Riječko superračunalo BURA i STeP 2 Prof. dr. sc. Pero Lučin, dr. med. V. MEĐUNARODNI INVEST FORUM 21. listopada 2016., Opatija Hotel Royal
Riječko superračunalo BURA i STeP 2
Prof. dr. sc. Pero Lučin, dr. med.
V. MEĐUNARODNI INVEST FORUM 21. listopada 2016., Opatija
Hotel Royal
Lokacija Sveučilišta u Rijeci
© 2016. University of Rijeka 2
Rijeka 1689
31. srpnja, 1633
© 2016. University of Rijeka 3
Snažan industrijski razvoj koncem 19. stoljeća
© 2016. University of Rijeka 4
… i nakon II svjetskog rata
© 2016. University of Rijeka 5
Dvosmjerni transfer tehnologije
© 2016 University of Rijeka 6
XXLXL
LMS
XS
© 2016. Pero Lučin 7
Povećati broj ljudi s istraživačkom kompetencijom
© 2016 University of Rijeka 8
UniRi Campus
UniRi Hospital
Sveučilišna bolnica
© 2016 University of Rijeka 9
2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020
Centre for High Throughput Technologyin Biomedicine
Laboratory
for
Proteomics
Laboratory
for Systems
Biomedicine
Laboratory
for Cell
biology
Laboratory for
Organic and
Solid State
Chemistry
Laboratory
for
Bioorganic
Chemistry
© 2016. University of Rijeka 10
Centre for Micro and Nano Sciencesand Technologies
Laboratory for
Surface and
Materials
Science
Laboratory for
Precision
Engineering and
Microsystems
Technologies
Laboratory for
Ultrafast
Optocustics &
Quantum
Optics
Laboratory for
Elemental
Microanalysis
© 2016. University of Rijeka 11
Faculty of Civil Engeneering
Hydraulic
laboratoryTransportation
laboratory
Geotechnical
laboratoryMaterials
laboratoryStructures
laboratory
© 2016. University of Rijeka 12
Centre for Advanced Computing and Modelling
Laboratory for
Computer and
Network
Technologies
Laboratory for
E-Science, E-
Learning and
E-Business
Laboratory for
Signal
Processing and
Communication
Technologies
Laboratory for
AI Technologies
and Modeling
© 2016. University of Rijeka 13
Rmax: 233.565 TFlop/s
Rpeak: 287.539 TFlop/s
Peak Power (kW): 108.48
Processor: Xeon E5-2690v3 12C 2.6GHz
Sockets per Node: 2
Cores per Socket: 12
Nodes: 288
Primary Interconnect: InfiniBand FDR
440 175 48
Prof. dr. sc. Zlatan Car© 2016. University of Rijeka 14
Prof. dr. sc. Zlatan Car© 2016. University of Rijeka 15
HPC u biomedicini
Istraživanje malignih bolestiObrada podataka putem superračunala u što kraćem vremenu omogućuje bolje razumijevanje mehanizama koji stvaraju genetsku nestabilnost, a time i pojavu malignih bolesti. Efikasnija dijagnostika poradi brže analize slikovnih podataka, a time i efikasnije liječenje te njega pacijenata.Razvoj personalizirane terapije uz pomoć računalnih modela i simulacija.
Stvaranje preciznog i realističnog modela mozga je iznimno kompleksan postupak koji zahtijeva ogromne računalne resurse koji su dostupni isključivo putem superračunala za potrebe modeliranja, simulacija, vizualizacije i analize podataka.
Prof. dr. sc. Zlatan Car© 2016. University of Rijeka 16
HPC u biomedicini
RadioterapijaUporaba superračunala za optimizaciju plana liječenja uporabom dinamične adaptivne radioterapije gdje se radijacija, na osnovu brzog proračuna pacijentove geometrije tumora, usmjerava na tumor značajno smanjujući količinu radijacije na zdravo tkivo.
fMRI analiza na višejezgrenimCPU i mnogojezgrenim GPUfMRI podaci su sve više i više računalno zahtijevniji kako se povećava veličina i kvaliteta rezolucije, javna dostupnost setova podataka te metodološka poboljšanja kao što su linearna prostorna normalizacija, neparametrijski permutacijski testovi i BMCMC metode.
MikrokirurgijaStvaranje 3D slika mikrostruktura i tkiva u realnom vremenu, koje se nalaze izvan vidljivog dosega kirurga, omogućuju bolje sagledavanje trenutnog stanja čime se omogućuju trenutne reakcije, a stoga i smanjenje rizika za vrijeme operacije.
Prof. dr. sc. Zlatan Car© 2016. University of Rijeka 17
HPC u biomediciniMapiranje genomaSuperračunala omogućuju uštedu vremena korištenjem paralelnog procesiranja razlaganjem kompleksnih problema na manje zadatke koji se izvode simultano što dovodi do mogućnosti interakcije sa podacima u skoro realnom vremenu.
Ubrzanje istraživanja HIVKorištenje superačunala za izvođenje all-atom HIVsimulacije poradi utvrđivanja precizne kemijske strukture i razvoja lijekova koji ciljano djeluju na virus.
Sprječavanje potencijalne pandemijeIzvođenje velikog broja naprednih simulacija, u što kraćem vremenu, omogućuje uvid kako mutacije mogu uzrokovati promjene u kemijskoj i biološkoj strukturi i u ponašanje ključnog enzima virusa kako bi se odredilo zašto je virus otporan na postojeće antiviremike.
Prof. dr. sc. Zlatan Car
6
© 2016. University of Rijeka 18
HPC u biomedicini
Virtualna anatomijaRačunalna obrada, korištenjem naprednih algoritama, velike količine visoko rezolucijskih 3D slika nastalih na CT, ultrazvuku i MRI skenerima, u što kraćem vremenu, omogućuje realističan 3D pogled prema pojedinom organu pacijenta poradi brže i kvalitetnije dijagnostike, za potrebe forenzike, ali i korištenja u obrazovanju studenata (3D naočale).
Napredna dijagnostikaAnaliza ogromne količine nestrukturiranih podataka (Big Data) iz velikog broja senzora od aktivnosti u realnom vremenu (nosivi uređaji), biometrijskih podataka do kartona pacijenata poradi što bržeg i kvalitetnijeg odabira liječenja
© 2016. University of Rijeka 19
Translacijska i sistemska medicine
3.000 m2
200+ radnih mjesta5 stalno zaposlenih
STeP 1
© 2016 University of Rijeka 20
© 2016. University of Rijeka 21
Znanstveno-tehnološki park II STePRi2
Mlaka zapad3,42 Ha
Mlaka sjever2,01 Ha
Mlaka centarZona zahvata
8,06 HaMlaka istok1,55 Ha
© 2016. University of Rijeka 22
Znanstveno-tehnološki park II STePRi2
© 2016. University of Rijeka 23
STEP-2.0-MLAKA
© 2016. University of Rijeka 24
STEP-2.0-MLAKA
© 2016. University of Rijeka 25
STEP-2.0-MLAKA
Mlaka centarZona zahvata
8,06 Ha
STePRi2 2020.
© 2016. University of Rijeka 26
© 2016. University of Rijeka 27
STEP-2.0-MLAKA
Mlaka centarZona zahvata
8,06 Ha
Marine biotechnologyBiopolymersRenewable energyPharma industryAdriatic monitoring – high throuput analytsics
© 2016. University of Rijeka 28
STEP-2.0-MLAKA
Mlaka centarZona zahvata
8,06 Ha
© 2016. University of Rijeka 29
Zdravstvena industrija
Hvala na paž[email protected]
© 2016. University of Rijeka 30