This month's cover of the El·lipse, the Barcelona Biomedical Research Park (PRBB) magazine, is dedicated to the 10th anniversary of the park, celebrated on May 5. The cover also invites everyone to participate in PRBB Biomedical Wikimarathon also framed in the activities of the anniversary, which will take place on 9 June. Inside the newspaper, you will find an article about the work by Lucas Carey's research group at the CEXS-UPF, and an interview with Leroy Hood, president and co-founder of the Institute for Systems Biology. In the Science Uncovered section, Toni Hermoso (CRG) tells us about "Open Science". The news this month include a genetic test to detect resistance to colon cancer treatments, the largest study on the global trends of diabetes or a key mechanism in the origin of animals. Enjoy!
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
PARC RECERCABIOMÈDICA BARCELONA
CONNECTEM CIÈNCIA I DIVERSITAT EN UN ESPAI CREATIU ÚNIC Maig de 2016 NÚM. 94 www.prbb.org GRATUÏT
DESTACAT / HIGHLIGHT
Editorial
I was against it; I was a fool
I’ve been part of the PRBB virtually since its inception. Actually, rather, the PRBB
has been part of me all these years, and the people at the PRBB have impregnated my scientific and management background. Recently, I assumed the management of universities and research in this country and, inevitably, the PRBB is part of my baggage. The PRBB. This small scientific “town” makes me think of the article “Science and the City” that was published in Nature in 2010. The lessons learned from the large global science hubs and collected in that spe cial article find shape and content at the PRBB: “funding, freedom and lifestyle” to attract the best talent from around the world. As a scientist, I feel compelled to revise my opinions and acknowledge my mistakes. When I go back to the PRBB, with my baggage a little fuller, I will have learned that everything I doubted about the park at the beginning — its massive structure and even its architecture — are inseparable from the success of this ellipse open to the ocean, built for the glory of science. Thanks for helping me correct my mistakes
Arcadi Navarro
Hi estava en contra; era ruc
He format part del PRBB pràcticament des del seu inici. No, millor dit,
el PRBB ha estat part de mi tots aquests anys, i la gent del PRBB ha impregnat el meu bagatge científic i gestor. Recentment, he assumit la gestió de les universitats i la recerca d’aquest país, i duc, indefectiblement, el PRBB a la motxilla. Aquesta petita “ciutat científica” em fa pensar en l’espe cial «Science and the City» que va publicar Nature el 2010. Les lliçons apreses dels grans pols de ciència mundials i recollides en aquest especial prenen forma i contingut al PRBB: «finançament, llibertat i estil de vida» per atraure el millor talent d’arreu. Com a científic, em sento obligat a revisar les meves opinions i reconèixer els meus errors. Quan de nou torni al PRBB, amb la meva motxilla un xic més plena, hauré après que tot allò que al seu moment em feia dubtar del PRBB —l’estructura massiva del parc i, fins i tot, la seva arquitectura— és indestriable de l’èxit d’aquesta el·lipse oberta a l’oceà, construïda per a l’esplendor de la ciència. Gràcies per ajudarme a corregir errors.
Arcadi Navarro
Viquimarató biomèdica
En el marc del desè aniversari del PRBB, el 9 de juny tindrà lloc la Viquimarató biomèdica PRBB 2016, organitzada pel PRBB i Amical Wikimedia. L’objectiu: actualitzar, ampliar i crear articles sobre la biomedicina a les viquipèdies en diferents idiomes. Es vol aprofitar la diversitat de nacionalitats presents al parc —més de 50—, així com l’ampli ventall d’expertesa científica dels seus investigadors, que fan recerca en aspectes que van des de l’àmbit molecular fins al poblacional.
La Viquimarató és oberta als investigadors del parc i als d’altres centres de recerca de Barcelona i rodalies, que poden inscriure’s a http://bit.ly/wikimara toPRBB. Tindrà lloc de 9 h a 15 h i s’hi serviran cafè i entrepans.
Biomedical Wikimarató
As part of the PRBB’s tenth anniversary, on June 9 the PRBB 2016 Biomedical Wikimarathon (editathon) will take place, organised by Amical Wikimedia and the PRBB. The aim: to update, expand and create articles about
Elvira López
El 5 de maig el PRBB va celebrar el seu 10è aniversari. En un emotiu acte
amb la presència de nombroses personalitats de la política i la ciència, Ian Mattaj, director del Laboratori Europeu de Biologia Molecular (EMBL, per les seves sigles en anglès), va destacar que el PRBB s’ha situat al capdavant de la recerca biomèdica europea, captant talent internacional i facilitant la suma de coneixements i la transversalitat de la recerca. «El nou Francis Crick Institute, que s’ina u gurarà enguany a Londres, és la resposta britànica al PRBB», va bromejar el científic escocès. Jordi Camí, director general del Parc, va realitzar una retros
pectiva de la darrera dècada al PRBB, «el millor lloc per fer recerca biomèdica de l’Estat i possiblement del sud d’Europa». Arcadi Navarro, secretari d’Universitats i Recerca de la Generalitat de Catalunya, va destacar el paper de Camí en la creació d’aquest gran projecte. Jaume Casals, rector de la Universitat Pompeu Fabra, i el director de Salut de l’Ajuntament de Barcelona, Davide Malmusi, van cloure l’acte a l’auditori del PRBB davant de 250 persones. A continuació, va tenir lloc la festa d’aniversari a la plaça interior del PRBB. L’orquestra i la coral del parc van amenitzar una jornada emotiva per a tots els implicats, on no van faltar el pastís i el cava per celebrar aquests 10 anys d’èxits.
Happy birthday, PRBB!
On Thursday May 5, the PRBB celebrated its 10th anniversary. In a mo
ving ceremony attended by numerous figures from the political and scien tific arenas, Ian Mattaj, director of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL), stressed that the PRBB has been at the forefront of biomedical research in Europe, attracting international talent and increasing the sum of knowledge facilitated by interdisciplinary research. “The new Francis Crick Institute which will open this year in London is the British answer to the PRBB”, joked the Scottish scientist. Jordi Camí, general director of the park looked back over the past decade at the PRBB
“the best place for biomedical re search in Spain, and possibly in southern Europe”. Arcadi Navarro, Secretary of Universities and Research from the Catalan government, highlighted the role of Camí in the creation of this great project. Jaume Casals, director of the University Pompeu Fabra, and Davide Malmusi, Director of Health at Barcelona City Council, closed the event held in the PRBB Auditorium with 250 attendees. Then it was time for the birthday party in the PRBB’s inner square. The park’s orchestra and choir entertained everyone in an emotional afternoon for all involved, topped off by cake and champagne to celebrate 10 years of successes ■
PRBB: per molts anys!
biomedicine in the Wikipedias in different languages, taking advantage of the diversity of nationalities present in the park (more than 50), as well as the wide ranging scientific expertise of the researchers at the centres, who work in areas from the molecular up to population levels. This first wikimarathon is open to researchers at the PRBB centres and other centres around Barcelona and will take place from 9am to 3pm. Coffee and sandwiches will be served. To register and for more information: http://bit.ly/wikimaratoPRBB ■
CELEBRACIÓ DELS 10 ANYS DEL PRBB / CELEBRATION OF 10 YEARS OF PRBB
Residents del PRBB celebrant els 10 anys amb la tassa commemorativa / PRBB residents celebrating 10 years with the commemorative mug
El mateix ADN, el mateix ambient i diferent comportament
Detectant resistència al tractament de càncer de còlon
LUCAS CAREY – SINGLE CELL BEHAVIOR LAB, CEXS-UPF
Maruxa Martínez-Campos
Nascut a Nova York, Lucas Carey va arribar al PRBB l’octubre de 2013 per crear el seu primer grup
independent al CEXSUPF. Aquest biòleg reconvertit en expert en informàtica tracta d’entendre per què organismes que tenen el mateix ADN i comparteixen el mateix entorn poden comportarse de manera diferent. Quan fem servir antifúngics o antibiòtics a concentracions baixes no aconseguim matar tots els microbis; una petita fracció sempre sobreviu, i són genèticament idèntics als que han mort. Per què aquesta diferència? Una raó sembla que és la segregació i l’estat dels orgànuls de la cèl·lula. Quan una cèl·lula es divideix, el seu ADN es segrega entre les dues cèl·lules filles d’una manera ben controlada. Però amb orgànuls com ara els mitocondris, amb 10 o 20 d’ells surant pel citoplasma, la divisió entre les dues cèl·lules filles pot no ser igualitària. Les cèl·lules que reben menys mitocondris tendeixen a créixer més lentament —els mitocondris són, al capdavall, els productors d’energia de la cèl·lula. Però, de fet, això podria ser bo per a la cèl·lula. «Les cèllules de creixement lent tendeixen a ser resistents als antibiòtics, ja que aquests afecten la divisió cel·lular; si les cèl·lules es divideixen menys, seran menys atacades», explica Carey. El grup està utilitzant microorganismes, sobretot el llevat, per als seus estudis. La raó: es poden obtenir 100 milions d’individus amb el mateix genotip i en el mateix entorn.
