Remerciements Je tiens à remercier Mr. Jean-marc THIRION, directeur de l’association Obios au sein de laquelle j’ai effectué mon stage, et maître de stage, pour son aide, ses conseils, notamment dans la réalisation de ce rapport, mais aussi pour m’avoir fait découvrir le sonneur à ventre jaune, espèce que je ne connaissais pas, et avant tout de m’avoir permis de réaliser ce stage. Je tiens aussi à remercier la faculté de sciences fondamentales et appliquées de Poitiers, pour nous offrir l’opportunité de réaliser ce stage en 3 ème année de Licence. Pour finir, je tiens à remercier mes parents pour l’aide qu’ils m’ont fournie sur le plan matériel, pour financer l’essence pour me rendre sur le terrain, et pour le véhicule qu’ils m’ont prêté. 1
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rapport sonneur croissance avec table des matières
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Remerciements
Je tiens à remercier Mr. Jean-marc THIRION, directeur de l’association Obios au sein de
laquelle j’ai effectué mon stage, et maître de stage, pour son aide, ses conseils, notamment
dans la réalisation de ce rapport, mais aussi pour m’avoir fait découvrir le sonneur à ventre
jaune, espèce que je ne connaissais pas, et avant tout de m’avoir permis de réaliser ce stage.
Je tiens aussi à remercier la faculté de sciences fondamentales et appliquées de
Poitiers, pour nous offrir l’opportunité de réaliser ce stage en 3ème année de Licence.
Pour finir, je tiens à remercier mes parents pour l’aide qu’ils m’ont fournie sur le plan
matériel, pour financer l’essence pour me rendre sur le terrain, et pour le véhicule qu’ils
m’ont prêté.
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Présentation de l’association Obios
L’organisme d’accueil, l’association Obios, est une association crée récemment pas Mr
Jean-marc THIRION, et dont le siège est basé en Charente-Maritime. Cette association est
née dans le but de remplir plusieurs objectifs dans le cadre de la conversation de la
biodiversité :
Préserver la biodiversité en veillant à une cohérence scientifique des actions
Rappeler aux décideurs leurs engagements pour la conservation de la biodiversité
Former et sensibiliser les acteurs à la gestion conservatoire de la biodiversité
Sensibiliser le grand public sur les enjeux de conservation de la biodiversité
Faire connaître les enjeux « biodiversités » lors de projets d'aménagement OBIOS
s'engage à réaliser ses actions en partenariat avec les différents acteurs
Pour plus d’informations, il est possible de consulter le site internet de l’association :
puis décroîtra pour s'annuler quand la population atteint une taille limite qui sera donc L∞.
Ce modèle prévoit donc une limite précise de croissance.
Ceci correspond à l'équation :
Le modèle de Weibull
Le modèle de Weibull est plus utilisé pour traduire des probabilités. Il se définit par
l’équation suivante :
Où δ représente le paramètre qui contrôle la coordonnée en abscisse du point d’inflexion.
Si celui-ci vaut 1, la courbe est alors une simple courbe exponentielle.
2. Courbes de croissance obtenues
Après avoir insérée les données des tableaux I puis II (le nombre d’individus n’a pas été
pris en compte, les courbes ne sont donc pas pondérées) dans le logiciel growth, chaque cas
a été modélisé grâce aux équations citées précédemment.
Ces courbes ont ensuite été comparées, et, grâce à l’indice AIC (Akaike Information
Criterion), qui exprime les variations existantes entre le tracé obtenu et les données de
départ, c’est-à-dire les moyennes et écart-type calculés sous excel, la courbe la plus fidèle
aux données enregistrées a été sélectionnée. Le modèle le plus fidèle sera alors celui dont
l’indice AIC est le plus faible.
Courbe modélisant la croissance en longueur des femelles
Dans le tableau ci-dessous sont récapitulés les indices AIC obtenus avec les 5 modèles
présentés.
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Tableau III - Tableau indiquant les indices AIC obtenus en fonction du type de courbe modélisé pour la croissance des femelles sonneurs à ventre jaunes de la population d'Aignes-et-Puypéroux
Modèle
Non
linéaire de von
BertalanffyExponentiel De Gompertz Logistique De Weibull
Il apparait donc que l’indice d’AIC le plus faible se retrouve pour les deux premiers
modèles, à savoir le modèle non linéaire de von Bertalanffy et le modèle exponentiel. Le
reste des paramètres mesurables une fois la courbe établie (c'est-à-dire l’asymptote
supérieur, le taux de croissance, le temps t0 …) est identique, c’est pourquoi une seule des
deux courbes sera présentée.
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Figure 10 – courbe représentative de la croissante en longueur des individus femelles de la population de Bombina variegata d’Aignes-et-Puyperoux en fonction de l’âge.
