8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
1/17
PRAKATA
Alhamdulillahirabbil’aalamin, puja dan puji syukur kami persembahkan
kepada Allah SWT yang telah melimpahkan rahmatNya sehingga kami bisa
menyelesaikan makalah yang berjudul “Filogeni Mikrobia Prokariotik !akteria"
dengan baik# Makalah ini disusun demi memenuhi tugas Sistematika Mikrobia#
Adapun terbentuknya makalah ini telah kami usahakan semaksimal mungkin$
tetapi tidak terlepas oleh bantuan dari berbagai pihak yang telah memperlan%ar dalam
pembuatan makalah ini# &leh karena itu$ kami mengu%apkan banyak terimakasih
kepada 'r# (ndah Retnaningrum#$ M# (ng selaku dosen pengampu matakuliah
Sistematika Mikrobia dan teman)teman yang sudah berkontribusi dalam pembuatan
makalah ini#
Kami masih sangat menyadari bah*a makalah ini jauh dari sempurna# +ntuk
itu dengan tangan terbuka$ kami mengarapkan kepada pemba%a untuk memberi kritik
dan saran yang membangun demi perbaikan makalah ini#
Semoga makalah ini memberikan in,ormasi bagi masyarakat dan berman,aat
untuk pengembangan *a*asan dan peningkatan ilmu pengetahuan bagi kita semua#
-ogyakarta$ No.ember /012
Penulis
1
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
2/17
Daftar Isi
Cover .......................................................................................................................... i
Prakata 3333333333333333333333333333######## ii
'a,tar 4si 33333333333333333333333333333 iii
!ab 1# Pengantar 333333################################################################################## 1
1#1 5atar !elakang 3333###333333333333#33333### 1
1#/ Rumusan Masalah ##############33333333333333333### /
1#6 Tujuan 3333333##333333333333333#333 /
!ab /# 4si33#############################################333333333333333##### 6
/#1 Karakter +tama 'omain !akkteria333333333###3##333## 6
/#/ Klsi,ikasi 'omain !akteria######################################################################## 7/#6 Analisis Filogenetik Rhi8obia yang 'iisolasi dari Aeschynomene spp# ####2
!ab 6# Penutup#############################################################################################################16
'a,tar Pustaka##############################################################################################################17
2
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
3/17
BAB I
PENDAHULUAN
1.1. Latar BelakangMikrobia di alam jumlahnya relatif banyak dan beranekaragam.
Pada tahun 1978 eorang ahli mikrobia bernama Carl. !oee
berhail meneliti molekul "#$ "iboomal yang menjadi daar
%engelom%okan item & domain. 'item terebut terdiri dari
domain arkaea( bakteria( dan eukarya. )eberhailan terebut
membuat kemajuan yang %eat dalam bidang itematika. *alam
mem%elajari keanekaragaman dan hubungan kekerabatan makhluk
hidu% di bumi dibuatlah item klai+kai. ,erda%at item
klai+kai fenetik dan +logenetik. 'item klai+kai fenetik
didaarkan %ada kemiri%an ifat ementara item klai+kai
+logenetik didaarkan %ada hubungan evoluioner. )eduanya
memiliki keunggulan dan kelemahan.*ari ketiga domain terebut terda%at 2 domain yang ama-
ama tidak memiliki item endomembran yaitu bakteria danarkhaea. al terebut membuat keduanya digolongkan dalam
organime %rokariota. Prokariot modern memiliki truktur dan fungi
+iologi yang beranekaragam. )eragaman %rokariot di%erkirakan
/00.000 am%ai / milyar %eie. Penggunaan karakter fenoti%
angat menyulitkan dalam menganalii kedua domain berbeda ini.
Maka ara yang angat efektif adalah dengan menggunakan
karakter molekular yang menghailkan data +logenetik. *engan
membandingkan "#$ riboom dan data urutan lengka% genomnya
maka %eneliti mam%u mengidenti+kai 2 abang utama evolui
yaitu arkhaea dan bakteria.
1
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
4/17
Bakteria memiliki banyak anggota +lum dan ifat yang angat
%enting untuk di%elajari. leh ebab itu( makalah ini dibuat untuk
membantu mem%elajari a%ek-a%ek terebut.
1.2. Rumusan Masalah"umuan maalah yang ingin dikaji dalam makalah ini adalah
bagaimanakah iri umum domain bakteria dan item klai+kai
+logeninya31.3. Tujuan
*alam %enulian makalah ini( ada%un tujuannya adalah
mengkaji iri umum domain bakteria dan item klai+kai
+logeninya.
BAB IIISI
2
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
5/17
2.1. ara!t"r Utama D#main Ba!t"riaBakteria adalah domain yang terdiri dari makhluk hidu% yang
tidak memiliki membran inti ehingga diebut organime %rokariota.