Variabilitat i la immunodepressió
En col·laboració amb Andreas Meyerhans, també de la UPF, Carey està estudiant la variabilitat de les cèl·lules T en persones immunodeprimides. Quan pacients VIH+, que tenen poques cèl·lules T primàries, són tractats amb teràpia antiviral, el nombre de cèl·lules T augmenta, però aquestes cèl·lules T són menys diverses que en un sistema immunològic «normal». «La població de cèl·lules T és molt variada, cadascuna respon a un antigen diferent. El fet que una “repoblació” de les cèl·lules T després de les teràpies immunosupressores sempre ve amb una diversitat menor podria significar que algunes de les cèl·lules T que han sobreviscut a la immunosupressió proliferen molt més ràpid que d’altres», diu l’investigador. «Estem tractant
d’entendre per què això és així, per intentar millorar la distribució de la proliferació de cèl·lules T en els pacients amb el VIH o en persones que han rebut un trasplantament». Tornant al llevat, en col·laboració amb Ben Lehner del CRG, l’equip de Carey utilitza la microscòpia time-lapse (en viu) i la citometria de flux per mesurar el nombre de divisions que cada cèl·lula ha patit. «Hem demostrat que les cèl·lules amb menys mitocondris tendeixen a créixer més lentament. Ara volem saber quin és l’efecte d’aquesta desacceleració en el llevat, en les cèl·lules T i en fongs patògens», explica l’investigador.
Projectes paral·lels
L’investigador nordamericà està collaborant amb d’altres joves científics al PRBB, com Mar Albà de l’IMIM, amb la qual comparteix un estudiant de doctorat que investiga la formació «de novo» de gens en espècies de llevat. Altres projectes inclouen l’estudi de l’epístasi amb Fyodor Kondrashov, al CRG, o la col·laboració amb Gian Tartaglia (CRG) per estudiar les xarxes de retroalimentació de les proteïnes d’unió d’ARN. «Hem vist que la retroalimentació negativa (quan una proteïna reprimeix la seva pròpia expressió) disminueix la variabilitat en la població, mentre que la retroalimentació positiva l’augmenta. Amb una fórmula matemàtica podem utilitzar la diversitat en la població per entendre la forma com funcionen les xarxes de regulació», conclou Carey.
Rosa Manaut
Oncòlegs de l’Hospital del Mar i de l’IMIM han ampliat i millorat el test genètic que permet detectar
la presència de mutacions que provoquen resistència a un grup de fàrmacs freqüentment usats en càncer colorectal, els fàrmacs antiEGFR. Aquest test, fruit d’una recerca publicada el 2012 pels doctors
Clara Montagut i Joan Albanell i incorporat a la pràctica clínica el 2014 mitjançant un acord amb l’empresa Biocartis, ara s’amplia a noves mutacions, la qual cosa permet una major personalització dels tractaments contra el càncer de còlon. Els investigadors estan treballant en la versió en biòpsia líquida d’aquest assaig, la qual permetrà determinar les mutacions en una anàlisis de sang i saber en temps real com s’està comportant el tumor.
New genetic test for detecting resistance to colon cancer treatments
Oncologists from Hospital del Mar and the IMIM have expanded and improved a genetic test for detec
ting the presence of mutations that cause resistance to a drug group frequently used in colorectal cancer, the antiEGFR drugs. This test was the result of research published in 2012 led by the doctors Clara Montagut and
Joan Albanell, and was incorporated into clinical practice in 2014, through an agreement with the company Biocartis. The researchers have now expanded it to include new mutations, enabling further personalisation of colon cancer treatments. They are working towards a liquid biopsy version of this trial, which will allow mutation determination through the analysis of a patient’s blood sample, and will give a realtime view of how the tumour is behaving ■
“Why organisms with the same DNA and in the same environment can exhibit different behaviours?”
Born in New York, Lucas Carey arrived at the PRBB in Barcelona in October 2013 to create his first inde
pendent group. This “biologist turned computer scientist” is trying to understand why organisms with the same DNA and sharing the same environment behave differently. When we use antifungals or antibiotics at low concentrations not all cells are killed; a fraction always survives, and these are genetically identical to those that died. What causes this difference? One reason seems to be the segregation and state of the organelles in the cell. When a cell divides, the DNA is segregated into two daughter cells in a wellcontrolled manner. But with organelles such as mitochondria, with 10 or 20 of them floating around in the cytoplasm, the splitting between the two daughter cells may not be even. The cells that receive less mitochondria tend to grow more slowly — mitochondria are, after all, the cell’s energy producers. But that might actually be good for the cell. “Slowgrowing cells tend to be resistant to antibiotics, because these drugs affect cell division; if cells divide less they will be attacked less”, says the head of the laboratory. The group uses microorganisms, mostly yeast, for their studies. The reason: you can get 100 million individuals
with the same genotype and in the same environment.
Variability and immunodepression
In collaboration with Andreas Meyerhans, also at the UPF, Carey is looking at the variability of T cells in immunosuppressed people. When HIV+ patients, who have few primary T cells, are treated with antiviral therapy, their number of T cells increases; but these are less diverse than in a “normal” immune system. The population of T cells is very varied, each responds to a different antigen. The fact that a ‘repopulation’ of T cells after immunosuppressive therapies always comes with less diversity might mean that some of the T cells that had survived the immunosuppression proliferate much quicker than others. “We are trying to understand why that is the case, so we can improve the distribution of the T cell proliferation in HIVtreated patients, or people that have received an organ transplant”, says Carey. Going back to yeast, in collaboration with Ben Lehner at the CRG, Carey’s team uses time lapse microscopy and flow cytometry to track the number of divisions each cell has undergone. “We have shown that cells with fewer mitochondria tend to grow slower. Now we want to know what the effect of this slowing down is: in yeast, in T cells, and in pathogenic fungi”, explains the researcher.
