Wprowadzenie do użytkowania infrstruktury PLGrid. Usługi QCG dla gridu dziedzinowego: chemia kwantowa i fizyka molekularna czyli PLGrid Plus i Chemia kwantowa prof. Jacek Komasa (UAM) dr Krzysztof Kurowski (PCSS) Piotr Kopta (PCSS) Tomasz Piontek (PCSS) Mariusz Mamoński (PCSS) Poznań, 31 listopada 2012 r.
27
Embed
prof. Jacek Komasa (UAM) dr Krzysztof Kurowski (PCSS) Piotr Kopta (PCSS) Tomasz Piontek (PCSS)
prof. Jacek Komasa (UAM) dr Krzysztof Kurowski (PCSS) Piotr Kopta (PCSS) Tomasz Piontek (PCSS) Mariusz Mamoński (PCSS). Wprowadzenie do użytkowania infrstruktury PLGrid. Usługi QCG dla gridu dziedzinowego: chemia kwantowa i fizyka molekularna czyli PLGrid Plus i Chemia kwantowa. - PowerPoint PPT Presentation
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Wprowadzenie do użytkowania infrstruktury PLGrid. Usługi QCG dla gridu dziedzinowego: chemia kwantowa i fizyka molekularnaczyli
PLGrid Plus i Chemia kwantowaprof. Jacek Komasa (UAM)
dr Krzysztof Kurowski (PCSS)Piotr Kopta (PCSS)
Tomasz Piontek (PCSS)Mariusz Mamoński (PCSS)
Poznań, 31 listopada 2012 r.
Agenda
1. PLGrid Plus i gridy dziedzinowe2. Dostęp do infrastruktury3. Zlecanie zadań4. Granty
Konsorcjum
Akademickie Centrum Komputerowe CYFRONET AGH w Krakowie
Poznańskie Centrum SuperkomputerowoSieciowe w Poznaniu
Interdyscyplinarne Centrum ModelowaniaMatematycznego i Komputerowego w Warszawie
Wrocławskie CentrumSieciowo - Superkomputerowe we Wrocławiu
Akademickie Centrum Komputerowe CYFRONET AGH w Krakowie
Gridy dziedzinowe
• Przygotowanie specyficznych środowisk i usług dostosowanych do potrzeb różnych grup naukowców (początkowo 13 grup użytkowników: AstroGrid, HEPGrid, Nanotechnologie, Akustyka, LifeScience, Chemia kwantowa i fizyka molekularna, Ekologia, SynchroGrid, Energetyka, Bioinformatyka, Zdrowie, Materiały, Metalurgia).
• Stworzenie platformy do współpracy i wymiany doświadczeń pomiędzy grupami naukowców pracującymi nad podobnymi zagadnieniami
• Umożliwienie przeprowadzenia eksperymentów obliczeniowych, jakie z powodu swojej złożoności i czasochłonności nie były możliwe do wykonania z wykorzystaniem mniejszej ilości zasobów
Chemia kwantowa i fizyka molekularna
• Udostępnienie zintegrowanego środowiska uruchamiania skomplikowanych, wieloetapowych eksperymentów obliczeniowych na platformie gridowej (w Infrastrukturze PL-Grid)
• Utworzenie platformy do efektywnego modelowania komputerowego własności mechanicznych i termomechanicznych materii na różnych poziomach złożoności struktury i dla różnych skal przestrzennych i czasowych
• Migracja użytkowników do nowoczesnych pakietów oprogramowania• Wsparcie dla grup tworzących oprogramowanie• Zaangażowane instytucje:
– Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, – Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe, – Wydział Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego
Koszt dostępu
• Dostęp do infrastruktury gridowej oferowanej w ramach projektu PL-Grid jest nieodpłatny dla naukowców i wszystkich osób prowadzących działalność naukową, związaną z uczelnią lub instytutem naukowym w Polsce.
• Użytkownikiem infrastruktury PL-Grid może być każda osoba prowadząca badania naukowe, związana z jednostką naukową w rozumieniu ustawy z dnia 8 października 2004 r. o zasadach finansowania nauki.
• Z konta dostępowego do infrastruktury ma prawo korzystać wyłącznie właściciel tego konta. Zabronione jest udostępnianie konta osobom trzecim.
• Użytkownik jest uprawniony do korzystania z zasobów infrastruktury PL-Grid jedynie w celu wykonywania obliczeń oraz przechowywania danych zgodnie z zadeklarowanym tematem badań.
• Zabrania się wykorzystywania zasobów niezgodnie z prawem oraz wszelkich działań umyślnych, które mogą zakłócić poprawne funkcjonowanie infrastruktury.
• Użytkownik jest zobligowany do załączenia informacji o wykorzystaniu infrastruktury PL-Grid w publikacjach, które powstały w oparciu o wyniki uzyskane przy użyciu tej infrastruktury.
