1 Evaluación de Coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos, colifagos CB390 y fagos de Bacteroides GA17 como indicadores microbiológicos de contaminación en afluentes de plantas de tratamiento de agua residual doméstica. Luisa Fernanda Riaño García Directora: María Claudia Campos Pinilla. Ph.D. TRABAJO DE GRADO Presentado como requisito parcial para optar el título de MICROBIÓLOGA INDUSTRIAL PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA FACULTAD DE CIENCIAS CARRERA DE MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL BOGOTÁ D.C. JUNIO 2017
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Evaluación de Coliformes totales, E. coli, colifagos ...
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Evaluación de Coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos, colifagos CB390 y fagos
de Bacteroides GA17 como indicadores microbiológicos de contaminación en afluentes
de plantas de tratamiento de agua residual doméstica.
Luisa Fernanda Riaño García
Directora:
María Claudia Campos Pinilla. Ph.D.
TRABAJO DE GRADO
Presentado como requisito parcial para optar el título de
MICROBIÓLOGA INDUSTRIAL
PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA FACULTAD DE CIENCIAS
CARRERA DE MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL BOGOTÁ D.C.
JUNIO 2017
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NOTA DE ADVERTENCIA
Artículo 23 de la resolución Nº. 13 de Julio de 1946:
“La Universidad no se hace responsable por los conceptos emitidos por sus alumnos en sus
tesis de grado. Solo velará porque no se publique nada contrario al dogma y a la moral católica
y porque las tesis no contengan ataques personales contra persona alguna, antes bien se vea en
ellas el anhelo de buscar la verdad y la justicia”.
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AGRADECIMIENTOS Hoy agradezco en primer lugar a Dios por permitirme culminar este trabajo de grado, a mi mamá
María Elena García por ser mi gran apoyo, consejera y mi ejemplo a seguir, por enseñarme el
valor del esfuerzo y la perseverancia, a mi papá Julio Riaño por confiar y creer en mí, a mi
hermana Alexandra por acompañarme en cada paso y su apoyo incondicional.
A Claudia Campos, por su apoyo y confianza, por ser esa persona que me guio a lo largo de este
camino, por enseñarme y mostrarme lo que es sentir pasión por lo que se hace. Agradezco a mis
compañeros del Laboratorio de Indicadores de Calidad de Aguas y Lodos, Camilo Venegas y
Andrea Sánchez por toda su colaboración y apoyo que me brindaron, y por permitirme ser parte
4.2.4. Fagos de Bacteroides GA17……………………………………………………………....8
5. Objetivos …………………………………………………………………………………10
5.1. Objetivo general .............................................................................................................................. 10
Tabla 1. Resultados del análisis de Coliformes totales, E. coli, Colifagos Somáticos, CB390 y
Bacteroides GA17 en agua residual doméstica de la planta de tratamiento del municipio de
Guasca………………………………………………………………………………………14
Tabla 2. Resultados del análisis de Coliformes totales, E. coli, Colifagos Somáticos, CB390 y
Bacteroides GA17 en agua residual doméstica de la planta de tratamiento El Salitre…………...15
Tabla 3. Resultados del análisis de Coliformes totales, E. coli, Colifagos Somáticos, CB390 y
Bacteroides GA17 en agua residual doméstica de la planta de tratamiento del municipio de
Cajicá………………………………………………………………………………………..15
Tabla 4. Resultados del análisis e índice de Colifagos Somáticos y Bacteroides GA17, en agua el
agua residual doméstica de la planta de tratamiento del municipio de Guasca, El Salitre y
Cajicá………………………………………………………………………………………..19
Lista de Figuras
Figura 1. Concentración de Coliformes totales y E. coli en el agua residual de las tres plantas de
tratamiento de agua residual doméstica………………………………………………………17
Figura 2. Concentración de Colifagos somáticos, Colifagos CB390 y fagos de Bacteroides GA17
en el agua residual de las tres plantas de tratamiento de agua residual
doméstica…………………………………………………………………………….….…..18
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1. RESUMEN
El crecimiento de la población a nivel mundial ha generado un aumento en la contaminación del
agua, por lo que los residuos domésticos, agrícolas e industriales están generando problemas a
nivel ambiental y de salud pública. En el caso de los residuos de origen doméstico, el mayor
riesgo se evidencia en las altas concentraciones de materia orgánica y microrganismos patógenos.
Determinar la presencia de estos agentes patógenos resulta costoso, y requiere periodos
prolongados de análisis por lo que se propone el uso de indicadores de contaminación fecal
bacteriano como coliformes totales, coliformes fecales, E.coli y Enterococos, y virales como
colifagos somáticos, colifagos F+ RNA específicos, utilizados como indicadores tradicionales de
la contaminación fecal, y fagos de Bacteroides, que permiten discriminar el origen de la
contaminación.
