Top Banner
RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI INDIKATORORGANISMER PATOGENA BAKTERIER
32

RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Nov 16, 2020

Download

Documents

dariahiddleston
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

RECIPIENTENMIKROBIOLOGI

INDIKATORORGANISMER

PATOGENA BAKTERIER

Page 2: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Förhållandena i en näringsfattig sjö

Koldioxid + vatten + solljus Organiskt material och syre

Inga näringsämnen = ingen tillväxt

Page 3: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Om näringsämnen tillförs

Näringsämnen

Assimilation och Fotosyntes

Koldioxid + vatten + näringsämnen + solljus Organiskt material och syre

Page 4: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Källor till näringsämnen

Läckage från jordbruk

Avloppsreningsverk

Enskilda avlopp

Atmosfäriskt nedfall med ursprung

i förbränning av bränslen.

Page 5: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Om näringsämnen tillförsNäringsämnen

Assimilation och Fotosyntes

Döda alger faller till botten

Organiskt material + syre koldioxid + vatten + närsalter

Syre förbrukas nära botten vilket kan leda till syrebrist och att svavelväte produceras så att bottenlevande organismer dör.

Page 6: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Om näringsämnen tillförsNäringsämnen

Assimilation och Fotosyntes

Syrefria bottnar leder till att näringsämnet fosfor frisätts ur bottensedimentÄven ammonium frisätts från sediment när organiskt material bryts ned

Fosforn och kvävet tillförs ytvattnet under vår och höst när språngskiktet upplöses

Page 7: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Språngskikt

Varmt vatten

Sommar situation när solen värmer ytvattnet

Kallt vatten

Stabil skiktning bottenvattnet stannar vid botten

Page 8: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Språngskikt

Kallt vatten

Höstsituation när ytvattnet kyls

Kallt vatten

Språngskiktet upplöses och omblandning kan ske

Page 9: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Språngskikt

Kallare vatten

Vintersituation när ytvattnet kyls ytterligare

Varmare vatten

Stabil skiktning bottenvattnet stannar vid bottenVid syrefria förhållanden avges fosfor från botten

sediment

Page 10: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Språngskikt

Varmare vatten

Vårsituation när ytvattnet värms

Varmare vatten

Språngskiktet upplöses och omblandning kan skeFosforhaltigt vatten tillförs ytvattnet.

Page 11: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Om näringsämnen tillförsNäringsämnen

Assimilation och Fotosyntes

Syrefria bottnar leder till att fosfor frisätts ur bottensedimentÄven ammonium frisätts från sediment när organiskt materialbryts ned

Fosforn och kvävet tillförs ytvattnet under vår och höst när språngskiktet upplöses

Detta resulterar i tillväxt, sk algblommning, varvid ammonium och fosfor tas upp ur vattnet

Page 12: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering
Page 13: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Om näringsämnen tillförsNäringsämnen

Assimilation och FotosyntesTillväxt av kvävefixerande cyanobakterier

När kväve tar slut:

Eftersom höga halter fosfor finns i ytvattnet får kvävefixerande bakterier konkurensfördelar jämfört med alger som behöver kväve från vattnet.

Tillväxten ger minskat sikdjup och därmed mindre vattenvolym som innehåller syre i vilket djur (syre) och växter (ljus) kan leva.

Luftkväve

Page 14: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering
Page 15: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering
Page 16: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Tillväxtbegränsande ämnen

Eftersom kväve och fosfor är så viktiga (essentiella näringsämnen) talar man om kväve- respektive fosforbegränsning i sjöar och hav. Näringsämnesbegränsning betyder att om det finns lite eller inget alls kvar av dessa ämnen i vattnet i en för växterna/algerna tillgänglig form så omöjliggörs vidare tillväxt för algarterna i fråga.

Näringsämnena finnas tillgängliga i rätt förhållande till varandra (16 kväveatomer för varje fosforatom). Vanligtvis är det kväve som är det tillväxtbegränsande näringsämnet men i vissa kustområden, och i de flesta sjöar är det tillgången på fosfor som begränsar algtillväxten.

Page 17: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Mikrobiologisk bestämmning

Page 18: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Renodling av bakterier

Petri plattor med agar

inokuleras med provet som

skall undersökas

Plattorna placeras i

inkubator vid viss

temperatur. 30, 37 eller 44

grader är vanligt

Page 19: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Prickarna kallas kolonier och kommer från en enskild bakterie. Bakterien är renodlad och kan studeras närmare.

Ofta får man fram bakteriekolonier av olika form färg och storlek.

Page 20: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Identifiering av bakterier

Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering

Gramnegativ Grampositiv

Page 21: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Identifiering av bakterier

Metabolism; odling på eller i olika medium

Det finns också reagenskit som ger utslag för olika metabola egenskaper hos bakterierna

Page 22: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Ett sådant hör schema använder man när man bestämmer bakterier

Page 23: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering
Page 24: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering
Page 25: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Indikatororganismerindikerar förekomst av fekal förorening

Koliforma bakterer

Förekommer även i jord

Termotoleranta koliforma

Förekommer även i djurs avföring

E. coli

Mycket i mänsklig avföring och hos andra

varmblodiga djur

-------------------

Fekala streptokocker

lever längre i naturen än de andra

indikatororganismerna

Page 26: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Metodik, indikatororganismer

MPN

MF

Most probable number

Provet späds 10 ggr mellan

varje odlingsrör. När det inte

blir tillväxt har provet spätts

så mycket att inga bakterier

finns kvar.

Membranfilter teknik

Provet filtereras

Filtret placeras på plattan och

inkuberas

Prickarna kallas kolonier och

motsvarar en bakterie av

den typ som mäts i provet.

Page 27: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Vattenburna sjukdomar

Exempel:

Patogena protozoer Giardia lamblia

Chryptosporidium parvum

Patogena bakterier

Legionella pneumoniae

Salmonella typhi

Campylobacter

Virus poliovirus

Page 28: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Protozoer: Giardia lambliaFlagellat m. 8 flageller

Parasit (tunntarm, tolvfingertarm)

Fäster vid slemhinnor med sugskiva

Orsakar Giardiasis – akut gastroenteritis

Symptom: diarré, magkramp, illamående,

gaser, viktminskning

Page 29: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Protozoer: Cryptosporidium parvum

Små (2-5m)

Parasiter I magsäck och tarmar

Symptom – mild diarré

Page 30: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Bakterier: Campylobacter

Tarmbakterie hos

boskap och andra djur

En av de vanligaste

orsakerna till magsjuka

Page 31: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Bakterier: Salmonella typhi

Gram negativ,

kort stav, flageller

Orsakar tyfoidfeber: hög

feber, diarré,

svettningar, sårbildning i

tarmar

Page 32: RECIPIENTEN MIKROBIOLOGI - Cornemamedlem.cornema.se/wp-content/uploads/2015/08/VM... · Mikroskopering,morfologi. Graminfärgning mikroskopering Gramnegativ Grampositiv. Identifiering

Virus

Patogena virus förekommer i avloppsvatten

Elimineras i vattenrening, klorkänsliga

Enterovirus (RNA-virus, finns i tarmar) Poliovirus

Norwalk virus

Hepatit A virus