TAXONOMÍA FÚNGICA - fbioyf.unr.edu.ar · Eubacteria Archaebacteria Eukaryotes DOMINIOS 1990 (Woese) Bacteria Archaea Eukarya. Cladograma simplificado donde se muestra la filogenia

TAXONOMÍA FÚNGICA

Dra. Alicia Luque

CEREMIC

Sistemática:estudio de la diversidad y las relaciones entre los

distintos grupos de organismos

Taxonomía: estudio de la clasificación, incluyendo reglas, teorías,

principios y procedimientos

Sistemática incluye a la taxonomía, y comprende por lo tanto:

clasificación, nomenclatura, identificación, filogenia.

TAXONOMÍA

Métodos para clasificar las especies en grupos:1. Método fenético: las especies se agrupan según sus atributos fenéticos (fenotípicos). Es una clasificación no evolutiva.2. Método filogenético: es evolutivo, se clasifican sólo las entidades que tienen relaciones evolutivas. Se clasifican las especies según cuanto tiempo hace que han compartido un ancestro común.

Dificultades en la clasificación de los hongos:-Pleomorfismo:

TeleomorfoAnamorfo (Sinanamorfo)

Holomorfo

Nomenclatura

Graphium eumorphum

Scedosporium apiospermum

Pseudallescheria boydii

SUFIJOS DIFERENCIALES:

FILO -mycota

SUBFILO -mycotina

CLASE -mycetes

SUBCLASE -mycetidae

ORDEN -ales

SUBORDEN -ineae

FAMILIA -aceae

SUFAMILIA -oideae

División: Ascomycota

Clase: Endomycetes

Orden: Onygenales

Familia: Onygenaceae

Género: Ajellomyces

Especie: A. capsulatus

Estado anamórfico: Histoplasma capsulatum

Nomenclatura

H. capsulatum var. capsulatumH. capsulatum var. duboisiiH. capsulatum var. farciminosum

Variedades, patotipos, formas, razas, etc.

Categorías taxonómicasrangos o taxones

NomenclaturaCódigo internacional de nomenclatura de algas hongos y

plantas ( antes CINB) Código de Melburne, 2012

El nombre de especie es binomial. Ej: Histoplasma capsulatum.

En publicaciones científicas se agrega en nombre del autor que introdujo el nombre. Ej: Histoplasma capsulatum Darling.

Cada especie está estandarizada por su primera descripción, que se hace en latín o en inglés, se aceptan publicaciones electrónicas. Una muestra de la misma debe estar depositada en una Colección de Cultivos para estudios comparativos: especimen tipo.

Se debe respetar el principio de prioridad: si se proponen varios nombres para una misma especie en distintas publicaciones, el más antiguo (siempre que sea correcto, claro) es el válido. Este principio de prioridad puede ser dejado de lado en el caso de ciertos nombres de uso amplio, cuya eliminación podría crear confusión.

El nombre científico de un hongo puede cambiar, si hay razones para ello. Por ej. un especialista realiza la revisión de toda una familia de hongos, y decide que algunos géneros no son válidos, por lo que las especies han de redistribuirse en nuevos géneros. Como consecuencia, una misma especie, además del nombre válido, puede exhibir toda una cohorte de sinónimos.

Nomenclatura

Código internacional de nomenclatura de algas, hongos y plantas ( antes CINB) Código de Melburne, 2012

Un hongo = un nombre

Hasta la fecha, existían un par de lagunas en las cualesuna misma especie podía recibir dos o tres nombresdistintos. Una de ellas eran las distintas formas (anamorfoy teleomorfo) que pueden presentar los hongos en funciónde su reproducción, a menudo difícilmentecorrelacionables. Este escollo cada vez es más fácil desalvar gracias a la genética.

Debe prevalecer el primer nombre válido independientementede que sea el anamorfo o el teleomorfo

DIVISIONES PRIMARIAS DE LA VIDA

REINOS

1869 Plantas Animales

1956

(Copeland)

Plantas Animales Protistas Bacterias

1969

(Whittaker)

Monera Protista Fungi Plantae Animalia

1987

(Woese)

Eubacteria Archaebacteria Eukaryotes

DOMINIOS

1990

(Woese)

Bacteria Archaea Eukarya

Cladograma simplificado donde se muestra la filogenia de los seres vivos. Los grupos fúngicos se resaltan en rojo.

Los hongos forman un grupo monofilético, loque significa que todas las variedades dehongos provienen de un ancestro común.El origen monofilético de los hongos se haconfirmado mediante múltiples experimentosde filogenética molecular; los rasgos ancestralesque comparten incluyen la pared celularquitinosa y la heterotrofía por absorción, asícomo otras características compartidas.