Para conocer la concentración de los indicadores bacterianos y virales, evaluar la concentración
y comportamiento de las cepas de E. coli CB390 y Bacteroides GA17 en nuestras condiciones
ambientales, se propuso evaluar 3 plantas de tratamiento de agua residual doméstica (Guasca, El
Salitre y Cajicá), donde se determinaron las concentraciones de los indicadores bacterianos de
contaminación fecal coliformes totales y E. coli e indicadores virales colifagos somáticos y
colifagos CB390 cómo cepa potencial para reemplazar el uso de colifagos somáticos y fagos
F+ RNA específicos, y fagos de Bacteroides GA17 para diferenciar el origen de la contaminación,
tomando 6 muestras en cada uno de los afluentes de las plantas seleccionadas. Una vez
finalizados los análisis microbiológicos, se encontró que en las aguas residuales domésticas sin
tratamiento la concentración promedio para coliformes totales se encuentra en 3,2 X106
UFC/100mL; E. coli 2,9 X105 UFC/100mL y colifagos somáticos presentó un promedio 6,8
X105 PFP/100mL, en el caso de las cepas E. coli CB390 y Bacteroides GA17, presentaron una
concentración promedio de 6,1 X105 PFP/100mL para los fagos CB390 evidenciando su
potencial para reemplazar el uso la cepa de E. coli WG5 en la detección de Colifagos somáticos
y 1,9 X104 PFP/100mL para los fagos de Bacteroides GA17, confirmando la presencia de esta
cepa en nuestras condiciones ambientales y geográficas. Finalmente, en cuanto al índice entre
Colifagos somáticos y fagos de Bacteroides GA17, se obtuvieron valores entre 1.2 y 2.2 unidades
logarítmicas, permitiendo confirmar el origen de la contaminación humano en las plantas de
tratamiento de agua residual doméstica seleccionadas. El análisis estadístico no mostró
diferencias significativas entre Colifagos somáticos y colifagos CB390, y entre Coliformes totales
y E. coli. (P>0,05 Shapiro-Wilk Test).
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2. INTRODUCCIÓN
El deterioro de la calidad del agua es provocado por tres principales fuentes de contaminación,
industrial que genera en un mayor porcentaje residuos químicos, agrícola que genera residuos
químicos por el uso de fertilizantes y pesticidas, biológicos por la cría, explotación y sacrificio de
animales y finalmente se tienen actividades domésticas o urbanas que generan residuos
biológicos debido a la concentración elevada de materia orgánica y microorganismos de origen
fecal provenientes de este tipo de vertimientos.
Debido a la dificultad de identificar los patógenos presentes en el agua a causa de su alto costo,
tiempo requerido, dificultad en su análisis y el riesgo que presenta para el personal de laboratorio,
se evalúan indicadores de contaminación de origen fecal como coliformes totales, coliformes
fecales y E. coli. Sin embargo, estos indicadores bacterianos no determinan la presencia de virus
en el agua, lo cual es importante ya que las enfermedades entéricas no están únicamente asociadas
con bacterias, sino también con la presencia de virus entéricos. Adicionalmente los virus tienen
mayor resistencia en el ambiente que las bacterias, por lo que se propone el uso de indicadores
virales como los colifagos somáticos y los fagos F+ RNA específicos, que son los
tradicionalmente evaluados debido a que reflejan la presencia de virus patógenos en todo tipo
de agua que presente contaminación fecal. Sin embargo, lo ideal es que se pueda utilizar un solo
indicador que evidencie la presencia tanto de colifagos somáticos y fagos F+ RNA específicos,
ya que estos dos indicadores virales no presentan el mismo comportamiento a nivel ambiental y
en sistemas de tratamiento.
Por esta razón se propuso el uso la cepa CB390 candidata para la determinación y evaluación de
los colifagos somáticos y fagos F+RNA específicos simultáneamente. Los indicadores de
contaminación fecal, han demostrado ser una buena alternativa frente a la dificultad que
representa identificar y cuantificar los patógenos causantes de enfermedades de origen hídrico;
su presencia denota contaminación fecal y constituyen un riesgo de transmisión de enfermedades
para la población. No obstante, los indicadores bacterianos (coliformes totales y E. coli ) y virales
(colifagos somáticos, fagos F+RNA específicos y fagos CB390) propuestos no permiten
discriminar el origen de la contaminación, por lo que se propone el uso de los fagos de
Bacteroides GA17 como uno de los indicadores discriminantes de la contaminación fecal, debido
a que los bacteriófagos que infectan cepas de Bacteroides son herramientas potenciales para el
seguimiento de la fuente u origen de contaminación fecal (animal o humano). Las cepas
hospedantes de Bacteroides varían su capacidad para discriminar entre fagos de diferentes fuentes.
Munesia et al., (2012) propusieron la evaluación del índice entre colifagos somáticos y fagos de
Bacteroides GA17, para determinar el origen de la contaminación fecal, ya que se ha reportado que
en otras zonas geográficas la cepa de Bacteroides GA17 es específica de contaminación de origen
humano, si se presenta un índice entre 1.4 a 2.2 unidades logarítmicas (UL) indica contaminación
de origen humano y si se tiene un índice > 4 se considera contaminación de origen no humano.
Para conocer la concentración de los indicadores bacterianos y virales, evaluar la concentración
y comportamiento de las cepas de E. coli CB390 y Bacteroides GA17 en el afluente de las plantas
de tratamiento de agua residual doméstica, se determinó la concentración de los indicadores
bacterianos de contaminación fecal tradicionalmente utilizados, coliformes totales y E. coli e
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indicadores virales colifagos somáticos, colifagos CB390 como cepa potencial para reemplazar
el uso de colifagos somáticos y fagos F+ RNA específicos, y fagos de Bacteroides GA17 para
diferenciar el origen de la contaminación. Para cumplir con este objetivo se seleccionaron 3
plantas de tratamiento de agua residual doméstica (Guasca, El Salitre y Cajicá) donde se tomaron
6 muestras en los afluentes de las plantas con un total de 18 muestras.
