Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 1 D I V I S I O N ANIM AL HEALTH D I V I S I O N ANIM AL HEALTH Dispositif INRA et partenaires d’UMR en Santé Animale Réseau Français de Santé Animale Groupe miroir de la Technical Platform for Global Animal Health Alfort-Afssa 29 Octobre 2007 Une communauté scientifique pour la recherche en santé animale et santé publique vétérinaire
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Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 1D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Dispositif INRA et partenaires d’UMR en Santé Animale
Réseau Français de Santé AnimaleGroupe miroir de la Technical Platform for Global Animal Health
Alfort-Afssa 29 Octobre 2007
Une communauté scientifique pour la recherche en santé animale et santé publique vétérinaire
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 2D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Évolution (lente) de l’organisation de la recherche en France•Concentration des organismes, identification des Instituts finalisés•Rapprochement Recherche / Formation supérieure•Agences (ANR, AERES, ANI)
Préservation des missions et spécificité des structures•Au niveau des entités de recherches : les Unités Mixtes de Recherche•Au niveau régional, les pôles : PRES, pôles de compétitivité, pôles DGER•Au niveau national : les réseaux et la répartition des clusters•Au niveau international : Les outils européens dont les TP, NeO, etc..•La tétrapartite (INRA, USDA-ARS, BBSRC, AAF Canada), •CGIAR et réseaux internationaux CIRAD, rapprochement INRA-CIRAD
Domaine agronomique Des recherches finalisées, recherches d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, et en partenariat académique, régalien et professionnel
INRA et partenaires académiques et de formation
un envionnement scientifique en structuration dans un contexte compétitif
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Une répartition des mandats mais une communauté scientifique de plus en plus inter connectée en recherche
Recherche
Surveillance et AST
Evaluation du risque
Formation pour/à la recherche
Développement
Structuration de la recherche publiqueen santé animale en France
INRA
180
CIRAD
20
ENVs
80
AFSSA
100
2008Département Santé Animale (+MICA)
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Principales tutellesMinistère de la Recherche, Ministère de l’Agriculture (ministère des affaires étrangères - CIRAD), ministère de la santé (Afssa)
Les principaux acteurs et partenairesINRA (Départements SA, MICA), ENVs (DGER), CNRS, CIRAD, AFSSA, Universités, Hôpitaux
Organismes dédiés à d’autres domaines concernant la Santé Animale : génétique, génomique, physiologie, systèmes de production, clinique, alimentation humaine, sécurité environnementale, économie
Les partenaires des départements
Département Santé Animale et Microbiologie de la chaîne alimentaireAutres partenaires sur champs spécifiques : ENVs, CIRAD
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Département Santé AnimaleUn « Board » constitué de collègues des différents organismes : INRA, ENVs, AFSSA (Aumont, Benmansour, Boireau, Toutain, Seegers), à terme CIRAD
Un conseil scientifique (stratégie, recrutement, évaluation collective), où sont représentés de nombreux partenaires de différentes origines institutionnelle et géographiqueINRA (SA, MICA, PHASE, GA), ENVs (toutes) CIRAD, AFSSA, CNRS, Inserm, CEA, DGAl, DGER, CGV, GTVD, AFSSA, Universités, Hôpitaux
Un staff scientifique très partagé entre différents organismes : Unités mixtes de Recherches, Unités sous contrats :ENV, CNRS, Universités, CIRAD, AFSSA
Un GDR en maladies infectieuses animales INRA CIRAD
Département INRA : une structure ouverte et un mode de fonctionnement
partagé
Volonté d’ouverture et de transparence sur nos exigences scientifiques garantes de la flexibilitéUne communauté scientifique pour la recherche en Santé Animale et la Santé Publique Vétérinaire
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INRA(51%)
ENVs(27%)
Universités
AFSSACIRAD : 4 %
CNRSHôpitauxInsermAutre
Répartition des scientifiques et ingénieurs en postes
dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA)
