Top Banner
III Kontrolltöö 627-645 Retroviirused - Kattega viirused - Positiivse ahelaga RNA viirused - Omavad RNA-sõltuvat deoksüribonukleotiidhappe (DNA) polümeraasi e pöörtranskriptaasi o Paljunevad DNA vahevormiga o DNA läheb peremeesraku kromosoomi - RNA tuumorviirused ehk onkornaviirused o Muudavad rakkude kasvu ekspresseerides kasvufaktorite analoogide geene (onkogeene) - Oncovirinae (HTLV-1,2,5), Lentivirinae (HIV-1,2), Spumavirinae(ei ole seotud haigusega) - Retroviirusi jaotatakse haiguse järgi, koe tropismi suhtes, peremeeste, morfoloogia järgi ja geneetilise kompleksuse alusel - Onkoviirused on ainsad, mis suudavad muuta rakku surematuks o Kapsiidi järgi jaotuvad A, B, C, D tüübiks - Lentiviirused on aeglased viirused, mis on seostatud neuroloogilise ja immunosupressiivsete haigustega - Spumaviirused ei tee otseselt midagi - Ehitus o Sfäärilised, kattega, RNA viirused, diameeter 80-120 nm o Kattes on viiruslikud glükoproteiinid - Ümbris ümbritseb kapsiidi, mis sisaldab 2 samasugust positiivse ahelaga RNA genoomi o Sees on ka 10-50 pöörtranskriptaasi ja 2 rakulist tRNAd Need tRNAd on alus-paarid vastavalt ühele RNA ahelale Kasutatakse praimerina RT-le Tuumik meenutab äralõigatud koonust Viriooni sees on genoomil mRNA struktuur (cap + polyA) – meenutab mRNA-d Iseeneses ei ole nakkav, sest genoom ei sisalda polümeraase - Genoomis 3 põhigeeni, mis kodeerivad polüproteiine järgnevatele ensüümidele ja struktuurivalkudele o Gag 1
32

Mikrobio III kt

Dec 27, 2015

Download

Documents

olivermees

arstiteaduskond
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Mikrobio III kt

III Kontrolltöö

627-645 Retroviirused

- Kattega viirused- Positiivse ahelaga RNA viirused- Omavad RNA-sõltuvat deoksüribonukleotiidhappe (DNA) polümeraasi e pöörtranskriptaasi

o Paljunevad DNA vahevormigao DNA läheb peremeesraku kromosoomi

- RNA tuumorviirused ehk onkornaviirusedo Muudavad rakkude kasvu ekspresseerides kasvufaktorite analoogide geene (onkogeene)

- Oncovirinae (HTLV-1,2,5), Lentivirinae (HIV-1,2), Spumavirinae(ei ole seotud haigusega)- Retroviirusi jaotatakse haiguse järgi, koe tropismi suhtes, peremeeste, morfoloogia järgi ja geneetilise

kompleksuse alusel- Onkoviirused on ainsad, mis suudavad muuta rakku surematuks

o Kapsiidi järgi jaotuvad A, B, C, D tüübiks- Lentiviirused on aeglased viirused, mis on seostatud neuroloogilise ja immunosupressiivsete haigustega- Spumaviirused ei tee otseselt midagi- Ehitus

o Sfäärilised, kattega, RNA viirused, diameeter 80-120 nmo Kattes on viiruslikud glükoproteiinid

- Ümbris ümbritseb kapsiidi, mis sisaldab 2 samasugust positiivse ahelaga RNA genoomio Sees on ka 10-50 pöörtranskriptaasi ja 2 rakulist tRNAd

▪ Need tRNAd on alus-paarid vastavalt ühele RNA ahelale● Kasutatakse praimerina RT-le

▪ Tuumik meenutab äralõigatud koonust▪ Viriooni sees on genoomil mRNA struktuur (cap + polyA) – meenutab mRNA-d

● Iseeneses ei ole nakkav, sest genoom ei sisalda polümeraase- Genoomis 3 põhigeeni, mis kodeerivad polüproteiine järgnevatele ensüümidele ja struktuurivalkudele

o Gag▪ Grupispetsiifiline antigeen – kapsiid, maatriks ja nukleiinhapet siduvad valgud

o Pol ▪ Polümeraas, proteaas, integraas

o Env▪ Kate, glükoproteiinid

o Genoomi lõpus on korduvad LTR järjestused▪ Promootereid, tugevdajaid

o Onkogeensetel viirustel võivad olla kasvu-reguleerivaid onkogeeneo Retroviirustel, HTLV ja lentiviirustel on mitmed virulentsust suurendavad valgud – vajavad splaissimist

- Glükoproteiinido Env-ist proteolüütilise lõikamise tagajärjelo Suurus on varieeruv

1

Page 2: Mikrobio III kt

▪ Gp62 – gp46, p21, gp160- gp41, gp120▪ Lutsukakujulised trimeerid

● Suurem glükoproteiin kinnitud raku pinnaretseptorile (määrab tropismi), antikeha tunneb selle järgi ära

● Väiksem moodustab pulga ning aitab kaasa rakuga ühinemisel● Gp120 on väga glükosüleeritud – see muutub erinevatel haiguse staadiumitel.

- Gag – group-specific antigen, int – integrase, pol – polymerase, pro – protease, env – envelope, - Paljunemine

o Alguses kinnituvad glükoproteiinid (gp120, gp41) CD4-le, koretseptor on CCR5 või CXCR4▪ R5 kasutab CCR5, X4 kasutab CXCR4

o Gp41 aitab viirusel ja rakul ühineda▪ Fusiooni inhibiitorid (pmst ei kasutata, peab mitu korda päevas süstima)▪ Alpha4beta7 adhesioonimolekulile saab ka kinnitada

o Genoom vabaneb tsütoplasmasse, pol geenis on pöörtranskriptaas, tRNA-d kasutab virion praimerinao Sünteesitakse negatiivne komplementaarine DNA

▪ Pöördtranskriptaasi vastu on enamik ravimeid▪ RNAst luuakse ka positiivne DNA, RT töötab kui ribonukleaas H (kokku tuleb kaheahelaline

cDNA)● Mõjuvad pöörtranskriptaasi inhibiitorid (nukleotiidsed(nukleosiidi nukleotiidi

analoogid, panevad ahelasse stopi) ja mittenukleotiidsed(seonduvad pöörtranskriptaasi endaga))

▪ DNA on pikem kui esialgne DNA, sest LTRi sees luuakse veelgi promootereid ja tugevdajaid▪ Tekib 5 viga transkriptsiooni puhul

o cDNA läheb tuuma, splaissitakse kromosoomi integraasi abil (võib jääda aktiveerimata kujul)▪ integraasi inhibiitorid

o viiruslik DNA (provirus) transkribeerub RNA polümeraasi abiga ... sõltub promooteritest LTR-is▪ proteaaside inhibiitorid (ravimid)▪ proteaaside abil sünteesitakse mRNAst HIV-i valke

o HIV ja HTLV viirusel on kaks transkriptsioonifaasi▪ HTLV-l on tax ja rex valgud – reguleerivad viiruslikku paljunemist

● Aktiveerivad geene, ka soodustavad IL-2 vabanemist/ekspressiooni▪ HIV-l on on 6 lisageeni

● Tat – reguleerib transkriptsiooni● Rev – reguleerib mRNA transporti tsütoplasmasse● Nef – vähendab MHC I ekspressiooni, reguleerib viiruse tsütotoksilisust (aitab viirusel

säilida suurtes kogusteso AIDSini kulgemisel oluline roll

● Vif – kaitseb hüpermutatsioonide vastu● Vpu – vähendab CD4 ekspresiooni ja soodustab viiruse vabanemist● Vpr – aitab cDNA tuuma, paneb ka raku G2-faasi