Una vez finalizados los análisis microbiológicos, se encontró que en las aguas residuales
domésticas sin tratamiento las concentraciones promedio para coliformes totales oscilan entre
2,1 X106 UFC/100mL y 3,9 X106 UFC/100mL; E. coli 2,0 X105 UFC/100mL y 3,6 X105
UFC/100mL; colifagos somáticos presentó un promedio entre 4,5 X105 PFP/100mL y 1,1 X106
PFP/100mL. En el caso de las cepas E. coli CB390 y Bacteroides GA17, presentaron una
concentración promedio entre 2,0 X105 PFP/100mL y 1,16 X106 PFP/100mL para los fagos
CB390 evidenciando su potencial para reemplazar el uso la cepa de E. coli WG5 en la detección
de Colifagos somáticos y 1,3 X104 PFP/100mL y 3,2 X104 PFP/100mL para los fagos de
Bacteroides GA17, confirmando la presencia de esta cepa en nuestras condiciones ambientales y
geográficas.
Finalmente, en cuanto al índice entre Colifagos somáticos y fagos de Bacteroides GA17, se
obtuvieron valores entre 1.4 a 2.2 UL, permitiendo confirmar el origen de la contaminación
humano en las plantas de tratamiento de agua residual doméstica seleccionadas. El análisis
estadístico no mostro diferencias significativas entre Colifagos somáticos y colifagos CB390, y
entre Coliformes totales y E. coli. (P>0,05 Shapiro-Wilk Test).
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3. JUSTIFICACIÓN Y PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
La contaminación del agua está asociada con el vertimiento de aguas residuales domésticas e
industriales sin tratar. Las aguas sin tratamiento están siendo vertidas a ríos, zonas costeras y
aguas superficiales, generando un impacto negativo en el ambiente, ya que se alteran los
ecosistemas relacionados con los cuerpos de agua receptores. Adicionalmente en estos vertidos
se encuentra una concentración importante de microorganismos patógenos que pueden
transmitir enfermedades de origen hídrico, impactando el sector de la salud pública. El agua es
una de las fuentes de transmisión de microorganismos causantes de diferentes enfermedades,
entre ellos están Salmonella, Shigella, E. coli, H. pylori, Hepatitis, Rotavirus, Giardia, Cryptosporidium,
entre otros.
La evaluación de la calidad microbiológica del agua se realiza por medio de indicadores de
contaminación fecal como son coliformes totales, coliformes fecales, E. coli, Enterococcos y esporas
de Clostridium sulfito reductor. A pesar de que son los indicadores tradicionalmente utilizados, la
normativa nacional sugiere evaluar como indicadores bacterianos de contaminación Coliformes
totales y E. coli, y estos no permiten confirmar o evidenciar la presencia de patógenos virales;
por esto se propone el uso de indicadores virales de contaminación fecal como colifagos
somáticos y fagos F+ RNA específicos, los cuales evidencian la presencia de virus patógenos
bajo diferentes condiciones ambientales. Poder utilizar una cepa que sea capaz de medir ambos
fagos significaría ahorro de tiempo y costos en su diagnóstico. Por esta razón se propone el uso
de la cepa CB390, ya que esta cepa podría ser a futuro la que se implemente en las normativas
utilizadas para la evaluación de la calidad del agua detectando colifagos somáticos y colifagos F+
RNA específicos simultáneamente. Además de detectar la contaminación de origen fecal, es
necesario discriminar el origen de la contaminación, diferenciando si es animal o humano. Esta
diferenciación es indispensable para definir el riesgo en salud pública por la presencia de
microorganismos provenientes de animales que pueden generar enfermedades zoonóticas, en la
implementación de sistemas adecuados de saneamiento y en las decisiones a nivel normativo y
legal que deben tomar las Autoridades Ambientales. Por esta razón es importante evaluar cepas
como Bacteroides GA17, que ha permitido discriminar el origen de la contaminación en Europa y
ha mostrado resultados positivos en nuestras condiciones ambientales, así como de igual forma
el índice de colifagos somáticos y fagos de Bacteroides GA17.
Los resultados de los indicadores obtenidos en este estudio servirán para complementar el
trabajo de maestría ̈ Selección de los marcadores cultivables y moleculares útiles para diferenciar
el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá ̈ en donde se busca encontrar los indicadores
adecuados, para discriminar el origen de la contaminación fecal a través del uso de marcadores
cultivables y moleculares evaluados en diferentes tipos de agua, este estudio aporta la
concentración de este tipo de indicadores en la en la entrada de sistemas de tratamiento de aguas
residuales domésticas.
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4. MARCO TEÓRICO
El crecimiento acelerado de la población a nivel mundial ha generado un aumento en la demanda
del recurso hídrico y en los niveles de contaminación del mismo. En el caso específico de la
contaminación de origen doméstico, el mayor riesgo se presenta por las altas concentraciones de
materia orgánica y microorganismos patógenos que pueden difundirse a través del agua.
