Colloque jeudi 21 novembre 2019 Retraitement de données, construction d’un SGBDR puis d’une application de gestion de Collections paléontologiques Brigitte Barchasz (Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement – UMR 5276) Colloque Dijon Donnees Ouvertes - 21nov2019 - Brigitte Barchasz 1 Les données de la Recherche et la Science Ouverte
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Colloque
jeudi 21 novembre 2019
Retraitement de données, construction d’un SGBDR
puis d’une application de gestion de Collections paléontologiques
Brigitte Barchasz (Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement – UMR 5276)
- nées en 1808 avec la création de la ’Faculté des Sciences de Lyon’- 9 millions de fossiles stockés dans 14 salles, avec compactus- parmi les 20 premières collections universitaires mondiales- Aussi dépositaires des Collections de l’Ecole des Mines
- plateforme scientifique au service des chercheurs paléontologues
l’informatique pour gérer des centaines de milliers de specimens : 3 étapes historiques
• Années 1960… : Louis David1965 : met au point l’utilisation de cartes perforées pour les Bryozoaires, avec des « zones à codification numérique » - codes toujours existants dans nos données :
• 1990-2010 : Abel Prieur, anc. Resp. des Collections géologiques de Lyon Acquisition de Filemaker Pro ; 30 ans de travail de catalogage 330.000 références dont les fossiles et vertébrés => 350 fichiers Filemaker
• 2015-16 : Brigitte Barchasz, expertise ces 350 fichiers descriptifs de fossiles, Conception, Réalisation BDD unique et relationnelle (SGBDR) ; dévt des fonctionnalités sous Filemaker ; invente l’application de gestion des Collections :
• Panier historique des dernières saisies à réutiliser Dans la même session : alléger les recherches répétitives et dans de lourdes tables de données (ici index de 60.700 VILLES !)
• Espaces personnalisés pour les utilisateurs, dans leur contexte de travail et sur des
sujets de recherche en cours de chantier (Oiseaux, Ammonites, Montagne Noire, Codes géographiques…)
•Assistance à la saisie par exploitation des tables de données, ou par création
• Editions de rapports croisés avec calculs statistiques
Avant // Après 2015-2016 : FILEMAKER PRO V11 // V18 2019350 fichiers de données // 1 seule BDDMonotable façon excel // multitables SGBDRMonoposte // multipostes grâce à Filemaker Server + AdvancedForte hétérogénéité // harmonisation des donnéessans développement // avec développement : programmes, scripts => application
grande modernisation et outil professionnel Base 410 MO (sans photos).
+ amélioration de la sécurité : les clés, les N sauvegardes quotidiennes
Filemaker vs Données ouvertes ?Filemaker Pro = Outil de dévt de BDD permettant de développer des projets personnalisées ; Langage de programmation propriétaire, mais a développé une API permettant l’interopérabilité.
Recherche de référentiels pluridisciplinairesEn parallèle à la Fouille de données dans la BDD (vs. Absence de règles de saisie et données de références)
+ Recherches cartographiques et bibliographiques en français-anglais-espagnol
Bibliographie SGBDR : Revue, Issue, Document, Auteur publi, Détails publicationsimports et restructuration des données Recolnat
encore 23.700 codes géographiques à traiter !moyens RH ?!
nvx descripteurs géographiques :
Pbl Géolocalisation – territorialité - cartographie de qualité inégale Algérie, période de la colonisation française Translittération de l’alphabet arabe
• coelenterata, scyphozoa, conulata, conulariina, conulariidae, conulariinae [d'après treatise on invertebrate paleontology, R. C. Moore ed. (1956), part F]
• Secondaire, jurassique supérieur, kimméridgien inférieur, zone à Hypselocyclum, sous-zone à Lothari
• Paléozoïque, Cambrien moyen, Série 3, Etage 5, Languedocien inférieur, Formation de Coulouma(niveau E), Zone à Solenopleuropsis (S.)
éclatement dans 12 champs de données
CHAMPS MULTIVALUES (stratigraphie + lithostratig. + biostratig.) qui ont pu être retraités par calculs
Codes de cartes perforées pour la TAXONOMIE
Nous rencontrons un pbl majeur sur une partie des NUMEROS D’INVENTAIRE doublons : 1 BLOC ROCHEUX ou 1 BOITE = N FOSSILES
solutions techniques 3 sous-champs + discrimination par les suffixes + programme de création automatique des suffixes alphabétiques solution humaine (moyens RH géologue) pour vérifier fiches / specimens et les discriminer scientifiquement