▪ Viiruslikke proteiine sünteesitakse ER-is, sealt Golgi kompleksi

2

Page 3: Mikrobio III kt

o Moodustatakse ümbris ja viirus väljub rakusto Viiruse tuumikust väljub pöördtranskriptaas, et ei toimuks RNA transkribeerimisto HIV võib ka liikuda rakust-rakku mitmetuumaliste rakkudega või süntsüütidegao HIV-i raviskeem

1. 1PI+2NRTI2. 1NNRTI+2NRTI

- HIVo Patogeneesi peamine determinant on viiruse tropism CD4-ekspresseerivate T rakkude ja

makrofaagide suhtes▪ Haiguse jooksul väheneb CD4 T rakkude hulk▪ Helper-rakkude funktsioon kaob delayed type hypersensitivity kaob

o Infitseerib mukoosarakkeo Kiiresti liigub edasi MALTio CD4 ja CCR5 (CXCR4) retseptorile kinnitub, infitseerib monotsüüte ja makrofaage ja perifeerseid vere

T rakkeo CCR5 retseptori modifikatsiooniga inimestel on nakatumise suhtes resistentsemad (hetero- ja

monosügoodid)▪ Sinna mõjub ka uus viirusvastane ravim

o HIV võib ka püsida dendriitrakkude pinnal, DC-SIGNi küljeso Makrofaagid ja dendriitrakud on reservuaarido Gp120 mutatsioonid muudavad tropismi – M-troopilised (R5), T-troopilised (X4)

▪ T-troopilised CXCR5-le ja CD4-le▪ Osad viirused kinnituvad mõlemale R5X4

o CD4 rakud võivad väheneda▪ HIV poolt põhjustatud tsütolüüsiga – mitteintegreerunud DNA akumuleerub, apoptoosi

soodustab, muudavad rakkude omadusi (t-rakkude ja makrofaagide)▪ Tsütotoksiliste CD8 rakkude poolt, kroonilise aktivatsiooni tõttu

o Nef proteiin mängib rolli AIDSiks kujunemiselo Antikehadega kaetud HIV-d on nakkusohtlikudo CD8 T-rakkude arv väheneb koos CD4 T-rakkudega (CD8 tapavad HIV-d)o HIV muteerub kergelt ja saab oma antigeensust muutao HIV haiguse kulge saab mõõta CD4 T-rakkude hulgaga ja viiruse hulgaga veres

1. Agluses GALTi rakud infitseerivad CD4 rakud2. Akuutses faasis on suur viiruse hulk plasmas (107)3. Kliinilises latentses perioodis viiruse hulk väheneb, kuid viiruse paljunemine jätkub lümfisõlmedes4. Hilises faasis viiruse hulk suureneb ja CD4, CD8 rakkude hulk väheneb

a. Hävineb lümfisõlmede ehitus, patsient immunosupresseeritudo HIV väljendubki CD4 rakkude hulga vähenemisenao Latentsed viirused löövad välja – PML, HSV, VZV, CMV, EBV lümfoomid, HHV8 – Kaposi sarkoomido HIV võib lisaks põhjustada neuroloogilisi abnormaalsusi

3

Page 4: Mikrobio III kt

▪ Monotsüüdid jms vabastavad selliseid toksilisi mediaatoreido 6,6 milj uut juhtu aastaso M, N, O subtüübid – A-K, HIV-2l A-Fo Akuutne faas

▪ 2-4 nädala pärast▪ Gripilaadsed sümptomid, aseptilist meningiiti, mononukleoosi, võib olla lööve▪ 2-3 nädala pärast kaovad

o Asümptomaatiline infektsioon ▪ Mitmed aastad▪ Võib olla generaliseerunud lümfoadenopaatia, viirus paljuneb lümfisõlmedes

o Süsteemne haigusfaas/AIDS▪ CD4, makrofaagidest, CD8-st, DTH sõltuvad haigused löövad välja▪ Haigused tulevad, kui 450 kanti mikroliitri vere kohta jõuab CD4 hulk, p24 hulk tõuseb▪ AIDS 200 CD4/mikroliitri kohta, 75 000 HIV-d ml kohta

● Kaasnevad ka – HIV wasting syndrome(kaalulangus ja kõhulahtisus), Kaposi sarkoomid, pneumocystis pneumonia, MAC, CMV

● Võivad väljenduda lümfoadenopaatiao Võib kaasneda kaalulangus ja haigustunne (opportunislikud inf, khulahtisus,

öine higistamine, nõrkus)● Palavik, opportunistlikud infektsioonid

o Algloomad▪ Aju toksoplasmoos, krüptosporidioos kõhulahtisusega, isosporiaas

kõhulahtisusegao Seened

▪ Sõõgitoru, trahhea, kopsude kandidaas, pneumocystis jirovecii, krüptokokkus (kopsuväline), histoplasmoos (dissimineerunud), koktsidioidomükoos (dissimineerunud)

o Viirused▪ CMV, HSV, progresseeruv multifokaalne leukoentsentsefalopaatia, EBV

o Bakterid▪ MAC, atüüpilised mükobakterid, kopsuväline tuberkuloos, salmonella

septitseemia (korduv), püogeensed bakteriaalsed infektsioonido Opportunistlikud neoplaasiad

▪ Kaposi sarkoom, aju lümfoomid, mitte-Hodgkini lümfoomido Teised

▪ HIV wasting syndrome, HIV entsefalopaatia, interstitsiaalne pneumoonia

● maliigsed kasvajad, dementsus (aju mikrogliia rakud kahjustuvad, meenutab Alzheimerit)

o testitakse lisaks, et teada, kui kaugele on HIV haigus arenenud ning kui hästi ravi edenebo Diagnoos

4

Page 5: Mikrobio III kt

▪ Seroloogilised testid, RNA hulga määramine, p24 antigeeni määramine, western-blot, PCR, real-time PCR, RT-PCR

o cDNA-d määratakse PCRi abil, DNA amplifitseerimineo antikehad tekivad 4-8 nädala pärast, mõnel ka kuni 6 kuu pärasto western-blot näitab antikehasid viiruslike antigeenide vastu (p24, p31) ja glükoproteiinide vastu

(gp41 pg120/160)o määratakse CD4/CD8 suhet ja hulka – alustatakse ravio ravimid

▪ nukleosiidide analoogid pöördtranskriptaasi inhibiitorid (NRTI)▪ mittenukleosiidsed pöördtranskriptaasi inhibiitorid (NNRTI)▪ proteaaside inhibiitori (PI)▪ kinnitumise ja ühinemise inhibiitorid▪ integraasi inhibiitorid▪ CCR5 inhibiitorid ja uus integraasi inhibiitor▪ kombod

● abakaviir/zidovudiin/lamivudiin● 2NNRTI+2NRTI● 2PI+2NRTI jpt

o Enamikel ravimitel on ebameeldivad kõrvaltoimedo Antakse HAART meetodil

▪ Väiksem võimalus resistentsuse kujunemiseks▪ Määratakse CD4 rakkude hulga järgi▪ Alla 200, või alla 350, kui viiruste hulk on suur

o Doonorite kontroll- Onkoviirused

o RNA tuumori viirusedo Seostatud leukeemiate, sarkoomide, lümfoomidega paljudes loomadeso Sarkoomide ja leukeemiate viirused

▪ Modifitseerunud rakugeene sisaldavad (proto-onkogeene)▪ V-onc´id

● Sisaldavad kasvuhormoone, proteiinikinaase, GTP siduvaid proteiine, DNA-d siduvaid proteiine