Side projects
The US researcher is collaborating with other young scientists at the PRBB, like Mar Albà at the IMIM, with whom he cosupervises a PhD student studying the de novo formation of genes in yeast species. Other projects include looking at epistasis with Fyodor Kondrashov, at the CRG, creating libraries with lots of mutations in the same gene and then finding those that are incompatible within the same gene. And he collaborates with Gian Tartaglia (CRG) to study feedback regulatory networks of RNAbinding proteins. “We developed a mathematical way to measure how often RNA binding proteins regulate themselves and how they do it. We know negative feedback (when a protein represses its own expression) decreases the variability in the population, while positive feedback increases it. We can use this populational diversity to understand the way regulatory networks work”, concludes Carey ■
The members of the group: 1 Russian PhD student, 3 Catalan undergrad students, 1 technician from the Canary Islands and 2 other members (1 PhD and a technician) shared with other labs
7 febrer de 2011 | www.prbb.org 3 maig de 2016 | www.prbb.org Ciència
NOTÍCIES CIENTÍFIQUES / SCIENTIFIC NEWS
El major estudi sobre la tendència mundial de la diabetisRosa Manaut
Un estudi publicat a The Lancet amb participació d’investigadors de l’IMIM ha comparat
els nivells de diabetis d’homes i dones entre els anys 1980 i 2014. Els prop de 500 investigadors que hi han participat han estudiat les dades de 4,4 milions d’adults i han creat mapes interactius que mostren les dades per a cada país. Segons l’estudi, en els últims 35 anys la freqüència de diabetis s’ha doblat a nivell global entre els homes, i ha passat d’un 4,3% el 1980 al 9% el 2014. Pel que fa a les dones, d’un 5% s’ha passat a un 7,9%. Aquest increment, juntament amb l’en
velliment de la població, es tradueix en 422 milions de persones a escala mundial amb diabetis l’any 2014, xifra que quasi quadruplica la de 1980. El treball ha calculat també el cost anual d’aquesta malaltia, uns 825 milions de dòlars per any, comptabilitzant el tractament, la gestió i les complicacions. «La malaltia ha arribat a nivells inassumibles pels sistemes de salut d’alguns països. Cal trobar maneres eficaces per fer front a l’epidèmia mundial d’obesitat que s’ha disparat en els últims anys i que és clau per lluitar contra aquesta malaltia», diuen els autors. Segons els investigadors, si les tendències actuals continuen, més de 700 milions d’adults a tot el món es veuran afectats amb diabetis el 2025.
The largest study on global diabetes trends
Astudy published in The Lancet with the participation of IMIM researchers compares the evolu
tion of diabetes levels in men and women between 1980 and 2014. About 500 researchers studied data from 4.4 million adults and created interactive maps showing the data for each country. According to the study, over the past 35 years, across the globe the frequency of diabetes has doubled in men, rising from 4.3% in 1980 to 9% in 2014, while in women, it has risen from 5% to 7.9%. This increase, along with the ageing of the po
pulation, means 422 million people had diabetes worldwide in 2014, nearly quadrupling the 1980 figure. The study also calculated the cost of this disease, which totals 825 million dollars annually when you take into account disease treat ment, management and complications. “The disease has reached unacceptable levels for the health systems of some countries. We need to find effective ways of addressing the global obesity epidemic that has spread rapidly in recent years and is key in the fight against this disease”, say the authors. According to researchers, if the current trends continue, more than 700 million adults worldwide will suffer diabetes by 2025 ■
Primer estudi genòmic sobre el benestar subjectiuRaül Torán
Un treball publicat a Nature Gene-tics en què ha participat el CREAL, centre aliat d’ISGlobal, ha identi
ficat tres variants genètiques asso ciades amb el benestar subjectiu, dues variants amb símptomes depressius i 11 amb la inestabilitat emocional o neuroticisme, incloent dues inversions genètiques. Aquestes inversions han estat analitzades amb una eina bioinformàtica desenvolupada per Alejandro Cáceres i Juan Ramón Gónzalez, del Grup de Recerca de Bioinformàtica del CREAL. «Les nostres anàlisis han determinat que dues inver
sions polimòrfiques (regions del genoma amb la seqüència invertida) mostren una major associació al benestar subjectiu que les variants genètiques que normalment s’analitzen en aquests estudis», explica González. Entre els loci identificats, n’hi ha diversos que regulen l’expressió gènica en el sistema nerviós central. Aquest estudi és el més important fins a la data per a aquestes patologies. Per estudiar l’associació genòmica amb el benestar subjectiu es van utilitzar dades de 59 cohorts, que han inclòs unes 300.000 persones. A més, es va analitzar una cohort de subjectes amb símptomes depressius (180.000 individus) i una altra de neuroticisme (170.000 individus). Hi han participat més de 190 científics.
First genetic study on subjective well-being
Astudy published in Nature Gene-tics with the participation of the CREAL, an ISGlobal allied centre,
has identified three genetic variants associated with Subjective WellBeing (SWB), two with depressive symptoms (DS), and eleven with emotional instability or neuroticism, including two inversion polymorphisms. These inversions have been analysed using a bioinformatics tool developed by Alejandro Cáceres and Juan Ramon González, from the Bioinformatics research group at the CREAL. “Our analysis
has allowed us to identify two inversion polymorphisms (genome regions where the sequence is inverted) that show a stronger association to Subjective WellBeing than the genetic variants normally analysed in these studies”, says González. Some of the loci identified regulate gene expression in the central nervous system. This is the most important study to date for these pathologies. In order to look at the genetic variants associated with SWB, 59 cohorts were used, involving nearly 300,000 subjects. The researchers also analysed a cohort with depressive symptoms (180,000 subjects) and neuroticism (170,000 subjects). More than 190 researchers participated in this study ■
The exposure to UV light causes specific lesions in DNA
Excés de mutacions per manca d’accés de la maquinària de reparacióCarolina Pozo
En un estudi publicat a Nature el grup liderat per Núria LópezBigas, investigadora ICREA del CEXS
UPF, ha trobat la causa per la qual les mutacions s’acumulen específicament a certes regions del genoma en les cèl·lules de melanoma i de càncer de pulmó, dos tipus de càncer molt prevalents en la població. L’anàlisi dels genomes de 38 melanomes, seqüenciats pel consorci de l’Atlas del Genoma del Càncer en el qual participa LópezBigas, mostra que la taxa de mutacions en les regions de l’ADN on s’uneixen els factors de transcripció —les proteïnes que s’encarreguen de regular l’activitat dels diferents gens— és aproximadament cinc cops més elevada que a les regions veïnes del genoma. Els resultats de l’estudi indiquen que la unió d’aquestes proteïnes a l’ADN dificulta l’ac
cés de la maquinària de reparació, la qual cosa provoca l’acumulació de les mutacions en aquestes zones. El mecanisme de reparació de danys a les cèl·lules de la pell és el mateix que el de reparació dels danys causats pel fum del tabac que originen alguns tipus de càncer de pulmó, i per això van reproduir l’estudi en aquests tumors. Van trobar que a les zones d’unió dels factors de transcripció de les cèl·lules pulmonars també hi havia una taxa de mutacions molt més elevada respecte a la de les regions veïnes del genoma.
Lack of access to repair machinery causes excess mutations
In a study published in Nature, the team led by Núria LópezBigas, an ICREA researcher at the CEXSUPF,
has found the reason why mutations specifically accumulate in certain regions of the genome in the cells of melanoma and
have a much higher mutation rate than neighbouring regions of the genome ■
lung cancer, two highly prevalent cancers in the population. An analysis of the genomes of 38 melanomas sequenced by The Cancer Genome Atlas consortium, in which LópezBigas participates, shows that the mutation rate in regions of the DNA to which transcription factors — proteins that regulate the activity of different genes — are bound is approximately five times higher than in neighbouring regions of the genome. The results of the study indicate that by binding to the DNA these proteins hinder access of the DNA’s repair machinery, causing the accumulation of genetic mutations in these areas. The mechanism responsible for repairing skin cells is the same as that which fixes the damage caused by tobacco smoke that leads to certain types of lung cancer. For this reason, the researchers reproduced the study in these kinds of tumours. They found that the areas where transcription factors bind in lung cells also
Ciència www.prbb.org | maig de 2011 4Ciència www.prbb.org | maig de 2016 4
ENTREVISTA CIENTÍFICA / SCIENTIFIC INTERVIEW
«El genoma no controla el teu destí, només el teu potencial»
LEROY HOOD – PRESIDENT I CO-FUNDADOR DE L’INSTITUTE FOR SYSTEMS BIOLOGY, USA
Maruxa Martínez-Campos
Com ha canviat la biologia en els últims 50 anys?
Hi ha hagut diversos canvis de paradigma en els quals he participat. El primer va ser apropar l’enginyeria
a la biologia per crear les tecnologies necessàries per explorar noves dimensions, com el seqüenciador automàtic d’ADN. El segon va ser el projecte del genoma humà, i el tercer, adonarse de la importància de la interdisciplinarietat. Naturalment, a partir d’aquí va seguir la biologia de sistemes, i més recentment, la medicina de sistemes i la medicina P4.