(Campos et al., 2008). Las aguas residuales domésticas son producto del uso del recurso hídrico
en diferentes actividades del hogar, las cuales generan una contaminación debido a los residuos
de tipo físico, químico y biológico. La importancia de su depuración y tratamiento consiste en la
posibilidad de verter estas aguas a cuerpos receptores naturales sin presentar ningún tipo de
peligro ambiental y de salud pública.
Las plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas reciben el agua proveniente de
sistemas de alcantarillado para reducir los contaminantes orgánicos e inorgánicos, en una serie
de tratamientos físicos, químicos y biológicos, acompañados de diferentes etapas y
procedimientos, de acuerdo al funcionamiento y sistema de la planta que tenga establecido.
Dentro de las etapas de tratamientos se encuentra los tratamientos primarios que se encargan de
la remoción de solidos o cribado, remoción de arena, separación de solidos sedimentables y
suspendidos como las grasas. Los tratamientos secundarios pueden ser lodos activados, placas
rotativas, reactores biológicos, y sedimentación secundaria. Finalmente están los tratamientos
terciarios que tienen como objetivo eliminar contaminantes específicos como los
microorganismos a través de sistemas de desinfección.
La contaminación de origen fecal es una de las principales fuentes del deterioro de la calidad del
agua; por esta razón en el agua se pueden encontrar una gran diversidad de microrganismos
patógenos intestinales como bacterias, virus y parásitos (Harwood et al., 2005). Sin embargo, la
identificación de estos agentes patógenos es costosa, requiere de mucho tiempo, y presenta alto
riego para el personal manipulador. Frente a la dificultad de identificar los patógenos
directamente, se propone el uso de indicadores de contaminación de origen fecal.
Durante más de 100 años, la seguridad microbiológica del agua ha sido evaluada principalmente
por la cuantificación de bacterias indicadoras de contaminación fecal, principalmente Escherichia
coli o alternativamente coliformes termotolerantes (fecales) y coliformes totales ya que reflejan la
posible presencia de patógenos entéricos (Edberg et al., 2000). Sin embargo, estos indicadores
no están relacionados con la presencia de virus, generando así una desventaja para este tipo de
indicadores tradicionales que no permiten evidenciar la presencia de virus entéricos patógenos
que están siendo transmitidos por la ingesta de comida o agua contaminados (Baker et al., 2003).
Por esta razón en el caso de indicadores virales, se propone el uso de colifagos somáticos y F+
RNA específicos, también encontrados en aguas residuales domésticas, debido a que en diversos
estudios indican una fuerte correlación entre los bacteriófagos y virus patógenos (Mandilara et
al., 2006). Actualmente se sabe que la cepa CB390 es capaz de recuperar colifagos somáticos y
colifagos F+ RNA específicos simultáneamente, reuniendo las ventajas que presentan estos dos
indicadores virales y recolectando mayor información en un solo indicador; evidenciando así el
potencial uso de la cepa CB390, como reemplazo de estas cepas.
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De acuerdo con Munesia et al., (2012), diferentes estudios muestran que los métodos existentes
para identificar contaminación fecal en diferentes tipos de agua son insuficientes y es necesario
el uso de otros marcadores, por lo que propone el uso combinado de indicadores para
discriminar el origen de la contaminación, haciendo uso de fagos que infecten cepas de Bacteroides
(Bacteroides thetaiotaomicron y Bacteroides fragilis), implementando el índice entre Colifagos somáticos
y Bacteroides thetaiotaomicron GA17, Coliformes fecales y fagos de Bacteroides fragilis RYC2056.
4.1 Indicadores bacterianos de contaminación fecal
4.1.1 Coliformes totales
El grupo de Coliformes totales pertenecen a la familia Enterobacteriaceae, los cuales se definen
como microorganismos anaerobios facultativos, bacilos Gram negativos, no formadores de
esporas, oxidasa negativos y productores de gas por la fermentación de la lactosa. Este grupo
incluye géneros de origen fecal y ambiental como E. coli, Citrobacter, Klebsiella sp., Enterobacter y
Serratia y conforman aproximadamente el 10 % de los microorganismos intestinales del hombre
y otros animales de sangre caliente.
En aguas residuales tratadas, los Coliformes totales son utilizados para la identificación de
contaminación, pero no se consideran buenos indicadores, ya que algunos de sus géneros no son
específicos de contaminación fecal. La concentración de Coliformes totales en aguas residuales
crudas reportada por literatura oscila en un rango de 106-108 UFC por 100 mL y se estima que
E. coli se encuentre en menores concentraciones (Servais et al., 2007).
4.1.2 Escherichia coli
E. coli hace parte del grupo de los Coliformes fecales, es un bacilo corto Gram negativo, móvil
con flagelo perítrico, no esporulado, indol positivo y oxidasa negativa. Es un indicador potencial
de contaminación fecal ya que habita en el intestino del hombre y otros animales de sangre
caliente (McLellan et al., 2001). E. coli es considerado como el indicador más sensible de la
contaminación fecal, debido a que representa más del 95% del grupo de los coliformes en heces
humanas y es especifico de contaminación de origen fecal. Es por esto que se recomienda a E.
coli como indicador de contaminación fecal para la evaluación microbiológica del agua (Elmund
et al., 1999; Yates, 2007; Odonkor y Ampofo, 2013)
Algunos estudios reflejan que las concentraciones para E. coli son menores a 106 UFC/100mL;
es decir, que se encuentra en concentraciones más bajas que Coliformes totales (Servais et al.,
2007). Estas concentraciones son similares en diferentes sitos geográficos y en todos los casos
se deben tener en cuenta factores socio-económicos y condiciones ambientales tales como,
temperatura, zona geográfica y clima (Lucena et al., 2003).
