Dpto. de Genética, Universidad de Granada http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol Dpto. de Genética Seminarios de Evolución Molecular, 2013 EVOLUCIÓN DEL GENOMA DEL VIRUS DE LA GRIPE Laura Sánchez Maldonado GUIÓN 1º ¿POR QUE ESTUDIAR EL VIRUS DE LA GRIPE? 2º ¿QUE ES LA GRIPE? 3º ESTRUCTURA DEL VIRUS 4º CLASIFICACION 5º ACCION DEL VIRUS Y CICLO REPLICATIVO 6º EVOLUCIÓN DEL VIRUS -Mutaciones y variación de la especificidad -Cambio estructural de la hemaglutinina -Cambio en la actividad biológica -Variaciones antigénicas 7º PANDEMIAS, VIRULENCIA Y PATOGENEIDAD 8º REDES VIRICAS Y PATRONES EVOLUTIVOS REFERENCIAS Cabezas Fernández del Campo, J. A. Nuevos datos acerca del virus causante de la pandemia de gripe de 1918-19 y su relación con los de la gripe aviar. Datos recientes relativos a éstos (*). in Anales de la Real Academia Nacional de Farmacia 71, (2009) Investigación y ciencia abril 2012 / Evolucion vírica en la era genómica <http://www.investigacionyciencia.es/files/7029.pdf Influenza Book | Virology of Human Influenza. at <http://www.influenzareport.com/ir/virol.htm Lamb RA, Krug RM. Orthomyxoviridae: The viruses and their Replication. In: Fields Virology fourth edition, Knipe DM, Howley PM eds, Lippincott, Philadelphia 2001, pp 1487-1531 Naeve, C. W., Hinshaw, V. S. & Webster, R. G. Mutations in the hemagglutinin receptor-binding site can change the biological properties of an influenza virus. Journal of virology 51, 567–569 (1984) Rumschlag-Booms, E. & Rong, L. Influenza A Virus Entry: Implications in Virulence and Future Therapeutics. Advances in Virology 2013, 1–9 (2013)
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Seminarios de Evolución Molecular, 2013 - bioinfo2.ugr.esbioinfo2.ugr.es/PDFsClase/EvolMol/GuionesSeminarios.pdf · 5º Eva mitocondrial. 6º Mecanismos de reparación. - Gredilla
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Dpto. de Genética, Universidad de Granada http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol
Dpto. de Genética
Seminarios de Evolución Molecular, 2013
EVOLUCIÓN DEL GENOMA DEL VIRUS DE LA GRIPE
Laura Sánchez Maldonado
GUIÓN
1º ¿POR QUE ESTUDIAR EL VIRUS DE LA GRIPE?
2º ¿QUE ES LA GRIPE? 3º ESTRUCTURA DEL VIRUS
4º CLASIFICACION
5º ACCION DEL VIRUS Y CICLO REPLICATIVO 6º EVOLUCIÓN DEL VIRUS
-Mutaciones y variación de la especificidad
-Cambio estructural de la hemaglutinina
-Cambio en la actividad biológica -Variaciones antigénicas
7º PANDEMIAS, VIRULENCIA Y PATOGENEIDAD
8º REDES VIRICAS Y PATRONES EVOLUTIVOS
REFERENCIAS
Cabezas Fernández del Campo, J. A. Nuevos datos acerca del virus causante de la pandemia de gripe de 1918-19 y su relación con los de la gripe aviar. Datos recientes relativos a éstos (*). in
Anales de la Real Academia Nacional de Farmacia 71, (2009)
Investigación y ciencia abril 2012 / Evolucion vírica en la era genómica
Naeve, C. W., Hinshaw, V. S. & Webster, R. G. Mutations in the hemagglutinin receptor-binding site can change the biological properties of an influenza virus. Journal of virology 51, 567–569
(1984)
Rumschlag-Booms, E. & Rong, L. Influenza A Virus Entry: Implications in Virulence and Future
Therapeutics. Advances in Virology 2013, 1–9 (2013)
elements and their hosts; Nature, Volumen 12 (2011).
D, C, Hancks., H, H, Kazazian Jr., 2012; Active human retrotransposons:
variation and disease; Elsevier 22:1-13 (2012).
