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MODELLI NEURONALI: 1) Comprensione misure sperimentali 2) Analisi teorica del sistema 3) Predizione interazioni in reti neuronali 4) Ricostruzione delle funzioni nervose
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MODELLI NEURONALI: 1) Comprensione misure sperimentali 2) Analisi teorica del sistema 3) Predizione interazioni in reti neuronali 4) Ricostruzione delle.

May 01, 2015

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MODELLI NEURONALI:

1) Comprensione misure sperimentali

2) Analisi teorica del sistema

3) Predizione interazioni in reti neuronali

4) Ricostruzione delle funzioni nervose

Page 2: MODELLI NEURONALI: 1) Comprensione misure sperimentali 2) Analisi teorica del sistema 3) Predizione interazioni in reti neuronali 4) Ricostruzione delle.

Registrazioni da fettine di tessuto cerebellare (tecnica del patch-clamp)

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-62 mV

20 mV

200 ms

A B20 mV

200 ms

C

sAHP

fAHP

ADP

5 mV

100 ms

Repetitive firing

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bursting

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A 40 mV

200 ms

B

0.5 Hz

2 Hz

6 Hz

10 Hz

30

40

50

60

70

0 5 10 15

Stim . Freq. (Hz)

Sp

ike

fre

q. (

Hz)

200 ms -45

-40

-35

0 5 10 15Stim . Freq. (Hz)

De

pola

rizat

ion

(mV

)

Vm (mV)

resonance

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rmmm

m

m

rmmmicm

EVGdt

dVC

R

EV

dt

dVCIII

Circuito equivalente

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Modello a circuito parallelo

)()()( ClClNaNaKk

ClNaKc

EVgEVgEVgdt

dVCI

IIIII

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Conduttanze voltaggio e tempo dipendenti

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Canali ionici : teoria del gating

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Gating:

tempo-dipendenza

y/0

y

)(0

00

0

)(

)(

1 detto

)(

quindi

0 contorno al condizione nella

)()(ln)(

integrando

))(()()()(

osostituend

cui da

)1(0

ostazionari stato allo

)1(

ordine primo di cinetica

t

t

t

eyyyy

eyyyy

yyAAyy

)y(ty

AeyyCyydtyy

dy

yyyyydt

dy

y

yydt

dy

yydt

dy

a b

y (1-y)

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Gating: voltaggio dipendenza

RTG

RTG

RTVzF

RTVzF

Be

Ae

eV

eV

/00

/00

/)1(0

/0

)(

)(

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RTVzF

RTVzFRTVzFRTVzF

RTVzF

ey

eee

e

VV

Vy

/1

00

/00

0

/)1(0

/0

/0

1

allora se

)()(

)(

Processo attivato dalla depolarizzazione

Processo inattivato dalla depolarizzazione

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Dinamica del Ca2+ intracellulare

esistono conduttanze Ca-dipendenti, ed è quindi necessaria una

rappresentazione esplicita della dinamica del Ca2+

Ca2+

Ca2+

)(1

0CaCaVol

I

zFdt

CadCa

Ca

in

outCa

CaCaCa

Ca

Ca

F

RTV

VVgI

ln(2

)(

Pompe, tamponi ecc.

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Sistema di ODE del primo ordine

iiiii

CaCa

totmmtot

iii

m

ydt

dy

CaCaVol

I

zFdt

Cad

gRg

EVgV

dt

dV

)(

)(1

/dove ))(

(1

0

Soluzione con metodi di integrazione numerica

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Modello di Hodgkin-Huxley (HH)

4

3

)()()(

ngYgg

hmgYgg

EVgEVgEVgdt

dVCI

KKKK

NaNaNaNa

LLNaNaKK

Page 16: MODELLI NEURONALI: 1) Comprensione misure sperimentali 2) Analisi teorica del sistema 3) Predizione interazioni in reti neuronali 4) Ricostruzione delle.

Estrazione parametri cinetici

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Ricostruzione conduttanze

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Ricostruzione risposta eccitabile

i

iIdt

dVCI

dt

dV0CC

i

iIIdt

dV0VC

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Predizione conduzione negli assoni

(Rall) cavo di equazione 02

22 mm V

t

Vm

t

Vm

(HH) conduzione di tà veloci2 CRka/θ mi

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Sinapsi

)( synsynsyn

atesyn

EVgI

ag

sinapsi eccitatoriesinapsi inibitorie

synI

1 ms

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Modelli multicompartimentali

))()()(

(1

tot

brbr brsynsyn syniii

m g

EVgEVgEVgV

dt

dV

In ogni compartimento

V1

V2

V3

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ConductancesState Variables

n Gmax(S/cm2)

Vrev(mV)

(s-1)

(s-1)

