Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede kartoffelpartier. • Steen Lykke Nielsen, Mogens Nicolaisen og Annemarie Fejer Justesen • Danmarks JordbrugsForskning, Afdeling for Plantebeskyttelse, Forskningscenter Flakkebjerg, Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
17
Embed
Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede kartoffelpartier.
Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede kartoffelpartier. Steen Lykke Nielsen, Mogens Nicolaisen og Annemarie Fejer Justesen Danmarks JordbrugsForskning, Afdeling for Plantebeskyttelse, Forskningscenter Flakkebjerg,. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri - PowerPoint PPT Presentation
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede
kartoffelpartier.
• Steen Lykke Nielsen, Mogens Nicolaisen og Annemarie Fejer Justesen
• Danmarks JordbrugsForskning, Afdeling for Plantebeskyttelse, Forskningscenter Flakkebjerg,
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Baggrund.
• Problemer med Phoma- og Fusarium-råd i lagrede kartofler.
• Et forprojekt bevilget af Kartoffelafgifts-fonden i 2003.
Disposition
• Symptomer.
• Faktorer, der påvirker udvikling af Phoma- og Fusarium-råd.
• Sårings-tests.
• Test baseret på real time PCR.
• Test baseret på kunstig næse.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Symptomer af Phoma
• Mørk rund tommelfingeraftryks-lignende rådplet.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Symptomer af Fusarium
Mørk indsunken plet med indskrumpede koncentriske ringe.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 1.
Sygdom Phoma-råd,kraterråd Fusarium-råd, tørråd
Værtplanter. Kartoffel. Kartoffel.
Smitteveje. Udsædsbåren. Smitter fra inficerede stængler.
Jord- og udsædsbåren.
Overlevelse i jord. Kort tid (1 år). Op til 7 år.
Etablering i kartoffelplanten
I stængler og knolde. Inficerer undertiden sunde knolde. Aggressiv sårparasit.
Kun i knolde. Såring en nødvendig forudsætning.
Aggressiv sårparasit.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 2.
Sygdom Phoma-råd,kraterråd Fusarium-råd, tørråd
Udvikling af råd på lager
Entydigt sammenhæng mellem omfang af såring og udvikling af råd. Hurtig sårheling giver reduceret råd.
Entydigt sammenhæng mellem omfang af såring og udvikling af råd.
Optimale forhold for udvikling af råd
4-5C og tør luft, dvs. forhold, som hæmmer sårheling
15-20C og høj luftfugtighed. Efter etablering udvikles råd også fra 4C og opefter
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 3.
Sygdom Phoma-råd,kraterråd Fusarium-råd, tørråd
Knoldenes varierende modtagelighed
Høj på tidligt vækststadium, minimal hos afmodnede knolde for igen at stige under lagringen.
Høj på tidligt vækststadium, minimal hos afmodnede knolde for igen at stige under lagringen.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 4.
Sygdom Phoma-råd,kraterråd Fusarium-råd, tørråd
Forebyggelse Undgå såring. Hurtig sårheling (2 uger ved 15 C og RH > 70%). Afmodning af knoldene inden høst. Hurtig høst efter nedvisning. Undgå sen sortering.
Undgå såring. Hurtig tørring af knoldoverflade før temp. hæves til sårheling. Undgå kondensdannelse. Afmodning af knoldene inden høst. Undgå sen sortering.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Sårings-test til at bestemme latente Fusarium-infektioner.
• Princip: Knolden såres og inficeres med den påhæftede jord.
• Eksempel: ”Skæringstesten”:
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Sårings-test til at bestemme latente Phoma-infektioner.
• Princip: Knolden såres og inficeres med den påhæftede jord.
• Eksempel: ”Knack-testen”.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 1
• Princip: Knoldenes påhæftede jord afvaskes. • Der ekstraheres totalt DNA fra jorden. • Der køres ”real-time” PCR på DNA’et. • Testen er ikke udviklet endnu.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 2
• Eksisterende elementer:
• Ekstraktion• Primere• Udstyr tilgængeligt
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 3
• Manglende elementer:• Nye primere• Korrelation mellem
DNA- og såringstests• Indre og ydre latent
Phoma• Korrelation mellem
DNA og % knolde
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Test baseret på kunstig næse 1
• Princip: Måling af flygtige organiske forbindelser, der udskilles af knoldene.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Test baseret på kunstig næse 2
• Der udskilles specifikke flygtige organiske forbindelser, når svampen metaboliserer knold-vævet.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning
Konklusion.
• Der eksisterer allerede standardiserede tests til at påvise og kvantificere latent smitte af Phoma- og Fusariumråd.
• Testen tager 2 uger for Fusarium og 6-9 uger for Phoma.
• Det vil antageligt være muligt at udvikle en hurtigere test baseret på real-time PCR, men det vil kræve et stort udviklingsarbejde.
• Anvendelse af kunstige næser vurderes til ikke at være velegnet til at påvise latent smitte.
Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og FiskeriDanmarks JordbrugsForskning