Cette courbe, représentative de la croissance des femelles en fonction de l’âge de celles-
ci, apporte donc différentes informations sur la croissance des sonneurs à ventre jaune
femelles de la population d’Aignes-et-Puypéroux : (Les valeurs suivantes sont rapportées par
le logiciel)
Le taux de croissance K, qui est de 0,770543
La valeur de l’asymptote supérieure : 459,13
La somme des résidus au carré, qui désigne qui donne les variations entre la
courbe obtenue et les valeurs hypothétiques du modèle : 16,9327
Le critère de Schwarz, qui permet tout comme l’indice d’AIC, de déterminer le
modèle le plus réaliste : -2,95856
Courbe modélisant la croissance en longueur des mâles
Pour les mâles, 4 courbes ont aussi été réalisées. Les indices AIC obtenues sont indiqués
dans le tableau ci-dessous :
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Tableau IV - Tableau indiquant les indices AIC obtenus en fonction du type de courbe modélisé pour la croissance des femelles sonneurs à ventre jaunes de la population d'Aignes-et-Puypéroux
Ainsi, l’indice AIC est le plus faible pour le modèle non linéaire de von Bertalanffy. La
courbe obtenue nous donne les valeurs suivantes :
Le taux de croissance, K : 0,538868
La valeur de l’asymptote supérieure : 469,529
La somme des résidus au carré : 2,08284
Le critère de Schwarz : 12,1082
Discussion
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Figure 11 – courbe représentative de la croissante en longueur des individus mâles de la population de Bombina variegata d’Aignes-et-Puyperoux en fonction de l’âge.
I. Taille maximale atteinte en fonction du sexe
Les mâles ont tendance à atteindre une taille plus importante que les femelles, puisque
les résultats ici montrent une taille maximale atteinte pour les femelles de l’ordre de
459.10-1 mm, contre une taille maximale atteinte pour les mâles de 469.10-1 mm (asymptote
supérieure). Ce qui nous donne une différence d’1 mm, non négligeable pour des espèces
dont l’arrêt de croissance ce situe autour des 4-5 cm. Mais l’on peut noter que les femelles
qui ont été sélectionnées pour l’étude ont au maximum atteint un âge de 7 ans tandis que
les mâles sont arrivés jusqu’à 8 ans (pour 2 d’entre eux). Les données ne nous permettent
donc pas d’obtenir des résultats relativement précis, puisque les courbes n’ont pas été
pondérées en fonction du nombre d’individus.
Cependant, une autre étude réalisée entre 1994 et 2000 sur la croissance des crapauds
sonneurs à ventre jaune, en Lombardie, sur 85 individus (DI CERBO, 2001). Cet étude
s’appuie sur une classification déjà établie précédemment (PLYTYCZ & BIGAJ, 1993), qui
répartit les sonneurs en 9 classes suivant leur taille.
Dans cette étude, les
résultats étaient inversés : les mâles n’atteignaient que la classe 8, tandis que les femelles
atteignaient la classe 9. Les femelles ont donc été determinées comme plus grandes que les
mâles.
Une autre étude, menée en Ardèche par Massemin (2001) a montré, de même, que les
femelles avaient une taille et une masse corporelle plus importante que les mâles.
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Tableau V - Classification établie par PLYTYCZ et BIJAG (1993)
Figure 12 - Graphique montrant la répartition des individus, mâles ou femelle, en fonction de la classe, à partir de la classe 5, classe qui comprend le passage à l'âge adulte. (DI CERBO, 2000)
II. Taux de croissance en fonction du genre
Le taux de croissance des femelles Bombina variegata étudiées K est égal à 0,770543
contre un taux de croissance K de 0,538868 pour les mâles de la même population. Les
femelles ont donc une vitesse de croissance 1,4 fois plus importante que les mâles. Cette
différence s’observait déjà au niveau des tableaux présentant les moyennes de taille
obtenues en fonction de l’âge et du sexe des individus, puisque la femelle a tendance à
atteindre sa taille maximale lors de sa quatrième année, tandis que le mâle l’atteint un an
après, lors de sa cinquième année.
L’étude cité précédemment réalisée en Lombardie laissait apparaître les mêmes
résultats : la croissance annuelle mesurée pour les femelles était de 2,19 contre une
croissance annuelle mesurée de 1,523 pour les mâles, ce qui exprime bien un taux de
croissance plus élevé pour les femelles que pour les mâles.
III. Croissance générale (mâles et femelles confondus)
Les résultats obtenus montrent une croissance des sonneurs à ventre jaune de la
population d’Aignes-et-Puypéroux rapide dans les 3 première années, avec l’acquisition
d’environ 1 cm entre la première et la deuxième année, puis de 6 mm entre la deuxième et
la troisième année. Les années suivantes, les individus observés prennent 1 à 2 mm par an,
et cela régulièrement jusqu’à atteindre leur taille adulte.
La taille maximale atteinte par femelles et mâles confondus est de 46,9 mm (en
moyenne). Ce qui correspondrait aux données établies par de précédentes études, puisque
dans le tableau V, la classe 9 comprend des individus atteignant 51 à 55 mm, mais la figure ?
qui présente la répartition des individus (mâles et femelles) en fonction de ces classes
montre un nombre plus important d’individus se situant dans les classes 6 à 8, pour une
taille donc de 36 à 50 mm.