Filogenia fúngica

REINO FUNGI: hongos verdaderos

Antes

REINO FUNGI

Supergrupo: OPISTOCONTOS

Ciclo de vida del hongo acuático Allomyces macrogynus

REINO FUNGI

DOMINIO EUKARYA

Filo Blastocladiomycota

Orden Blastocladiales

Tradicional Chytridiomycota

El filo Zygomycota no es monofilético.Las endomicorrizas V-A ya no se incluyen aquí, sino en el filo Glomeromycota.

Actualmente se distinguen 4 subfilos dentro del filo tradicionalmente conocido como Zygomycota:

Subfilo Mucoromycotina

Subfilo Kickxellomycotina

Subfilo Entomophthoromycotina

Subfilo Zoopagomycotina

Ciclo de vida del hongo del pan Rhizopus stolonifer

REINO FUNGI

DOMINIO EUKARYA

Subfilo Mucoromycotina

Orden Mucorales

• saprófitos en su mayoría • importancia económica, síntesis de productos industriales:Rhizopus stolonifer (=R. nigricans), fabricación de ácido fumárico, y en la elaboración de cortisonaR. oryzae, producción de alcohol Rhizopus sp., producción de ácidos láctico, cítrico, succínico, oxálico, etc.parásitos débiles sobre frutos • causantes de infecciones oportunistas en pacientes inmunocomprometidosAgentes: Rhizopus, Mucor, Absidia, Cunninghamella.• producen deterioro de semillas, hongos de almacenaje, Rhizopus, Mucor.

Subfilo Mucoromycotina

No hay diferencia de nomenclatura entre anamorfo y teleomorfo

Supergrupo: OPISTOCONTOS

Filo Glomeromycota

A este filo, con una única clase (Glomeromycetes), pertenecen los hongos

MVA (micorrizas vesículo-arbusculares, el tipo más extendido de

endomicorrizas).

Las MVA forman los arbúsculos, dentro de las células del córtex radical pormedio de los arbúsculos se realiza la transferencia de nutrientes entre los dossimbiontes. Las MVA se dan en más del 80% de las especies de vegetalessuperiores.

Fotografía de arbúsculos en el interior de células de raíz

(Subreino)

Reino Fungi

Filo Ascomycota

El primer grupo en diferenciarse fue el de los Archiascomycetes,hoy incluidos en el subfilo Taphrinomycotina. En éste hayfitoparásitos como Taphrina, parásitos humanos comoPneumocystis, etc.El resto de ascomicetos se escindió en dos grandes grupos : laslevaduras típicas (Saccharomycotina) y los ascomicetosfilamentosos (Pezizomycotina).

Ciclo de vida de un ascomicete.

REINO FUNGI

DOMINIO EUKARYA

SUBREINO DIKARYA

Filo Ascomycota

Orden Onygenales

Histoplasma capsulatum

Ajellomyces capsulatus

Gimnotecio

Ascosporas

Otros Ascomicetes de importancia clínica: Arthroderma (dermatofitos), Pseudallescheria boydii. Teleomorfos de Candida, Aspergillus, Penicillium.

Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides spp.

Histoplasmosis

Filo Ascomycota

Pezizomycotina

Fusarium tucumaniaeSMS (Síndrome de la muerte súbita de la soja)

Filo Ascomycota Pezizomycotina Orden Hypocreales

Pucciniomycotina (antes Urediniomycetes =Teliomycetes): las royas y hongos afines.

Ustilaginomycotina (antes Ustilaginomycetes =Ustomycetes): los carbones y afines.

Agaricomycotina (antes Basidiomycetes =Hymenomycetes): son los basidiomicetos en sentido estricto, como setas.

Existen otros taxones minoritarios

Filo Basidiomycota

Subfilos

Ciclo de vida de un basidiomicete.

REINO FUNGI

DOMINIO EUKARYA

SUBREINO DIKARYA

Filo Basidiomycota

Filo Basidiomycota

Cyptococcus neoformans Filobasidiella neoformans(basidios y basidiosporas)

Otros Basidiomicetes de importancia clínica: Malassezia, Trichosporom y Rhodotorula.

Agaricomycotina

Tremellomycetes

HONGOS MITOSPÓRICOS(Deuteromicotina, Deuteromicetes, Fungi

Imperfecti, hongos asexuales)

A muchos hongos mitospóricos no se les conoce el teleomorfo

Algunos hongos han perdido la habilidad de reproducirsesexualmente

Algunos hongos pueden reproducirse sexualmente sólo raramente, y bajo muy definidas condiciones

Los ciclos de vida de muchos hongos son desconocidoso poco conocidos

HONGOS MITOSPÓRICOS(Deuteromicotina, Deuteromicetes, Fungi

Imperfecti, hongos asexuales)

Hifomicetes: formas miceliares con conidios sobre hifas Separadas o en agregados.

Agonomicetes: (Mycelia sterilia) formas miceliares

estériles, pueden producir clamidoconidios, esclerotes.

