Publish ? Yes We Can !

Et surtout : comment être publié ???

Dr Gérard Bozet

Comment écrire un article ?

Vous avezune idée brillante

“Surely you were aware

when you accepted the position, Professor,

that it was Publish or Perish”

Comment publier ?

• Des principes

• Simples

• Mais plasticité neuronale indispensable

• Des méthodes : accessibles à des Bac + 10

• Des outils : un site web

How To Write a Scientific Paper – A General Guide

Background: Author’s Perspective

Motivation to publish:–Dissemination (54% 1st choice)

–Career prospects (20% 1st choice)

–Improved funding (13% 1st choice)

–Ego (9% 1st choice)

–Patent protection (4% 1st choice)

–Other (5% 1st choice)

Bryan Coles (ed.) The STM Information System in the UK, BL Report 6123, Royal Society, BL, ALPSP, 1993

Author Publishing Priorities

• Quality and speed

–Top items were

• Refereeing speed

• Refereeing standard

• Journal reputation

• Editor/board, physical quality and publication services

Reader’s priorities

• Authoritative quality articles

• Ease of access

• Rapid delivery

• Convenient format

• Linking of information - clustering

• Low or no cost

• Up-to-date information

Differences: Authors and Readers

• Authors are journal focused

• Readers are article focused

• Publish more/read less dichotomy

Key Elements of Publishing

• Ethical Issues

• Style and language

• Structure of paper

• Components of paper

• Article submission/journal selection

• Publisher’s process/peer review

Les principes

• Ne pas ranger (son disque dur), trouver !

• Lire les autres

• Les outils : un site web à votre disposition

• Quelques bonus

Ne pas ranger, trouver !

• Disque dur : fouiller

• Google desktop

• Indispensable, gratuit

• Articles : comme la musique

• Non pas iTunes

• Mais Papers (OSX) ou PDF Explorer (Win)

Tamisage double

AspirationPreprint

OA

Les outils

23

Brin S, Page L. The Anatomy of a Large-Scale Hypertextual Web Search Engine.

www-db.stanford.edu

Nature 2000 ; 405: 113

25

5 ans plus tard…Google résout les cas cliniques

du New Engl J Med

26

27

Design Internet based study using Google to search for diagnoses; researchers were blind to the correct diagnoses.

Setting Diagnostic cases published (2005) in the NEJM

Main outcome measure Percentage of correct diagnoses from Google searches

Results Correct diagnosis in 58% cases (IC 95% : 38-77%)

Conclusion 1) The web is rapidly becoming an important clinical tool for doctors2) Web based searching may help doctors to diagnose difficult cases

28

Giustini D. How Google is changing medicine.

BMJ 2005 ; 331:1487-8.

0

100

200

300

400

BMJ : d'où viennnent les lecteurs (nov. 2005)

GoogleScholarYahoo!PubMed

(Visiteurs ‰)

Steinbroock R. Searching for the right literature (NEJM 2006)

30

… And a diagnostic test was performed

• L’histoire d’un “beau malade”

• Greenwald R : « …And a diagnostic test was performed. » N Engl J Med 2005 ; 353 : 2089-90.

• Un nourrisson à l’hôpital de Long Island

31

Nourrisson - diarrhée

• Eruption cutanée : peau « d’alligator »

• Déficit de la fonction des cellules T

• Hyperéosinophilie

• Sanguine

• Biopsie de muqueuse gastrique

• Interrogatoire des parents plusieurs garçons décédés avec le même tableau (maladie génétique récessive liée à l’X)

32

Un consultant est invité

• Longue discussion, puis…

• …Il demande son avis à l’interne !

• Réponse : syndrome IPEX (Immunodeficiency, Polyendocrinopathy, Enteropathy, X-linked)

• Méthode ? Le Googling !

AspirationPreprint

Open Access

35

Intérêt du cache de Google

Chloé James et coll., Nature 2005

Une mutation unique du gène de la protéine JAK2 provoque la polyglobulie

36

38

40

• 1 principe – Non pas page originale– Mais copie dans la base

• 4 indications– Affichage rapide– Source indisponible, modifiée ou disparue– Surlignage automatique– Lire gratuitement un article payant (parfois -

souvent ?)

Pourquoi concevoir un diaporama…

Puisqu’il est déjà prêt !

.edu

how to get published

Tamisage double

Quelques bonus

Anne O’TateBiomedexperts

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