30 ETP chercheurs en CDD
75 Doctorants (PhD) en postes
Scientifiques et ingénieurs en postes : 360
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174
247
112
65
0
50
100
150
200
250
300
350
Scientifiques et ingénieurs266
Techniciens & Administratifs312
Non INRA
INRA
Tous corps578
Agents permanents (en ETP) dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA)
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1 – Connaissances pour des méthodes de prévention, de contrôle et d’estimation de l’impact des maladies des animaux d’élevage en vue d’améliorer la compétitivité des filières ;
2 - Contribuer à la santé des consommateurs et des populations par l’appréciation, puis la prévention des risques infectieux et toxiques, alimentaires et environnementaux ;
3 - Participer à l’analyse du risque et à l’appui à la décision publique dans le domaine de la santé publique vétérinaire ;
4 - Accroître la cohérence de l’ensemble du dispositif national de recherche en santé animale (comprenant en particulier la formation par/pour la recherche);
Missions du Département SA (+ MICA)
Des recherches finalisées, sur le long terme, d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, en partenariat académique, régalien, industriel et professionnel
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« Guidelines » stratégiques
Excellence scientifique basée sur de compétences disciplinaires coordonnées et regroupées dans des unités ou des équipes fondées sur des questions biologiques plus que des maladies. Le département assure coordination et transversalités
Thématiques sans limite de liste : maladies modèles mais aussi maladies pandémiques, réglementées, zoonotiques émergentes ou récurrentes. Choix « raisonné » et collectif sur la base de collaborations scientifiques (public, privé) et de pertinences scientifique et sanitaire
Outils de la biologie moderne à haut débit, « *omics » et biologie structurale (à terme l’imagerie pour l’étude des processus infectieux et toxiques). Continuum allant de la biologie structurale à la modélisation épidémiologique
Microbiologie cellulaire, virologie, parasitologie moléculaire et cellulaire, immunologie générique, immunopathologie, génomique animale, pharmacologie, toxicologie des faibles doses et de la chronicité , épidémiologie et modélisation épidémiologique
Méthodes de maîtrise variées : vaccins, pharmaceutique, résistance, systèmes d’information pour l’aide à la décision (épidémiologie)
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Schéma Stratégique : actions Renforcer des entités (têtes de réseau ou pôles) ayant
une identité lisible et reconnue (Virologie francilienne, Pôle santé animale de Tours, pôle de Pharmacologie et toxicologie animale de Toulouse), structuration d’équipes
Équilibrer les collaborations avec l’AFSSA et le CIRAD, le CNRS et les universités tout en consolidant le partenariat consubstantiel avec la DGER
Renforcer les relations avec les gestionnaires du risque (DGAL, OIE), avec les partenaires de la société civile (filières) et industrie (innovation, R&D, Lyon biopôle)
Améliorer, mettre aux normes, ouvrir et partager nos dispositifs
Veille stratégique, communication, information (domaines embryonnaires de l’organisation des départements)
Politique plus construite à l’international (Global Animal Health, 7ième PCRD, SCAR, ERA Net, labo bi-nationaux)Réseau français en santé Animale : une suite logique et naturelle de la stratégie déclinée depuis 7 années
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0 10 20 30 40 50 60 70 80 90
Prions, TSE (hors épidémiologie)
Virologie (hors épidémiologie)
Maladies bactériennes (hors ABD)
Immunologie
Parasitologie
Maladies vectorisées par les arthropodes
Épidémiologie
Pharmacologie Toxicologie
Modèles animaux et pathologie comparée
Plate formes et logistiques
Gestion Département SAINRA Non INRA
Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08)
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Prions, TSE (hors épidémiologie)
Virologie (hors épidémiologie)
Maladies bactériennes (hors ABD)
ImmunologieParasitologie
Maladies vectorisées
Épidémiologie
Pharmacol.-Toxicol.