▪ Inimeste viirusi ei ole sellelaadseid leitud▪ Rakkude jagunemine soodustab viiruse paljunemist

o Leukeemia viirused▪ HTLV-1

● Ei suuda transformeedia rakke in vitro● 30 aastaga suudavad vähki esile kutsuda● Tax-id soodustavad promootorite aktivatsiooni● HTLV-1 põhjustab täiskasvanute akuutset t-rakulist lümfootilist leukeemiatja HTLV-1

assotseerunud müelopaatiat

5

Page 6: Mikrobio III kt

▪ Patogenees● Pärast vereülekannet, suguühet, rinnapiimaga● CD4 rakke ründab ja DTH T rakke● Inaktiveerib IL-2 produtseerimise ja IL-2R retseptori (soodustab kasvu)● Jaapanis, Karriibidel, Kesk-Aafrikas● Okinawas , rinnapiim ja seks● On CD4 rakkude neoplaasia

o Lillerakud● ATLLi puhul on naha moodustised, aasta pärast saabub surm● ELISA test, RT-PCR● AZT ja interferoon-alfa (otsest ravi pole)

- Teised retroviirused on juba üks osa meie kromosoomist

- Hepatiit A viiruso fekaal-oraalselt levibkontamineerunud veega, karpkaladega ja teiste toitudegao pikornaviirus, heparnaviruso katteta, ikosaeedriline kapsiid, positiivne, üksikahelaline RNAo ainult üks serotüüpo paljunemine

▪ kinnitub kindlale retseptorile maksarakul▪ ei ole tsütolüütiline, väljub eksotsütoosi teel

o patogenees▪ tuleb orofaarünksist või seedetrakti epiteelirakkude kaudu - maksa parenhüümirakkudesse▪ paljuneb hepatotsüütides ja Kupferi rakkudes▪ sapi kaudu läheb viirus väljaheidetesse

● 10 päeva enne sümptomeid juba väljaheidetes▪ paljuneb maksas aeglaselt - ei põhjusta tsütopaatilist efekti▪ tsütotoksilised rakud ja NK rakud tapavad kõige paremini▪ antikehade kaitse on eluaegne▪ histoloogiline pilt sarnane HBV-ga▪ HAV ei tekita kroonilist infektsiooni ja ei ole seostatav vähiga

o moodustab 40% hepatiidi juhtudesto inimesed on nakkusohtlikud 10-14 päeva enne haigusnähtusid

▪ paljudel on sümptomiteta haiguskulgo HAV on stabiilne pH 1, eetri kloroformi vastu, detergentide vastu, soolavee suhtes, põhjavees püsib

mitu kuud, kuivamisele stabiilne, temp kuni 60▪ inaktiveerub klooriga, formaliiniga, UV-kiirgusega

o must põhjavesi võib koorikloomi nakatadao Kliiniline pilt

▪ HAV ja HBV on sarnasedo Lastel on kliiniline pilt kergem, tihti asümptomaatiline

6

Page 7: Mikrobio III kt

o Sümptomid muidu tekivad järsku 15-50 päeva pärast ja lähevad jubedamaks 4-6 päeva enne ikterusto alguses

▪ palavik, haigustunne, iiveldus, söögiisu kadumine, kõhuvalu▪ tume uriin - bilirubinuuria▪ värvitu väljaheide, ikterus, kõhuvalu ja sügelus▪ ikterus 70-80% täiskasvanutest, kuid ainult 10% lastest▪ enne sümptomite teket kaob viirus väljaheitest▪ võib ka esineda fulmimantne hepatiit 2-3/1000

o Diagnoos▪ haiguse kulg ja pilt▪ IgM tüüpi HAV-i vastased antikehad ELISA testiga - akuutne infektsioon▪ muid meetodeid ei ole

o Preventatsioon▪ kontamineerunud toidu vältimine, mittepraetud koorikloomade söömine▪ immuunseerum profülaktikana▪ vaktsiin - surmatud ja elus viirus

- Hepatiit B viiruso peamine hepadnaviiruso piiratud kudede tropism ja peremeeste valiko HBV on maksas ja osaliselt ka neerusid ja pankreast inimestel ja šimpansitelo Ehitus

▪ väike, ümbrisega DNA viirus▪ väike genoom, rõngasmolekul, osaliselt kaheahelaline DNA, sisaldab pöördtranskriptaasi

● paljuneb üle RNA▪ virion - Dane´i partikkel

● on erakordselt vastupidavad ümbriseta virioni kohta● peavad vastu eetrile, madalale pH-le, jäätamisele, ja kergemale kuumutamisele

▪ virionil on ka proteiini kinaas ja polümeraas - pöörtranskriptaasi ja ribunekleaas H aktiivsus, ka P proteiin genoomi küljes

▪ ikosaeedriline kapsiid moodustatud hepatiit B tuumaantigeenist… ümbris sisaldab HB pinnaantigeeni ja HBe antigeeni

▪ HBsAg-sisaldavaid partikleid on rohkem kui virione nakatunud inimestel - immunogeensed● sisalduvad vaktsiinis● sisaldab glükoproteiine L, M, S

o Paljunemine▪ paljuneb läbi RNA vahemehe ja vabastab antigeenseid peibutisi▪ glükoproteiinide abil kinnitub hepatotsüüdile - täpset mehhanismi ei teata▪ osalisest kahelaahelalisest DNAst tehakse täielik kaheahelaline DNA

● genoom läheb siis tuuma● rakulised transkriptsioonifaktorid kontrollivad viiruse paljunemist

▪ mRNA on suurem kui genoom

7

Page 8: Mikrobio III kt

▪ DNA läheb tuuma, kus toimub transkriptsioon - tekib 4 mRNAd (üks on suurem kui genoom)▪ mRNA läheb siis tsütoplasmasse, seal sünteesitakse valgud▪ tuumiku sees sünteesitakse negatiivne DNA… siis ribunukleaas H abil degradeeritakse RNA ja

sünteesitakse positiivne DNA▪ tuum ümbritsetakse enne DNA täielikku valmimist - vabaneb eksotsütoosi abil

o Patogenees▪ võib olla krooniline, sümptomaatiline või asümptomaatiline haigus

● sõltub inimese immuunstaatusest● kui leidub nii HBsAg ja HBeAg komponente, siis on tegemist aktiivse infektsiooniga

▪ saadakse verega peamiselt, ka spermaga, süljega, piimaga, vaginaal ja menstruaalsekreediga ja amnioni vedelikuga - süstimine siiski kõige efektiivsem

▪ viirus hakkab 3 päeva jooksul paljuneb, sümtomid võivad tekkida 45 päeva jooksul või hiljem (infektsiooni kogus, sisenemistee ja inimesest), minimaalne tsütopaatiline efekt

▪ HBV integreerub hepatotsüüdi kromatiini - latentne▪ CMCT on põhjuseks, miks hepatotsüüdid hävivad - hävitatakse hepatotsüüt

● kui seda ei esine, siis tekib krooniline haiguspilt▪ HBsAH ja anti-HBs vahelised kompleksid võivad tekitada tüüp III hüpersensitiivsusreaktsioone

- vaskuliit, artralgia, lööve ja neerukahjustused▪ 90% imikutest saavad kroonilise haiguspildi▪ Akuutses faasis - rakuline paisumine, nekroos eriti ümber tsentraalveeni, põhjustub

lümfotsüütidest, ● fulminantne haiguspilt viib maksakahjustusteni ja tsirroosini

▪ levib ka akupunktuurigao Akuutne inf

▪ 25%, salakaval teke (pikk inkubatsiooniperiood)▪ prodromaalne periood - palavik, oksendamine, alakõhu ebameeldivustunne, anoreksia,

haiguslik tunne, külmavärinad▪ ikterus - kollanahk, tume uriin, värvitu väljaheide▪ paranemist märgitakse palaviku alanemisega ja söögiisu taastamisega▪ fulminantne hepatiit (1%) - eluohtlik - astsiit ja veritsus

o Krooniline inf▪ 5-10%, krooniline aktiivne hepatiit, maksa armistumine, tsiroos, maksapuudulikkus, leitakse

juhuslikult suurenenud maksa ensüümide uurimiselo Esmane hepatotsellulaarne kartsinoom

