Top Banner
SYBR Green miRNA 荧荧荧荧 PCR
16

SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

Jan 11, 2016

Download

Documents

Jamie Dowell

SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR. microRNA(miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为 22 个核苷酸的非编码单链 RNA 分子 , 它们在动植物中参与转录后基因表达调控。. miRNA 简介. miRNA 形成过程. 前体. 成熟体. 加尾法定量 PCR(QIAGEN) 茎环法定量 PCR(RIBO). SYBR 荧光定量检测 miRNA. 加尾法原理. 茎环法原理. 两种方法的比较. rno-miR-34b. 茎环法. 加尾法. hsa-miR-99a. 茎环法. 加尾法. - PowerPoint PPT Presentation
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

SYBR Green miRNA荧光定量 PCR

Page 2: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

miRNA 简介

microRNA(miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为 22 个核苷酸的非编码单链RNA 分子 , 它们在动植物中参与转录后基因表达调控。

Page 3: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

miRNA 形成过程

Page 4: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

前体

Page 5: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

成熟体

Page 6: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

SYBR 荧光定量检测 miRNA

• 加尾法定量 PCR(QIAGEN)

• 茎环法定量 PCR(RIBO)

Page 7: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

加尾法原理

Page 8: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

茎环法原理

Page 9: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

两种方法的比较 加尾法 茎环法

逆转录 一次逆转录得到全部miRNA 、 pre-miRNA和 mRNA 的 cDNA ,操作简单,但是没有选择性

特异的茎环结构逆转录引物,每条 miRNA单独逆转录,特异性好,但是成本更高,工作繁琐

PCR 特异性 检测 mature miRNA的同时,也会检测到 pre-miRNA

特异性检测 mature miRNA ,可以避开 pre-miRNA

Page 10: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR
Page 11: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR
Page 12: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

加尾法 茎环法

rno-miR-34b

Page 13: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

加尾法 茎环法

hsa-miR-99a

Page 14: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

hsa-miR-99a 表达量比较

Sample 加尾法表达量 茎环法表达量

1 1.00 1.00

2 1.05 0.91

3 0.64 0.77

Page 15: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

策略1. 根据我们的经验,大部分样品中 pre-miRN

A 含量很低甚至没有,可以采用 QIAGEN加尾法进行 miRNA 的定量 PCR 检测。

2.PCR 特异性都很好的时候,两种方法得到的相对表达量一致。

3. 对于加尾法预实验有非特异性扩增的样品,采用 RIBO 茎环法进行检测。

Page 16: SYBR Green miRNA 荧光定量 PCR

谢 谢!