Dpto. de Genética, Universidad de Granada http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol
ADN ancestral y el origen de los humanos modernos
María Isabel Rosa García
1. Modelos hasta “Homo sapiens” actual.
2. ADN ancestral y el origen de los humanos modernos.
3. Diferencia básica entre la sustitución africana y la evolución multirregional.
3.1. Modelo de África.
3.2. Modelo multirregional.
4. Estudio de los genes: ADN mitocondrial.
4.1. Interpretaciones.
4.2. Comparaciones.
5. Aportaciones de “Adcock et. al” .
6. Conclusiones.
BIBLIOGRAFÍA:
Los artículos siguientes:
1. Ancient DNA and the origin of modern humans.
2. The influence of habitats on female mobility in Central and Western Africa
inferred from human mitochondrial variation. Autores: Valeria Montano,
Verónica Marcari, Mariano Pavanello, Okorie Anyaele, David Comas,
Giovanni Destro-Bisol y Chiara Batini. BMC EVOLUTIONARY
BIOLOGY, 2013.
3. An African American paternal lineage adds an extremely ancient root to the
human Y chromosome phylogenetic tree. Autores: Fernando L. Mendez,
Thomas Krahn, Bonnie Scharck, astrid-Maria Krahn, Krishna R. Veeramah,
August E. Woemer, Forka Leypey Mathew Fomine, Neil Bradman, Mark G.
Thomas, Tatiana M. Karafet y Michael F. Hammer. THE AMERICAN
JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2013.
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Migraciones Humanas Javier López-Ibáñez Infante
1.-Introducción: Importancia del estudio de las migraciones
2.-Estrategias para el estudio de las rutas migratorias
2.1-Concepto Reloj Molecular
2.2-Polimorfismos (tanto genotípicos como fenotípicos)
2.3-El ARN mitocondrial y su utilidad para el estudio de movimientos migratorios
3.-Búsqueda de la “Eva” mitocondrial
4.-Grandes migraciones a lo largo de la historia
BIBLIOGRAFÍA:
1. Ebenesersdóttir, S. S. et al. A new subclade of mtDNA haplogroup C1 found in
icelanders: Evidence of pre-columbian contact? American Journal of Physical
Anthropology 144, 92–99 (2011).
2. Cruciani, F. et al. A Revised Root for the Human Y Chromosomal Phylogenetic Tree:
The Origin of Patrilineal Diversity in Africa. The American Journal of Human Genetics
88, 814–818 (2011).
3. Soares, P. et al. Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial
Molecular Clock. The American Journal of Human Genetics 84, 740–759 (2009).
4. Pakendorf, B. & Stoneking, M. Mitochondrial DNA and human evolution. Annu Rev
Genomics Hum Genet 6, 165–183 (2005).
5. Brown, W. M. Polymorphism in mitochondrial DNA of humans as revealed by restriction
endonuclease analysis. PNAS 77, 3605–3609 (1980).
6. Reich, D. et al. Reconstructing Native American population history. Nature 488, 370–
374 (2012).
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MtDNA y evolución humana Cándido Robles Sánchez INDICE 1º Esquema general del DNA mitocondrial. - Reddy PH. Mitochondrial medicine for aging and neurodegenerative diseases.
NeuroMolecular Medicine. 2008; 10(4):291-315.
2º Replicación. 3º Intercambio DNA nuclear y MtDNA. - Hazkani-Covo E, Zeller RM, Martin W. Molecular poltergeists: Mitochondrial DNA copies
(numts) in sequenced nuclear genomes. PLoS Genetics. 2010; 6(2).
4º Halogrupos. - Badro DA, Douaihy B, Haber M, et al. Y-chromosome and mtDNA genetics reveal significant
contrasts in affinities of modern middle eastern populations with european and african populations. PLoS ONE. 2013;8(1)
4º Evolución de África oriental y paso a los continentes. - Behar DM, Van Oven M, Rosset S, et al. A "copernican" reassessment of the human
mitochondrial DNA tree from its root. American Journal of Human Genetics. 2012;90(4):675-684.
- Balloux F, Lawson Handley L-, Jombart T, Liu H, Manica A. climático forma a la distribución
mundial de la variación de la secuencia de ADN mitocondrial humano. Proceedings of the Royal Society B: Ciencias Biológicas .2009, 276 (1672) : 3447-3455.
- Boattini A, Castrì L, Sarno S, et al. MtDNA variation in east africa unravels the history of
afro-asiatic groups. American Journal of Physical Anthropology. 2013; 150(3):375-385.