▪ surmav▪ 3. kohal vähisurmadest▪ viirus suurendab hepatotsüütide jagunemist ja geneetilise info ümberpaiknemist

o Diagnoos▪ kliinilised sümptomid ja maksaensüümide olemasolu▪ akuutse ja kroonilise puhul esinevad seerumis HBsAg ja HBeAg (vabanevad viiruse

replitseerumise käigus)

8

Page 9: Mikrobio III kt

● sümptomite ajal ei ole võimalik antigeene määrata● siis IgM anti-HBc

o Ravi▪ HB immunoglobuliini saab manustada nädal pärast (arvatavat) nakatumist▪ polümeraasi vastu lamivudiin (ka HIV ravim), adefoviir, famcicloviir, INF-alfa▪ vaktsineerimine on isegi näidustatud pärast nakatumist

- Hepatiit C ja Go HCV on peamine NANBH viiruso HCV elutsükkel on sarnane HBV omaga, võib põhjustada veel tugevamalt kroonilist hepatiitio HCV on ainus hepaciviruse flaviviridae esindaja, positiivne RNA genoom, ümbrisega, kümme proteiini

kodeeribo hüpervariabeelsus glükoproteiinide seas - suur mutatsioonide hulk võimaliko seostub CD81-le - hepatotsüütidel ja B lümfotsüütidel

▪ saab ka lipoproteiinidega katmisel rakkuo Patogenees

▪ suudab ära hoida raku apoptoosi - pikk infektsioono 90% süstivatest HIV haigetest on kandjado akuutne, krooniline ja kiire haiguskulgo põhjustab samuti vähkio ELISA test anti-HCV antikeha, või RNA määramineo INF-alfa ja ribaviriin

- Hepatiit Do 40% fulminantsetest hepatiitidesto on HBV viirus, kasutab hepatotsüüdi abi, et paljunedao RNA genoom on väga väikeo rõngasmolekul, paikneb delta-antigeeni tuumikuso HBsAg abil tungib rakkuo moodustab paljunemise ajal ribosüümio Patogenees

▪ saab ainult paljuneda inimestel, kellel on HBV▪ akuutne HBV+deltaantigeen = mitte nii hull… kroonilise puhul on superinfektsioon▪ põhjustab tsütopaatiat

o 5% HBV nakkusega inimestesto suurendavad HBV infektsiooni raskust, võib esineda hepaatiline entsefalopaatia, ränk kollatõbi,

hepaatiline nekrooso Diagnoos

▪ RNA genoom, delta antigeeni leid (akuutses faasis), anti-HDV antikehad - RT-PCRo Ei ole ravi… HBV vältimine, HBV vaktsiin järelikult

- Hepatiit Eo fekaal-oraalselt levibo arengumaades, sarnesed sümptomid HAVile

9

Page 10: Mikrobio III kt

o suremus 1-2%... eriti kõrge rasedatel

Inimese herpesviirus

- suured, ümbrisega viirused, mis sisaldavad 2-ahelalist DNAd, ikosadeltaheedriline kapsiid, mis sisaldab kindla arvuga kapsomeere, kapsiidi ümber on glükoproteiinidega ümbris, tegumendis on viiruse proteiinid

● tundlikud hapetele, lahustitele, detergentidele ja kuivamisele● genoomid erinevate viiruste vahel erinevad ümberpööratud geenide, inverteeritud kordusjärjestuste

alusel● Paljunemine

○ viiruslikud proteiinid kinnituvad raku pinna retseptorile■ osaliselt koespetsiifiline tropism

○ nukleokapsiid vabastatakse tsütoplasmasse■ transkriptsioonifaktorid ja ensüümid kantakse rakku tegumendist

○ nukleokapsiid ühineb tuumaga ja vabastab genoomi■ transkribeeritakse ja paljundatakse

○ sünteesitakse■ kõige esmased proteiinid (alfa)

● olulised geenide transkriptsiooni regulatsioonis ja raku ülevõtmises■ esmased proteiinid (beeta)

● veel rohkem transkriptsiooni faktoreid ja ensüüme, ka DNA polümeraas■ hilised proteiinid (gamma)

● struktuuriproteiinid (siis kui viiruse genoomi replikatsioon on alanud)○ RNA polümeraas sünteesib RNA, reguleerivad viiruse proteiinid ja raku tuumafaktorid

■ tekib kas lüütiline, persisteeruv või latentne infektsioon

● Herpes simplex viirus○ HSV-1,2 - DNA homoloogsus, antigeensed determinandid sarnased, koe tropism sarnane, ja

haiguse sümptomid sarnased - siiski eristatavad○ Ehitus

■ genoomis on kodeeritud - DNA polümeraas, scavenger ensüümid - DNAas, tümidiini kinaas, ribonukleotiidi reduktaas (RNAst DNA) ja proteaas

■ paljud antigeenivastaseid mehhanisme○ Paljunemine

■ lüütiline fibroblastide infektsioon epiteelirakkudes ja latentsed infektsioonid neuronites■ HSV kinnitub heparaansulfaadi proteoglükaanile, lisaks lisaretseptorid■ rakku penetratsiooniks vajab nektiin 1-te… (ka HveA retseptor)■ toimub ühinemine… osad ensüümid hakkavad tsütoplasmas tegutsema (proteiini kinaas,

tsütotoksilised proteiinid), kapsiid läheb läbi poori tuuma

10

Page 11: Mikrobio III kt

■ (alfa proteiinid) soodustavad esmaste viiruslike geenide sünteesi, latentses faasis sünteesitakse latentsusega-assotseerunud RNAsid

■ (beeta proteiinid) sünteesitakse DNA polümeraas ja tümidiini kinaas, aitavad geenide transkribeerimisel

● genoomi hakatakse replitseerima kohe kui polümeraas sünteesitakse○ sünteesitud DNA meenutab vetsupaberit, DNA läheb prokapsiidi

● sünteesitakse hilised valgud - struktuurivalgud… need lähevad nukleuse juurde (need ongi prokapsiidid… sisse siis DNA)

● viiruslikud glükoproteiinid sünteesitakse ERis… tegumendivalgud ümbritsevad kapsiidi… Golgi lõpust saavad omale ümbrise

○ viirus vabaneb eksotsütoosi või raku lüüsumise abil○ võib ka liikuda läbi rakuvaheliste sildade

● ainult LAT geeni transkribeerimisel saavutatakse latentsus○ Patogenees

■ alguses fibroblastides, siis latentsena neuronites■ HSV-1 üldiselt infektsiooniga, mis on ülalpool puusasid, HSV-2 allpool

● erinevad samuti kasvu poolest ja antigeensuse poolest, HSV-2 põhjustab suurema tõenäosusega süsteemse haigusega (gripilaadsed sümptomid)

■ lüütiline infektsioon, persisteeruv inf lümfotsüütides ja makrofaagides ja latentne inf neuronites

■ Lüüs ● makromolekulaarsete osakeste sünteesi inh., peremeesraku DNA degradeerimisel,

membraani permeaabluse kadumisel, tsütoskeleti lõhkumisel, raku vananemisel■ satub läbi mukoosa või läbi naha, kahjustuse põhjas paljuneb■ läheb g. trigeminusse (HSV1) või g. sacralisesse (HSV2)■ CD8 ja INF-gamma hoiavad viiruse latentsena■ latentsuse kadumisel läheb nakatumise alguskohta tagasi, tekivad vesised kahjustused

(seal viirused sees)■ rakuline immuunsus tagab latentsuse, mitte antikehad■ suudab blokeerida INF-gamma vabanemist■ haiguse taastuse võib põhjustada - stress, trauma, palavik, UV-B

● haigus tekib samas kohas● saab aktiveeruda ka antikehade olemasolul (siiski vähemrängad, rohkem

lokaliseerunud ja lühema kuluga)○ kandub sekreetide ja lähedase kontaktiga (inimene on kogu elu kandja)○ väga labiilne○ mukoossete membraanide vahetamisel○ HSV-1 … suudlemine, joogiklaasid, hambaharjad, teiste süljega kontamineerunud esemetega