Què és la medicina P4?És medicina predictiva, preventiva, personalitzada i participativa. És proactiva més que reactiva: pretén evitar la malaltia en lloc d’actuar després que aparegui. Se centra en el benestar, no només en la malaltia; i es basa en la biologia de l’individu, no en una «mitjana» de la població. I la persona és al centre de la seva pròpia salut; hi té un paper actiu en adoptar mesures per augmentar el seu benestar.
Explica’ns com el teu projecte «100K Wellness» encaixa en això.El 2012 vaig proposar un estudi longitudinal de dades de grans dimensions per monitorar els canvis a la salut de 100.000 individus sans i intentar veure les transicions de la salut a la malaltia per tal d’aprendre a predirles. No vaig obtenir cap finançament del govern —massa arriscat!—, però mitjançant la filantropia vam aconseguir començar el 2014 amb 108 persones. Els vam seguir durant sis mesos: vam seqüenciar el seu genoma sencer, vam analitzarne la sang, la saliva, l’orina i el microbioma intestinal cada tres mesos, i vam monitorar el seu estil de vida. Vam trobar que alguns participants tenien malalties cròniques i no ho sabien! Vam buscar «possibilitats viables» que podien fer per augmentar el seu benestar, i un instructor mèdic els va explicar per què aquests canvis —com la substitució del sushi de tonyina que menjaven per sushi de salmó, amb nivells de mercuri més baixos— eren una bona idea.
Com van reaccionar els participants?Alguns d’ells eren escèptics des del principi, però tots es van sorprendre amb els resultats. Alguns van trobar que eren prediabètics sense saberho i introduint els canvis suggerits els seus nivells de sucre van tornar a la normalitat. Es van adonar que el teu genoma no controla el teu destí —només el teu potencial— i que tens cert poder per canviar això, si disposes de la informació adequada.
Sembla poc realista ampliar aquesta mesura a tota la població... Avui en dia costa al voltant de 6.000 dòlars per persona i any, però els costos baixaran. Si podem detectar una transició de la salut a la malaltia prou aviat i evitar la malaltia i el seu car tractament, estalviarem molts diners. A llarg termini, estic convençut que la medicina P4 serà més eficient que la medicina tradicional.
“Your genome does not control your destiny, just your potential”
How has biology changed in the last 50 years?
There have been several paradigm changes in biology I have been involved in. The first was brin
ging engineering to biology to create the technologies needed to explore new dimensions, such as the automated DNA sequencer. The second was the human genome project. The third, realising the importance of interdisciplinarity. Naturally from that followed systems biology and, more recently, systems medicine and P4 medicine.
What is P4 medicine?It is predictive, preventive, personalised and participatory medicine. It is proactive, rather than reactive: it aims to avoid the disease rather than act after it manifests. It focuses on wellness and not just disease. It’s based on the individual’s own biology, and not on a populational “average”. And the person is at the centre of his or her own health, they play a role by taking action to increase their wellness.
Tell us how your 100K Wellness project fits into this.In 2012 I proposed a longitudinal, highdimensional data study of 100,000 healthy individuals, to monitor their health changes and try to see the transitions from health to disease in order learn to predict them. I didn’t get any govern
ment funding — too risky! But through philanthropy we managed to start in 2014 with 108 people. We followed them for 6 months: sequenced their whole genome, did blood, saliva, urine and gut microbioma analyses every three months, and tracked their lifestyle. We found some participants had chronic diseases they didn’t know about! We looked for “actionable possibilities” they could implement to increase their wellness, and a medical coach explained to them why these changes — like substituting the tuna sushi they ate for salmon sushi, with lower mercury levels — were a good idea.
How did participants react?A few of them were sceptical from the beginning, but they all were surprised by the results. Some found they were prediabetic without knowing it, and by introducing the changes suggested their sugar levels became normal. They realised your genome does not control your destiny — just your potential, and you have some power to change this, if you have the information.
It seems unrealistic to scale this up to the whole population… Today it costs about $6,000 per person and year, but cost will go down. If we can detect a transition from wellness to disease early enough and avoid that illness and its expensive treatment, we will save a lot of money. In the long term, I am convinced P4 medicine will be more efficient than traditional medicine ■
PRBB-CRG CONFERENCES Conference Programme financed by the CRG and the PRBB
WILFRIED HAERTY, Friday May 20. Haerty, from the Genome Analysis Centre in Norwick, UK, aims to tackle the evolution of functional elements with a spe-cific focus on those that are
non-protein-coding. He focuses on identifying long non-coding RNAs (lncRNAs) and charac-terizing their potential biological relevance and function, and the impact of mutations within these loci. He is also interested in the comparative analysis of vertebrate genomes. He has been invited by Rory Johnson (CRG).
MANUEL FRANCO TEJERO, Monday May 23. Franco, from the University of Alcalá, Spain, is interested in the epidemio-logy and prevention of cardio-vascular diseases (CVD) and
its major risk factors. He studies how diffe-rent social characteristics relate to CVD and CVD risk factors such as dietary patterns, hypertension, diabetes and obesity. In parti-cular, he is interested in food environment and the risk of CVD. His research also aims to study population characteristics and CVD mortality to highlight the relevance of popu-lation strategies to prevent CVD. He has been invited by Montse Fitó (IMIM).
TIMOTHY MITCHISON, Thurs-day June 2. Tim Mitchison, from Harvard Medical School, is a world class leader in the molecular mechanism of cell organisation and microtubule
dynamics. He is also a key player in deve-lopment of pharmacological therapeutics that kill cancer cells through effects on mi-crotubule associated molecular motors and activation of tumor-resident macrophages by mimicking viral infection to trigger an in-nate immune response. He has been invi-ted by Vivek Malhotra (CRG).
JANA WOLF, Friday June 3. Wolf, from the Max Delbrueck Center for Molecular Medicine in Berlin, Germany, develops and analyses mathematical models of signalling pathways
and gene-regulatory networks in normal and disease states. She is interested in cell spe-cific differences in signalling and gene-regula-tory networks, since these are critically invol-ved in the prediction of the efficiency and possible side-effects of drugs. She has been invited as part of the EU-life invited speakers series. She has been invited by Manuel Irimia (CRG).
MITCHELL GUTTMAN, Friday June 16. Guttman, from the Ca-lifornia Institute of Technology, US, aims to understand how large ncRNAs control gene ex-pression programs and cell sta-
te decisions in the context of mouse embryo-nic stem cells. To achieve this goal he aims to define lincRNA-Protein interactions and si-tes of interactions, define regulatory targets of lincRNAs and their mechanisms of interac-tion and determine how lincRNAs, through these interactions, regulate gene expression. He has been invited by Thomas Graf (CRG).
JULIAN SALE, Monday June 13. Sale, from the MRC-Labora-tory of Molecular Biology in Cambridge, UK, is interested in the mechanisms that alleviate arrested DNA replication and
the impact their loss has on mutagenesis and on the maintenance of epigenetic me-mory through the recycling of histones during replication. He has been invited by José Yéla-mos (IMIM).
PERFIL / PROFILEMés de 36 patents, 17 títols honorífics i més de 100 premis. Aquest és el bagatge de Lee Hood, una de les tan sols 15 persones elegides per les tres acadèmies nacionals dels Estats Units: de Ciència, Enginyeria i Medicina. Hood també ha fundat 15 empreses de biotecnologia, així com l’Institut de Biologia de Sistemes a Seattle. Aquest pioner en l’enfocament sistèmic a la biologia i la medicina va venir al PRBB a explicar la seva visió sobre el futur de la medicina.
More than 36 patents, 17 honorary degrees and 100 plus awards. This is the weight behind Lee Hood, one of only 15 people elected to all three US National Academies—of Science, Engineering and Medicine. Hood has also founded 15 biotech companies, as well as the Institute for Systems Biology in Seattle. A pioneer in the systems approach to biology and medicine, he came to the PRBB to talk about his vision for the future of medicine.