• Użytkownik ma obowiązek raportowania wszystkich takich publikacji poprzez funkcjonalność udostępnianą w Portalu Operacyjnym, w celu rozliczenia grantu, nie rzadziej niż co rok. Brak wypełnienia obowiązku rozliczenia użycia zasobów może spowodować zawieszenie usług.
Od czego zacząć –zasady funkcjonowania
• Aby zostać użytkownikiem infrastruktury PL-Grid należy dokonać rejestracji w portalu PL-Grid. W trakcie procesu rejestracji wymagana jest akceptacja regulaminu używania infrastruktury oraz określenie dziedziny i tematyki badań. W wyniku rejestracji nadawany jest użytkownikowi identyfikator PL-Grid, który jednoznacznie identyfikuje użytkownika w infrastrukturze.
• W procesie rejestracji użytkownika dane weryfikowane są przez operatora Centrum Operacyjnego PL-Grid z wykorzystaniem bazy danych: "Ludzie nauki" dostarczanej przez Ośrodek Przetwarzania Informacji (zwanej dalej bazą OPI). Użytkownik musi potwierdzić wprowadzone dane poprzez odpowiedź na e-mail wysłany przez operatora na adres zarejestrowany w bazie OPI.
• Osoby niezarejestrowane w OPI (doktoranci, studenci) lub osoby, których dane w bazie OPI są niekompletne bądź nieaktualne, zobowiązane są wskazać opiekuna naukowego, którego dane w OPI są aktualne i który spełnia warunki określone dla użytkownika infrastruktury PL-Grid. Opiekun naukowy potwierdza autentyczność danych osobowych i związek z działalnością naukową wykonywaną za jego wiedzą.
• Opiekun naukowy nie jest prawnie odpowiedzialny za niezgodne z prawem działania potwierdzonego przez niego użytkownika. Potwierdzenie użytkownika przez opiekuna naukowego jest traktowane jako potwierdzenie tożsamości użytkownika i jego udziału w pracach naukowych.
Dostęp do infrastrukturyPortal
• Umożliwia założenie konta bądź zalogowanie się do niego
• Sprawdzenie zużycia zasobów
• Aplikowanie o dostęp do zasobów
• Składanie wniosków o grant
https://portal.plgrid.pl
Dostęp do infrastrukturyZakładanie konta
• Wymagane informacje:• dane osobowe (imię, nazwisko, pesel, login, email,
numer telefonu, hasło)• numer z bazy OPI (swój lub opiekuna naukowego) http://nauka-polska.pl/dhtml/raportyWyszukiwanie/
wyszukiwanieLudzieNauki.fs
• Cała procedura dokładnie opisana w Podręczniku użytkownika
http://plgrid.pl/podrecznik_uzytkownika
Generowanie certyfikatów
• Certyfikat poświadcza tożsamość użytkownika• Simple CA vs Polish Grid CA• Potrzebny przy zlecaniu zadań i dostępie do
infrastruktury obliczeniowej• Generowanie w portalu (przycisk wygeneruj
certyfikat SimpleCA w zakładce Moje konto, w ramce Certyfikaty SimpleCA)
Aplikowanie o dostępdo zasobów
• Ramka Usługi w zakładce Moje Konto
• Umożliwia włączenie/wyłączenie dostępu lub uzyskanie informacji o usługach oferowanych w projekcie PLGrid
• Do zlecania zadań w przez nas prezentowany sposób należy aplikować o usługę Globalny dostęp QosCosGrid
• Czas propagowania się informacji na wszystkie systemy
Zlecanie zadańInfrastruktura QCG
• Zestaw narzędzi do zarządzania zasobami i zadaniami uruchomionymi na wielu klastrach dostęp do lokalnych systemów klastrowych
• Wspiera m. in. obsługę zadań wielo-klastrowych, parametrycznych, typu workflow.
• Zainstalowany na wszystkich maszynach infrastruktury PL-Grid
• Zawiera zarówno tekstowe, graficzne, jak i portalowe narzędzia dostępowe.
• Aplikacja graficzna napisana dla systemów Windows, Linux oraz Mac OS.
• Umożliwia zlecanie zadań w bardzo prosty i intuicyjny dla użytkownika sposób.
• Aktualnie obsługuje aplikacje: Matlab, Mathematica, Gamess, LAMMPS, Molpro, Ansys-Fluent, NAMD, Gaussian-09, Ansys-CFX, a także skrypty w językach Bash oraz R.
• Istnieje możliwość dodania innych aplikacji używanych przez użytkowników.
• Pozwala na dostęp do plików wyjściowych w trakcie działania aplikacji.
• Wymaga od użytkownika posiadania certyfikatu PL-Grid.