Travaux pratiques de mycologie Veronica RODRIGUEZ-NAVA – Aymeric MENARD – Frédéric LAURENT Patrick BOIRON Laboratoire de Mycologie Faculté de Pharmacie,

Travaux pratiques de mycologie

Veronica RODRIGUEZ-NAVA – Aymeric MENARD – Frédéric LAURENT

Patrick BOIRON

Laboratoire de MycologieFaculté de Pharmacie, Lyon, France

Classification

Spores

Asexuée Sexuée

Endospores

Conidies

ZygosporesZygomycètes

AscosporesAscomycètes

BasidiosporesBasidiomycètesDeutéromycètes

Champignons inférieurs

Classe des Zygomycètes

Les Zygomycètes

• Les champignons de la Classe des Zygomycètes sont caractérisés par :

• Un mycélium non cloisonné (= siphonné = cœnocytique)

• Une multiplication asexuée par endospores : sporocystospores

• Une reproduction sexuée : zygospore

Intérêts des Zygomycètes

• Moisissures communes : agents de pourritures et d’altérations alimentaires (Mucor, Absidia, Rhizopus, Rhizomucor, …)

• Mycoses humaines, peu fréquentes mais graves : mucormycoses (Rhizopus, …)

• Industries agro-alimentaires :

• Fermentation de l’amidon en anaérobiose : alcool de riz, de pomme de terre, … (choum choum, whiskys, vodkas, schnaps, …)

• Affinage de certains fromages (Cantal), galettes de soja (Tempeh)

• Industries chimiques et pharmaceutiques :

• Production d’acides aminés, acide lactique, présure, vitamine A, …

• Bioconversion des stéroïdes

Absidia glauca

Sporocystophore

Sporocyste

Columelle

Apophyse

Aspect macroscopique

Mucor

Absidia

Zygorhynchus heterogamus

Suspenseurs

Les Rhizopus (non vu en TP)

Les Rhizopus (non vu en TP)

• Cosmopolites et ubiquitaires

• Environ 12 espèces de Rhizopus

• Allergies de type I et III

• Mycoses : mucormycoses

• Industries agro-alimentaires (fromages, fermentations diverses), chimiques (alcool, acides organiques) et papetières

Les Mucor (non vu en TP)

Les Mucor (non vu en TP)

• Cosmopolites et ubiquitaires

• Environ 50 espèces de Mucor

• Allergies de type I et III

• Mycoses (rares) : mucormycoses

• Industries agro-alimentaires (fromages)

Champignons supérieurs

Classe des Ascomycètes

Les Ascomycètes

• Les champignons de la Classe des Ascomycètes sont caractérisés par :

• Un mycélium cloisonné (= septé = articulé)

• Une multiplication asexuée par conidies : modes de conidiogénèse très variés

• Une reproduction sexuée : ascospores dans les asques

Intérêts des Aspergillacées

Les Aspergillus

• Moisissures très communes : bois, pain, confiture, fruits, …

• Biodétérioration : textiles, papiers, cuirs, matières plastiques, matériels électroniques et optiques, …

• Mycotoxicoses : aflatoxines, ochratoxine, …

• Mycoses souvent graves : API, aspergillome, ABPA, AAE, …

• Industrie chimique : acides (citrique, gluconique, oxalique, fumarique, gallique, …), dextranes, amylases, …

Les Penicillium

• Industries agro-alimentaires : affinage de fromages (roqueforts, bleus, camemberts, …)

• Pourriture des fruits : agrumes, pommes

• Mycotoxicose : patuline

• Industrie pharmaceutique : antibiotique (pénicilline), antifongique (griséofulvine)

• Industrie chimique : acide citrique, …

• Mycose tropicale : pénicilliose à Penicillium marneffei

Aspects macroscopiques

Aspergillus flavus

Vésicule

Phialides

Conidiophore (stipe)

Phialoconidies

Métules

Aspérités

Aspergillus ochraceus

Zones concentriques

Aspergillus niger (non vu en TP)

Aspergillus versicolor (non vu en TP)

Penicillium frequentans

Phialides

Conidiophore (stipe)

Phialoconidies

Complexité du conidiophore

Complexité du conidiophore

Penicillium

Chaetomium globosum

Asques

Ascocarpe : périthèce

Ascospores

Les Chaetomium

• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

• Environ 80 espèces de Chaetomium

• Intérêt industriel : production de cellulase

• Mycotoxines : chaetomine, sterigmatocystine chez quelques espèces de Chaetomium, chaetoglobosines chez Chaetomium globosum

• Mycoses (rares) : onychomycose

• Allergie de type I ?

• Phytopathogènes

Champignons supérieurs

« Classe » des Deutéromycètes

Aspergillus fumigatus (non vu en TP)

Aspergillus fumigatus

• Un des 3 principaux agents responsables de mycoses profondes (avec Candida albicans et Cryptococcus neoformans)

• Responsable de 95 % des aspergilloses, notamment de l’aspergillose pulmonaire invasive (API), mais également d’aspergilloses allergiques (ABPA, AAE)

Fusarium oxysporum

Les Fusarium

• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

• 50 à 70 espèces de Fusarium

• Phytopathogènes

• Mycotoxines : trichothécènes, toxine T-2, zéaralénone (= toxine F-2), vomitoxine, déoxynivalénol, fumonisine, …

• Mycoses graves (kératites, endophthalmies, onychomycoses, mycétomes), notamment chez les patients immunodéprimés (fusariose profonde, résistante aux antifongiques) et chez les grands brûlés

• Allergies de type I

• Intérêt vétérinaire : zéaralénone (stimulant de croissance animale, anabolisant, contraception)

Alternaria alternata

Les Alternaria

• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

• 40 à 50 espèces d’Alternaria

• Phytopathogènes

• Allergies de type I et III

• Mycoses (rares) : lésions sous-cutanées, onychomycoses

• Mycotoxines : alternariol, alternariol monométhylether (AME), acide tenuazonic, altertoxines (mutagénique)

Stemphylium botryosum

Les Stemphylium

• Cosmopolites et ubiquitaires

• 6 espèces de Stemphylium

• Phytopathogènes

• Allergies de type I

• Mycoses (très rares) : sinusites

Cladosporium herbarum

Les Cladosporium• Cosmopolites et ubiquitaires, extrêmement

communs

• 28 à 40 espèces de Cladosporium

• Phytopathogènes

• Allergies de type I et III

• Mycoses tropicales : chromoblastomycoses ( Cladiophialophora carrionii, C. bantiana)

• Mycotoxines : cladosporine, émodine (toxicité ?)

• Intérêt pharmaceutique : bioconversion de précurseurs stéroïdiens en progestérone et pregnenolone

Aureobasidium pullulans

Les Aureobasidium

• Cosmopolites et ubiquitaires

• 15 espèces d’Aureobasidium

• Phytopathogènes

• Allergies de types I et III

• Mycoses (rares) : lésions cutanées, kératites, abcès splénique

• Intérêt industriel (préparation de textiles) et agro-alimentaire (pullulane : polysaccharide biodégradable, utilisé pour la protection d’aliments)

Anthracnose

Scopulariopsis brevicaulis

Les Scopulariopsis

• Mycoses (rares) : onychomycoses, lésions cutanées, mycétomes, sinusites, kératites, …

• Arsine (gaz mortel) à partir de l’arsenate des colorants de papiers muraux (historique)

Trichothecium roseum

Les Trichothecium

• 2 ou 3 espèces de Trichothecium ?

• Phytopathogène

• Mycotoxines : trichothécine (toxicité ?)

• Parasite de macromycètes

Nodule noirdu prunier