7 febrer de 2011 | www.prbb.org 5 maig de 2016 | www.prbb.org Ciència
NOTÍCIES CIENTÍFIQUES / SCIENTIFIC NEWS
Més de 640 milions d’obesos Raül Torán
Investigadors del CREAL, centre aliat d’ISGlobal, han participat en el major estudi sobre l’obesitat en el món fins a la
data. L’estudi, publicat a The Lancet, ha estimat en més de 640 milions de persones el total de la població mundial que pateix obesitat, la xifra més alta registrada en la història. Els investigadors han recollit les mesures de pes i alçada de gairebé 20 milions d’adults de 186 països. Després de calcular i comparar l’IMC d’adults entre el 1975 i el
2014, els investigadors han trobat que en quatre dècades l’obesitat global entre els homes s’ha triplicat i ha passat del 3,2% el 1975 al 10,8% el 2014. D’altra banda, l’obesitat en les dones s’ha més que duplicat i ha passat del 6,4% el 1975 al 14,9% el 2014. Els països amb major nombre de persones obeses són la Xina i els Estats Units. Quant a Espanya, un de cada quatre adults —prop de 10 milions de persones— és obès. Si continuen aquestes tendències globals, el 18% dels homes de tot el món i el 21% de les dones seran obesos l’any 2025, segons prediuen els autors.
World’s obese population hits 640 million
Researchers from the CREAL, an ISGlobal allied centre, have participated in the largest ever study
of obesity. Published in The Lancet, the results show that more than 640 million people worldwide suffer from obesity, the highest figure recorded in history. The researchers collected height and weight measurements from nearly 20 million adults in 186 countries. After calculating and comparing the BMI of adult
men and women from 1975 to 2014, researchers found that in these four decades global obesity among men tripled, from 3.2% in 1975 to 10.8% in 2014. Obesity among women in the same period more than doubled, from 6.4 % in 1975 to 14.9% in 2014. China and the USA have the largest number of obese people. In Spain, one in every four adults — nearly 10 million people — is currently obese. The team predicts that if these global trends continue, by 2025 18% of the world’s men and 21% of women will be obese ■
Els gens del cordó umbilical en prematurs infectatsCarolina Pozo
Robert Castelo, investigador de la UPF, i Daniel Costa, metge de l’Hospital de Figueres, han desco
bert que gairebé 4.000 gens canvien coordinadament la seva activitat en el cordó umbilical quan el fetus desencadena una resposta inflamatòria a una infecció intraamniòtica. L’estudi, publicat a la revista Pediatric Research, ha utilitzat dades d’una cohort de nounats prematurs ex
trems recollides en 14 hospitals dels Estats Units. Els científics han trobat que els gens més expressats estan involucrats principalment en l’activació del sistema immune innat i adaptatiu i constitueixen una valuosa font de candidats potencials a biomarcadors de resposta inflamatòria fetal. Aquest és el catàleg més ampli i complet fins avui dels canvis produïts en l’activitat gènica desencadenada per la resposta inflamatòria fetal en nounats prematurs extrems, i ajudarà a avançar en la comprensió de les malalties associades a la prematuritat.
An infection of preterm newborns changes gene expression at the umbilical cord
Robert Castelo, researcher at the UPF, and Daniel Costa, a doctor at Hospital de Figueres, have
found that almost 4,000 genes change their activity in a coordinated way in the umbilical cord when the foetus triggers an inflammatory response to an intraamniotic infection. The study, published in Pediatric Research, used data from a cohort of extremely preterm newborns
collected from 14 hospitals in the United States. The researchers saw that the most highlyexpressed genes are principally involved in the activation of the innate and adaptive immune system and constitute a valuable source of potential candidate biomarkers of foetal inflammatory response. This is the largest and most complete catalogue of changes in gene activity triggered by foetal inflammatory response in extremely preterm newborns, and will help advance our understanding of diseases associated with prematurity ■
Nou mecanisme per aturar la divisió defectuosaLaia Cendrós
Un estudi publicat a Nature Cell Biology identifica els actors clau per evitar que les cèl·lules se sepa
rin quan la divisió de l’ADN és defectuosa. A vegades, a causa de problemes durant la duplicació de l’ADN, es generen connexions entre els brins d’ADN. En migrar els cromosomes cap als pols durant la divisió cel·lular, aquestes connexions els mantenen units i donen lloc als «ponts d’ADN» entre les dues meitats de la cèllula. Aquests ponts, que es troben amb freqüència en càncer, són una font d’inestabilitat genètica, perquè durant la divisió poden trencarse i danyar la informació genètica de les cèl·lules filles.
El treball, liderat per Manuel Mendoza al CRG, demostra que en el llevat, quan hi ha problemes de replicació de l’ADN, els ponts de cromatina envien un senyal d’alarma —a través de la via de senyalització NoCut— que atura temporalment el procés de divisió cel·lular. Això dóna temps perquè l’ADN acabi la seva separació abans que la cèl·lula es divideixi.
New mechanism to avoid a faulty cell division
Astudy published in Nature Cell Bio-logy identifies the key players that prevent cells from being physica
lly separated when DNA division is faulty. Occasionally, due to problems during DNA duplication, connections can be
created between the strands of DNA. As the chromosomes migrate toward the poles, these connections hold them together, leading to “DNA bridges” between the two halves of the cell. These DNA bridges, which are frequently found in cancer cells, are a source of potential genetic instability because during division they can break and damage the genetic information passed on to the daughter cells. The work led by Manuel Mendoza at the CRG shows that, in yeast cells, when there are problems with DNA replication, the resultant chromatin bridges send an alarm signal through the NoCut signalling pathway that temporarily stops the cell division process. This gives time for the DNA to finish its separation before the cell is split in two ■
Pont de cromatina en llevat, amb microtúbuls (verd) i embolcall del nucli (taronja)
Chromatin bridge in yeast; microtubules (green) and nucleus (orange)
La gran innovació dels animals és la regulació distal, és a dir, la capacitat que té l’ADN de regular gens distants entre si i determinar amb exactitud el moment de ferho. Els investigadors han comparat els sistemes de regulació gènica i epigenètica de l’ameba Capsaspora owczarzaki amb els dels animals. «Mentre C. owczarzaki fa servir els mecanismes de regulació genètica per controlar la transició entre les fases del seu cicle vital, els animals els utilitzem per poder especialitzar les nostres cèl·lules, per exemple, per obtenir neurones o cèl·lules musculars, augmentant radicalment la nostra complexitat», especifica RuizTrillo.
Troben un mecanisme clau en l’origen dels animals Jordi Lanuza
Un equip liderat per Iñaki RuizTrillo, investigador ICREA de l’IBE (CSICUPF), i amb participació del
també ICREA Luciano Di Croce i d’Eduard Sabidó —ambdós del CRG— ha descobert els mecanismes genètics responsables del gran èxit evolutiu dels animals. Els resultats, publicats a Cell, indiquen que aquests mecanismes es troben en tot el regne animal, però no en els nostres ancestres unicel·lulars.
Distal gene regulation, key to the emergence of animals
Ateam led by Iñaki RuizTrillo, ICREA Research Professor at the IBE (CSICUPF), in collaboration
with CRG scientists Eduard Sabidó and Luciano Di Croce, another ICREA researcher, has deciphered the genetic me chanisms responsible for the evolutionary success of animals. The results, published in Cell, highlight that these mechanisms are found in the entire animal kingdom, but not our
unicellular ancestors. The greatest innovation in animals was distal gene regulation: DNA’s ability to regulate genes that are physically separate from one ano ther and determine the exact moment to do so. Researchers have compared the genetic and epigenetic regulatory mechanisms of the amoeba Capsaspora owczarzaki with those of animals. “While C. owczarzaki applies gene regulatory mechanisms to control the transition between the different cell stages in its life cycle, animals use them to specialise their cells , increasing their complexity”, says RuizTrillo ■
Ciència www.prbb.org | maig de 2011 4Ciència www.prbb.org | maig de 2016 6
CIÈNCIA AL DESCOBERT / SCIENCE UNCOVERED EL PLAT PREFERIT DE... / THE FAVOURITE DISH OF...
