i SELEKSI BAKTERI FILOSFER PADI SEBAGAI AGEN BIOKONTROL Xanthomonas oryzae pv. oryzae PENYEBAB PENYAKIT HAWAR DAUN BAKTERI PADA PADI TESIS Disusun untuk memenuhi sebagian persyaratan mencapai derajat Magister Program Studi Biosain Oleh Rivia Kumala Dewi S901308016 PROGRAM PASCASARJANA UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA 2015 perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id commit to user
18
Embed
SELEKSI BAKTERI FILOSFER PADI SEBAGAI AGEN … · tentang bakteri yang bersifat antagonis terhadap Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo), identifikasi bakteri antagonis berdasarkan
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
i
SELEKSI BAKTERI FILOSFER PADI SEBAGAI AGEN BIOKONTROL
Xanthomonas oryzae pv. oryzae PENYEBAB PENYAKIT
HAWAR DAUN BAKTERI PADA PADI
TESIS
Disusun untuk memenuhi sebagian persyaratan mencapai derajat Magister
”Sesungguhnya sesudah kesulitan itu ada kemudahan. Maka apabila kamu telah selesai (dari suatu urusan), kerjakanlah dengan sungguh-sungguh (urusan) yang lain, dan
hanya kepada Tuhan-mulah hendaknya kamu berharap” (QS. Al-Insyiroh: 6-8)
”Barang siapa yang menghendaki kehidupan dunia maka wajib baginya memiliki ilmu, dan barang siapa yang menghendaki kehidupan akhirat, maka wajib baginya memiliki
ilmu, dan barang siapa menghendaki keduanya maka wajib baginya memiliki ilmu” (HR. Turmudzi)
”Tidaklah didapatkan ilmu dengan jasad yang santai” (Yahya bin Abi Katsir)
“Jika kamu berada di sore hari jangan tunggu pagi hari dan jika kamu berada di pagi
hari jangan tunggu sore hari, gunakanlah kesehatanmu untuk (persiapan saat) sakitmu dan kehidupanmu untuk kematianmu “ (HR. Bukhori)
Awal dari efisiensi adalah ketertiban
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
viii
HALAMAN PERSEMBAHAN
Teriring rasa syukur kepada Allah SWT, karya ini kupersembahkan kepada:
Ibunda (almh.) tersayang yang selalu menguatkan dan mencurahkan kasih sayangnya . . .
Ayahanda tercinta yang selalu menjaga dan memberikan pandangan lain dalam menyikapi
suatu permasalahan . . .
Seluruh keluarga besarku yang selalu memberikan semangat dan bantuan . . .
Almamaterku . . .
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
ix
KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis panjatkan Kehadirat Allah Subhanahu Wa Ta`ala atas segala
nikmat, hikmah dan petunjuk-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan tesis yang
berjudul “Seleksi Bakteri Filosfer Padi Sebagai Agen Biokontrol Xanthomonas oryzae pv.
oryzae Penyebab Penyakit Hawar Daun Bakteri Pada Padi”. Tulisan ini menyajikan bahasan
tentang bakteri yang bersifat antagonis terhadap Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo),
identifikasi bakteri antagonis berdasarkan karakter morfologi dan gen penyandi 16S rRNA,
deteksi gen polyketide synthase (PKS), senyawa bioaktif yang dihasilkan bakteri antagonis,
serta uji aktivitas anti-Xoo ekstrak senyawa bioaktif.
Nilai penting dari penelitian ini adalah dengan ditemukannya bakteri yang bersifat
antagonis terhadap Xoo maka dapat dikembangkan alternatif pengendalian penyakit hawar
daun bakteri pada padi yang ramah lingkungan sehingga penurunan hasil produksi padi
dapat diminimalisir tanpa menimbulkan pencemaran lingkungan. Bakteri antagonis
ataupun senyawa bioaktif yang dihasilkannya dapat diaplikasikan pada padi yang sehat
sebagai langkah pencegahan penyakit atau pada padi yang terserang penyakit sebagai
langkah pengobatan.
Tulisan ini masih banyak memiliki kekurangan dan jauh dari sempurna. Oleh karena
itu, penulis mengharapkan saran yang bersifat membangun sehingga tulisan ini menjadi
lebih baik dan bermanfaat bagi yang membutuhkan.