■ autoinokulatsioon võib põhjustada konjunktiviiti… arengumaades 90% seropositiivsed○ HSV-2

■ peamiselt seksuaalse kontaktiga või emalt lapsele

11

Page 12: Mikrobio III kt

■ genitaale, anus, orofaarünks■ HSV-1 ja HSV-2 genitaalinfektsioonid on peaaegu samad juba■ elus nakatutakse tavaliselt hiljem

○ Kliiniline pilt■ HSV-1 - entsefaliit(peamine tekitaja), keratokonjunktiviit, oraalne gingivostomatiit,

tonsilliit, labialis, farüngiit, esofagiit, trahheobronhiit, gladiatorum, genitaalherpes, panariitsium

■ HSV-2 - entsefaliit(neonataalne entsefaliit - kõrge suremus), oraalne herpes, farüngiit, genitaalherpes(peamine tekitaja, valulikud kondüloomid), perianaalherpes, panariitsium

■ herpes tavaliselt suu äärtes või huulte kõrval■ keratiit on ühele silmale peaaegu alati lokaliseerunud (armistumine, kornea kahjustused,

pimedus)○ Diagnoos

■ Tzancki äie, Pap-test■ kindel diagnoos DNA leidmisel või antigeeni leidmisel vedelikust, CSFi PCR■ kultuuris kasvatamine, tüüpspetsiifiline PCR test

● Ravi○ nukleosiidide analoogid, lühendavad inf kulgu… latentsus jääb○ atsükloviir, valatsükloviir, pentsikloviir, famtsikloviir

● Varicella-Zoster viirus○ paljuneb sarnaselt kuid aeglasemini kui HSV

■ fibroblastid, aktiveerunud T rakud, epiteelirakud, ○ latentne infektsioon neuronites

■ leidub siiski viiruslikku RNAd ja viiruslikke proteiine○ Patogenees

■ sissehingamisel■ algab tonsillides ja hingamisteede mukoosas, sealt edasi verre ja lümfidesse■ viirus nakatab T rakke need viivad viiruse epiteelirakkudesse■ tekib naha vesine mädane lööve, palavik ja süsteemsed sümptomid■ hiljem latentne kraniaalnärvides■ viiruse ärkamisel võib tekkida herpes zoster või vöötohatis■ antigeenid olulised viiruse leviku pidurdamisel

○ inimesed on nakkavad enne ja sümptomite esinemise ajal○ 10-20% varem nakatunutest tekib herpes zosteri viirus (vanusega tõenäosus suureneb)○ Tuulerõuged

■ palavik, makulopapulaarne lööve (inkubatsiooniperiood 14p), tügevaseinalised punnid erütematoosse põhjaga

■ rohkem kerel, sügamise tagajärjel võib tekkida bakteriaalne infektsioon■ vanematel võib tekkida kopsupõletik - võib põhjustada surma■ hiljem võib tekkida vöötohatis

12

Page 13: Mikrobio III kt

○ Diagnoos■ Tzancki äie, antigeeni määramine ja PCR, herpes zosteri haigetel on kõrgem antikehade

tase○ Ravi

■ atsükloviir, famtsikloviir, valatsükloviir■ varicella zosteri antikehi neile, kelle immuunsüsteem on nõrk■ on olemas vaktsiin

● Epstein-Barri viirus○ Paljunemine

■ range kudede tropism, CR2 (komplemendi retseptor 2-le kinnitub - B rakud ja osadel epiteelirakkudel)

■ võib paljuneda, võib püsida latentsena, võib muuta B rakud surematuks■ infektsiooni ajal sünteesitakse varajast antigeeni, viiruslikku kapsiidi antigeeni ja

membraani antigeeni glükoproteiine■ latentses faasis paljunevad ainult koos B rakkude paljunemisega■ EBNA-d põhjustavad infektsiooni püsimist ja surematuse teket■ LMP soodustavad samuti raku muutumist surematuks

○ Patogenees■ haigus tekib kas immuunsüsteemi ülereguleeritusel (mononukleoos… B rakke ründavad T

rakud… tekib väga palju T rakke) või alareguleeritusel (lümfoom, karvrakuline leukoplaakia)■ EBV proteiinid inhibeerivad apoptoosi ja soodustavad B-rakkude kasvu

○ nakatutakse süljega, 90% inimestest, kontamineerunud klaasidega, suudlused (the kissing disease)○ Kliiniline pilt

■ mononukleoos● llümfoadenopaatia, põrna suurenemine, eksudatiivne farüngiit… kõrge palavik,

haigustunne, põrna-maksa suurenemine… raviga võib kaasneda lööve (ampitsilliin)● võivad kaasneda rängemad tagajärjed

○ guillan-barre sündroom■ võivad tekkida tsükliliselt korduvad haiguspuhangud indiviidil■ Lümfoproliferatiivsed haigused

● inimestel, kellel on T rakkude puudus● leukeemiasarnane haigus● immuunsupresseerivaid ravimeid võtvatel inimestel, ka AIDSi haiget

■ Burkiti lümfoom -- lõua ja nöopiirkonnas malaariahaigetel lastel■ Hodgkini lümfoom■ nasofarüngeaalne kartsinoom - Aasias■ Karvane suu leukoplaakia

● keele ja suu paistetus, AIDSi haigetel○ Diagnoos

■ sümptomite alusel, lümfotsütoos(vastav lümfotsüütide suhe)■ heterofiilsed antikehad

13

Page 14: Mikrobio III kt

● mitogeense aktiveerimise tagajärjel tekkivad antikegad - tunnevad ära Paul-Bunnelli antikeha - sobib täiskasvanutele see test

■ atüüpilised lümfotsüüdid■ seroloogilised testid - IgM antikehad

● tekivad EBV infektsiooniga○ Ravi pole

● Tsütomegaloviirus○ lümfotroopne, sisaldab spetsiifilist mRNA-d, paljuneb ainult inimeste rakkudes

■ fibroblastid, epiteeli rakud, makrofaagid■ latentne infektsioon mononukleaarsetes lümfotsüütides

○ patogenees■ satub organismis igale poole lümfo- ja leukotsüütidega■ muudab lümfo- ja leukotsüütide funktsioone… segab antigeenide presentatsiooni CD8 ja

CD4 T rakkudele… ka NK rakkude tööd segatakse○ isoleeritav uriinist, verest, spermast, väljaheidetest, amnionivedelikust, vaginaalsekreedist,

transplantaatidelt○ põhjustab harva sümptomeid… immuunkompremeeritud inimestel○ Kliiniline pilt

■ 10% nakatunud imikutest tekivad hiagusnähud● väike kasv, trombotsütopeenia, mikrotseefalus, kaltsifikatsioon, kollatõbi, põrna ja

maksa suurenemine ja lööve● kuulmishäire ja alaareng võib kaasneda

■ täiskasvanutel võivad tekkida mononukleoosi nähud■ immuunkompremeeritutel

● kopsus - pneumoonia ja pneumoniit… retiniit, koliit, esofagiit■ põhjustab tihti transplantatsioonide ebaõnnestumise

○ Diagnoos■ tsütomegaalrakud - suured rakud, tsentraalse inklusiooniga■ antigeenide määramine ELISA abiga, ka PCR■ IgM antikehade tiiter

○ Ravi■ gantsitsükloviir, valgantsikloviir

● HHV 6,7○ HHV6 infektsioon tekib varajasel eluperioodil○ viirus paljuneb mukoosa rakkudes… levitatakse süljega○ nakatab lümfotsüüte, monotsüüte, epiteeli rakke, endoteeli rakke, neuroneid○ aktiveerub tavaliselt AIDSi haigetel○ Kliiniline pilt