Obrint la ciència
Toni Hermoso
Ha passat gairebé una dècada des que el terme «ciència oberta» va aparèixer per primera vegada a
la Viquipèdia. La pàgina va ser creada per Aaron Swartz i inicialment redirigia a «open access»(accés obert). Uns anys més tard, aquest jove activista es va suïcidar com a conseqüència de la pressió dels càrrecs contra ell després d’haver pujat molts articles amb llicència privada a Internet. Open access (OA) es refereix a l’accessibilitat d’articles científics per a tothom a través d’Internet i de forma gratuïta —al contrari del que passa en la publicació científica tradicional, on, un cop publicat un article en una revista, cal pagar per llegirlo. Moltes agències governamentals ja demanen als científics que financen que publiquin en una revista d’accés obert (l’anomenat «gold OA»), o bé que pugin l’article publicat en una altra revista a un repositori obert (el «green OA»), quan ha passat un temps pruden cial. Els preprints, articles publicats a Internet abans de la revisió per parells i de la publicació en una revista, també comencen a guanyar terreny en les ciències biològiques. Però la ciència oberta és més que el simple accés obert. Open data i Open metho-dology són altres dos pilars indispensables per fer la ciència moderna reproduïble. Impliquen fer accessibles no solament els resultats finals, sinó també les dades originals i la metodologia utilitzada per analitzarles. La recent inundació de dades ha donat lloc al naixement de repositoris públics oberts, com el Sequence Read Archive o el European Variant Archive, perquè investigadors puguin reanalitzar el material existent. Un requisit comú d’aquests dipòsits és que les dades estiguin en un format obert (open format), de manera que altres investigadors les puguin processar amb eines diferents de les utilitzades originàriament. A més de les dades, un nombre creixent de revistes també requereixen als autors que proporcionin el seu codi (open source) perquè els revisors puguin avaluar plenament els resultats. Avui dia hi ha un creixent esforç a formar científics en tecnologies que permeten la col·laboració d’una manera oberta i traçable, com els sistemes de control de versions com GitHub, les wikis o els quaderns de laboratori digitals. Potser en el futur ja no caldrà distingir «ciència oberta» de simplement ciència.
Opening science
It’s been almost a decade since the term “Open Science” first appeared in Wikipedia, although it was initially
redirected to “Open Access”. The page was created by Aaron Swartz, a young activist who some years later committed suicide due to pressure from the charges brought against him after he uploaded many privative licensed articles to the internet. Open Access (OA) means making scientific articles freely available to everyone through the internet, contrary to what happens traditionally in scientific publishing where, once an article is published in a journal, anyone wanting to read it must pay a fee. Many government agencies are already asking the scientists they fund to either publish in an openaccess journal (the “golden road” to OA) or upload the published article into an open repository (the “green road”). Preprints, articles posted on the internet prior to peer review and publication in a journal, are also starting to spread in the biological sciences. But there is more to Open Science than Open Access. Open Data and Open Methodology are two other indispensable keystones to making modern science reproducible. They mean not only making final results available, but also the original raw data (straight from the machines) and the me thods used to analyse them. The recent flood of data has led to the birth of public open repositories, such as the Sequence Read Archive and the European Variant Archive, so researchers can freely reuse existing material. A common requirement of these repositories is that data be delivered in an Open Format, so other researchers may process it with different tools to the ones originally used. As well as the data itself, an increasing number of journals also require authors to provide their program code (Open Source) so reviewers may assess the results more fully. Moreover, nowadays there is a growing effort to train scientists in technologies that enable collaboration in an open and traceable way, such as version control systems like GitHub, wikis, and digital lab notebooks. In the future we might not even need to distinguish Open Science from simple “Science” anymore ■
Luca Cozzuto (CRG) recomana: Pizza casolana
FOTO CIENTÍFICA / SCIENTIFIC PHOTO
Dins el cap d’un embrió de ratolíAquesta foto, feta per Jim Swoger del
laboratori de sistemes multicellulars de James Sharpe (CRG),
mostra el cap d’un embrió de ratolí de 12 dies. Els marcadors fluorescents permeten visualitzar els precursors del teixit nerviós (vermell i blau a la imatge superior, verd a la inferior) i el muscular (verd a la imatge superior, de color vermell a la inferior). La imatge va ser obtinguda fent un scan del cap amb la tècnica microscòpica Selective Plane Illumination Microscopy. Les imatges superior i inferior són representacions alternatives de les dades obtingudes amb aquesta tomografia.
Inside an embryonic mouse head
This image, taken by Jim Swoger from James Sharpe’s Multicellular Systems Biology lab (CRG), shows
the head of a 12dayold mouse embryo. The fluorescent labels allow us to see the
Sens dubte, el que més troba a faltar un immigrant napolità és una bona pizza. Aquí teniu la recepta per a ferne qua
tre casolanes. Ingredients: 800 g de farina de força, 450 ml d’aigua, 20 g de sal, 4 g de llevat. Dissoleu el llevat en aigua tèbia. Incorporeuhi la meitat de la farina i comenceu a pastar. Afegiuhi la sal i la resta de la farina. Pasteu fins que la massa quedi rodona. Deixeula reposar 10 minuts i pasteu de nou durant uns minuts més, fins que quedi suau, homogènia i elàstica (enfonseu el dit a la massa; en treure’l, la pasta ha de reprendre la seva forma original). Deixeu que la massa pugi durant dues hores en un recipient cobert amb un embolcall de plàstic. A continuació, dividiu la massa en quatre trossos, poseulos en un motlle per coure, lleugerament untat amb una mica d’oli i cobert amb un embolcall de plàstic. Deixeu que la massa pugi durant quatre o sis hores més. A continuació, esteneu la pizza en una safata untada amb una mica d’oli d’oliva o amb paper de forn. Cal estendrela amb un moviment circular de manera que s’aconsegueixi una forma rodona. Afegiuhi la salsa de tomàquet i qualssevol altres ingredients i poseu la pizza al forn preescalfat a tempera
tura màxima i amb ventilació. La mozzarella s’hi afegeix només uns minuts abans del final de la cocció, per evitar que es ressequi. Podeu veure més receptes d’en Luca a http://bioinfornatico.blogspot.com.es/
Luca Cozzuto (CRG) recommends: homemade pizza
Undoubtedly, the thing a Neapolitan most misses from home is a good pizza. For the best homemade pizza
you need 800 g strong flour; 450 ml water; 20 g salt; 4 g yeast (for 4 pizzas). Dissolve the yeast in warm water. Add half the flour and begin to knead. Add the salt and the rest of the flour. Work until the dough becomes rounded. Let it rest for 10 mins and knead it again: at this point the dough will be much smoother, homogeneous and elastic (stick your finger into it; when you remove it, the dough should regain its original form). Leave the dough to rise for 2 hours in a bowl covered with cling film. Then divide into quarters, put them on a baking pan, lightly greased with oil and covered with cling film. Leave these to rise for 46 hours. After rising, roll out the pizza in a pan greased with a little olive oil, or on baking paper. It has to be spread using a circular motion so that it becomes round. Next add the tomato sauce and any other ingredients and put the pizza in a ventilated preheated oven at maximum temperature. Add any mozzarella only a few minutes before the end of the cooking to avoid over drying. Check out more of Luca’s recipes at http://bioinfornatico.blogspot.com.es/ ■
Imat
ge d
e M
ari C
arm
en C
ebriá
n
precursors of neural tissue (red and blue in the top image, green in the bottom one) and muscle (green in the top image, red in the bottom one). The image was obtained from a Selective Plane Illumination Microscopy scan of the head. The top and bottom images are alternative representations of the data ■
7 febrer de 2011 | www.prbb.org 7 maig de 2016 | www.prbb.org Diversitat
RETRAT / PORTRAIT
Pablo Baeza Rio de Janeiro, Brasil (1989) Estudiant de doctorat al CRG
Què vas estudiar? Primer, lingüística i traducció, i més endavant, bioquímica.
