Top Banner
Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique Faculté de Médecine, Université de Rennes 1 Centre d'Investigation Clinique INSERM 1414 CHU de Rennes, Hôpital Pontchaillou Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la qualification d’un biomarqueur en termes d’utilité clinique: prédictif ou pronostique?
25

Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Aug 24, 2020

Download

Documents

dariahiddleston
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

AudreyLAVENU,Maîtredeconférencesenbiostatistique.

LaboratoiredepharmacologieexpérimentaleetcliniqueFacultédeMédecine,UniversitédeRennes1

Centred'InvestigationCliniqueINSERM1414CHUdeRennes,HôpitalPontchaillou

Unvocabulairespécifiqueàutiliseràbonescientpourlaqualificationd’un

biomarqueurentermesd’utilitéclinique:prédictifoupronostique?

Page 2: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

§ prédictifoupronostique?

Page 3: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

Variablepronostique.

§ prédictifoupronostique?

Page 4: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

Variablepronostique.

ModèledeCox:GroupebiomarqueurM- (référence):

Risqueinstantané=RisquedebaseGroupebiomarqueurM+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur )

§ prédictifoupronostique?

Page 5: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

Variablepronostique.

ModèledeCox:GroupebiomarqueurM- (référence):

Risqueinstantané=RisquedebaseGroupebiomarqueurM+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur )

( )MM .exp0 βλλ = SiPvaluesurβM<5%

§ prédictifoupronostique?

Page 6: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

Variablepronostique.

Biomarqueurprédictif=variablequimodifie l’effetdutraitementsurlecritèredejugementdel’étude.

§ prédictifoupronostique?

Page 7: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Variableprédictive(quipeutêtreunbiomarqueur) =variablequiauneffetsurlecritèredejugementdel’étude.

Variablepronostique.

Biomarqueurprédictif=variablequimodifie l’effetdutraitementsurlecritèredejugementdel’étude.

Effetsignificatifdel’interactionentrelebiomarqueur etletraitement.

§ prédictifoupronostique?

Page 8: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Biomarqueurprédictif=variablequimodifie l’effetdutraitementsurlecritèredejugementdel’étude.

Effetsignificatifdel’interactionentrelebiomarqueur etletraitement.

ModèledeCox:GroupebiomarqueurM- ettraitementderéférenceT-:

Risqueinstantané=RisquedebaseGroupebiomarqueurM- ettraitementétudiéT+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effettraitement)GroupebiomarqueurM+ettraitementderéférenceT- :

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur )GroupebiomarqueurM+ettraitementétudiéT+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur +effettraitement+effetinteraction)

§ prédictifoupronostique?

Page 9: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Biomarqueurprédictif=variablequimodifie l’effetdutraitementsurlecritèredejugementdel’étude.

Effetsignificatifdel’interactionentrelebiomarqueur etletraitement.

ModèledeCox:GroupebiomarqueurM- ettraitementderéférenceT-:

Risqueinstantané=RisquedebaseGroupebiomarqueurM- ettraitementétudiéT+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effettraitement)GroupebiomarqueurM+ettraitementderéférenceT- :

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur )GroupebiomarqueurM+ettraitementétudiéT+:

Risqueinstantané=Risquedebase× exp(effetbiomarqueur +effettraitement+effetinteraction)

( )TMTM MTTM ....exp0 βββλλ ++= SiPvaluesurβMT<5%

§ prédictifoupronostique?

Page 10: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

§ prédictifoupronostique?

Page 11: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

§ prédictifoupronostique?

Page 12: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Mêmeécart,danslemêmesens

Cetécartn’estpasnégligeable⇒ effettraitement

§ prédictifoupronostique?

Page 13: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

§ prédictifoupronostique?

Page 14: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

§ prédictifoupronostique?

Page 15: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

Ecartdifférent

§ prédictifoupronostique?

Page 16: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

Ecartdifférent

Effettraitementseulementdanslegroupebiomarqueur+

§ prédictifoupronostique?

Page 17: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

§ prédictifoupronostique?

Page 18: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

§ prédictifoupronostique?

Page 19: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

biomarqueur« pronostique »uniquementdanslegroupetraitementétudié…

§ prédictifoupronostique?

Page 20: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

Page 21: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

biomarqueur« pronostique »uniquementdanslegroupetraitementétudié…

biomarqueurpronostiquequelquesoitlegroupedetraitement

Page 22: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

Biomarqueur - :HRtraitement = 0.78 [0.57;1.07]Log-rank P = 0.12Biomarqueur + :HRtraitement = 0.42 [0.30;0.60]Log-rank P = 7.3 10-7

Ecartdifférent

Effettraitementseulementdanslegroupebiomarqueur+

Page 23: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Compléments

Modèle traitement et biomarqueursans interaction :HRtraitement = 0.72 [0.57;0.91]HRbiomarqueur = 0.48 [0.38;0.62]

Analyse en sous-groupe :Biomarqueur - :HRtraitement = 0.88 [0.64;1.21]Log-rank P = 0.42Biomarqueur + :HRtraitement = 0.40 [0.28;0.57]Log-rank P = 1.3 10-7

Biomarqueur - :HRtraitement = 0.78 [0.57;1.07]Log-rank P = 0.12Biomarqueur + :HRtraitement = 0.42 [0.30;0.60]Log-rank P = 7.3 10-7

Page 24: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique

Cequ’ilfautretenir

Biomarqueurpronostique:- effetdubiomarqueur- modèleavecfacteurbiomarqueur(enprésenceounonfacteurtraitement)- coefficientassociéaubiomarqueur significativementdifférentde0

Biomarqueurprédictif:- différenced’effetdutraitemententrelesmodalitésdubiomarqueur- modèleavecfacteurtraitementetfacteurbiomarqueuretleurinteraction- coefficientassociéàl’interaction significativementdifférentde0- différenced’effetdubiomarqueurdanslesgroupestraitement(prouvéeuniquementainsi)quipeutfaireenvisageruneétudepronostiqueensous-groupes*

*Box1.SubgroupsandInteractions.REMARK:explanationandelaboration.Altmanetal.PLoSMed.2012

PourallerplusloinGoshoMetal.Studydesignsandstatisticalanalysesforbiomarkerresearch.Sensors(Basel).2012.BallmanKV. Biomarker:PredictiveorPrognostic?JClinOncol.2015SimonR.Theuseofgenomicsinclinicaltrialdesign.ClinCancerRes.2008LiuYetal.Testingfortreatment-biomarkerinteractionbasedonlocalpartial-likelihood.StatMed.2015

§ prédictifoupronostique?

Page 25: Un vocabulaire spécifique à utiliser à bon escient pour la ......Audrey LAVENU, Maître de conférences en biostatistique. Laboratoire de pharmacologie expérimentale et clinique