4.2 Indicadores virales de contaminación fecal
Gran parte de la carga de enfermedades transmitidas por el agua en los países desarrollados y sub desarrollados se atribuye a infecciones virales (Harwood et al., 2014). Los virus a diferencia de las bacterias, no se encuentran normalmente en la materia fecal humana, estos por el contrario están presentes en el tracto gastrointestinal únicamente de personas infectadas y son eliminados a través de las heces. Los fagos representan a los virus, mejor que cualquier otro grupo de indicadores una vez fuera del intestino y muestran una resistencia moderada a los tratamientos
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y la persistencia en el medio ambiente (Agulló et al., 2016). Las características de un indicador de contaminación fecal de origen viral incluyen el aislamiento y conteo mediante métodos sencillos, su identificación es de gran importancia debido a que presentan mayor resistencia que las bacterias en el ambiente y en los sistemas de tratamiento, se obtienen resultados más rápidos cuando se analizan colifagos que cuando se trabaja con enterovirus (Pulido et al., 2005).
4.2.1 Colifagos Somáticos
Un gran número de virus patógenos humanos son excretados en las heces y orina; estos desechos
están presentes en aguas residuales domésticas, que al no recibir un tratamiento adecuado pueden
contaminar diferentes cuerpos de agua, representando un riesgo para la salud del hombre, ya que
cuando hay consumo de estas aguas se pueden generar enfermedades de origen entérico
(Borrego et al., 1987).
Los virus que son capaces de infectar y reproducirse en bacterias, se conocen como bacteriófagos, son parásitos intracelulares obligados, actuando como agentes biológicos que parasitan bacterias de forma específica, los cuales están integrados por una molécula de ácido nucleico (ADN o RNA). Para su multiplicación usan maquinaria del huésped también por la capacidad de estos virus de ser más resistentes al proceso de tratamiento del agua que las bacterias indicadoras convencionales (Jofre y Lucena 2006; Martínez et al., 2015) Los bacteriófagos son usados cada vez más como indicadores de la calidad del agua. Hay dos
grupos de colifagos que infectan bacterias, Colifagos somáticos y Fagos F+ RNA específicos,
los cuales son considerados como indicadores virales de contaminación fecal. La diferencia entre
estos dos grupos es la vía de infección y la bacteria huésped (Guzmán et al., 2008).
Los colifagos somáticos inician la infección uniéndose a las células de E. coli mediante la
membrana celular. Los colifagos somáticos incluyen gran variedad de fagos pertenecientes a las
familias de; Myoviridae, Siphoviridae, Podoviridae y Microviridae (Jofre y Lucena 2006). Son los
indicadores virales que se encuentran en mayor concentración en aguas, con valores entre 104 y
107 UFP/100mL (Yahya et al., 2015).
4.2.2 Fagos RNA específicos
Los colifagos F específicos infectan las células de Salmonella typhimurium y E. coli por medio del
pili sexual el cual ha sido codificado por la detección del plásmido F en la cepa de E. coli K12
(Guzmán et al., 2008). Los colifagos de ARN F+ específicos pertenecen a la familia Leviviridae
(Jofre y Lucena 2006). La concentración en la que estos fagos se encuentran en las aguas
residuales es una unidad Log10 por debajo de las concentraciones de los colifagos somáticos
(Yahya et al., 2015).
Los colifagos somáticos y F+ RNA específicos han sido usados en estudios científicos por
muchos años como indicadores de contaminación fecal y viral en diferentes tipos de agua, debido
a la similitud estructural que tienen con los virus entéricos patógenos (Hot et al., 2003; Muniesa
et al., 2004).
A su vez los ARN F+ específicos se han sugerido como marcadores útiles para el seguimiento
del origen de la contaminación fecal o Microbial Source Tracking (MST) por sus siglas en inglés,
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ya que habitualmente se encuentran relacionados con la flora microbiana intestinal de los
humanos o animales, causantes de la contaminación fecal (Yahya et al., 2015).
4.2.3 Colifagos CB390
Tradicionalmente los colifagos somáticos y los colifagos F+ RNA específicos han sido utilizados
como indicadores de contaminación fecal; sin embargo, hacer las dos técnicas por separado
resulta más costoso, por lo que se ha propuesto el uso de una cepa capaz de detectar estos dos
tipos de fagos.
La cepa de E. coli WG5, recomendada por la ISO (Organización Internacional de Normalización)
para la detección de colifagos somáticos, fue transformada para detectar colifagos específicos y
somáticos simultáneamente. El plásmido Famp fue usado para la trasformación de la cepa de E.
coli WG5 y la trasformación de las células fue dada por electroporación; las células transformadas
fueron seleccionadas gracias a la resistencia a la ampicilina y luego fueron probadas para la
detección de colifagos somáticos y colifagos específicos usando los fagos de referencia 174 y
MS2 (Guzmán et al., 2008). Por esta razón la evaluación de esta cepa es de gran importancia, ya
que es candidata para la determinación y evaluación de los colifagos somáticos y colifagos F
específicos simultáneamente, reduciendo costos y tiempo en cuanto a la cuantificación de
indicadores virales de contaminación fecal.