- Blanco R, Mayordomo E, Montoya J, Ruiz-Pesini E. Rebooting the human mitochondrial
phylogeny: An automated and scalable methodology with expert knowledge. BMC Bioinformatics. 2011;12.
5º Eva mitocondrial. 6º Mecanismos de reparación. - Gredilla R, Bohr VA, Stevnsner T. Mitochondrial DNA repair and association with aging - an
D.N. Cross-comparison of the genome sequences from human,
chimpanzee, Neanderthal and a Denisovan hominin identifies novel
potentially compensated mutations. Human Genomics. 2011. 5: 453-484.
- Reich, D.; Green, R.E. et al. Genetic history of an archaic hominin group
from Denisova Cave in Siberia. Nature. 2010. 468: 1053-1060.
- Gibbons, A. A Crystal-Clear View Of an Extinct Girl’s Genome.
Science. 2012. 337: 1028-1029.
- Meyer, M.; Kircher, M. et al. A high coverage genome sequence from an
archaic Denisovan individual. Science. 2012.
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Ylenia Liria González
EL GENOMA DE LOS NEANDERTALES
¿ Qué entendemos por Neandertal?
Espacio y tiempo de los Neandertales
Proyecto Genoma Neandertal
El genoma de los Neandertales
mtDNA de los Neandertales
Secuencias nucleares
Contribución genómica de los Neandertales a los humanos
Fundamentos y perspectivas de secuenciar el genoma Neandertal
Tattersall, I & H.Schwartz, J. (1999) Hominids and hybrids:The place of Neanderthals
in human evolution. Proc.Natl.Acad.Sci. 96:7117-7119.
Green, R.E et al. (2010) A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science. 328:
710-722.
Relethford, J.H. (2001) Ancient DNA and the origin of modern humans. 98: 390-391.
Noonan, J.P et al (2006) Sequencing and Analysis of Neanderthal Genomic DNA.
Science. 314: 1113-1118.
Green, R.E et al (2009) The Neandertal genome and ancient DNA authenticity. The
EMBO Journal. 28:2494-2502.
Lalueza-Fox, C. (2010)El Proyecto Genoma Neandertal; hacia una definición genética
del ser humano. Memorias R.Soc.Esp.Hist.Nat, 2ªep. 8: 69-78.
Dpto. de Genética, Universidad de Granada http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol
EL genoma del hombre de los hielos
1º Localización del hombre de los hielos
2º Secuenciación completa del genoma
3º Control de contaminación
4º Análisis de SNP
5º Descendencia
6º Análisis metagenómico.
Bibliografia:
Keller, A. et al. New insights into the Tyrolean Iceman's origin and
phenotype as inferred by whole-genome sequencing. Nat. Commun. 3:698
doi: 10.1038/ncomms1701 (2012).
Molecular genetic analyses of the Tyrolean Ice Man O Handt, M Richards,
M Trommsdorff, C Kilger, J Simanainen, O Georgiev, K Bauer, A Stone, R
Hedges, W Schaffner, al. Et
Alfonso Calle Pérez
Dpto. de Genética, Universidad de Granada http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol
EL GENOMA DEL GORILA Y LA EVOLUCIÓN DE LOS HOMÍNIDOS Alonso Rodríguez Caparrós Homínidos: 1. Introducción 2. Homínidos y otros hominoideos. 3. Características y adquisiciones de los distintos géneros de homínidos. Historia evolutiva. 4. Humanos como simios (introducir “los cariotipos humanos y de simio parecen similares pero no idénticos”). Diferencias genéticas entre humanos y otros primates. 5. Tricotomía gorila/chimpancé/humano. Resolución usando datos de las secuencias de ADN. 6. Datos de la divergencia en homínidos. Gorila: 1. Especiación de los grandes simios. 3. Clasificación y selección incompletas del linaje. 4. Evolución de la secuencia funcional. Evolución proteica. Transcripción génica y regulación 5. La diversidad genética dentro del Gorila. 6. Conclusión. Bibliografía: 1. Scally, A., Dutheil, J.Y., Hillier, Jordan, G.E, Goodhead,I., Herrero, J., Hobolth,
A., Lappalainen, T., Mailund, T., Marques-Bonet, T., McCarthy, S., Montgomery,