Seminario biologia molecular

Blood stream infections due to OXA-48- like carbapenemase-

producing Enterobacteriaceae: treatment and survival

Ioka Dela Peña Lozano Sara Cardona HenaoIII Semester 2014

Introduction

• Resistance to extend spectrum cephalosporins is a well recognized problem among

enterobacteriaceae. Carbapenems have served as an important antimicrobial class for the

treatment of these organisms and, until recently resistence to carbapenems has benn

uncommon among enterobacteriaceae in turkey.

• In 2008 was reported the firts case of

carbapenem-resistant

And a subsequent spread of it in that coutry.

• CRE are often resistent to all beta-lactam

antibiotics and frequently co- resistant to most

other antibiotics, presenting a tremendous

challenge to the clinician

Enterobacteriaceae

Its a big and heterogeneous group of

grammnegative bacterias.

Their are named like that because of its habitual

localization as saprophytes in the digestive

tract, but it is about ubiquitous germs that may

be found in the ground, water and vegetation.

Microbiological characteristics of enterobacterias • Are aerobic non-spore that can grow

anaerobically (facultative anaerobes) • Reduce nitrate to nitrite (with some

exceptions) • No liquified alginate • To ferment glucose with or without acid

gas production • They are oxidase-negative, except

Plesiomonas • produce catalase • No growth are favored by the presence of

NaCl • Most are motile (peritrichous flagella) • No spore-forming

Carbapenemase

• Are enzymes of the beta lactamase family that due they are produced by bacteria,

they give a very significative clinical resistance to carbapenem antibiotics like

(Imipenem,Meropenem, Doripenem,Ertapenem)

Carbapenem-resistant enterobacteria

• CRE, which stands for carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, are

a family of germs that are difficult to treat because they have high

levels of resistance to antibiotics. Klebsiella species and E. coli are

examples of Enterobacteriaceae, a normal part of the human gut

bacteria, that can become carbapenem-resistant

Healthy people usually do not get CRE infections – they usually

happen to patients in hospitals, nursing homes, and other

healthcare settings. Patients whose care requires devices like

ventilators (breathing machines), urinary (bladder) catheters,

or intravenous (vein) catheters, and patients who are taking

long courses of certain antibiotics are most at risk for CRE

infections.

CRE are sometimes known as KPC (Klebsiella pneumoniae

carbapenemase) and NDM (New Delhi Metallo-beta-lactamase).

KPC and NDM are enzymes that break down carbapenems and

make them ineffective.

Some CRE bacteria have become resistant to most available antibiotics. Infections with these germs are very difficult to treat, and can be deadly—one report cites they can contribute to death in up to 50% of patients who become infected

Main Objective

• Investigate the clinical characteristics and treatment

outcomes of blood stream infections due to

carbapenem-resistant enterobacteriaceae that are

associated with high hospital mortality and present a

tremendous challenge to clinicians

Diseño y Recolección de datos

• Revisión de 36 pacientes diagnosticados con BSls

debidas a CRE en el hospital universitario de

Cerrahpasa entre febrero de 2011 y marzo de

2013.

• Con un estudio retrospectivo de control de

sobrevivencia de 28 días, o de 14 días y respuesta

al tratamiento en el día 7.

Materiales y métodos

• Mueller hinton II agar: es un medio para

realizar pruebas de suceptibilidad

antimicrobiana mediante el metodo de

difusion en disco, su composicion permite el

crecimiento de bacterias no exigentes

como(enterobacterias bacilos gram

negativosno fermentadores, estafilococos y

enterococos

• Incubación de muestras a 35-37º por 16-18 horas• Resistencia de bacterias por el método E-test • Evaluación de resultados a través de EUCAST

• HiCrome UTI Agar es un medio diferencial utilizado para la determinación de microorganismos causantes de infecciones del tracto urinario

Composición• Ingredientes Gms / Litre• Peptic digest of animal tissue 15.000• Chromogenic mixture 26.800• Agar 15.000• Final pH ( at 25°C) 6.8±0.2

Criterios de inclusión y exclusión

API

( analytical profile index system)

• El Índice de Perfil Analítico (API) es un panel en miniatura de las pruebas bioquímicas

compilados para la identificación de los grupos de bacterias estrechamente

relacionadas. Diferentes paneles de ensayo se preparan en formas deshidratadas que

se reconstituyen en el uso mediante la adición de suspensiones bacterianas.

• Después de la incubación, los resultados positivos se puntúan como un número de

siete dígitos (perfil).

• La Identidad de la bacteria es entonces fácilmente derivada de la base de datos con el

libro de códigos perfil acumulativo pertinente o software.