4.2.4 Fagos de Bacteroides GA17
Durante décadas, el grupo de coliformes totales y E. coli se han utilizado como indicadores de la
calidad del agua con respecto a la presencia de patógenos, sin embargo, estos indicadores
bacterianos tradicionales, parecen tener un valor predictivo limitado para la detección de virus
patógenos, debido a que se reconoce que los virus entéricos son más resistentes a la inactivación
natural y a los sistemas de tratamiento, que los indicadores bacterianos, por lo que se propone
el uso de indicadores virales como lo son los Colifagos somáticos, fagos F+ RNA específicos y
fagos de Bacteroides. Este último grupo se ha sugerido como uno de los microorganismos
indicadores de contaminación fecal, debido a que predominan en las heces humanas
representando el 30% de la microbiota total, que se encuentra entre 108 -1010 UFC/g de heces.
Estos microorganismos presentan una baja supervivencia en el ambiente ya que son
microorganismos anaerobios estrictos, presentan una morfología típica del grupo Siphoviridae;
cabeza en forma de icosaedro y una cola flexible; adicionalmente son virus que son capaces de
infectar la cepa huésped penetrando la pared celular siendo este el primer paso en el proceso de
infección.
Independientemente de cómo los fagos infectan cepas seleccionadas de Bacteroides sp., los
bacteriófagos cumplen algunos de los requisitos como; rastreadores de origen, incluyendo
especificidad, abundancia, métodos de detección, continuidad - discontinuidad geográfica,
resistencia a los factores estresantes naturales y antropogénicos y resultados adecuados para el
análisis numérico (Jofre et al., 2014).
Los métodos de seguimiento del origen de la contaminación están diseñados para discriminar el
origen de la contaminación fecal en un cuerpo de agua determinado, los bacteriófagos que
infectan Bacteroides son herramientas potenciales para el seguimiento del origen de la
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contaminación, debido a que diversos estudios muestran que los métodos existentes para
identificar contaminación fecal en diferentes tipos de agua son insuficientes y es necesario el uso
de otros marcadores, los cuales pueden variar dependiendo de su situación geográfica.
Se ha informado que algunas cepas, tales como Bacteroides fragilis RYC2056 puede ser utilizado
para detectar bacteriófagos en residuos de seres humanos y no humanos, mientras que otras
cepas como Bacteroides thetaiotaomicron GA17 sólo indican fagos en residuos de origen humano.
Se encuentran diferentes especies de Bacteroides que son específicos de humanos, en las que se
encuentran; B. vulgatus, B. distasonis y B. thetaiotaomicron, en donde esta última se deja infectar por
el fago Bacteroides GA17 (Tartera et al., 1992; Bernhard et al., 2000; Mandilara et al., 2005; Payán
et al., 2005; Munesia et al., 2012).
La cepa de Bacteroides thetaiotaomicron GA17, fue aislada y probada por Payan et al., (2005) en
Europa, evidenciando su especificidad y potencial para discriminar el origen de la contaminación.
Esta cepa se ha evaluado en otras zonas geográficas, como marcador potencial de la
contaminación humana, confirmando su utilidad en el sur de Europa, Túnez y Colombia. (Payan
et al., 2005; Jofre et al., 2014; Yahya et al., 2015; Venegas et al., 2015)
De acuerdo con Munesia et al., (2012), diferentes estudios muestran que los métodos existentes
para identificar contaminación fecal en diferentes tipos de agua son insuficientes y es necesario
el uso de estos marcadores, por lo que propone el uso combinado de indicadores para
discriminar el origen de la contaminación, implementando el índice entre colifagos somáticos y
Bacteroides thetaiotaomicron GA17. Un rango entre 1.4 a 2.2, es el índice de contaminación de origen
fecal humano, y un índice > 4 para determinar la contaminación de origen no humano. La
aplicación de este índice permitira determinar sí las muestras de agua residual doméstica tienen
una contaminación específica de origen humano o no humano.
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5. OBJETIVOS
5.1 Objetivo general
Evaluar Coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos, colifagos CB390 y fagos de Bacteroides
GA17 como indicadores microbiológicos de contaminación en aguas residuales domésticas
provenientes de los afluentes de plantas de tratamiento.
5.2 Objetivos específicos
- Evaluar la concentración de Coliformes totales y E. coli como indicadores de
contaminación bacteriana en afluentes de plantas de tratamiento de aguas residuales
domésticas
- Evaluar la concentración de los colifagos somáticos y colifagos CB390 como indicadores
de contaminación de origen viral en afluentes de las plantas de tratamiento de aguas
residuales domésticas.
- Evaluar la concentración y el comportamiento de los fagos de Bacteroides GA17 en
afluentes de las plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas, como
discriminador del origen de la contaminación.
- Calcular el índice de colifagos somáticos y fagos de Bacteroides GA17 como herramienta
para discriminar el origen de la contaminación.
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6. MATERIALES Y MÉTODOS
Para evaluar los indicadores bacterianos y virales de contaminación fecal, fue necesario
seleccionar una serie de plantas de tratamiento de agua residual doméstica (PTARD) donde se
asume que dichas plantas reciben únicamente residuos de origen humano. Las plantas
seleccionadas como zona de estudio fueron, PTARD del municipio de Guasca, PTARD El
Salitre y PTARD del municipio de Cajicá.
