊,將透過這⼀年的籌備與研究,進軍美國波⼠頓之世界舞

台,讓成功⼤學的學⽣能在世界⽴⾜被看⾒、被肯定。

此外,在對岸在中國,2008年時的⾹山科學會、國務院,以及2009年中國科學

院都將合成⽣物學列為2030年前後若⼲年的⽣物科技的關鍵技術,在《創新2050:科

學技術與中國的未來》戰略研究系列報告指出:「合成⽣物學是未來⾰命性突破的4

個基本學科之⼀。」,在中國的⾼等教育,合成⽣物學也已經編成教材,出現《合

成⽣物學導論》,為合成⽣物學推廣和研究,從⼤學⽣開始做起。

即使是⾸屆成⽴,我們也已於2015年暑假參加交通⼤學舉辦的亞洲iGEM交流

會,觀摩及學習其他亞洲團隊,發現這是世界級的比賽,其規模與成果都讓⼈驚嘆

不已。然⽽,由於我們為第⼀屆成⽴,資⾦、規模和研究上急需校⽅的⽀持與協助,

願校⽅能關注到此國際盛事,投入經費栽培成⼤的優秀學⽣擴展國際視野資與此,

合⼒將南台灣最具歷史地位的成功⼤學帶到世界舞台上,榮耀學校、城市與國家。

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團隊願景

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產學合作

透過各學院的跨領域合作,並結合iGEM的技術研究,發展產學合作。

(如:2015台灣⼤學團隊,與麗寶⽣醫合作︔更多請參考:iGEM Sponsors)

成功⼤學擁有豐富的校友資源,以及地緣靠近南部科學⼯業園區,藉由iGEM的團

隊,不僅將學⽣所學實際運⽤於社會解決問題之上,並帶動業界連結。

※常⾒的團隊合作廠商:

創新創業

國際化

06

iGEM不僅是⼀個合成⽣物學最⾼領域的國際競賽,更是⼀整合各⽅⾯領域的實踐計

畫。迄今已有許多團隊透過iGEM競賽後成⽴公司。

(2014交通⼤學團隊已將當年計畫成⽴公司,更多請參考:iGEM Startups)

因此,我們團隊認為iGEM,不只單單是⼀年的競賽,更是⼀項長期的創新創業計

畫。結合成⼤技轉中⼼、研究總中⼼,以及教育部創新創業紮根計畫,發展出學⽣、學

校,以及國家的三贏層⾯︔針對教務層⾯,也能推動相關學程。

每年超過250個隊伍,來⾃超過30個國家,藉由iGEM可以直接與世界各⼤專院校進

⾏交流,給台灣、成功⼤學⼀個舞台,不論是結交姐妹校,交換學⽣,或者進⾏校際間的

合作計畫,iGEM皆可作為⼀個基⽯,進⾏長時間的交流以及合作。此外,iGEM更可以給

校內國際學位⽣,⼀個管道與舞台發揮,展現成⼤的國際⼒。

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計劃大綱

由於iGEM NCKU Tainan,為第㆒屆創立,

希望與成大校方進行「短、長」期的合作:

iGEM NCKU Tainan,也將盡力配合校方提出之相關計畫,

㆒同為成功大㈻以及台灣在世界舞台㆖爭光。

【⼈⼒與其他資源】

短期

指導⽼師以及顧問 召集有意參與計畫之⽼師以及⼈員共同協⼒推動。 包含訓練團隊成員相關技能,協助問題解決、提供實驗資源,以及引入外部資源…等。

⽬前Wet-Lab於化⼯系吳意珣⽼師實驗室,以及醫學院⽣理所蔡美玲⽼師實驗室。

長期

成⽴專案中⼼,擁有討論空間

及實驗室

成⽴專案中⼼,或教學單位…等。 擁有相對應的課程、師資及學⽣,並於成功⼤學校內擁有⾏政位階,建⽴相關⾏政程序,以便外界資源引入,也能使得此計畫永續經營。

【經費籌募】

短期

iGEM⼤賽報名費⽤及研究經費 ※經費預算表於下⼀⾴,藉由校⽅可⽤計畫與資源進⾏籌募 (如:成⼤校友、頂尖⼤學計畫…等)

長期

成⽴校內iGEM基⾦ 將輔助未來團隊有效的規模化、推廣和相關事宜。

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經費預算表

2016 iGEM ⼤會註冊相關

隊伍註冊費 USD 4,000 NTD 129,898

成員報名費 695*18=USD 12,510 NTD 406,256

台灣 - 波⼠頓 來回機票 45,000*20=NTD 900,000

波⼠頓住宿(2016.10.26~11.03) USD 12,000 NTD 389,694

實驗耗材費、宣傳品、⾏政⽀出 NTD 250,000

總計 NTD 2,076,448

時程規劃表

2015

團隊招募 前期資⾦籌募(校⽅、校友)

10⽉

Pre-Training

12⽉ 2016 2⽉

Model Project

Functional Work

20163⽉ 7⽉ 10⽉

Website Developed

⼆期資⾦籌募(政府計畫、產學合作、企業贊助)

Research, Prototype 外部宣傳、亞洲交流會 MIT世界舞台

11⽉

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其他團隊狀況

交通⼤學 台灣⼤學 長庚⼤學

負責⽼師 ⽣物科技學系 陳⽂亮 助理教授

⽣化科技系 陳彥榮 助理教授

⽣物醫學系羅時成 系主任 特聘教授

⽣物醫學系楊淑元 助理教授

⽣物醫學系Scott C. Schuyler 助理教授

團隊⼈數 20 14 17

經費來源 主要為學校⽅的補助也有⾯膜廠商的贊助

其他管道:校友會的募款

本屆為麗寶⽣醫贊助,以及各系補助

校⽅直接補助

歷屆得獎 歷年都有⾦牌或銀牌,2014為世界總排名第三。

2012~2014皆為⾦牌

備註 將iGEM設為⽣科學院之學程,欲參賽者必須修習相關課程。

iGEM設為課程,兩學期四學分:⽣化科技實習專案

由頂尖⼤學計畫撥出經費

中國中山⼤學 北京師範⼤學

負責⽼師 ⽣科院 ⿈軍就 副教授 ⽣命科學院副院長 向本瓊

微⽣物學系 朱旭東 特聘教授

團隊⼈數 13 26

經費來源 學校經費、Genestar⽣物公司贊助

由學校與學院給予,每⼀年會有⼀筆專⾨⽤於創新性實驗的資⾦。

歷屆得獎 2013亞洲區⾦牌、世界第三 ⾦牌數⾯

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Potential Topic

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成功⼤學化⼯博⼠ 廈⾨⼤學化⼯系副教授(帶領過3年iGEM團隊) 中央研究院南部⽣物技術中⼼ 博⼠後研究員

Instructor

美國加州⼤學Irvine分校化⼯暨⽣化⼯程系博⼠ 成⼤能源科技與策略研究中⼼ ⽣質能源組召集⼈暨中⼼委員 亞洲⽣物技術聯盟 執⾏會委員

吳意珣教授(2014年成⼤化⼯系新進教師)

張嘉修教授(成⼤化⼯系特聘教授)

蔡美玲教授(成⼤醫學院⽣理所副教授)

密西根⼤學毒物學博⼠ 成功⼤學國際學⽣事務組 組長 第七屆亞太⽣理科學聯盟學術⼤會 秘書長

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Member

林哲毅 醫學五 陳⼄軒 醫學四/雙物理

王佳恩 醫學四/雙物理 林協霆 醫學三

侯智薰 化⼯三 汪維萱 化⼯三

⾼紹軒 化⼯三 蕭荷青 材料⼀

何岳霖 ⽣科四 游⽅暐 ⽣科四

吳佩璇 ⽣科三 賴健誠 ⽣科三

陳書宇 物理三 張宏卿 數學三

洪迎欣 化學三

⿈啟軒 資訊碩⼀ 楊靜妃 資訊四

陳識宇 資訊三/雙電機

李筱⽂ 都計⼀

劉珈君 政治⼀

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Knowledge Building

Profession Training

訓練規劃

Weekly meeting (Every Wednesday)

[Reference Reading] :

參考國外合成⽣物學課程,安排每週進度,所有成員皆必須研讀,於每週會議時

間進⾏討論。 本學期預計研讀:《合成⽣物學導論, 宋凱︔⿈熙泰》、《Synthetic Biology From iGEM

to the Artificial Cell, Spinger》、《Synthetic Biology-Tools and Applications, Huimin

Zhao》、《Synthetic Biology-A Lab Manual, World Scientific》

[Case Study]:

分析過去得獎團隊資料,建⽴資料庫。每週三位成員上台報告,以分析的資料對所

有成員進⾏專業項⽬的「教學」。

[Wet-Lab]

由化⼯系吳意珣⽼師,及其研究⽣,帶領成員們做實驗操作與訓練,預計三個週末實驗演

練,與⼀週合成⽣物學理論課程。

[Dry-Lab]

由醫學系陳毓宏⽼師,及其研究⽣,進⾏成員的分析⼯具、數據模擬…等訓練。

[English Speaking]

由葉靜怡、杜佩璇⽼師進⾏成員的英語會話、報告、寫作…等教學。

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