• No se evaluó a través del APACHE II porque los puntajes no se

encontraban en la mayoría de los casos, entonces se utilizo el

índice de severidad de PITT

Índice de severidad

APACHE (II)utiliza 12 parametros de los 34 del Acute Physiology Score con la finalidad de obtener un índice que refleje el nivel de los servicios recibidos. Asi pues, para calcular el score se suman a las 12 variables fisiologicas, la puntuacion obtenida por edad y aquella obtenida por enfermedad

Apache II

PITT

Respuesta

Una respuesta clínica en el día 7 se definió como parcial o total

la recuperación de los síntomas, signos y hallazgos de

laboratorio de la infección.

• Mejoria en la fiebre y conteo de glóbulos blancos en

pacientes no neutropénicos. significativo

• disminuciones en los niveles de proteína C reactiva y de

procalcitonina fueron utilizados como marcadores de la

recuperación de la sepsis.

Una respuesta microbiológica en el día 7 se

definió como un negativo

Se obtuvieron resultado hemocultivo en el

día 7 (cultivos de sangre de control dentro de

las primeras 48-72 h de tratamiento).

• Esta técnica sirve para amplificar un fragmento de ADN; su

utilidad es que tras la amplificación resulta mucho más fácil

identificar con una muy alta probabilidad, virus o bacterias

causantes de una enfermedad, identificar personas (cadáveres) o

hacer investigación científica sobre el ADN amplificado.

PCR

PFGE

Es una técnica utilizada para la separación

de grandes moléculas de DNA, aplicando

una matriz en gel y electricidad que

periódicamente cambia de dirección.

RESULTADOS

RESULTADOS

No se observaron diferencias significativas entresobrevivientes y no sobrevivientes

características basales,condiciones etiologías, y fuentes de bacteriemia

La mediana de la muerte era 8 días después del primer cultivo positivo

RESULTADOS

Neoplasias hematológicas y la neutropenia prolongada fueron más frecuentes en los no sobrevivientes

la duración de la estancia en la UCI fue mayor para los sobrevivientes, pero no era estadísticamente significativo

La respuesta microbiológica y clínica en el dia 7 son dos variables independientes que determinan en un 85% la mortalidad a los 28 dias , la falta de respuesta en el dia 7 fue correlacionada con un fracaso de supervivencia

3 ptes

X en el dia 15 = sepsis

X 1inmundeprimido por anemia aplasica

Ptes sobrevivieron fueron tratados con ≠ combinaciones

aminoglucosidos

colistina

carbapenm

tigeciclina

cefalosporinas

Dosis combinada > supervivencia triples75% vs Dobles38%

PFGE CKP

Los primeros 4 casos fueron iguales, o sea todos provenientes de la misma cepa

Se aislaron 15 diferentes tipos de CKP y se evaluaron en los criterios de indistinguibles, muy relacionado, posiblemente relacionado o diferente

Los nueve restantes no se relacionaban con los primeros 6, sin embargo todos contenían las carbapenemasas tipo OXA-48

El perfil de DNA para los primeros 6 tipos de CKP aislada= recolectados entre febrero de 2011 y marzo de 2013

DISCUSSIONAUTHORS PHRASE YES NO

Nguyen et al “microbiological eradication and clinical improvement on day 7 were found to be two major indicators of 28-day survival” consistent with the study.

X

Qureshi et al “reported that the most common successful combination for treating Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) infections is colistin with either tigecycline or a carbapenem.”

X

Tumbarello et al. “demonstrated that a triple-drug regimen including tigecycline, colistin, plus a carbapenem, was independently associated with improved sur-vival in KPC infections.

X

Borer et al. “In a series of CRKp BSIs (n = 32) reported crude and attributable mortality rates The overall hospital mortality of 71.9% and 28-day attributable mortality of 50% .”

X

Personal conclusions

The ICU stay was not related to a higher probability of

survival although in the study coincide

the use of colistin doses combined (double or triple) increases

survival.

Personal conclusions

It is a topic which must delve deeper to get clear dose and the drugs we

use to this infection.

knowing the clinical and molecular features of bacterial infections is very

important to development of an appropriate treatment, because these

microorganisms are constantly mutating and becoming resistant to

different antibiotics

Mapa Sara

Mapa Ioka

Bibliografía

• http://www.meiga.info/escalas/apacheii.pdf• http://

www.microbelibrary.org/library/laboratory-test/2878-bacterial-identification-by-the-analytical-profile-indexsystem-analytical-profile-index-e20-for-enterobacteriaceae

• http://www.eucast.org/resistance_mechanisms/• http://proantibioticos.com/uso-de-antibioticos-2/tratamiento-empirico/evaluac

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• http://www.biomerieux-culturemedia.com/product/42-mueller-hinton-e-agar-90-mm

• http://www.cdc.gov/hai/organisms/cre/• http://

www.sochinf.cl/sitio/templates/sochinf2008/documentos/2012/antimicrobia/12.pdf

• http://www.facmed.unam.mx/deptos/microbiologia/pdf/Enterobacterias_Medicine2010.pdf