6.1 Estaciones de muestreo
6.1.1 Planta de tratamiento de agua residual doméstica del municipio de Guasca
Localizada en el municipio de Guasca, a 45 kilómetros al nororiente de la ciudad de Bogotá. Las
muestras se tomaron del afluente de la planta de tratamiento. Cuenta con pretratamiento (rejillas
de gruesos y finos) y adición de cloruro de aluminio para terminar en tanque de sedimentación.
Esta planta trata aguas residuales domésticas del municipio el cual no tiene planta de sacrificio
de animales.
6.1.2 Planta de tratamiento de agua residual doméstica El Salitre
Localizada al occidente de la ciudad de Bogotá. Las muestras se tomaron del río Salitre, a partir
del cual se toma el agua para su tratamiento. Este río nace en los cerros orientales de la ciudad
de Bogotá y la recorre de oriente a occidente recibiendo a su paso aguas residuales domésticas.
6.1.3 Planta de tratamiento de agua residual doméstica del municipio de Cajicá
Localizada en el municipio de Cajicá, a 17 kilómetros al norte de la ciudad de Bogotá. El
tratamiento consiste en pretratamiento con rejillas de gruesos y finos, paso por desarenador y
trampa de grasas y finalmente paso a laguna anaerobia, laguna facultativa y laguna aerobia. Las
muestras se tomaron después de la trampa de grasas. Esta planta trata aguas residuales del
municipio, el cual no cuenta con planta de sacrificio de animales.
6.2 Muestreo
De cada planta de tratamiento de aguas residuales domésticas se recolectaron 6 muestras de agua
(250 mL) para un total de 18 muestras. En la planta de tratamiento del municipio de Guasca y
El Salitre de Bogotá, se tomaron las seis muestras en diferentes días; en la planta de tratamiento
del municipio de Cajicá se tomaron las muestras en tres días, tomando cada día dos muestras
con una hora de diferencia entre estas. El muestreo se realizó durante dos meses iniciando en
julio y finalizando en agosto de 2016.
Todas las muestras se recolectaron en un frasco de plástico polipropileno de 250mL estéril,
debidamente marcado con: el lugar de la zona de muestreo, fecha, hora y código de la muestra.
Luego de recolectar la muestra, esta se preservó en condiciones de refrigeración (4-8 °C), según
el protocolo Standard Methods for Examination of Water and Wastewater 9006 A- 3 (APHA,
2012). Adicionalmente cada una de las muestras tuvo una cadena de custodia, y se procesaron
en el Laboratorio de Indicadores de Calidad de Aguas y Lodos de la Pontificia Universidad
Javeriana dentro de las 24 horas de la toma de la muestra, de acuerdo con el protocolo ISO 9308-
20
1 (2014) para Coliformes totales y E. coli, colifagos somáticos y colifagos CB390 el protocolo
ISO 10705-2 (2000) y para Bacteroides GA17 el protocolo ISO 10705-4.
6.3 Análisis de indicadores de contaminación fecal en agua residual
6.3.1 Determinación de Coliformes totales y E. coli. (ISO 9308-1 - 2014)
Se realizaron diluciones seriadas a partir de la muestra homogenizada (1:10) hasta 10 -4 en peptona
salina estéril. Seguidamente se realizó el montaje de la técnica de filtración por membrana. Esta
técnica consiste en el uso de un equipo de filtración que implementa una membrana de nitrato
de celulosa con un tamaño de poro de 0.45 µm, con el objetivo de retener las bacterias presentes
en la muestra. Se filtró 1mL de cada una de las diluciones, adicionando 20 mL de peptona salina
en cada campana de filtración. Al finalizar cada filtración, la membrana se sembró en agar
Chromocult (Merck, Darmstadt, Alemania) incubando las cajas a 37°C por 21 h +/- 2h.
La identificación de Coliformes y E. coli, es posible por la presencia de los dos sustratos
cromógenos; Salmon-Gal y X-Glucurónido presentes en el medio Chromocult. En el caso de
Coliformes se observaron colonias de color rojo-fucsia por la presencia de la enzima -D
Galactosidasa y para el caso de E. coli se evidenciaron colonias de color morado-violeta por la
presencia de las enzimas -D Glucuronidasa y -D Galactosidasa. Cada una de las muestras
analizadas contó con cepas control; para el control positivo se utilizó la cepa de E. coli ATCC
25922 y para el control negativo se trabajó con la cepa de Salmonella ATCC 13076 que se
sembraron en el medio de cultivo Chromocult a 37°C por 21 h +/- 2h. El reporte para
Coliformes totales y E. coli está dado por Unidades Formadoras de Colonia/100mL
(UFC/100mL).