Com va acabar un traductor fent recerca biomèdica? Per accident! En traduir alguns articles científics i fer d’intèrpret a conferències de biologia em va picar la curiositat i vaig decidir estudiar alguna cosa relacionada a temps parcial, mentre treballava a Madrid. Després vaig tenir l’oportunitat de marxar a una bona universitat a l’estranger. A poc a poc em va anar enganxant la recerca i ara no puc imaginarme fent una altra cosa.
Què és el que t’agrada més de la teva feina?Bàsicament, em paguen per aprendre! En aquest sentit, crec que no hi ha millor feina al món. D’altra banda, el component de creativitat que té la recerca no és fàcil de trobar en altres àmbits.
Quin és el lloc més estrany on has estat mai? Més que un lloc, és una situació. Viatjant per Japó, em vaig apuntar a una excursió sense saber que anava dirigida a persones grans. Vaig passar un dia envoltat d’avis japonesos parlantme, rient i fentse fotos amb mi —l’únic jove del grup, i estranger— sense entendre res! Va ser molt estrany, però molt divertit.
Què et faria totalment feliç?Un val d’un milió d’euros per gastar a Amazon.
What did you study?First linguistics and translation, and later on biochemistry.
How did a translator end up in biomedical research?By accident! Translating scientific articles and acting as an interpreter in biology conferences aroused my curiosity about the subject and I decided to study something related, while working parttime in Madrid. Then I had the opportunity to go to a good university abroad. Gradually research hooked me and now I can’t imagine myself doing anything else.
What do you like most about your work?Basically, I get paid to learn! :) In this sense I think there is no better job in the world. Moreover, the creative component of research is not easy to find in other fields.
What is the strangest place you have ever been?More than a place, it’s a situation. Travelling in Japan, I joined a tour without knowing that it was aimed at the elderly. I spent an entire day surrounded by elderly Japanese people speaking to me, laughing and taking pictures with me — the only young person in the group, and a foreigner! I didn’t understand anything! It was very strange but fun.
What would make you completely happy?A one million euro voucher to spend on Amazon ■
DEBAT ACTUAL / CURRENT-AFFAIRS DEBATE
El 15 d’abril va tenir lloc al PRBB la segona edició de BioJunior, on prop de 300 alumnes de quart d’ESO i primer de batxillerat van apropar-se a la recerca de pri-mera mà. Els assistents van participar en una taula rodona sobre «La carrera cien-tífica» amb joves investigadors i van assistir a la xerrada d’estudiants d’enginyeria biomèdica de la UPF que estan participant al concurs internacional de biologia sin-tètica iGEM. Després d’una visita guiada a un laboratori, van descobrir les profes-sions del futur guiats per Barcelona Activa i van participar en una activitat dirigida per investigadors de l’IBE i «La ciència al teu món». La jornada va coincidir amb el lliurament de guardons de l’XI Premi PRBB al millor treball de recerca, organitzat per la UPF i el PRBB. El·lipse ha demanat a voluntaris i estudiants com valoren la seva participació a la jornada.
Biojúnior: First-hand science
On April 15, the second edition of BioJúnior was held at the PRBB, where nearly 300 high school students got up close and personal with research. They partici-pated in a roundtable on “The scientific career” with young researchers and at-tended a talk by biomedical engineering students at the UPF who are taking part in IGEM, an international synthetic biology contest. After visiting a laboratory, they discovered the professions of the future thanks to Barcelona Activa and they participated in an activity conducted by researchers from the IBE and “La Ciència al teu Món”. The event coincided with the prize-giving ceremony for the XI PRBB Award for the best research project organised by the UPF and PRBB. El·lipse asked volunteers and students about their experiences.
Biojúnior: Ciència de primera mà
Isabel Farrés, professora de l’IES Lluís Vives
«Vaig venir amb alumnes de primer i segon de batxillerat, tots ells estudiants de biologia.
Va ser molt interessant el diàleg amb els investigadors; que expliquessin la importància dels coneixements en altres matèries científiques va ser bo perquè els nostres alumnes han de triar molt aviat quines matèries són del seu interès i ho han de fer sense conèixerne el contingut. Així, van poder veure que la investigació requereix un coneixement global i necessita científics de totes les àrees. Tots els estudiants van sortir contents. Als de primer de batxillerat els van agradar molt els tallers, perquè eren molt visuals, sobretot el de genètica; hauria estat bé que n’hi hagués hagut més! Els de segon ara són a final de curs i han de decidir quina carrera triar. Això pot ser difícil i veure que pots fer ciència des de qualsevol àrea i que no cal que estigui compartimentada va ser una bona lliçó.»
“I came with my high school students, all of them studying biology. The dialogue with researchers was very interesting; their explanation about the importance of knowledge in other scientific subjects was good because our students will very soon have to choose what subjects they are interested in and they will have to do this without knowing much about the different fields. Here they could see that research requires information from many subjects and that researchers are needed in all areas. All the students left happy. The first course students liked the workshops because they were very visual, especially the one about genetics; it would have been nice to see more! The more senior students are now at the end of their year and they must decide which degree to choose. This may be difficult, and realising you can do science in any field and it does not necessarily need to be compartmentalised was a good lesson.” ■
Helena Izquierdo, guanyadora del Premi PRBB
«Guanyar el Premi PRBB m’ha aportat motivació i m’ha fet adonar que amb es
forç i dedicació pots fer el que et proposis. Des de sempre he considerat el PRBB una institució important i reconeguda en el món de la ciència. Per això, que reconeguin una feina que he realitzat amb molta il·lusió i esforç, m’ha inspirat confiança en mi mateixa i m’ha aportat esperit i valor per continuar treballant i cercar un futur dins l’àmbit de la recerca biomèdica o de les ciències en general.»
“Winning the PRBB award has motivated me and made me realise that with effort and dedication you can do whatever you want. I have always seen the PRBB as an important and wellrecognised institute within the scientific world. Therefore, the fact that they appreciate a project that I did with a lot of effort and enthusiasm has increased my selfconfidence and given me the courage to continue working and looking for a future in the field of biomedical research or science in general.”
Sergi Aranda (CRG), investigador participant a la taula rodona
«Espero que la nostra experiència serveixi als estudiants per veu
re que alguns dels neguits que tenen són normals i que molts de nosaltres també els vam patir al seu moment! Quina carrera escollir? A què em vull dedicar? Hi haurà sortides professionals després de la meva carrera? Confio que la trobada hagi servit per mostrar la motivació que ens va portar a escollir la nostra carrera professional i quina ha estat la nostra trajectòria, així com per donarlos un tast de com és el dia a dia d’un investigador.
Crec que el format d’aquesta taula rodona va ser un encert per l’ambient relaxat i col·loquial que tenia, i també perquè estava formada per investigadors en diferents etapes de la seva vida professional i amb trajectòries molt diverses.»
“I hope that our experiences will be useful to the students, they will see that some of their concerns are normal, and that we suffered too! Which career to choose? What do I want to do? Will I find a job after my degree? I hope that the roundtable served to show them the motivation that led us to choose our careers, what our experience has been like, and give them a taste of the daily life of a researcher. I think the format of the roundtable was a success due to the relaxed and informal atmosphere, and also because there were researchers at different stages of their professional careers and who had followed different paths.”
Núria Armengol, Laura Ros, Maria Montano i Arianne Bercowsky, estudiants d’enginyeria biomèdica a la UPF i participants a iGEM
«Vam tenir l’oportunitat de difondre el nostre coneixement a estudiants de batxillerat i d’explicarlos la nostra experiència en el projecte de biologia sintètica que estem duent a terme de forma amena i senzilla. Així doncs, vam sentir com n’era d’important la nostra trajectòria per servir de guia i incentiu a futurs estudiants universitaris. Realment, es van sentir atrets i motivats davant allò que els explicàvem, potser perquè, com que nosaltres també som joves, s’hi van sentir molt reflectits. Les seves preguntes i aportacions durant la conferència també van servirnos com a grup, ja que vam descobrir nous punts de vista, opinions i aspectes a millorar en un futur. Tot, fruit de l’intercanvi d’experiències i coneixement entre joves amb anhels de fer evolucionar el món de la ciència!»
