Subtipificación Molecular para la Vigilancia de Shigella Shigella spp. spp. en Argentina Avances y Metas 2006-2008 23 al 25 de octubre 2007 23 al 25 de octubre 2007 Mariana Pichel Angela Salve María Rosa Viñas Departamento Bacteriología Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas – ANLIS “Carlos G. Malbrán”
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Subtipificación Molecular para la Vigilancia de Shigella Shigella spp.spp.
en ArgentinaAvances y Metas 2006-2008
23 al 25 de octubre 200723 al 25 de octubre 2007 Mariana PichelAngela SalveMaría Rosa Viñas
Departamento BacteriologíaInstituto Nacional de Enfermedades Infecciosas – ANLIS “Carlos G. Malbrán”
Actividades Desarrolladas Implementación del protocolo estandarizado de PFGE de la Red PulseNet -CDC para Shigella sonnei (Certificación, 2006 y Prueba de Competencia, 2007). Protocolo aplicable también a aislamientos de S.boydii .
Criterios de selección :-S. sonnei: se seleccionaron aislamientos, considerando la inclusión de cepas de diferentes lugares y tiempos de aislamiento y todos aquellos relacionados a sospecha de brote.- S. boydii: estudio de dos brotes y de aislamientos esporádicos
Creación de la Base de Datos Nacional
ShigellaShigella spp. spp.
Base de Datos Nacional (2002 - 2007Base de Datos Nacional (2002 - 2007))
Especies Especies
dede
ShigellaShigella
Nº de aislamientosNº de aislamientos
Periodo 2002 -2007Periodo 2002 -2007
Nº de patrones Nº de patrones de de XbaXbaI-PFGE/I-PFGE/
Nº Nº aislamientosaislamientos
Nº de patrones Nº de patrones de de BlnBlnI-PFGE/I-PFGE/
Nº Nº aislamientosaislamientos
S.sonneiS.sonnei
S.boydiiS.boydii
223223
2525
124 /223124 /223
13 /25 13 /25 (10 patrones de 15 (10 patrones de 15
aislamientos aislamientos esporádicos)esporádicos)
12 /40 *12 /40 *
3 /10 **3 /10 **
* S.sonnei: 40 aislamientos correspondientes a 6 brotes
** S.boydii: 10 aislamientos correspondientes a 2 brotes, que mostraron 3 patrones de XbaI-PFGE y BlnI-PFGE
Brotes y clusters 2006 – 2007 analizados por XbaI-PFGE y BlnI-PFGE
FechaFecha EspecieEspecie ProvinciaProvincia Tipo de broteTipo de brote Nºaisl.Nºaisl. Nº patronesNº patrones
con con XbaXbaI-PFGEI-PFGE
Abril 2006Abril 2006 S. sonneiS. sonnei Entre RíosEntre Ríos Comunitario sin Comunitario sin confirmaciónconfirmación
1414 2 perfiles relacionados2 perfiles relacionados
Enero 2007Enero 2007 S. sonneiS. sonnei La PampaLa Pampa Comunitario sin Comunitario sin confirmaciónconfirmación
2020 4 perfiles relacionados 4 perfiles relacionados (17aisl.)y 3 no (17aisl.)y 3 no relacionados.relacionados.
Brotes confirmados por el laboratorio y epidemiología
FechaFecha Especie y Especie y serotiposerotipo
ProvinciaProvincia Tipo de broteTipo de brote NºaislNºaisl Nº patronesNº patrones
con con XbaXbaI-PFGEI-PFGE
Abril 2006Abril 2006 S. boydii 4S. boydii 4 MendozaMendoza ComunitarioComunitario
(Comedor universitario) (Comedor universitario)
33 11
Marzo 2007Marzo 2007 S. sonneiS. sonnei San LuisSan Luis FamiliarFamiliar 22 11
Enero 2007Enero 2007 S. boydii 2S. boydii 2 NeuquénNeuquén ComunitarioComunitario
(Viaje de egresados)(Viaje de egresados)
77 22
Detección de “clusters” identificado por el laboratorio y sin confirmación epidemiológica
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-XbaI
100
90
80
PFGE-XbaI
SB108/07
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SB1310/06
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SB357/06
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SB680/05
SB2249/05
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Neuquén
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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamiento
1er Brote
2do Brote
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-XbaI
100
90
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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamiento
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-XbaI
100
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PFGE-XbaI
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SB1679/05
SB719/06
SB1310/06
SB959/05
SB916/06
SB986/06
SB987/06
SB988/06
SB357/06
SB414/06
SB680/05
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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamiento
1er Brote
2do Brote
Dendrograma de relación genética de Shigella boydii XbaI-PFGE
Mar del Plata
2
5
3
4
6
7
NeuquénMar del Plata
2
5
3
4
6
7
Neuquén
Dice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-BlnI
100
959085
PFGE-BlnI
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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamiento
1er Brote
2do Brote
Dice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-BlnI
100
959085
PFGE-BlnI
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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamientoDice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
PFGE-BlnI
100
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Shigella boydii 2
Nª de cepa/ Lugar de Serotipo
año aislamiento
1er Brote
2do Brote
Dendrograma de relación genética de Shigella boydii por BlnI-PFGE.
METAS 2008METAS 2008
Incorporar la aplicación de PFGE en forma activa en la vigilancia de Shigella spp . en Argentina.
Asignación de patrones en la Base de Datos Nacional e ingreso de patrones y datos de aislamientos humanos a la Base de Datos Regional en tiempo real (aislamientos 2006-2007).
Participar del control de calidad anual para Shigella sonnei mediante la prueba de competencia para la realización de geles y análisis remitida por el CDC, USA
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