Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in ...

Workshop on Tools for DNA sequencing and resequencing in diagnostics

14th of January 2010Harnack-Haus, Berlin, Germany

���������

• ����� ��� ��������������������������������

�����������

• ����� �������������������������� ����������

• ����������������������� ������������� ������

�����������

• ��� ���������� �������������� �������

• ��� ������ ������������ �������������������

����������������������������������� ���

�������������������� ������!

����������

" #$%������&��' �����������(

�������������' ���� ���)��

������������*������

" #)%������&��' �����������(

�' �����' ���������+�������� �

�+������' �����

" #,%�-����������(�����.������

/ ��������.�*�������

" #0%����������.�*�������

" #1%���� �2����������3��������

" #4%�&���������������' �������

" #5%�/ �����' ���

www.cng.fr/READNA

,�� 2��������������.�*������

• 3����������

• 6���������7�$�8�

– ��' ��1�8������

– 9�+���������

– 1:;;;:;;;�����

• � ����������������< ����

" �������� �������������� ��' ���

,�� ����������������*��������

• 2���' ����' ����� ��' ����������

• ��������' ���

• 6���(������������������� ��' �����

• 3�=>������>���������

• ������������� �/ �3�( ����������

• ���' �������������� ���������������

WP2 – Activities

1) riboPCR MS Sequencing (CEA).

2) HLA Typing (CEA).

3) DASH Resequencing (ULEIC-FGEN-GWAVE).

4) Datta Arrays (ULEIC-PHO-MPIMG).

5) Risk Profiling of multifactoiral diseases by MALDI

mass spectrometry (MPIMG-CAU).

riboPCR MS Sequencing and HLA Typing

RNA/DNA Chimeras

DNA + mixThermocycling

Incubation

Mass spectrometer

Target

Alkali Cleavage

Sample transfer

Alkali

CEA - Ivo Gut / Florence MaugerCEA- LIST - Vincent Picaud