Animaux modèles & pathologie comparée
Plate formes & logstique
Gestion Animal Health Division
Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08)
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Périmètre des recherches de l’INRA et de ses partenaires d’UMR
Tous les agents infectieux et toxiques, xénobiotiques d’intérêt en santé animale, troubles locomoteurs des chevaux Tous animaux de production (comprenant les poissons et les chevaux) Animaux de compagnie avec les ENVs uniquement dans des problématiques de santé publique (toxicologie, zoonoses)Animaux modèles : biologie fondamentale, modèles de pathologie humaine (en général étudié avec les ENVs) : myopathie, cancers, maladies de la pléthore et de la longévité (diabète, artériosclérose, dégénérescence maculaire, etc…)
Méthodes de contrôle : innovation en diagnostic, vaccins, méthodes de prévention, thérapeutiques et usage des médicamentsBien être et souffrance : Département PHASE
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Animal Health Centre, ToursRU IASP: Virus, prions, bacteria, parasites, Zoonoses, immunology, infection & immunity, pathologyJRU IPV (Univ) : Immunology, vaccine, Toxoplasma Jouy en Josas
RU VIM : Mol virology, immunol., prions, fish pathology UMR1157 VMS (INRA CNRS) : Structural virology
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 15D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Animal Health Centre, ToursRU IASPAvian Virology (MDV, IA)
Jouy en Josas, INRARU VIM : Mol virology, immunologyRespiratory Virus (RSVB, IA)Birnavirus, Viruses of fish,Integrative virology of PRVStructural biology of viruses
Montpellier CIRADVirus from the southsIA, PPRV, paramyxovirus, ASF
Virus et maladies virales, thématiques
Jouy Gif
Coordination par tête de réseau Ile de France
Influenza aviaire, comprenant aussi réponses de l’hôte, programme agro vétérinaire DGAl INRA AFSSA CIRADLentivirus, CaeV, VmV, JSRV, IAEV.Herpes virus : Mareck VD, Aujesky Virus, simplex virusMaladies virales émergentes (FMD, Borna Virus, West Nile Virus, Hepatite E, avec AFSSA)Rotavirus, flavivirusVirologie structurale (rhabdovirus, bacteriophage, VSV, etc..)RSV, BTV : vaccinologieAdenovirus, pox virus, vectorologieMaladies virales des poissons : NHI (Rhabdovirose), SHV, Maladie du sommeil et maladie pancréatique
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Jouy en Josas, INRARU VIM : Mol virology, immunologyCell models, transgenic animal modelsPhysiopathologyStrain diversityBiophysic and structural biology of PrP
Montpellier CIRADImmunomodulation response to pathogen tansmitted by arthropodVaccine PPCB, PPR
Immunologie, immunopathologie
Jouy
Nat. Vet. Sch. ToulouseJRU IHAP (INRA, NVS):•Pox virus, vaccine (BTV)•Genetic variability of animal response to mastitis & nematodes
Animal Health Centre, ToursRU IASP, JRU IPV
•Avian immunology ( IA)•Swine immunology•Immunology of the young•Digestive mucosal immunity•Immunopathology of mastitis•Immunopathology of MAP•Vaccine against Toxoplasma•Vaccine against different bacteria (Brucella, Coxiella)
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 19D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Parasites, maladies parasitaires, thématiques
Toulouse, Nat. Vet. Sch. ToulouseJRU PTE (INRA, NVS), RU PT •Pk/Pd, Metabolism of anthelmintics, and resistance
Nat Vet Sch. AlfortJRU BIPAR
•Diagnostic, diversity, virulence of parasites of interest for food and water safety (Trichinella, Toxoplasma, Cryptosporidum)•Physiopathology of Aspergillosis
Nantes
Toulouse
Theix
Tours Alfort
Animal health Centre, ToursRU IASP, JRU IPV•Ecology and genomics of nematodes, virulence, anthelmintic resistance•Metabolism of anthelmintics in parasites•Genomics of Eimeria•Interactions Poultry - Eimeria and control•Vaccine control of Toxopasma
Montpellier
Reims