■ roseool e kolmepäevapalavik● kiire palavik, järgneb lööve (DTH tõttu)● võivad tekkida epileptilised hood, ka mononukleoos

14

Page 15: Mikrobio III kt

● HHV 8○ Kaposi sarkoom (AIDSi haigetel), Castlemani tõbi, B rakuline kasvaja

583-593 Ortomüksoviirused

- influentsa A ja B põhjustavad haigust

● ümbrisega viirused, segmenteerunud negatiivne RNA genoom○ segmenteerunud genoom soodustab uute tüvede teket, igaaastased epideemiad (influentsa A)

● pleomorfsed, näivad sfäärilistena või tubulaarsetena● ümbrises on glükoproteiinid hemaglutiniin(HA) ja neuraminidaas(NA)... membraani proteiini katab

maatriksi proteiin● genoom koosneb 8 erinevast heeliksiküjulisest nukleokapsiidi segmendist, RNA, mis on assotseerunud

nukleoproteiiniga ja transkriptaasiga● HA moodustab trimeeri, iga osa aktiveerib proteaas

○ on viiruse kinnitumiseks vajalik (siaalhappele epiteelirakkudel), aitab sulandumisele kaasa, hemaglutineerub, tekib antikeha reaktsioon

● NA on tetrameer○ lõhestab siaalhappe, et viirus saaks rakust väljuda○ ravimid zanamivir, oseltamivir(tamiflu)

● M1, M2, NP aitab erinevaid tüvesid eristada, vooderdavad viiruse sisepinda (amantadiin, rimantadiin)

● Paljunemine○ HA kinnitub siaalhappele○ viirus siseneb raku vesiikulisse ja läheb endosoomi○ sealt vabaneb happelisuse tõstmise abiga… kaotab ümbrise ja läheb tsütoplasmasse○ läheb koos kapsiidiga tuuma, transkribeeritakse mRNAks○ kasutab peremehe mRNAd praimerina, saab kinnituda ribosoomidele○ HA ja NA sünteesitakse Golgi kompleksis○ sünteesitakse nii positiivne kui ka negatiivne RNA○ genoomi osad assotseeruvad polümeraasi ja NP proteiinide - tekivad nukleokapsiidid○ need liiguvad tsütoplasmasse, kus tekib ümbritsev kate○ genoomi segmendid lähevad juhuslikult ümbrisesse 8-11 erinevat segmenti

■ väike number virione, kellel on 8■ teised on defektsed - antigeensed

● Patogenees ja immuunsus○ ülemiste hingamisteede inf, tapab lima eritavaid, karvakestega rakke ja teisi epiteeli rakke - kaob

esmane kaitse○ NA lõhustab siaalhapet - ligipääs teistele kudedele○ alumistes hingamisteedes võib tekkida bronhide ja alveolaarepiteeli deskvamatsioon○ soodustab bakterite adhesiooni - võib tekkida pneumoonia

15

Page 16: Mikrobio III kt

○ mnotsüüdid, lümfotsüüdid ja neutrofiilid○ submukoosa ödeem, alveolaarne emfüseem või nekroos○ kaitse tagavad HA antikehad, rakuline immuunsus on laiahaardelisem (ka teiste tüvede vastu)

● nimes sisaldub tüüp (A,B,C), isoleerimise asukoht ja aeg, ja antigeen (HA, NA)● suudab paljuneda mitmetes erinevates liikides/kandub üle● linnugripp levib lindude väljaheidetega● minoorsed antigeenide muutused (iga 2-3 aasta), suured muutused (erinevate liikie vahel)● influentsa B ei läbi suuri muutusi (ainult inimese haigus)● suremus on suurem inimeste seas üle 65 aasta● Kliiniline pilt

○ asümptomtomaatiline kuni raskekujuline○ raskem kulg - südameprobleemidega, immuunpuudulikkus (vanurid, rasedad), suitsetajad○ 1-4 päeva inkubatsioon○ algab peavaluga, hiagustundega - paar tundi○ palavik, külmavärinad, lihasvalu, isu kadumine, käre kurk, kuiv köha○ palavik3-8 päeva… paranemine 7-10 päevaga○ alla 3 aastastel - raskekujuline, bronhioliit, keskkõrvapõletik, oksendamine, alakõhuvalu○ võivadd järgneda bakteriaalne kopsupõletik, müosiit, Reye sündroom○ võib tekkida hüpoksia - strep. pneumoniae, h. influenzae, s. aureus

● Diagnoos○ sümptomid, hooaeg, viiruse olemasolu kommuunis○ hemaglutinatsioonitest, merisigadega hemadsorptsioonitest○ RT-PCR, kiire antigeeni test (A, B eristamiseks)

■ saab teada, kas on A või B või siis kindel A tüüp (kindlad praimerid vajalikud)○ EIA, immunoflourestsents○ laboratoorsed uuringud on olulised epidemioloogilistes uuringutes

● Ravi○ haiguspilti leevendavad ravimid - antihistamiinid○ amantidiin, rimantadiin○ zanamiviir, oseltamiviir○ vaktsineerimine

571-583 Paramüksoviirused

● negatiivsest üksikahelalisest RNAst, heeliksikujuline nukleokapsiid, mida ümbritseb pleomorfne ümbris● sarnased ortomüksoviirustele, ei oma segmenteerunud genoomi● nukleokapsiid koosneb RNAst, mis on assotseerunud nukleoproteiiniga (NP), polümeraasi

fosfoproteiinist(P) ja suurest(L) proteiinist.● L on RNA polümeraas, P vastutab RNA süteesi eest, NP aitab hoida genoomset struktuuri● maatriksi (M) proteiin vooderdab ümbrise sisepinda● ümbrises on sulandumis (F) proteiin ja kinnitumiseks on hemaglutiniin-neuraminidaas (HN… või H ja G).

16

Page 17: Mikrobio III kt

● alguses kinnituvad paramüksoviirused HN, H või G proteiinid siaalhappele (leetritekitaja ka CD46● paramüksoviirused saavad soodustada rakkude ühinemist (süntsüütium)● RNA polümeraas transporditakse rakku nukleokapsiidi koostises● transkriptsioon, proteiinide süntees ja genoomi replikatsioon toimuvad kõik tsütoplasmas● genoom transkriberitakse mRNAsse ja positiivsesse RNAsse● sünteesitakse valgud, mis ühinevad genoomiga… glükoproteiinid sünteesitakse nagu tavalised raku

valgud… viiruse moodustumine toimub membraanil● Leetrid● Patogenees

○ soodustab rakkude ühinemist, tekivad hiidrakud.. viirused levivad rakust rakku, on kaitstud antikehade eest

○ infektsioon viib rakkude lüüsumiseni - mitte närvikoes○ piisknakkus○ viiruse disseminatsioon põhjustab konjunktiviiti, hingamisteede infektsiooni, UTI, väikeste

kapillaaride põletikku, lümfisüsteemi põletikku, KNS põletikku.○ makulopapulaarne lööve tekib T rakulisest reaktsioonist nakatunud endoteeli rakkude suhtes○ tekib eluaegne immuunsus○ võib tekkida entsefaliit - otseselt, postinfektsioosselt, defektsest viirusest○ kui puudub rakuline immuunsus, tekib hiidrakuline kopsupõletik

● Kliiniline pilt○ inkubatsiooniperiood 7-13 päeva○ kõrge palavik,CCC ja P köha, nohu, konjunktiviit, fotofoobia○ 2 päeva pärasttekivad - Kopliki laigud - molaaride ümber, konjunktiviidil ja vagiinas○ laikude järel tekib eksanteem (kõrvade juurest ja siis üle keha).... lööve on makulopapulaarne

(haiguse kõrgpunkt)○ võib tekkida kopsupõletik, entsefaliit

● Diagnoos○ väga iseloomulik haiguspilt, tihti ei tehta lisateste○ RT-PCR, hiidrakkude otsimine, IgM antikehad

