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R: A Language and Environment forStatistical Computing
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Version 4.2.0 Under development (unstable) (2021-05-19)
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i
I 1
1 The base package 3base-package . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.bincode . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 3.Device . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 4.Machine . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.Platform .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 7abbreviate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9agrep . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
10all . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 12all.equal . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14all.names
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 17any . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18aperm . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
19append . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 20apply . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21args . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 22Arithmetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24array . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 26as.data.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 28as.Date . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
30as.environment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 33as.function . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34as.POSIX* .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 35AsIs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38asplit . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
39assign . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 40assignOps . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41attach . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 42attr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44attributes . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 45autoload . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 47backsolve . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48basename . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 49Bessel . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50bindenv . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 53bitwise . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55body . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
56bquote . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 57browser . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58browserText
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 59builtins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60by . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
61c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 62call . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64callCC
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 65CallExternal . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66capabilities . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 67cat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 69cbind . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
71char.expand . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 74character . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
-
ii
charmatch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 76chartr . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77chkDots .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 79chol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80chol2inv . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 82class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 83col . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85Colon .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 86colSums . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87commandArgs . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
89comment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 89Comparison . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90complex . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 92conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 94conflicts . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
98connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 99Constants . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109contributors
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 110Control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110copyright . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
112crossprod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 112Cstack_info . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113cumsum .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 114curlGetHeaders . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115cut . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 116cut.POSIXt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 118data.class . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
120data.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 121data.matrix . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123date . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 124Dates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125DateTimeClasses . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 126dcf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 130debug . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
132Defunct . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 134delayedAssign . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135deparse
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 136deparseOpts . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138Deprecated . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 140det . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 141detach . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142diag
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 144diff . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145difftime . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 146dim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148dimnames . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
149do.call . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 151dontCheck . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153dots .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 153double . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154dput . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 156drop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 158
-
iii
droplevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 158dump . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159duplicated
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 161dyn.load . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163eapply . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 166eigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 167encodeString . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
169Encoding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 170environment . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172EnvVar . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 174eval . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176exists . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
179expand.grid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 181expression . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 182Extract
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 183Extract.data.frame . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188Extract.factor . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 191Extremes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 192extSoftVersion . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
194factor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 195file.access . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
199file.choose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 200file.info . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
201file.path . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 202file.show . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
203files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 205files2 . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
207find.package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 209findInterval . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210force .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 212forceAndCall . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213Foreign . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 214formals . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 216format . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
217format.info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 220format.pval . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221formatC
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 222formatDL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 227function . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 228funprog . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 229gc . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
231gc.time . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 233gctorture . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234get .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 235getDLLRegisteredRoutines . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236getLoadedDLLs . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 238getNativeSymbolInfo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 239gettext . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 241getwd
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 242gl . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244grep . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 244grepRaw . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 250
-
iv
groupGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 252grouping . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254gzcon . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 255hexmode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256Hyperbolic . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
258iconv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 259icuSetCollate . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
261identical . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 264identity . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 266ifelse
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 267integer . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268interaction .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 270interactive . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271Internal . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 272InternalMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 272invisible . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
274is.finite . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
276is.language . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 277is.object . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278is.R .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 278is.recursive . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 279is.single . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 280is.unsorted . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 281ISOdatetime . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
281isS4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 282isSymmetric . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283jitter .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 285kappa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286kronecker . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 288l10n_info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 289labels . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
290lapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
294La_library . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 295length . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 296lengths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297levels . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 298libcurlVersion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 300libPaths . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
301library . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
306license . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 308list . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
308list.files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 310list2DF . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
312list2env . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 313load . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314locales
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 316log . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318Logic . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 320
-
v
logical . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 322LongVectors . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
323lower.tri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 324ls . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
324make.names . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327mapply . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329mat.or.vec . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
330match . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 331match.arg . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
333match.call . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 334match.fun . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335MathFun
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337matrix . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 338maxCol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 340mean . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
341memCompress . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . 342memlimits . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344Memory . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . 346memory.profile . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