Lyon
Thématique en « renaissance »limitation du nombre de modèles
ProtozoairesCoccidioses aviairesToxoplasma gondiiHistomonas (en fermeture)Protozoonoses hydriques et alimentaires : Gardia,
Cryptosporidia, Trichinella, avec AFSSABabesia (avec maladies transmises par les tiques)
Trichostrongylidae : génomique, virulence, résistance génétique, résistance aux anthelminthiquesAspergillose aviaire
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Nat Vet Sch. LyonJRU MTCX•Mycotoxins transport in tissue and cell•Ecotoxicology (rodenticides and genetic resistance of rodents to AVKs
Nantes
Toulouse
Lyon
INRA ToulouseUR PT•Anthelmintics pharmacology and metabolism•Mycotoxins : metabolism, distribution and impacts •Food contaminants, endocrine disruptors•Integrative toxicology : molecular and cellular impacts of contaminants
Nat. Vet. Sch. Nantes, INRAJRU BIOEPAR (previously CAE) •Pk/Pd of antibiotics in fish•.Spreading antibiotics in the environments
INRA Human Nutrition Division
Pharmacologie vétérinaire (Pk/Pd)contaminant de la chaîne alimentaire, faibles doses,
contamination chronique, contamination multiple
Résistance aux antibiotiques et antiparasitaires, pharmacologieEndectocides : relation devenir / efficacité / résidus / déterminants de la pharmacocinétique (transporteurs, lipoprotéines) chez petits ruminantsFipronil : devenir et perturbation endocrinienne chez le rat et le mouton, transcriptomique chez la souris Rodenticides : réponse du nuisible, résistance génétiqueFumonisine B1, Penicillium, Zéaralénone : devenir et impacts chez le porcTrichothécènes (DON) : réponse immunitaire du porc, transports transmembranairesPatuline et toxines d’A. fumigatus : toxinogenèse moléculairePerturbateurs endocriniens ou métaboliques contaminants de la chaîne alimentaire : mycotoxines, plastifiant, bisphénol A, polybromés
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 22D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Nat. Vet. Sch. ToulouseJRU PTE (INRA, NVS):•Skills in modelling & probability
LYON, Gerland, RTRA, Nat vet Sch. Lyon•Wild animals and epidemiology•Ecology and emerging diseases
Nantes
Toulouse
ToursTheix
Lyon
Montpellier
INRA Clermont - TheixRU EpiA•Detection and analytical epidemiology of emerging diseases (EMERG)•Epidemiology and modelling of TSE and arthropod borne diseases•Methods in epidemiology and statistics
Montpellier CIRAD•Spatio temporal modelling•Emerging diseases from the Souths
Epidemiologie
Nat. Vet. Sch. Nantes, INRAJRU BIOEPAR (previously GSA) •Assessment of health (food borne pathogen carriage) status and risk in farm animal populations. •Modelling of transmissible pathogens spread and of health disorders occurrence in farm animal populations •Economic evaluation of impacts of health disorders & economic assessment of control strategies in farm
Domaine en émergence depuis 6 ansModélisation épidémiologique, vers l’économie
Scrapie , BSEArthropod borne diseases (Bartonella, WNV, BTV, CHIKV)Maldies d’élevage : BDVD, syndromes repiratoiresPortage Salmonelles, Camplylobacter en filière porcine et aviaireRésistance aux antibiotiques, diffusion dans l'environnementZoonoses (Inf Aviaire, Coxiella, Trichinelloses, MAP) Observatoires du vivants, maladies émergentes, liens avec faune sauvageQualification sanitaire de région ou de filièreÉconomie de la santé (en construction)
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 23D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Une politique d’ouverture des plateaux et plateformes, accès aux plateaux des «pôles»
Plate forme d’expertise et de formation en anatomie pathologiqueAdossé à DTPTM à ENV Nantes et board européen
Outils d’imagerie et de chirurgie des pôles et centres
Outils « omic » des pôles INRA et génopôles(recrutement d’ingénieurs)
Unités expérimentales