6.3.2 Determinación de Colifagos somáticos (ISO 10705-2 - 2000).
A partir de la muestra previamente homogenizada se filtraron 10 mL, utilizando filtros con un
tamaño de poro de 0.22 µm y partir de la muestra filtrada se realizaron diluciones seriadas (1:10)
hasta 10-3 en peptona salina estéril. De cada dilución de la muestra se tomó 1 mL y se transfirió
a un tubo estéril. Seguidamente a cada tubo se le adicionó 1 mL de la bacteria E. coli WG5, en
fase exponencial (108células/mL) con una densidad óptica entre 0.3 nm - 0.5 nm y 2.5 mL del
medio Agar Scholtens Modificado semi-solido (MSAss). Posteriormente se homogenizó en
vortex y se vertió en la caja de Petri que contiene medio Agar Scholtens Modificado (MSA),
distribuyéndolo homogéneamente. Finalmente se llevó a incubar a 37°C por 18h +/- 2h. La
identificación de los fagos se evidenció por la formación de placas o calvas de lisis en cada una
de las cajas de Petri. La formación de placas o calvas es el resultado de una infección dada por
una única partícula infecciosa. Estas placas o calvas de lisis se reportaron como Partículas
Formadoras de Placa/100 mL (PFP/100mL). Cada una de las muestras contó con un control
positivo utilizando como fago de referencia 174 ATCC 13706 B-1 y como control negativo la
cepa E. coli WG5 ATCC 700078.
21
6.3.3 Determinación de Colifagos CB390 (ISO 10705-2 - 2000).
A partir de la muestra previamente homogenizada se filtraron 10 mL, utilizando filtros con un
tamaño de poro de 0.22 µm. Se realizaron diluciones seriadas (1:10) hasta 10-3 en peptona salina
estéril. De cada dilución de la muestra se tomó 1 mL y se transfirió a un tubo estéril.
Seguidamente a cada tubo se le adicionó 1 mL de la bacteria E. coli CB390, en fase exponencial
(108células/mL) con una densidad óptica entre 0.3 nm - 0.5 nm y 2.5 mL del medio Triptona-
Glucosa-Extracto de Levadura semi-solido (TYGAss). Posteriormente se homogenizó en vortex
y se vertió en la caja de Petri que contiene medio Triptona-Glucosa-Extracto de Levadura
(TYGA), distribuyéndolo homogéneamente. Finalmente se llevó a incubar a 37°C por 18h +/-
2h. La identificación de los fagos se evidenció por la formación de placas o calvas de lisis en cada
una de las cajas de Petri, donde la formación de placas o calvas es el resultado de una infección
dada por una única partícula infecciosa. Estas placas o calvas de lisis se reportaron como
Partículas Formadoras de Placa/100 mL (PFP/100mL). Cada una de las muestras contó con dos
controles positivos utilizando como fagos de referencia MS2 ATCC 597 B-1 y 174 ATCC
13706 B-1 y como control negativo la cepa CB390 ATCC 700078 modificada por Guzmán et al
(2008).
6.3.4 Determinación de fagos Bacteroides GA17 (ISO 10705-4).
A partir de la muestra previamente homogenizada se filtraron 10 mL, utilizando una membrana
con un tamaño de poro de 0.22 µm. Se realizaron diluciones seriadas (1:10) hasta 10-2 en peptona
salina estéril. De cada dilución de la muestra se tomó 1 mL y se adiciono a un tubo estéril,
seguidamente a cada tubo se adicionará 1 mL del inóculo de bacteroides, en fase exponencial
(108células/mL) con una densidad óptica entre 0.3 nm - 0.5 nm y 4 mL del medio Agar
semisólido para la recuperación de fagos de bacteroides (BPRMAss); posteriormente se
homogenizó en vortex y se vertió en la caja de Petri que contiene medio BPRMA,
distribuyéndolo homogéneamente. Finalmente se llevó a una incubar a 37°C por 22h +/- 2h, en
condiciones de anaerobiosis. La identificación de los fagos se evidenció por la formación de
placas o calvas de lisis en cada una de las cajas de Petri, donde la formación de placas o calvas es
el resultado de una infección dada por una única partícula infecciosa. Estas placas o calvas de
lisis se reportaron como Partículas Formadoras de Placa/100 mL (PFP/100mL). Cada una de
las muestras contó con un control positivo utilizando como fago de referencia Bacteroides GA17
y como control negativo la cepa Bacteorides theaiotaomicron GA17.
22
7. RESULTADOS Y DISCUSIÓN
7.1 Indicadores de contaminación bacteriana y viral
A continuación, se presentan los resultados de los indicadores bacterianos (Coliformes totales y
E. coli) e indicadores virales (colifagos somáticos, colifagos CB390) e indicadores discriminantes
(fagos de Bacteroides GA17), de contaminación fecal en agua residual doméstica de las tres plantas
seleccionadas (Guasca, Cajicá y El Salitre), en las Tablas 1, 2 y 3.
7.1.1 Indicadores de contaminación fecal en la Planta de Tratamiento de Agua
Residual Doméstica del municipio de Guasca
Tabla 1. Resultados del análisis de Coliformes totales, E. coli, Colifagos Somáticos, CB390 y
Bacteroides GA17 en agua residual doméstica de la planta de tratamiento del municipio de Guasca.
La media geométrica para Coliformes totales se encuentra en 2,1 X106 UFC/100 mL; y para E.
coli de 3,0 X105 UFC/100 mL. En cuanto a los colifagos somáticos, colifagos CB390 y fagos de
Bacteroides GA17 se tienen medias geométricas de 4,5 X105 PFP/100 mL, 2,0 X105 PFP/100 ml,
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ISO/International Organization For Standardization 10705.2. Water quality-Detection and Enumeration of Bacteriophages-Part 2: Enumeration of Somatic Bacteriophages.2000
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