Coelomicetes: producen conidios en cuerpos fructíferos(picnidios y acérvula).

Blastomicetes: levaduras anamórficas.

Sistemas de clasificación de levaduras1.- Morfología : crecimiento en varios medios de cultivo.

Blastomiceteslevaduras anamórficas

2.- Características fisiológicas:.- asimilación y fermentación de fuentes de carbono y nitrógeno.- crecimiento a diferentes temperaturas.- producción de ácido de glucosa.- producción de almidón.- hidrólisis de urea.- actividad lipolítica.- resistencia a cicloheximida.- tolerancia a ácido acético.- liquefacción de la gelatinaEstos estudios han sido utilizados para elaborar claves de identificación que nos permiten clasificar las especies de los diferentes géneros de levaduras.

ID 32 C

Criterios de clasificación en el género Candida

1.- Reproducción vegetativa: gemación multilateral, células globosas, elipsoidales o cilíndricas, y ocasionalmente ojivales, triangulares o en forma de media luna. Pueden existir pseudomicelio y micelio verdadero. No se forman artroconidios. Se puede observar película en cultivo líquido2.- Fisiología: pueden fermentar azúcares. Los nitratos pueden ser asimilados. No se producen compuestos amiloideos extracelulares. Algunas especies pueden asimilar inositol. Ureasa negativas. Pueden degradar la gelatina.En la actualidad hay descritas 163 especies pertenecientes al género Candida. Para simplificar las claves de identificación, el género esta dividido en 12 grupos fisiológicos que abarcan a las especies. Dentro de cada grupo fisiológico hay una clave para la identificación de las diferentes especies.La especie Candida albicans, junto a otras especies del génerocausan infecciones en humanos. Candidiasis

Clave dicotómica

Agonomicetes: (Mycelia sterilia)

Rhizoctonia

Sclerotium

Coelomicetes: producen conidios en cuerpos fructíferos.

PicnidiosPhoma spp.AcérvulaColletotrichum spp.

Sistemas de clasificación de hongos filamentosos

1.- Caracteres morfológicos macroscópicos: apariencia de la colonia cuando crece en diferentes medios de cultivo y temperaturas.- tamaño de la colonia, diámetro.- textura, lanosa, flocosa, granulosa, etc.- color, escala de colores.- presencia de surcos.- exudado.- producción de pigmento, etc...2.- Caracteres morfológicos microscópicos: .- estructuras reproductoras asexuales: conidios, artrosporas, clamidosporas, etc....- micelio: hifas gruesas, no septadas o con pocos septos (Zygomycetos), hifas con brazos (clamp connections) (Basidiomicetos), hifas delgadas, muy septadas, etc.Estos estudios han sido utilizados para elaborar claves de identificación que nos permiten clasificar las especies de los diferentes géneros de hongos filamentosos.

Hifomicetes

Criterios de clasificación en el género Fusarium

Las características macroscópicas más evidentes en Fusarium son:1.- Crecimiento generalmente rápido.2.- Colores pálidos o brillantes.3.- Colonias con micelio aéreo flocoso o lanoso.

Criterios de clasificación en el género Fusarium

Las características microscópicas más relevantes para la identificación de especies del género Fusarium son:1.- Esporodoquio: masa algodonosa constituida por conidioforos de escaso tamaño que crecen directamente sobre el medio de cultivo.2.- Conidióforo: Hifa fértil simple o ramificada, que lleva células conidiógenas.3.- Célula conidiógena: Célula de la cual se produce directamente el conidio.4.- Fiálide: Célula conidiógena, que suele tener forma de botella, y que puede desarrollar uno (monofiálide) o más (polifiálide) extremos abiertos a partir de los cuales se producen los conidios, aunque sin incrementar la longitud de la fiálide misma.5.- Locus: Sitio en la célula conidiógena donde nace el conidio.6.- Conidio: Estructura asexual inmóvil de propagación, nunca encerrada en una estructura en forma de saco. Hay varios tipos: macroconidios, mesoconidios y microconidios.7.- Clamidosporas: Esporas asexuales que presentan una pared gruesa. Se originan por la modificación de un segmento de la hifa. Su función, mas que de propagación, es la de supervivencia durante largo tiempo.A partir de estas características se puede elaborar una clave que nos diferencia las especies del género.

Características morfológicas microscópicas del género Fusarium.

Clave dicotómica

Fusarium solani

Fusarium oxysporum

Fusarium verticillioides

Clave sinóptica

LOS CRITERIOS DE CLASIFICACIÓN SON:

•Caracteres Morfológicos

•Bioquímicos •Fisiológicos•Hábitat•Hospederos •Localización en hospedero •Efecto sobre el hospedero •Fases de su ciclo •Ecología•Caracterización molecular (proteínas, ácidos nucleicos)