347merge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350missing
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 351mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352NA . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 354name . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 356names . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357nargs
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 359nchar . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 363norm . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
364normalizePath . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 367nrow . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 369ns-load . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
373NULL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 374numeric . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
375NumericConstants . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 377numeric_version . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
382options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
392outer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 395
-
vi
Paren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . 404plot . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
405pmatch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 407polyroot . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
408pos.to.env . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
410Primitive . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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415prmatrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 420pushBack . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 421qr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 422QR.Auxiliaries . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 425quit . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 426Quotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 428R.Version . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 431Random . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 433Random.user . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 437range .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
444rawConversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 445RdUtils . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 448readBin .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 453readLines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 454readRDS . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
456readRenviron . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 458Recall . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
459reg.finalizer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 459regex . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
460regmatches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 465remove . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 467rep . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 468replace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470Reserved . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 471rev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 472Rhome . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 472rle
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 473Round . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 474
-
vii
round.POSIXt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 476row . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
477row+colnames . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 478row.names . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 479rowsum . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 481S3method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 482sample . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
483save . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 485scale . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 488scan .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 489search . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 493seek . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 494seq . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 495seq.Date . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
497seq.POSIXt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 498sequence . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 500serialize
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 501sets . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 502setTimeLimit . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 503showConnections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 504shQuote . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 506sign . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 507Signals . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 508sink . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 508slice.index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 510slotOp . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
511socketSelect . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 512solve . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 512sort .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 514source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 517Special . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 520split . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 523sprintf . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
525sQuote . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 529srcfile . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
531standardGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 533startsWith . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 534Startup
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 535stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 538stopifnot . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 539strptime . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 541strrep . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
547strsplit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 548strtoi . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
550strtrim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 551structure . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
551strwrap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 552subset . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
553substitute . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 555substr . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 557sum . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 558summary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 560
-
viii
svd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 561sweep . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 563switch
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 564Syntax . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 566Sys.getenv . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 567Sys.getpid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 568Sys.glob . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
569Sys.info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 570Sys.localeconv . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 572sys.parent
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 573Sys.readlink . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 575Sys.setenv . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 576Sys.setFileTime . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 577Sys.sleep . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
578sys.source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 579Sys.time . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
580Sys.which . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 581system . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
582system.file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 584system.time . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
585system2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 586t . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 588table
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 589tabulate . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 592tapply . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 593taskCallback . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 595taskCallbackManager . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
597taskCallbackNames . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 598tempfile . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
599textConnection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 601tilde . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
603timezones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 604toString . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 608trace .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 609traceback . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 613tracemem . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 615transform . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 616Trig . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
618trimws . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 619try . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620typeof
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 622unique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 623unlink . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 624unlist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 625unname . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
627UseMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 628userhooks . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
630utf8Conversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 632UTF8filepaths . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 634validUTF8
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 635vector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 636Vectorize . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 638
-
ix
warning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 639warnings . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 641weekdays
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 642which . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 644which.min . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 646with . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 647withVisible . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 649write
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 650writeLines . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 651xtfrm . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 652zapsmall . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 653zpackages . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
653zutils . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 654
2 The compiler package 655compile . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655
3 The datasets package 659datasets-package . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659ability.cov
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 659airmiles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 660AirPassengers . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 661airquality . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 662anscombe . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 663attenu .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 664attitude . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 665austres . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 666beavers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 666BJsales . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
668BOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 668cars . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
669ChickWeight . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 670chickwts . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 671CO2 . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 672co2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 673crimtab . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 674discoveries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 676DNase . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
676esoph . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 677euro . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 679eurodist
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 680EuStockMarkets . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 680faithful . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 681Formaldehyde . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 682freeny . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
683HairEyeColor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 684Harman23.cor . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 685Harman74.cor
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 685Indometh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 686infert . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
687InsectSprays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 688iris . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
688islands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 690
-
x
JohnsonJohnson . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 690LakeHuron . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 691lh . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . 691LifeCycleSavings . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 692Loblolly . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
693longley . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 694lynx . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 695morley .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 695mtcars . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 696nhtemp . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 697Nile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 698nottem . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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-
xi
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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-
xii
pretty.Date . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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5 The graphics package 851graphics-package . . . . . . . . . . .
