• Amino Acidos: Sillares de las Proteínas
• Química Acido-Base de Amino Acidos
• Separación y Análisis de mezcla de a.a.
• Enlace peptídico
L-Amino ácido
COO-
H3N+ C H
R
CHO
HO C H
CH2OH
L-Gliceraldehído
COO-
H3N+ C H
H
L-Glicina (Gly, G)
Estructuras, valores de pKa, abreviaturas
• Aminoácidos No polares• Aminoácidos Polares, sin carga
• Aminoácidos Acídicos• Aminoácidos Básicos
Propiedades Espectroscópicas• Todos los aas absorben luz en
region I.R.• Sólo Phe, Tyr, y Trp absorben
luz UV• Absorbancia a 280 nm es buen
diagnóstico de la presencia de aminoácidos
Estereoquímica de los Aminoácidos
• Todos quirales EXCEPTO Glicina (Gly)• L-aminoácidos predominan en naturaleza• Nomenclatura D,L basada L-gliceraldehido
Propiedades de los Aminoácidos
Aminoácido Abreviatura PM % prot
Grupo R No polarGlicina Gly G 75 7.2Alanina Ala A 89 7.8Valina Val V 117 6.6 Leucina Leu L 131 9.1Isoleucina Ile I 131 5.3Metionina Met M 149 2.3R aromáticoFenilalanina Phe F 165 3.9Tirosina Tyr Y 181 3.2Triptofano Trp W 204 1.4
R polar sin cargaSerina Ser S 105 6.8Prolina Pro P 115 5.2Treonina Thr T 119 5.9Cisteina Cys C 121 1.9Asparagina Asn N 132 4.3Glutamina Gln Q 146 4.2
R carga positivaLisina Lys K 146 5.9Histidina His H 155 2.3Arginina Arg R 174 5.1
R carga negativaAspartato Asp D 133 5.3Glutamato Glu E 147 6.3
Aminoácido Abreviatura PM % prot
No en proteínas, parte del metabolismo
Qué es el Aspartame?Qué relación tiene con los aminoácidos y con la Fenilcetonuria?
COO-
H3N+ C H
R
COO-
H2N C H + H+
R
á c i d o (donador)
COO-
H3N+ C H
R H+
COOH
H3N+ C H
R
b a s e(aceptor)
Propiedades Acido-BaseAminoácidos son Acidos Polipróticos Débiles
• H2A+ + H2O HA0 + H+
• COOH-CH-R-NH3++ H2O -COO-CH-R-NH3
+ + H+
• COOH-CH-R-NH3+ = H2A+
• Ka1 = [ HA0 ] [ H+ ] [-COO-CH-R-NH3+ ] [ H+ ] __________ = ____________________
[H2A+ ] [COOH-CH-R-NH3+ ]
Propiedades Acido-BaseLa segunda disociación ( grupo amino):
• HA0 + H2O A¯ + H+
• COO--CH-R-NH3+ + H2OCOO--CH-R-NH2 + H+
• Ka2 = [ A¯ ] [ H+ ] __________ [ HA0 ]
• Ka2 = [ COO¯ ] [ H+ ] ________________ [ COO-CH-R-NH3
+ ]
Propiedades de los Aminoácidos
Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pI
Grupo R No polarGlicina Gly G 75 7.2 2.34 9.60 5.97Alanina Ala A 89 7.8 2.34 9.69 6.01Valina Val V 117 6.6 2.32 9.62 5.97Leucina Leu L 131 9.1 2.36 9.60 5.98Isoleucina Ile I 131 5.3 2.36 9.68 6.02Metionina Met M 149 2.3 2.38 9.21 5.74
R aromáticoFenilalanina Phe F 165 3.9 1.83 9.13 5.48Tirosina Tyr Y 181 3.2 2.20 9.11 5.66Triptofano Trp W 204 1.4 2.38 9.39 5.89
Propiedades de los Aminoácidos
Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pIR polar sin cargaSerina Ser S 105 6.8 2.21 9.15 5.68Prolina Pro P 115 5.2 1.99 10.96 6.48Treonina Thr T 119 5.9 2.11 9.62 5.87Cisteina Cys C 121 1.9 1.96 10.28 5.07Asparagina Asn N 132 4.3 2.06 8.80 5.41Glutamina Gln Q 146 4.2 2.17 9.13 5.65
R carga positivaLisina Lys K 146 5.9 2.18 8.95 10.53 9.74Histidina His H 155 2.3 1.82 9.17 6.00 7.59Arginina Arg R 174 5.1 2.17 9.04 12.48 10.76
Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pKR pI
R carga negativaAspartato Asp D 133 5.3 1.88 9.60 3.65 2.77Glutamato Glu E 147 6.3 2.19 9.67 4.25 3.22
COOH
H3N+ C H CH3
COO-
H3N+ C H CH3
HH++
pK’1
COO-
H2N C H CH3
HH++
pK’2
pH
0.5 1.0 1.5 2.0
pK1’pI
pK2’
Cuál es el pK del Acido acético, de la metil amina?Es éste diferente al pK1 y pK2 de los aminoácidos?Por qué?
R1
H2N CH C OH
O
H R2
H N CH COOH+
H2O
R1
H2N CH C
O
H R2
N CH COOH
dipéptido
H3C CH3
SH3 CH
CH2OH H H H CH2 H CH3 H CH2
H3N CH C N C C N C C N C C N C COO-
O H O H O H O H
Serilglicilcisteinilalanilleucina Ser.Gly.Cys.Ala.Leu
N-termC-term
El oxígeno carbonílico (C=O) tiene una carga parcial negativa
El nitrógeno amídico (NH) tiene una carga parcial positiva→ se establece pequeño dipolo eléctrico
Enlace peptídico tiene naturaleza parcial de enlace doble, → es menos flexible que un covalente simple convencional
Todos los enlaces peptídicos en proteínas ocurren en trans