● Ravi○ vaktsiin, otsene ravi puudub

● Parainfluetsa○ kerged külmetussümptomid, võib põhjustada rasket hingamisteede haigust -

larüngotrahheobronhiit○ Patogenees

■ epiteelirakke nakatab, tekivad hiidrakud ja lüüs■ tekib osaline immuunsus

○ inimeselt inimesele, piisknakkus○ Kliiniline pilt

■ külmetuslaadsed sümptomid (nohu, farüngiit, bronhiit, aevastamine, palavik■ bronhioliit ja kopsupõletik

17

Page 18: Mikrobio III kt

■ vanematel kergemad sümptomid■ larüngotrahheobronhiit võib põhjustada hingamisteede sulmumise

○ Diagnoos■ hemaglutinatsioonitest, hemaglutinatsiooni inhibitsiooni test ■ RT-PCR

○ Ravi■ auru kasutamine, ülemiste hingamisteede jälgimine

○ Mumpsiviirus■ parotiit - valulik suurenemine■ lüütiline infektsioon, ülemistes hingamisteedes, viirus läheb testistesse, munasarja,

pankreasesse, kilpnäärmesse jt■ vaktsineerimata inimeste seas tekib haigus 90% tõenäosusega■ bilateraalne parotiit, palavik, kiiresti tekib, ka teiste näärmete suurenemine, võib tekkida

steriilsus○ Dianoos

■ süljest, uriinist, faarünksist■ IgM taseme tõus, ELISA test

○ ainult vaktsiin● Hingamisteede süntsütiaalviirus

○ puudub hemaglutinatsiooni ja neuraminidaasi aktiivus○ surmav akuutne hingamisteede põletik○ 2-aastaselt on peaaegu kõik seda haigust põdenud○ süntsüütiumite teket soodustab, rakulise immuunsuse kahjustused ja epiteeli kahjustused○ bronhide nekroos, tekivad tropid○ peaaegu alati talvel, igal aastal, väga nakkav○ külmetus, kopsupõletik, riniit, bronhioliit(imikutel)○ palavik, tahhüpnea, tahhükardia○ RT-PCR○ ribaviriin (raskem kulg), tavaliselt toetav ravi○ passiivne immunisatsioon (enneaegselt sündinud)

● Inimese metapneumoviirus○ peaaegu kõik (5-aastased) on seropositiivsed○ sarnased sümptomid○ seronegatiivsed vanurid on riskirühm

● Nipahi ja Hendra viirused○ paljudelt loomadelt, puuviljadelt, nahkhiirtelt, sigadelt○ inimene on juhuslik peremees○ gripilaadsed sümptomid, epilepsia, kooma

553-565 Pikornaviruse

18

Page 19: Mikrobio III kt

● väiksed RNA viirused, millel pole ümbrist, väga resistentsed erinevatele keskkonna tingimustele● Struktuur

○ positiivne RNA, ikosaeedriline kapsiid, 12 pentameerset tippu, igaüks koosneb 5 protomeersest osast

○ protomeerid koosnevad polüpeptiididest VP1-VP4 (4 tükki), ○ stabiilsed kuumuse ja detergentide suhtes, riniiditekitajad kannatavad ka hapet○ genoom meenutab mRNA-d, genoom suudab ise nakatada rakku○ genoom kodeerib polüproteiini, mille lõikamisel tekivad ensüümid ja struktuuriproteiinid○ 2 proteaasi ja RNA polümeraas

● Paljunemine○ VP1 abil kinnitub viirus retseptorile○ 80% rhinoviridiae, ja paljud coxsakieviirused kinnituvad ICAM-1-le (epiteeli rakud, fibroblastid ja

endoteeli rakud○ cozsakieviirused, echoviirused ja enteroviirused kinnituvad CD55 (mitte kõik)○ polio kinnitub PVR/CD155 (HSV sarnane retseptor)○ VP4 vabaneb kinnitumisel, genoom läheb läbi membraani kanali, mille moodustab VP1.. genoom

kinnitub otse ribosoomidele, 10-15 minutiga sünteesitakse kõik vajalik… RNA sõltuva polümeraasi abiga genereeritakse negatiivne RNA, sünteesitakse uued RNA-d(+)... 400 000 ühes rakus

○ pärsitakse raku proteiinide ja RNA süntees… viirused pannakse prokapsiidide sise.● Enteroviirused

○ ei põhjusta tavaliselt seedekulgla haigusi.. levivad fekaal-oraalselt○ erinevad haiguspildid kujunevad erineva koetropismi tõttu ja tsütolüütiliste omaduste erinemisest○ sisenevad hingamisteedest, orofaarünksist või seedekulglast..○ seedekulgla kaitsefaktorid on köömes○ tungivad lümfisõlmedesse○ tsütolüütilised, paljunevad kiiresti, otsene kahju peremeesrakule○ polioviiruse puhul nakatab viirus lihast, siis liigub innerveerivat lihast mööda ülespoole - tekib

postpolio sündroom○ nakkusohtlikkus sälib 30p või enam○ antikeha on peamine kaitsev faktor○ Epidem

■ halvad sanitaarsed olud ja kambas elamine■ paralüütiline lastehalvatus on Aafrikas ja Afganistanis, Pakistan, India ja Nigeeria

● tekib hilisemas eluperioodis, varajases eas nakatumine on asümptomaatiline või kerge

○ Kliiniline pilt■ serotüüp, doos, tropism, sisenemispiirkond, vanus, sugu, tervislik seisund, rasedus■ inkubatsiooniperiood 1-35 päeva■ Lastehalvatus

● asümptomaatiline 90%● kerge haigus - palavik, peavalu, haigustunne, käre kurk

19

Page 20: Mikrobio III kt

● mittehalvav - KNS läheb, põhustab meningiiti nähtu, seljavalu, lihasspasmid● paralüütiline

○ columna anteriorisesse verest, halvatuse ulatus sõltub kahjustuse ulatusest○ halvatus võib kaduda, võib ka surra○ bulbaarne paralüüs - faarünksi lihased, häälepaelad○ 20-80% tekib hiljem 30-40 aastat poliojärgsed nähud

■ Koksakieviirus ja ehhoviirus● coxsackie A

○ herpangiin■ palavik, käre kuruk, raskusi neelamisel, anoreksia, oksendamine,

kahjustused uvulae piirkonnas○ käe-jala-suu haigus

■ vesikulaarne eksanteem■ kahjustused kätel, jalgadel ja suus/keelel■ väike palavik, kaob kiiresti

● coxsackie B○ pleorodüünia -Bornholmi tõbi

■ tekib kiiresti palavik, ühepoolne torakaalne pleuraalne rinnavalu (väga jube)

■ alakõhuvalu ja oksendamine■ väga tundlikud lihased valu tsentris

○ müokardi või perikardi põletik■ vanemad lapsed ja täiskasvanud, kõige ohtlikum imikutel■ palavik, kiiresti tekkiv südamepuudulikkus■ tsüanoos, tahhükardia, kardiomegaalia ja hepatomegaalia

● echovirus○ viiruslik aseptiline meningiit

■ peavalu, ajukelme ärritus, kaela kangus○ palavik, lööve, külmetussümptomid

○ Diagnoos■ CSF vedelikus on lümfotsüüdid (asept meningiit), glükoosi tase normaalne või pisut

alanenud■ kasvavad kultuuris■ antikeha või antigeeni testid (ELISA, immunoflourestsents)■ RT-PCR■ IgM-i määramine

○ Ravi■ pleoconaril - inhibeerib pikornaviiruste sisenemist■ lastehalvatuse vaktsiin

