Page 1
Mikrobiologický ústav MUMikrobiologický ústav MU, Brno, Brno
Vladana WoznicováVladana Woznicová
Miroslav Votava Miroslav Votava
Ondřej ZahradníčekOndřej Zahradníček
Klinická mikrobiologieKlinická mikrobiologie
Zubní lékařství podzim 2015Zubní lékařství podzim 2015
Page 2
Původci respiračních infekcíPůvodci respiračních infekcí
Page 3
Význam respiračních infekcíVýznam respiračních infekcí
•• nejčastějšínejčastější infekce (dýchací trakt = inkubátor)infekce (dýchací trakt = inkubátor)
•• ekonomický dopadekonomický dopad
•• časté časté epidemie epidemie
•• 75 %75 % (u dětí i více) působí (u dětí i více) působí viryviry
Page 4
LokalizaceLokalizace
•• klinická symptomatologie + specifická agensklinická symptomatologie + specifická agens
A) Infekce HCDA) Infekce HCD a oka, ucha, dutin a oka, ucha, dutin
B) Infekce DCDB) Infekce DCD (dolních cest dýchacích a (dolních cest dýchacích a
plic)plic)
Page 6
Infekce HCDInfekce HCD
–– infekce infekce nosu a nasopharynxunosu a nasopharynxu
–– infekce infekce oropharynxu aoropharynxu a tonsiltonsil
–– infekce infekce paranasálních sinusůparanasálních sinusů
–– otitis mediaotitis media
–– conjunctivitisconjunctivitis
Page 7
Infekce DCD a plicInfekce DCD a plic
-- infekce infekce epiglottisepiglottis
-- infekce infekce larynxularynxu and and tracheytrachey
-- infekce infekce bronchůbronchů
-- infekce infekce bronchiolůbronchiolů
•• infekce infekce plicplic
Page 8
Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest
•• Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky
•• Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokoky neisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky
•• DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD
Page 9
Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest
•• Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky
•• Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokoky neisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky
•• DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD
Page 10
Rhinitis/nasopharyngitis Rhinitis/nasopharyngitis -- ETIOLOGIEETIOLOGIE
•• ViryViry –– „nachlazení“„nachlazení“::
–– Víc než 50 % rhinoviryVíc než 50 % rhinoviry
–– koronaviry koronaviry
–– další respirační viry (ne chřipka!)další respirační viry (ne chřipka!)
•• BakterieBakterie: :
–– Akutní Akutní infekce: obvykle sekundárníinfekce: obvykle sekundární
•• S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae, S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae,
Moraxella catarrhalisMoraxella catarrhalis
–– Chronické Chronické infekce: infekce:
•• Klebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatisKlebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatis
Page 11
Rhinitis/nasopharyngitis Rhinitis/nasopharyngitis -- LÉČBALÉČBA
•• Nevyžaduje antibiotikaNevyžaduje antibiotika a a bakteriologické vyšetřeníbakteriologické vyšetření
•• Polymorfonukleáry, vysoké CRP Polymorfonukleáry, vysoké CRP markery bakt. markery bakt.
Infekce, léčba podleInfekce, léčba podle výsledků bakteriologického výsledků bakteriologického
vyšetřenívyšetření
•• Lokální terapie Lokální terapie -- nosičinosiči epidemiolgicky závažných epidemiolgicky závažných
patogenůpatogenů -- např. MRSA např. MRSA –– mupirocin (Bactroban)mupirocin (Bactroban)
Page 12
Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media –– ETIOLOGIE ETIOLOGIE
•• AkutníAkutní sinusitis a otitis začínají infekcemisinusitis a otitis začínají infekcemi
respiračními viryrespiračními viry, , M. pneumoniae M. pneumoniae (myringitis)(myringitis)
•• Sekundární Sekundární pyogenní infekcepyogenní infekce: :
S.S. pneumoniaepneumoniae, , H. influenzae H. influenzae bb, Moraxella , Moraxella
catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes, catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes, anaeroby anaeroby
((BacteroidesBacteroides, , PrevotellaPrevotella, , Porphyromonas...Porphyromonas...))