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872cdplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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-
xiii
locator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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. . . . . . . . . . . . . . . 946plot.table . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
947plot.window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 948plot.xy . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 949points
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 950polygon . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 954polypath . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 956rasterImage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 958rect . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
959rug . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 960screen . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
961segments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 963smoothScatter . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 964spineplot
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 966stars . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 969stem . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 972stripchart . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 973strwidth . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
974sunflowerplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 976symbols . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 978text . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 980title . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 983units . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 984xspline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 985
6 The grid package 989grid-package . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 989absolute.size .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 990arrow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 991calcStringMetric . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
991dataViewport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 993depth . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 994deviceLoc
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . 995drawDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 996editDetails . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 997editViewport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 998explode . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
999gEdit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 999
-
xiv
getNames . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1000gpar . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1001gPath .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1003Grid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1004Grid Viewports .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 1004grid.add . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 1008grid.bezier . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1009grid.cap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1010grid.circle . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1011grid.clip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1012grid.convert . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1014grid.copy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1016grid.curve . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1016grid.delay . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1018grid.display.list . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1019grid.DLapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1020grid.draw . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1021grid.edit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1022grid.force . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1023grid.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1025grid.function . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1026grid.get . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1028grid.grab . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1029grid.grep . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1031grid.grill . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1032grid.grob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1033grid.layout . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1034grid.lines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1036grid.locator . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1038grid.ls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1039grid.move.to . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1041grid.newpage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1042grid.null . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1043grid.pack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1044grid.path . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1045grid.place . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1048grid.plot.and.legend . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1049grid.points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1050grid.polygon . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1051grid.pretty . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1052grid.raster . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1053grid.record . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1054grid.rect . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1055grid.refresh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1057grid.remove . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1057grid.reorder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1058grid.segments . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1060grid.set . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1061grid.show.layout . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1062grid.show.viewport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1063grid.text . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1064grid.xaxis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1066
-
xv
grid.xspline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1067grid.yaxis . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1069grobCoords . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1071grobName . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1071grobWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1072grobX . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1073legendGrob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1074makeContent . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1075patterns
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1076plotViewport . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1078Querying the
Viewport Tree . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 1078resolveRasterSize . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . 1080roundrect . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1081showGrob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1082showViewport . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1083stringWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1084unit . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1085unit.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1087unit.length . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1088unit.pmin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1088unit.rep . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1089unitType . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1090valid.just . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1091validDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1092vpPath . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1092widthDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1093Working with Viewports . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1094xDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1096xsplinePoints . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1097
7 The methods package 1099methods-package . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1099.BasicFunsList . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1100as . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1100BasicClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1102callGeneric . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1103callNextMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1105canCoerce . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1109cbind2
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 1109Classes . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1111classesToAM . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 1111Classes_Details . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 1113className . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1116classRepresentation-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1118Documentation . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1119dotsMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1120environment-class . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1123envRefClass-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1124evalSource . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1125findClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1128findMethods . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1129fixPre1.8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1132genericFunction-class . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1133
-
xvi
GenericFunctions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1134getClass . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1137getMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1139getPackageName . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1142hasArg .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1143implicitGeneric . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1144inheritedSlotNames
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . 1146initialize-methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 1147Introduction . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1148is . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 1150isSealedMethod . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1152language-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1153LinearMethodsList-class . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1154LocalReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1155makeClassRepresentation . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1156method.skeleton . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1157MethodDefinition-class . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1158Methods
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1159MethodsList-class . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1159Methods_Details . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 1160Methods_for_Nongenerics . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1164Methods_for_S3 . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1169MethodWithNext-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1170new . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1171nonStructure-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1173ObjectsWithPackage-class . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1174promptClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1175promptMethods . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1176ReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1177removeMethod . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1188representation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1188S3Part . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1190S4groupGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1193SClassExtension-class . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1195selectSuperClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1196setAs . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1197setClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1200setClassUnion . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1204setGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1206setGroupGeneric . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1210setIs .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 1211setLoadActions . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1215setMethod . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 1218setOldClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 1222show . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1225showMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1227signature-class . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1229slot .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 1230StructureClasses . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1232testInheritedMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1234TraceClasses . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1235validObject . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1236
-
xvii
8 The parallel package 1239parallel-package . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1239clusterApply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1240detectCores . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1243makeCluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1244mcaffinity . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1246mcchildren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1247mcfork . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1249mclapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1251mcparallel . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1254pvec
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 1257RNGstreams . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1259splitIndices .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 1260
9 The splines package 1263splines-package . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1263asVector
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1263backSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1264bs . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . 1265interpSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1266ns . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1267periodicSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1269polySpline . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1270predict.bs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1271predict.bSpline . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1272splineDesign . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1273splineKnots . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1274splineOrder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1275xyVector . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1276
10 The stats package 1277stats-package . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1277.checkMFClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1277acf . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1278acf2AR
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . 1281add1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1281addmargins . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 1284aggregate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 1285AIC . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1288alias . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1290anova . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1291anova.glm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1292anova.lm . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1293anova.mlm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1295ansari.test . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1297aov .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 1299approxfun . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1301ar . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 1304ar.ols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1307arima . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 1309arima.sim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1313arima0 . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1314ARMAacf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1318
-
xviii
ARMAtoMA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 1319as.hclust . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1320asOneSidedFormula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1321ave . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1321bandwidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1322bartlett.test . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1324Beta
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . 1325binom.test . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1328Binomial . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 1330biplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1331biplot.princomp . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1333birthday . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1334Box.test . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1335C .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . 1336cancor . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1337case+variable.names . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1339Cauchy . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1340chisq.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1341Chisquare . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1343cmdscale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1346coef . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1348complete.cases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1349confint . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1350constrOptim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1351contrast . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1353contrasts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1355convolve . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1356cophenetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1357cor . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1359cor.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . 1362cov.wt . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1364cpgram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1366cutree . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1367decompose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . 1368delete.response . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1369dendrapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1371dendrogram . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1372density
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . 1377deriv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1380deviance . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . 1383df.residual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1384diffinv . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. 1385dist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . 1386Distributions . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1389dummy.coef . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . 1390ecdf . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1391eff.aovlist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . 1393effects . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1395embed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .