Hierarchie der Proteinstruktur
Sekundärstruktur: α-Helix
Ausrichtung lokaler Dipolmomente stabilisiert zusätzlich:
Bändermodell(Cartoon)
Sekundärstruktur: β-Faltblatt
Bändermodell(Cartoon)
Ramachandran-Plot
beta-Faltblatt
alpha-Helix
Lalpha
linkshändige Helix: Lalpha
Ramachandran-Plot Statistik: Unterschiede zwischen Aminosäuren
Tertiärstruktur (Folds): Beispiele
α/β Domain, Rossmann fold
PDB 1HDC
Immunoglobulin Domain,
PDB 1AQK
TIM BarrelPDB 1YPI Jellyroll
PDB 2BUK
Quartärstruktur
Actin Filament
from Stryer, Biochemistry
from Stryer, Biochemistry
Glycine
Alanine
Valine
Leucine
Isoleucine
Proline
Methionine
Phenylalanine
Tryptophan
Serine
Threonine
Asparagine
Glutamine
Cysteine
Tyrosine
Aspartic Acid
Glutamic Acid
Lysine
Arginine
Histidine
unpolar polar negativ geladen
positiv geladen
from Stryer, Biochemistry
pKa - Werte