KomplikaceKomplikace: mastoiditis, purulentní meningitis : mastoiditis, purulentní meningitis
Page 13
Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media –– ETIOLOGIEETIOLOGIE
•• SinusitisSinusitis maxillaris maxillaris chronicachronica, sinusitis , sinusitis
frontalis chronica: frontalis chronica: S. aureusS. aureus, ,
PeptostreptococcusPeptostreptococcus
•• OtitisOtitis media media chronicachronica: : Pseudomonas Pseudomonas
aeruginosa, Proteus mirabilisaeruginosa, Proteus mirabilis
Page 14
Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media -- LÉČBALÉČBA
•• Vhodný vzorekVhodný vzorek –– punktát ze středního ucha apunktát ze středního ucha a
paranasálního sinu; NE výtěr z nosu, ucha paranasálního sinu; NE výtěr z nosu, ucha
(kontaminanty)(kontaminanty)
•• Sinusitis Sinusitis ATB pouze uATB pouze u bolestivé sinusitidybolestivé sinusitidy, s bolestí, s bolestí zubůzubů, ,
hlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgie hlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgie
trigeminutrigeminu
•• Otitis mediaOtitis media -- ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka), ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka),
když antiinflamatorní léčba nedostačujekdyž antiinflamatorní léčba nedostačuje
•• Aminopenicilin nebo cefalosporin 1.generace Aminopenicilin nebo cefalosporin 1.generace
Page 15
http://www.drgreene.org/body.cfm?xyzpdqabc=0&id=21&action=detail&ref=1285
Page 16
Otitis media
http://www.medem.com/Me
dLB/article_detaillb.cfm?arti
cle_ID=ZZZPMV6D1AC&su
b_cat=544
http://www.otol.uic.edu/rese
arch/microto/Microtoscopy/
acute1.htm
• Agens jako u sinusitidy
Page 17
Konjunktivitis Konjunktivitis -- ETIOLOGIE ETIOLOGIE
•• Obvykle Obvykle virová, virová, u akutních infekcí HCD u akutních infekcí HCD
adenovirus, enterovirusadenovirus, enterovirus -- hemorrhagická conjunctivitis, hemorrhagická conjunctivitis,
HSVHSV -- herpetic keratoconjunctivitisherpetic keratoconjunctivitis
•• Bakteriální Bakteriální
a. a. Akutní:Akutní:
hnisavá konjunktivitis: hnisavá konjunktivitis: S. pneumoniae, S. aureusS. pneumoniae, S. aureus
inkluzní konjunkt.: inkluzní konjunkt.: C. trachomatisC. trachomatis D D –– KK
b. b. Chronická:Chronická: S. aureusS. aureus, , C. trachomatisC. trachomatis A A –– C (trachoma)C (trachoma)
•• Alergická, mechanická Alergická, mechanická (cizí těleso)(cizí těleso)
•• Obvykle Obvykle topická topická léčbaléčba
Page 18
Orofaryngeální infekce Orofaryngeální infekce -- ETIOLOGIEETIOLOGIE
•• Akutní tonsillitis a pharyngitis:Akutní tonsillitis a pharyngitis:
obvykle obvykle virovávirová (rhinoviry, coronaviry, adenoviry, (rhinoviry, coronaviry, adenoviry, EBV EBV –– inf. mononucleosis, coxsackieviry inf. mononucleosis, coxsackieviry –– herpangina)herpangina)
Nejvýznamnější bakteriálníNejvýznamnější bakteriální: : S. pyogenesS. pyogenes (= (= ββ-- hemol. streptokok hemol. streptokok skupiny Askupiny A))
•• Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky, Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky, H. influenzaeH. influenzae, , N. meningitidisN. meningitidis
•• Vzácné, ale Vzácné, ale důležitédůležité: : Corynebacterium diphtheriae, Corynebacterium diphtheriae, Neisseria gonorrhoeaeNeisseria gonorrhoeae
Page 19
Orofaryngeální infekce Orofaryngeální infekce -- LÉČBALÉČBA
•• Výtěr z krku u všech případů Výtěr z krku u všech případů , vč. „typické , vč. „typické
tonsilitidy“tonsilitidy“
•• Streptococcus pyogenesStreptococcus pyogenes -- penicilinpenicilin
•• Makrolidy u alergických pacientů (rezistence, horší Makrolidy u alergických pacientů (rezistence, horší
efekt)efekt)
•• stanovení CRPstanovení CRP (marker bakteriální infekce) (marker bakteriální infekce)
Page 20
Tonsillopharyngitis
http://medicine.ucsd.edu/Clinicalimg/He
ad-Pharyngitis.htm
http://www.newagebd.com/2005/sep/12
/img2.html
Page 21
Virová tonsillopharyngitis
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b1/Pharyngitis.jpg/250px-
Pharyngitis.jpg
Page 22
Hnisavá bakt. tonsillitis http://www.meddean.luc.edu/lumen/MedEd/medicine/PULMONAR/diseases/pul43b.htm
Page 23
Epiglottitis
http://health.allrefer.com/health/epiglottitis-throat-
anatomy.html
de.wikipedia.org/wiki/
Epiglottitis
Page 24
George Washington
www.fathom.com/course/10701018/session4.html
Page 25
EpiglottitisEpiglottitis
•• Riziko udušení!Riziko udušení!
