Biologische Systeme: Einzeller & multizelluläre Organismen (Pro- und eukaryotische Mikroorganismen bis zu Höheren Pflanzen) Zelluläre Ebene – Organellen & Zellkompartimente Molekülverbände & Einzelmoleküle Bioanalytik – Nukleinsäure- und Proteinanalysen Nutzung von Experimentalsystemen der Pflanzenwissenschaften, um komplexe organismische und zelluläre Leistungen zu verstehen. Stichworte: Komplexität der Genregulation, Signaltransduktionswege, Struktur & Funktion von Proteinkomplexen, Molekulare Physiologie, ´Metabolic Engineering´, Einsatz molekulargenetischer Erkenntnisse in biotechnologischen Verfahren SP Molekulare Biologie & Biotechnologie der Pflanzen & Mikroorganismen
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Biologische Systeme:
Einzeller & multizelluläre Organismen (Pro- und eukaryotische Mikroorganismen bis zu Höheren Pflanzen)
Zelluläre Ebene – Organellen & Zellkompartimente
Molekülverbände & Einzelmoleküle Bioanalytik – Nukleinsäure- und Proteinanalysen
Nutzung von Experimentalsystemen der Pflanzenwissenschaften, um komplexe organismische und zelluläre Leistungen zu verstehen. Stichworte: Komplexität der Genregulation, Signaltransduktionswege, Struktur & Funktion von Proteinkomplexen, Molekulare Physiologie, ´Metabolic Engineering´, Einsatz molekulargenetischer Erkenntnisse in biotechnologischen Verfahren
SP Molekulare Biologie & Biotechnologie der Pflanzen & Mikroorganismen
Mit dem Schwerpunkt assoziiert : Christian Doppler Labor für "Biotechnologie der Pilze"
Protein Research Department
Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt (Grünalgen in modularen Lebenserhaltungssystemen)
EU-Projekt "CyanoFactory" (Solar biofuel production with (photo)synthetic cell factories)
Mehrere nationale Verbundvorhaben (Membranproteomics; Biowasserstoffproduktion; Mitochondriale Netzwerke von Signalwegen bei der Alterung & der Lebensspannenkontrolle)
SP Molekulare Botanik & Mikrobiologie
Methoden: • Experimentalsysteme:
Bakterien, Algen, Hefen & Hyphenpilze
• Mikrobiologische Grundtechniken: Steriles Arbeiten, Optimierung von Anzuchtmedien
• Molekulargenetische Techniken: Herstellung und Analyse transgener Algen und Pilze à Funktionsanalyse von Genen
• Biochemische Techniken: Isolation und Charakterisierung von Multiproteinkomplexen
• à Kenntnis von zellulären Signaltransduktionsnetzwerken
• „Functional Genomics“: Genomics, Transcriptomics, Proteomics à Parallelanalyse der Genexpression
• Zellbiologische Techniken: Fluoreszenzmikroskopie à Kenntnis zelldynamischer Prozesse
Lehrstuhl für Allgemeine & Molekulare Botanik Prof. Dr. Ulrich Kück http://www.ruhr-uni-bochum.de/allgbotanik/ Projekte : Molekulare Entwicklungsbiologie von Algen und Pilzen
SP Molekulare Botanik & Mikrobiologie
Christian Doppler Labor für "Biotechnologie der Pilze" http://www.ruhr-uni-bochum.de/cd-labor/
• Steuerung Proteintransport zu den versch. Kompartimenten des Chloroplasten (beteiligte Proteine, Energieversorgung, Regulation?) • Transport eines Makromoleküls durch eine "undurchlässige" Membran?
Zentrale Fragestellung : Proteintransport-Mechanismen in Chloroplasten höherer Pflanzen
Methoden: • Molekularbiologische Techniken: PCR, Klonierungen, Southern & Northern Blots etc. • Proteinchemische Techniken: Proteinüberexpression in Bakterien, in vitro Translation von Proteinen; Protein-Protein-Interaktionen • Pflanzenspezifische Techniken: Chloroplastenisolation und Fraktionierung, in vitro Import Assays, Arabidopsis-Mutanten
Lehrstuhl für Pflanzenphysiologie (www.rub.de/Danja Schuenemann/) AG Molekularbiologie pflanzlicher Organellen, Prof. Dr. Schünemann
SP Molekulare Botanik & Mikrobiologie
Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen Prof. Dr. Franz Narberhaus (www.rub.de/mikrobiologie)
• Temperaturmessung durch RNA-Thermometer (Kontrolle der Translation durch Aufschmelzen der Ribosomenbindestelle)
• Kleine regulatorische RNAs in Agrobacterium tumefaciens • Regulierte Proteolyse in E. coli • Phosphatidylcholin bei der symbiontischen & pathogenen
Bakterien-Pflanzen-Interaktion • N2-Fixierung und Molybdän-Stoffwechel im phototrophen
Methoden: Genetik (Mutationen, Reportergen-Fusionen) Biochemie/Strukturbiologie (RNA-Strukturkartierung) Bioinformatik (Suche nach neuen regulatorischen RNAs) Proteomics (Einfluss von Antibiotika)
Wie wirken Antibiotika und technische Plasmen? Charakterisierung von Angriffsorten und Wirkmechanismen, physiologische Auswirkungen, Reaktion der Bakterienzelle
SP Molekulare Botanik & Mikrobiologie
Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen AG Mikrobielle Antibiotikaforschung, Prof. Dr. Julia Bandow
Methoden :
AG Redox Proteomics Prof. Dr. Lars Leichert (www.medizinisches-proteom-center.de)
Funktionelle Metagenomik • Entdeckung neuartiger Enzyme & Biokatalysatoren für die Biotechnologie • Erschliessung der mikrobiologischen Vielfalt
Lehrstuhl für Biochemie der Pflanzen: Prof. Dr. Matthias Rögner (www.bpf.rub.de)
SP Molekulare Botanik & Mikrobiologie
Fragestellungen: 1) Bioenergetik der Photosynthese
• Struktur, Funktion, Biogenese und Regulation von Komponenten der photosynthetischen und respiratorischen Elektronentransportkette der Cyanobakterien (3D Kristallisation; NMR – Coop. Prof. R. Stoll)