ActivationgNa-f

Inactivation

3

10.013 87.39

0.9(V+19)/(1-exp(-(V+19)/10))

0.315 exp(-0.3(V+44))

36 exp(-0.055(V+44))

4.5/(1+exp(-(V+11)/5))

ActivationgNa-r

Inactivation

1

15e-4 87.39

0.00024-0.015(V-4.5)/((exp(-(V-4.5)/6.8)-1))

0.96*exp(-(V+80)/62.5)

0.14+0.047(V+44)/(exp((V+44)/0.11)-1))

0.03*exp((V+83.3)/16.1)

gNa-p Activation 1 2e-4 87.39 0.091(V+42)/(1-exp(-(V+42)/5))

x=1/(1+exp(-(V+42)/5))=5/()

-0.062(V+42)/(1-exp((V+42)/5))

gK-V Activation 4 0.003 -84.69 0.13(V+25)/(1-exp(-(V+25)/10)) 1.69 exp(-0.0125(V+35))

ActivationgK-A

Inactivation

3

10.004 -84.69

14.67/(1+exp(-(V+9.17)/23.32))

0.33/(1+exp((V+111.33)/12.84))

x=1/(1+exp(-(V+46.7)/19.8))y=1/(1+exp((V+78.8)/8.4))

2.98 (exp(-(V+18.28)/19.47))

0.31/(1+exp(-(V+49.95)/8.9))

gK-IR Activation 1 9e-4 -84.69 0.4 exp(-0.041(V+83.94)) 0.51 exp(0.028(V+83.94))

gK-Ca Activation 1 0.004 -84.69 2.5/(1+1.5e-3/[Ca]exp(-0.085V))

1.5/(1+[Ca]/(0.15e-3exp(-0.085V)))

ActivationgCa

Inactivation

2

14.6e-4 129.33

*

0.15 exp(0.063 (V+29.06))

0.0039 exp(-0.055(V+48))

0.089 exp(-0.039(V+18.66))

0.0039 exp(0.012(V+48))

gK-slow Activation 1 3.5e-4 -84.69 0.008 exp(0.025(V+30))

x=1/(1+exp(-(V+30)/6))

0.008 exp(-0.05(V+30))

Parametri cinetici

modello

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A

B

20 pA

200 ms

Gx

1.4

K-s

low

G

x 4

Na-

r

20 pA

200 ms

fAH PsAHP ADP

Repetitive firing

modello

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20 pA

200 ms

BA12 pA 16 pA

0

-60

0

12

M

)(m

V)

Vm

INa-f

IK-V

IK-Ca

ICa

INa-p

INa-r

IK-slow

IK-A

IK-IR

[Ca ]2 +

150 pA

15 pA

3 pA

150 pA

3 pA

3 pA

0

50

100

0 10 20

0

50

100

150

0 10 20

Sp

ike

fre

quen

cy (

Hz)

1 s

pik

e la

tenc

y (m

s)s

t

In jected current (pA)

Injected current (pA)

25 ms175 ms

Repetitive firing

modello

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B

20 pA

200 ms

AG =0Na-r

Vm0

-60

100

% G

K-C

a5

0% G

K-C

a3

7% G

K-C

a2

5% G

K-C

a0

12

Mm

V

150 pA

15 pA

3 pA

INa-f

IK-V

IK-Ca

ICa

INa-p

INa-r

IK-slow

IK-A

IK-IR

150 pA

[Ca ]2 +

200 ms

3 pA

3 pA

G G =0Na-p, K-s low

37%

GK

-Ca

Control

Bursting

modello

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-45

-40

-35

0 5 1 0 1 5 2 0

0

2 0

4 0

6 0

8 0

1 00

0 5 1 0 1 5 2 0

Stim. Freq. (Hz)

Spi

ke fr

eq.

(H

z)D

epo

lariz

atio

n (

mV

)

S tim. Freq. (Hz)

A

B

2Hz 10 Hz

100 ms

Vm (mV)

-80250 ms

-40

2Hz

10 Hz

14 Hz

Resonance

modello

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Modelli tipo HH:

1) sono in relazione alla realtà molecolare

2) derivano da misure sperimentali

3) incorporano un numero arbitrario di meccanismi

4) sono applicabili a sistemi multicompartimentali

5) sono adattabili (modulazione)

6) riproducono il timing degli spikes

7) evolvono dinamicamente

8) sono passibili di analisi teorica

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Rete neuronale del cervelletto (schematica)

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Trasmissione ripetitiva

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Risonanza (frequenza theta)

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Plasticità sinaptica: LTP

Modifiche:

neurotrasmissione

eccitabilità intrinseca

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La prospettiva:

La realizzazione di reti simulate che incorporino modelli tipo HH (realistici) potrebbe consentire una migliore comprensione delle complesse dinamiche delle reti neuronali del sistema nervoso