•• Haemophilus influenzaeHaemophilus influenzae typ b typ b -- vakcinacevakcinace
Page 26
Laryngitis a tracheitisLaryngitis a tracheitis
RespiračníRespirační viry viry (jiné než u(jiné než u nasopharyngitis):nasopharyngitis):
parainfluenza/influenzaparainfluenza/influenza A A && RSVRSV
Symptomatická léčba Symptomatická léčba –– NE ATBNE ATB
BakteriálníBakteriální
•• Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae, , Mycoplasma pneumoniaeMycoplasma pneumoniae, , sekundární: sekundární: S. aureusS. aureus a a Haemophilus influenzae, Haemophilus influenzae, laryngotracheitis pseudomembranosa (záškrt): laryngotracheitis pseudomembranosa (záškrt): Corynebacterium diphtheriaeCorynebacterium diphtheriae
•• Výtěr z krku obvykle bezcenný Výtěr z krku obvykle bezcenný
Page 27
Lagyngitis acuta
http://www.emedicine.com/asp/image_search.as
p?query=Acute%20Laryngitis
Page 28
www.cartoonstock.com/directory/l/laryngitis.asp
Page 29
Bronchitis Bronchitis -- ETIOLOGIEETIOLOGIE
•• Akutní bronchitis:Akutní bronchitis:
chřipka, parainfluenza, adenoviruses, RSV , parainfluenza, adenoviruses, RSV
Bakteriální Bakteriální -- sekundární: pneumokoky, haemofily, sekundární: pneumokoky, haemofily,
stafylokoky, moraxelystafylokoky, moraxely
Bakteriální Bakteriální -- primární: primární: MycoplasmaMycoplasma pneumoniae,pneumoniae,
Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, BordetellaBordetella pertussispertussis
•• Chronická bronchitisChronická bronchitis (cystická fibrosa): (cystická fibrosa):
Pseudomonas aeruginosa, Burholderia cepaciaPseudomonas aeruginosa, Burholderia cepacia
Page 30
Bronchitis acutaBronchitis acuta http://www.yourlunghealt
h.org/lung_disease/copd
/nutshell/index.cfm
http://www.lhsc.on.ca/resptherapy/students/p
atho/brnchit5.htm
Page 31
BronchiolitisBronchiolitis •• Izolovaná bronchiolitida uIzolovaná bronchiolitida u novorozenců novorozenců
a kojencůa kojenců::
PneumovirusPneumovirus (= (= RSVRSV))
MetapneumovirusMetapneumovirus
https://www.nlm.nih.gov
Page 32
PneumoniePneumonie
www.medicin
enet.com/pn
eumonia/arti
cle.htm
Page 33
Typy pneumoniíTypy pneumonií
•• Akutní Akutní –– komunitní (communitykomunitní (community--acquired pneumonia acquired pneumonia CAP)CAP)
– u původně zdravých
• dospělých
• dětí
– u oslabených – Po kontaktu se zvířaty (Pasteurella multocida, Coxiella
burnetii - Q-horečka, Chlamydophila psittaci - psittakóza)
•• Akutní Akutní –– nosokomiálnínosokomiální pneumoniepneumonie
- ventilátorové
a) časné
b) pozdní
•• Subakutní a chronické pneumonieSubakutní a chronické pneumonie
Page 34
Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIEETIOLOGIE
AkutníAkutní komunitníkomunitní
•• bronchopneumoniabronchopneumonia a lobární pneumonia:a lobární pneumonia:
–– Streptococcus pneumoniaeStreptococcus pneumoniae
–– S. aureusS. aureus
–– Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae typ btyp b
•• atypická pneumonie:atypická pneumonie:
–– Mycoplasma pneumoniaeMycoplasma pneumoniae
–– Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae
–– Influenza A virus Influenza A virus
Page 35
Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IIETIOLOGIE II
AkutníAkutní komunitní, u oslabenýchkomunitní, u oslabených::
–– pneumokoky, stafylokoky, haemofilypneumokoky, stafylokoky, haemofily
–– KlebsiellaKlebsiella pneumoniaepneumoniae (alkoholici)(alkoholici)
–– LegionellaLegionella pneumophilapneumophila
•• ImunodeficicityImunodeficicity::
–– Pneumocystis jiroveciiPneumocystis jirovecii
–– CMVCMV
–– atypical mycobacteriaatypical mycobacteria
–– Nocardia asteroidesNocardia asteroides
–– aspergilli, candidaeaspergilli, candidae
Page 36
Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IIIETIOLOGIE III
AkutníAkutní nosokomiální:nosokomiální:
•• VentilátorováVentilátorová -- VAP:VAP:
–– časnáčasná (do 4. dne hospitalizace):(do 4. dne hospitalizace):
citlivé citlivé komunitníkomunitní kmenykmeny
–– pozdní pozdní (od 5. dne):(od 5. dne):
rezistentní rezistentní nemocniční kmenynemocniční kmeny
•• DalšíDalší
–– viry (RSV, CMV)viry (RSV, CMV)
–– LegionellaLegionella
Page 37
Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IVETIOLOGIE IV
•• Subakutní a chronické:Subakutní a chronické:
–– aspiračníaspirační pneumonie a plicní abscespneumonie a plicní absces
•• PrevotellaPrevotella melaninogenicamelaninogenica
•• BacteroidesBacteroides fragilisfragilis
•• peptokoky a peptokoky a peptostreptokokypeptostreptokoky
–– plicní tuberkulóza a mykobakteriózyplicní tuberkulóza a mykobakteriózy
•• Mycobacterium tuberculosisMycobacterium tuberculosis
•• Mycobacterium bovisMycobacterium bovis
•• atypická mykobaktériaatypická mykobaktéria
Page 38
PneumoniePneumonie
http://www.uspharmacist.com/in
dex.asp?page=ce/105057/defau
lt.htm
Page 39
BronchopneumoniaBronchopneumonia
www.szote.u-szeged.hu/radio/mellk1/amelk4a.htm
See the inhomogenous shadow in the lower and middle lobes of the right lung
Page 40
Lobární a lobulární pneumonie
www.supplementnews.org/
pneumonia
Page 41
Infekce plic Infekce plic -- vyšetřenívyšetření
•• Klinické vyšetření a RTG, rozlišení klasickáKlinické vyšetření a RTG, rozlišení klasická atypická pneumonieatypická pneumonie
•• Klasická pneumonie Klasická pneumonie -- sputumsputum, krev na , krev na hemokulturu, hemokulturu, S. pneumonie Ag v močiS. pneumonie Ag v moči
•• Atypická pneumonie Atypická pneumonie -- serologieserologie -- mykoplasma a mykoplasma a chlamydophila (+ „viral screen“).chlamydophila (+ „viral screen“).
•• Nemocniční pneumonieNemocniční pneumonie LegionellaLegionella –– Ag v močiAg v moči
Page 42
Bronchitis a pneumonie Bronchitis a pneumonie -- léčbaléčba
•• CAP CAP amoxicilinamoxicilin + ev. makrolid+ ev. makrolid
•• Atypická pneumoniae Atypická pneumoniae tetracyklin nebotetracyklin nebo (děti < 8) (děti < 8)
makrolidymakrolidy
•• Kombinovaná terapieKombinovaná terapie
•• U nemocničníchU nemocničních infekcí infekcí -- citlivostcitlivost -- rezistence!rezistence!
•• TB kombinační terapie TB kombinační terapie
Page 43
Gerrit Dou (1613 Gerrit Dou (1613 -- 1675) 1675)
LékařLékař