Surakarta, Juni 2015
Penulis
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
x
UCAPAN TERIMA KASIH
Alhamdulillah, puji syukur penulis panjatkan Kehadirat Allah Subhanahu Wa Ta`ala
yang telah menganugerahkan rahmat dan taufik-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan
tesis yang berjudul “Seleksi Bakteri Filosfer Padi Sebagai Agen Biokontrol Xanthomonas
oryzae pv. oryzae Penyebab Penyakit Hawar Daun Bakteri Pada Padi”. Penulis juga ingin
menyampaikan terima kasih dan penghormatan kepada semua pihak yang telah membantu
dalam penyelesaian tesis ini, yaitu:
1. Rektor Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah memberikan izin belajar di
Universitas Sebelas Maret.
2. Direktur Program Pascasarjana Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah
memberikan izin belajar di program studi Biosain.
3. Ketua Program Studi Biosain yang telah memberikan bimbingan dan dukungan dalam
menyelesaikan pembelajaran.
4. Prof. Drs. Suranto, M.Sc, Ph.D selaku dosen pembimbing pertama yang selalu
memberikan nasehat, arahan, dan motivasi hingga terselesaikannya penulisan tesis ini.
5. Dr. Ari Susilowati, M.Si selaku dosen pembimbing kedua yang telah banyak
membimbing, memotivasi, dan memberikan kepercayaan kepada penulis untuk ikut
ambil bagian dalam proyek penelitian ini.
6. Prof. Dr. Sugiyarto, M.Si selaku dosen pembimbing akademik dan dosen penguji yang
telah banyak memberikan bimbingan dan nasehat dalam menyelesaikan pembelajaran.
7. Dr. Artini Pangastuti, M.Si selaku dosen penguji yang telah banyak memberikan
bimbingan dalam penulisan tesis ini.
8. Semua dosen di Program Studi Biosain yang telah memberikan banyak ilmu kepada
penulis.
9. Ketua Laboratorium Biologi FMIPA Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah
memberikan izin kepada penulis untuk melakukan penelitian dalam suasana kondusif.
10. Semua guru penulis mulai dari RA, MI, MTsN dan MAN serta dosen program sarjana
atas semua pendidikan dan kasih sayang yang telah diberikan kepada penulis.
11. Ibunda (almh.) tersayang untuk semua bimbingan, kasih sayang, dan semangat yang
tiada terukur.
12. Ayahanda tercinta yang selalu menjaga dan memberikan nasehat yang berharga.
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xi
13. Semua keluarga besar penulis yang selalu memberikan semangat dan bantuan dalam
berbagai hal.
14. Sahabat-sahabat Biosain angkatan Agustus 2013: Mbak Yayah, Viktor, Mas Vector,
Raqib, Adi, Hailu, serta Danang untuk kebersamaan yang mengesankan dan tak
terlupakan.
15. Kakak dan adik kelas di Biosain untuk semangat dan semua bantuannya.
16. Mbak Ifah yang telah banyak membantu dalam hal administrasi dan untuk
keramahannya.
17. Semua staf Laboratorium Biologi FMIPA, Laboratorium terpadu FMIPA dan
Laboratorium Pusat MIPA untuk semua bantuannya.
18. Semua pihak yang turut membantu dalam penyelesaian tesis ini baik secara langsung
maupun tidak langsung yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu.
Semoga Allah SWT membalas semua kebaikan yang diberikan kepada penulis dengan
balasan yang lebih baik.
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xii
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL ............................................................................................................ i
HALAMAN PENGESAHAN PEMBIMBING .................................................................. ii
HALAMAN PENGESAHAN PENGUJI ........................................................................... iii
PERNYATAAN KEASLIAN DAN PERSYARATAN PUBLIKASI .............................. iv
ABSTRAK .......................................................................................................................... v
ABSTRACT ....................................................................................................................... vi
MOTTO ............................................................................................................................. vii
HALAMAN PERSEMBAHAN ....................................................................................... viii
KATA PENGANTAR ........................................................................................................ ix
UCAPAN TERIMA KASIH ............................................................................................... x
DAFTAR ISI ..................................................................................................................... xii
DAFTAR TABEL ............................................................................................................ xiv
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................................... xv
DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................................... xvii
DAFTAR SINGKATAN ................................................................................................ xviii
BAB I. PENDAHULUAN
A. Latar Belakang Masalah ..................................................................................... 1
B. Rumusan Masalah ............................................................................................... 3
C. Tujuan Penelitian ................................................................................................ 4
D. Manfaat Penelitian .............................................................................................. 4
BAB II. LANDASAN TEORI
A. Tinjauan Pustaka ................................................................................................. 5