RMN em proteínas - geral Pode ser dividida em 3 etapas: • assinalamento seqüencial das ressonâncias 1 H utilizando-se experimentos que demonstrem conexões através de ligações químicas (acoplamento escalar) e através do espaço (<5Å, acoplamento dipolar); • identificação e quantificação da maior quantidade possível de NOEs que levem a um conjunto de restrições de distâncias interprotônicas aproximadas; • cálculo de estruturas tridimensionais com base nessas restrições de distâncias, de preferência complementadas por restrições de ângulos torcionais obtidas de constantes de acoplamento.
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RMN em proteínas - geral 16...RMN em proteínas pequenas e médias Proteínas pequenas (até ~80 aminoácidos) - 2D •TOCSY •COSY •NOESY Proteínas um pouco maiores (até ~100
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RMN em proteínas - geral
Pode ser dividida em 3 etapas:
• assinalamento seqüencial das ressonâncias 1H utilizando-se experimentos quedemonstrem conexões através de ligações químicas (acoplamento escalar) e atravésdo espaço (<5Å, acoplamento dipolar);
• identificação e quantificação da maior quantidade possível de NOEs que levem aum conjunto de restrições de distâncias interprotônicas aproximadas;
• cálculo de estruturas tridimensionais com base nessas restrições de distâncias, depreferência complementadas por restrições de ângulos torcionais obtidas deconstantes de acoplamento.
TOCSY – PfTrx (104 resíduos + 10 resíduos da cauda de His)
NOESY – PfTrx (104 resíduos + 10 resíduos da cauda de His)
15N-HSQC – PfTrx (104 resíduos + 10 resíduos da cauda de His)
13C-HSQC – PfTrx (104 resíduos + 10 resíduos da cauda de His)
RMN em proteínas pequenas e médias
Proteínas pequenas (até ~80 aminoácidos) - 2D
• TOCSY• COSY• NOESY
Proteínas um pouco maiores (até ~100 aminoácidos) - 2D, 3D