La longueur museau-cloaque généralement établie dans les publications portant sur le
sonneur à ventre jaune est de 30-59 mm (ABBÜHL & DURRER, 1993, GOLLMANN &
GOLLMANN, 2002).
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IV. Critique
Bien sur, il est possible d’émettre des critiques sur les résultats obtenus quand à la
précision des outils de travail et donc des mesures relevées sur le terrain. De plus, le nombre
d’individus relevé dans chaque tranche d’âge n’est pas le même, avec un nombre très
important de juvéniles (2ème année), nombre indiqué dans les tableaux I et II.
Cependant, les valeurs relevées sur le terrain et les analyses effectuées grâce aux courbes
modélisées à partir des données se révèlent concordantes avec les précédentes études
menées : Bien que cette étude indique une taille adulte plus importante pour les mâles que
pour les femelles, les courbes ont été établies à partir de moyennes. Or les individus ayant
atteint la taille la plus importante se trouvaient chez les femelles.
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Conclusion
L’espèce de crapaud Bombina variegata est un amphibien de petite taille, qui réalise sa
métamorphose après deux mois de vie larvaire (c'est-à-dire dans une période de juillet à
septembre), acquiert sa taille adulte lors de sa 3ème ou 4ème année. Prenant jusqu’à 1 cm
entre la 1ère et la 2ème année, cet amphibien ne mesurera pas plus de 5 à 5,5 cm à l’âge
adulte. Cette étude n’aurait pu être réalisée sans les techniques actuelles de biométrie,
techniques qui visent à être améliorer par une reconnaissance numérique (DELARZE, CIARDO
& PELLET, 2000), ainsi que la méthode de CMR.
Peu de publications font état de la croissance du sonneur à ventre jaune, espèce qui reste
pourtant à surveiller sur le territoire français, puisque celle-ci est menacée, notamment par
la surexploitation due à l’agriculture. Mais d’autres rapports font état de la croissance d’une
espèce de la famille, Bombina bombina (LINNE, 1761), le sonneur à ventre de feu, chez qui
on observerait une croissance similaire.
Enfin, bien que abordé dans cette étude, le poids est aussi un facteur important quand à
la surveillance de la croissance chez Bombina variegata, puisque durant la première année
les individus pèsent approximativement 1 g, pour atteindre jusqu’à 8 g à l’âge adulte.
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Bibliographie
ABBÜHL, R. et DURRER, H., (1993) - Zum bestand der Gelbbauchunke Bombina variegata
variegata in der region Basel. Verhanlungen der Naturforschenden Gesellschaft in Basel 103:
73-80.
AKAIKE, H. (1974) - A new look at the statistical model identification. IEEE Trans. Automat.
Control. 19, 716-723.
BARANDUN, J., (1992) - Reproductive flexibility in Bombina variegata. In : Korsós, Z., Kiss,
I. (Eds.), Proceedings of the 6th Ordinary General Meeting of the Societas Europaea
Herpetologica, 19-23 August 1991, Budapest, Hungary, pp.65-68.
JAHN, K., KNITTER, H., RAHMEL, U., (1996) - Erste ergebnisse einer studie an der
Gelbbauchunke (Bombina variegata) in einem natürlichen habitat im französischen
Zentralmassiv. Naturschutzreport 11: 32-46.
MORAND, A., (1997) Stabilité relative des habitats de développement larvaire et de
reproduction de Bombina variegata et Bufo calamita : l’insuffisance des Modèles r-K et r-K-
A. Geobios. 21: 23-36.
PICHENOT J., (2008) - Contribution à la biologie de la conservation du Sonneur à ventre
jaune (Bombina variegata L.). Mémoire de thèse, Université de Reims Champagne-Ardennes.
PLYTYCZ, B. & BIGAJ, J., (1993) - Studies on the growth and longevity of the yellow bellied
toad Bonlbina variegufa, in natural enviroments. - Amphibia-Reptilia, 14: 35-44.
SEIDEL, B., (1988) - Die struktur, dynamik und fortpflanzungsbiologie einer
Gelbbauchunkenpopulation (Bombina variegata variegata L. 1758, Discoglossidae, Anura,
Amphibia) in einem habitat mit temporären kleingewässern im Waldviertel
(Niederösterreich). Ph.D. dissertation, Universität Wien.
WAGNER, T., (1996) - Untersuchungen zum aquatischen Lebensraum der Gelbbauchunke,
Bombina v. variegata (LINNAEUS, 1758), als Grundlage für Plege- und Entwicklungskonzepte.
Natuschutzreport. 11: 69-76.
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Annexes
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Annexe I - Cartes de la répartition géographique du Sonneur à ventre jaune. A : En Europe (GASC et al;, 1997); B : En France (CASTANET & GUYETANT, 1989).
Annexe II - Exemple de fiche d'identité d'un mâle Bombina variegata. On y retrouve le lieu de capture, le sexe, la taille, le poids, et les anomalies qui y sont répertoriées.
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Annexe III - Photo de sonneurs à ventre jaune dans une flaque. On retrouve au milieu un mâle et une femelle en amplexus. L'individu à droite est un juvénile. On peut ainsi remarquer la différence de taille entre les juvéniles et les adultes.