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Dispositif expérimental: 4 UE, une connexion avec les dispositifs partenaires
Bordeaux
Nantes
Jouy Alfort
Toulouse
Tours
Theix Lyon
Centre Animal Health, ToursEU 1277 PFIE : A2, A3, isolatorsAll size animals (from rodent to horses / cattle), except pets, fish & primatesINPRESTNational shared plat formEuropean Network of Experimental contained capacities
Objectifs : partenariat filières recherche•Exploiter les génomes et la génomique•Mobiliser les ressources de Bioinformatique, génomique comparée, biotechnologie•Soutiens aux programmes finalisés et génériques (ANR -Genanimal)
Quelques programmes et projets •Stress chronique et pathogène en aquaculture•Sélection intense et émergence de nouveaux pathogènes (porcs)•Résistance génétique au mammites•Résistance aux maladies virales chez la truite•Gene-aviflu : réponse au vaccins•Vaccinologie contre la Blue Tongue
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 26D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Le réseau AGRI-bien-être animalwww.tours.inra.fr/bien-etre
Créé par l'INRA en 1998, regroupe les chercheurs en bien-être animal, soit
– 78 INRA: dépts PHASE, GA, ALIMH, SA, SAE2– 58 non INRA: universités, grandes écoles, Instituts techniques,,…
Objectifs – Construire une culture commune (3 séminaires/an)– Harmoniser les approches, coordonner les recherches (au départ financement de projets). –Thématiques prioritaires : comprendre les attentes sociétales, identifier les émotions des animaux, préciser les outils d'évaluation du bien-être, identifier les facteurs de variation (génétique, expérientiels), mettre au point des solutions permettant de concilier bien-être et production.– Améliorer la visibilité des recherches françaises (projets européens)– Renforcer la formation (interactions avec écoles/univ.), le transfert des connaissances (contribution à des expertises), le dialogue science-société (ouverture des séminaires)
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 27D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Veterinary Research (3.152 ) Un journal soutenu par le Département Santé Animale
Veterinary Research American Journal of Veterinary ResearchVeterinary Immunology and Immunopathology Veterinary ParasitologyVeterinary Microbiology Preventive Veterinary MedicineVaccine
(59/87) (41/103)(33/139)
(24/129)
(3/128) (10/127)
(4/129)
(6/120)
(4/123)
(2/128)
(2/129)
Vet. Res. : A journal on animal infection & epidemiologyUn nouveau projet d’édition basée sur l’open access et un partenariat mixte en 2009
Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 28D I V I S I O NANIMAL HEALTHD I V I S I O NANIMAL HEALTH
Un bureau de veille stratégique et scientifique
ObjectifMeilleure connaissance de la demande sociétale et formalisation des questionsDéveloppement du partenariat d’orientationCommunication sur les produits scientifiques du Département SA (in WOS) Et autres produits de développement et de support technique
PrincipesDéfinition de cibles, et construction d’outils Web spécifiques et dédiés (RSS flux) , élaboration et entretien de bases de données par des veilleurs et modérateurs
Web Sites en productionVERSA : veille réglementaire en expérimentation animale bio confinée, éthique Visa : outil intranet veille industrielle, l’intelligence économique et PI en santé animale et santé publique vétérinaire (brevets,, licences, entreprises, etc…)VeliSA : Littérature francophone technique en santé animale (internet)@genda : Veille événementielle pour la recherche en santé animale Free-Archives for Veterinary Research
Web sites en développementDatanet : Références d’expertises du département Santé Animale (inranet)Produits du département Santé Animale (internet) PortSA: Portail de la santé animale en France pour le partenariat d’orientation