● Rhinovirus○ külmetushaiguse põhjustaja, ka ülemiste hingamisteede haigused

20

Page 21: Mikrobio III kt

○ ei paljune GI traktis, ei talu happeid, kasvavad kõige paremini 33 kraadi juures○ viiruse tiiter ja väljutus korreleeruvad haiguse raskusega○ nakatunud rakud vabastavad bradükiniini ja histamiini - lima eritumine○ mitu serotüüpi tekitajal, ei teki immuunsus○ antikehad kaovad (18 kuud või nii)○ piisknakkusega või puutumisega○ haigus tekib pooltel, asümptomaatilised ka levitavad○ aevastamine ja lima eritumine, käre kurk, peavalu ja haigustunne○ ei diagnoosita tavaliselt○ sooja auru sissehingamine ja ka kanasupi aurud võivad aidata

Coronavirus ja Norovirus

● põhjustavad külmetushaigusi (coronaviirused)● SARS-CoV● Paljunemine

○ ümbrisega viirused, positiivne RNA○ taluvad GI trakti tingimusi… levivad fekaaloraalselt○ N proteiiniga moodustab nukleokapsiidi○ RNA polümeraas genereerib negatiivse RNA○ sellest sünteesitakse mRNAsi ja +RNA ahel○ glükoproteiinid E1 ja E2 ja tuuma nukleoproteiinid○ E2 abil kinnitub ja ühineb, E1 on maatriksi proteiin

● Patogenees○ epiteeli rakke nakatavad, kasvavad hästi 33-35 kraadi vahel○ piisknakkus○ antikehad ei anna immuunsuse○ võivad ka põhjustada kõhulahtisust ja gastroenteriiti○ SARS - kõrge palavik, külmavärinad, krambid, peavalu, uimasus, haigustünne, müalgia köha ja

raske hingamine● Diagnoos

○ SARSi puhul ainult, RT-PCR, seroloogilised testid● Ravi

○ karantiin● Noroviirus

○ Paljunemine■ positiivne RNA, VPg proteiin, paljas kapsiid, ümarad räsitud ümbrisega■ ei kasva kultuuris

○ Patogenees■ piisab 10 tekitajast■ vesine diarröa, oksendamine

21

Page 22: Mikrobio III kt

○ gastroenteriit, kontaminatsiooni tagajärjel - vesi, karploomad, salat, toit○ fekaaloraalselt○ Diagnoos

■ RT-PCR, ELISA testid antigeeni määramiseks○ Ravi pole otseselt,

Adenoviirused

● Paljunemine○ kaheahelaline DNA, genoom on lineaarne, DNAl on terminaalne proteiin, ümbriseta

iksadeltaheedronid, omab fiibreid, millel on kinnitumisüksused - töötavad kui hemaglutiniinid, sisaldavad ka antigeene

○ transkribeeritud RNAst saavad mRNAd○ DNA polümeraas on seotud genoomi replikatsiooniga○ adenoviiruse proteiinid suruvad alla peremehe immunreaktsioonid ja põletikulised protsessid○ coxsackie adenoviiruse retseptorit kasutab või MHC I-te○ kapsiidi sees läheb DNA tuuma, geeni produktid soodustavad raku kasvu ja jagunemist○ E1A ja E1B transkribeeritakse… need aitavad kaasa raku kasvule (E1A on onkogeen)○ raku surm järgneb viiruse paljunemisest - vastuvõtlikes rakkudes○ mittevastuvõtlikes tekib latentsus ja viirus jääb genoomi○ hiline geeni transkriptsioon järgneb pärast DNA sünteesi (E1 oli esmane)○ kapsiidi proteiinid sünteesitakse tsütoplasmas ja transporditakse tuuma, seal lähevad valgud ja

genoom prokapsiidi○ väga palju vigu tekib ja väga vähe terveid viiruseid moodustatakse, viirus vabaneb raku lüüsil

● Patogenees○ lüütiline, latente kulg○ epiteeli rakke orofaarünksis, respiratoorsetes organites ja GI traktis, fiibrid määravad tropismi○ rakusisene tihe inklusioon (viiruspartiklid)○ resistentne kuivamisele, detergentidele, GI trakti sekretsioonidele ja vähesele kloorile○ levivad fekaal-oraalselt, aerosoolidega, näppudega, käterättidega○ moodustab 15% haiglaravi vajavatest gastroenteriidi juhtudest

● Kliiniline pilt○ farüngiit, konjunktiviit, farüngokonjunktiivi palavik○ noortel, näib nagu streptokoki infektsioon○ gripilaadsed sümptomid (kerged)○ akuutne respiratoorne tõbi (on vaktsiin)○ gastroenteriit ja kõhulahtisus serovariant 40,41

● Diagnoos○ peab sümptomite kohast võtma - peab välistama strep. pyogenese○ ELISA, fluorestseeruv antikeha, PCR

● Ravi

22

Page 23: Mikrobio III kt

○ vaktsiin, kätepesu ja kloori kasutamine○ adenoviirusi kasutatakse geeniteraapias

Rotaviirused

● katteta, kahekihiline proeiinide kapsiid, 10-12 kaheahelalist RNA genoomi, stabiilne erineva pH suhtes, temperatuuri vahemike, aerosoolides

● Rotaviirused põhjustavad imikute gastroenteriiti, 50% imikute haigestumistest, mis vajavad haiglaravi● Ehitus ja paljunemine

○ ikosaeedriline morfoloogia, meenutab ratast,○ proteolüütlilne kapsiidi lõikamine teeb viirusest infektsioosse partikli○ 10-11 erinevat RNAd kapsiidis, hübriidid võivad kergesti tekkida○ glükoproteiinid (VP7, NSP4) - väljaspool virioni○ genoomsed segmendid kodeerivad struktuurseid ja mittestruktuurseid osakesi○ VP4 on hemaglutinatsioonivõime, lõikamisel tekivad proteiinid, millega saab rakku (retseptorid ja

sulandumine)○ viirus neelatakse○ VP4 lõigatakse antud keskkonnas,tekivad ISVP, selle abil tungib viirus rakku, siaalhappele kinnitub,

ka beeta-adrenergilistele retseptoritele○ kapsiidi sisemuse ensüümid vabanevad kapsiidist ja alustavad mRNA produktsiooni, RNA jääb alati

kapsiidi○ negatiivsest RNAst sünteesitakse individuaalseid mRNAsid○ virioni proteiinid ja positiivsed RNA segmendid assotseeruvad tuumalaadses struktuuris

tsütoplasmas, ■ +RNAdest tehakse -RNAd uutes tuumades - saadakse kaheahelaline RNA… uued tuumikud

genereerivad veel +RNAd või muutuvad virionideks■ vabaneb raku lüüsumisel

○ serotüüpe eristatakse VP7 või VP4 alusel○ inimeste haigused on tavaliselt grupp A rotaviirusega (vahel B või C)○ Patogenees

■ suudab säilida happelises keskkonnas■ paljunemine algab epiteeli sisenedes, 8 tunni pärast on näha inklusioone, mikrovillid

lühenevad■ vett ei võeta vastu, ioonide puudus tekib - vedine diarröa■ IgA antikehad kergendavad haiguse kulgu - emapiimast, pärast läbipõdemist■ täiskasvanutel on tavaliselt asümptomaatiline

○ 95% on nakatunud 3-5 aastaseks saanult, fekaal-oraalselt, säilib hästi mänguasjadel ja kätel,○ Kliiniline pilt

■ gastroenteriit, inkubatsiooniperiood 48 tundi■ oksendamine, diarröa, palavik, veepuudus■ ei ole leukotsüüte ega verd väljaheites

23

Page 24: Mikrobio III kt

■ meenutab Norwalki viirust○ viirusliku antigeeni määramine väljaheitest, ELISA, või lateksaglutinatsioonitest○ rotaviiruse vaktsiin, muidu vee manustamine

Koronaviirused ja Noroviirused ja Kaltsiviirused ja Toroviirused

● Koronaviirus○ teisel kohal külmetuse põhjustajatena

24