“We had the opportunity to spread our knowledge to high school students and tell them about our experience in the synthetic biology project that we are carrying out. We realised how important our own path is as a guide and incentive to future students. They found what we said really interesting and motivating, maybe because we are also young and they identified with us. Their questions and contributions during the confe rence were also useful for us, because we discovered new points of view, opinions and areas for improvement in the future. Everything resulted from this exchange of experiences and knowledge among young people with aspirations to improve the scientific world!” ■
Si voleu rebre una versió digital d’aquest diari, registreu-vos a www.prbb.org/ca/divulgacio. If you would like to receive a digital copy of this newspaper, please register at www.prbb.org/divulgacio
Direcció:Jordi Camí, Reimund Fickert i Elvira López
Imprès en paper reciclatDipòsit legal: B. 23.796-2009
LA FOTO DEL MES / PHOTO OF THE MONTHReptes ètics de la recerca clínica en Alzheimer
Envieu les vostres fotos relacionades amb el PRBB a / Send your pictures related to the PRBB to: [email protected]
AGENDA
NOTÍCIA GENERAL / GENERAL NEWS NOTÍCIES BREUS / BRIEF NEWS
Jordi Lanuza
Durant un any, l’IBE (CSICUPF) tindrà una exposició a Top Ciència, un espai dins el museu de la
ciència a Barcelona, CosmoCaixa, destinat a promoure les vocacions científiques i mostrar la recerca espanyola d’avantguarda. L’exposició de l’IBE es compon de diferents materials audiovisuals i interactius per aconseguir una millor comprensió de la biologia evolutiva, així com de la recerca que es fa al centre. Comença amb un vídeo a mida real, on el director de l’IBE, Xavier Bellés, explica breument els diferents programes de recerca del centre, seguit d’Elena Bosch i Salvador Carranza, que parlen sobre els seus laboratoris. L’exhibició inclou dos jocs sobre arbres filogenètics i sobre el càlcul de la similitud entre espècies, realitzats amb l’ajut de l’investigador ICREA Iñaki RuizTrillo i d’Alicia Sánchez. Un cronograma interactiu de les fites en la biologia evolutiva, una vitrina amb papallones, escarabats i rèptils de les
La recerca de l’IBE al CosmoCaixa
col·leccions de l’IBE i una secció participativa on els visitants poden donar la seva visió personal de la ciència posen el toc final a l’exposició.
IBE research highlighted at CosmoCaixa
Anew exhibition about the IBE (CSICUPF) has been released at CosmoCaixa, the science muse
um of Barcelona. During one year, the IBE will be at Top Ciència, a space within the museum aimed at promoting scientific careers and showing off Spain’s cuttingedge research. The exhibition comprises audiovisual and interactive materials where you can get a better understanding of evolutionary biology as well as learning about the research at IBE. It begins with a life size video of Xavier Bellés, the centre’s director, explaining the research programmes, followed by videos where Elena Bosch and Salvador Carranza talk about their labs. There are also two games — about phylogenetic trees and the similarity between species — which have been developed with the guidance of ICREA researcher Iñaki RuizTrillo and Alicia Sánchez. The exhibition also includes an interactive chronogram on the milestones in evolutionary biology and a display cabinet with butterflies, beetles and reptiles from the IBE collections, as well as a participative section where visitors are asked about their personal views related to science ■
Sebastian Maurer guardonat amb una Young Investigator Grant del Programa Human Frontier Science (HFSP). El cap de grup Júnior del CRG ha guanyat una de les beques HFSP concedides cada any als millors projectes col·laboratius internacionals i multidisciplinars en recerca bàsica, desenvolupats per investigadors que es troben als primers cinc anys després d’haver obtingut un laboratori independent. El projecte seleccionat té com a objectiu investigar la disposició espacial de molècules dins de les cèl·lules que afecta el pla corporal dels animals durant el seu desenvolupament.
Sebastian Maurer awarded a Young Investigator Grant from the Human Frontier Science Programme (HFSP). The Junior group leader at the CRG has received one of the HFSP fellowships granted each year to the best international and multidisciplinary collaborative projects in basic research, developed by researchers who have had their own independent laboratory for five years or less. The project funded is aimed at investigating the spatial arrangement of molecules inside cells that impact the animal body plan during its development.
Tomàs Marquès-Bonet ha estat nomenat sotsdirector de l’IBE. L’investigador ICREA lidera el Grup de Genòmica Comparativa i està a l’Institut des de la seva fundació, el 2008. Substitueix David Comas, que recentment va ser nomenat director del Departament CEXSUPF. «Agraïm sincerament a David Comas la seva lleialtat i els seus esforços continus per millorar l’IBE, i a Tomàs MarquèsBonet el fet d’haver acceptat el repte», diu Xavier Bellés, director de l’IBE.
Tomàs Marquès-Bonet appointed as Vice-Director of IBE: The ICREA professor leads the “Comparative Genomics Group” and has been in the institute since its foundation in 2008. He takes over from David Comas, who was recently appointed Director of the UPF CEXS Department. “We sincerely thank David Comas for his loyalty and continuous efforts to improve the IBE, and Tomàs Marques for accepting the challenge”, says Xavier Bellés, Director of the IBE.
Dos estudiants de doctorat al PRBB, guanyadors de la competició Rin4’. Carlos Toscano, del grup de Jordi GarcíaOjalvo a la UPF ha rebut 900 euros pel 1r premi i 200 euros pel premi especial. Álvaro Castells, del grup de Pia Cosma al CRG, ha rebut 600 euros pel 2n premi. El tercer guanyador ha obtingut 300 euros. El Rin4’, un concurs on investigadors de doctorat han d’explicar el seu projecte en 4 minuts, és una iniciativa de l’Escola de Doctorat de la UPF i el seu propòsit és posar en relleu la importància de les habilitats de comunicació en la difusió de la ciència. Aquesta edició ha comptat amb 57 participants.
Two PhD students at the PRBB win the Rin4’ competition. Carlos Toscano, from Jordi GarciaOjalvo’s lab at the UPF has received both the €900 1st prize and €200 special prize. Álvaro Castells, from Pia Cosma’s lab at the CRG, got €600 for the 2nd prize, and there was a third prize of €300. Rin4’ is a competition in which PhD students must explain their research in four minutes. It is an initiative of the UPF’s PhD School and its purpose is to underline the importance of communication skills in the dissemination of science. This edition had 57 participants ■
AGENDA1 de juny. Abstracts submission dead-line for the International Conference on Systems Biology, which will take place in September 2016. Organised by CRG and UPF researchers http://www.icsb2016barcelona.org
1 de juny. Registration deadline for the “EMBO Practical Course: Targeted Proteomics. Experimental design and data analysis” which will take place 13-18 November at the PRBB. More info: http://events.embo.org/16-targeted-proteomics/
3 de juny. “The Microbiome in Respi-ratory Medicine”, a symposium at the PRBB Auditorium. More info and registra-tion: http://brn.cat/microbiome2016/
9 de juny. Wikimarató, comparteix el teu coneixement científic a la wiki-pedia, de 9 a 15 h a la sala Charles Darwin. Més informació i inscripcions a http://bit.ly/wikimaratoPRBB
13 de juny. «Biobancos: presente y fu-turo», jornada científica en motiu del 5è aniversari del MARBioban. A l’Audi-tori del PRBB de 9 a 16.30 h. Entrada gratuïta, però cal confirmar l’assistèn-cia a [email protected]
Per a més informació, aneu a www.prbb.orgFor more information please go to www.prbb.org
Foto de Jorge Palomino, guanyadora del repte #EllipseViatgera de maig. Times Square, Nova York, US. Més informació: http://bit.ly/EllipseViatgera