Bakteri dulu terbagi menjadi Bateria dan $rhaebateria( namun
ekarang $rhaebakteria memiliki domain endiri yang diebut
$rhaea. Bakteria memiliki iri-iri yang %aling umum antara lain
tidak memiliki membran inti( tidak memiliki organel bermembran(
memiliki dinding el %e%tidoglikan( dan materi aam nukleatnya
beru%a %lamid dan nukleoid.Berikut meru%akan %erbedaan domain bakteria dengan
arkhaea dan eukarya ,abel 1. Perbedaan karakter umum dalam item klai+kai &domain
&
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
6/17
Perbedaan utama *omain Bateria dengan $rhaea mau%un
4ukarya terletak %ada aam amino iniiator yang diba5a oleh t"#$
yang beru%a #-formylmethionine( eniti+ta riboom terhada%
hloram%heniol dan kanamyin( tidak adanya %rotein hiton( dan
keberadaan endo%ora.*engan menggunakan "#$ riboomal ub-unit keil %rokariota
da%at diklai+kaikan ke dalam domain bakteria atau arkhaea.
6ilogenetik %ada bebera%a takon %rokaryotik didaarkan %ada
itematika molekular. Pelajaran %enting yang di%eroleh dari
itematika molekular adalah nilai %enting dari tranfer gen
horiontal dalam evolui %rokaryota. 'elama ratuan tahun
%rokaryota mam%u mem%eroleh gen-gen dari %eie yang
berkerabat jauh ekali%un. $kibatnya( uku% banyak genom dari
%rokaryota yang meru%akan %roduk im%or moaik dari %eie lain.
,ranfer gen horiontal da%at mengaburkan lokai akar %ohon
kehidu%an.ntuk menarik keim%ulan +logeni ahli itematika haru
mengum%ulkan ebanyak-banyaknya data morfologi( gen dan
biokimia dari organime domain bakteria yang relevan. Penentuankekerabatan didaarkan %ada homologi morfologi erta ekuen
*#$. rganime dengan ekuen *#$ yang miri% mungkin lebih
berkerabat dekat dari%ada dengan organime yang truktur
ekuen *#$nya berbeda jauh.
2.2. lasi$!asi D#main Ba!t"ria*omain bakteria terdiri dari bebera%a +lum. Berikut meru%akan
anggota +lum dari domain bakteria diantaranya adalah +lum
$idobateria( $tinobateria( $ui+ae( $rmatimonadete(
Bateroidete( Caldieria( Chlamydiae( Chlorobi( Chloro:e;i(
Chryiogenete( Cyanobateria( *eferribatere( *einoou-
,hermu( *ityoglomi( 4luimirobia( 6ibrobatere( 6irmiute(
/
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
7/17
6uobateria(
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
8/17
yang relatif rendah. )ebanyakan berbentuk coccus dan
batang erta mam%u menghailkan endo%ora.e. 6ilum Chloro:e;i
6ilum ini berifat miri% dengan bakteri ulfur hijau yang
membedakan adalah terda%at chlorosom dan berifat
fototro+k. $nggota-anggotanya da%at tumbuh ebagai
heterotrof atau%un fotointei. Memiliki jalur %eial untuk
mem+kai C2 melalui jalur hydro%ro%ionat.
f. 6ilum hlorobiMeru%akan bakteri ulfur hijau yaitu bakteri fotointetik
yang tidak menghailkan okigen. Bebera%a berbentuk
unieluler dan yang lain membentuk el-el. ,idak ada
atu%un yang memiliki :agela.g. 6ilum yanobateria
Meru%akan bakteri fotoautotrof dengan fotointei miri%
dengan tumbuhan. 6ilum ini memiliki koloro+l a dan
menggunakan 2 fotoitem untuk memeah air yang
menghailkan okigen ebagai %roduk am%ingnya.
,erda%at bakteri yang hidu% di air ta5ar mau%un air laut.h. 6ilum aui+ae
Meru%akan bakteri autotrof hidrogen. Meru%akan bakteri
thermo+lik bahkan hi%erthermi+lik. Bakteri yang mem+kai
C2 melalui iklu reduki aam nitrat dan menggunakan 2
ebagai umber energinya.i. 6ilum thermotogae
Meru%akan bakteria fermentatif yang terdiri dari bebera%a
bakteri thermo+lik. Mam%u hidu% dan tumbuh %ada uhu
AAC am%ai 90C. memiliki kandungan li%id dalam el yang
kha. j. 6ilum +bobatere
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
9/17
6ilum +brobaktere da%at ditemukan dalam ruminania
he5an. Bebera%a %eie dari anggota +lum ini da%at
mendegradai eluloa dari tumbuhan. mumnya
meru%%akan bakteri anaerob gram negatif.
2.3. R"%i"& 'urnal
7
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
10/17
8
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
11/17
9
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
12/17
10
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
13/17
11
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
14/17
12
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
15/17
1&
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
16/17
BAB IIIPENUTUP
3.1. "sim(ulanCiri-iri umum domain Bakteria adalah aam amino iniiator
yang diba5a oleh t"#$ yang beru%a #-formylmethionine(
eniti+ta riboom terhada% hloram%heniol dan kanamyin( tidak
adanya %rotein hiton( dan keberadaan endo%ora.*omain bakteria terdiri dari bebera%a +lum yaitu
$idobateria( $tinobateria( $ui+ae( $rmatimonadete(
Bateroidete( Caldieria( Chlamydiae( Chlorobi( Chloro:e;i(
Chryiogenete( Cyanobateria( *eferribatere( *einoou-
,hermu( *ityoglomi( 4luimirobia( 6ibrobatere( 6irmiute(
6uobateria(
8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia
17/17
DAFTAR PUSTAKA
Madigan MT$ 9M Martinko$ 'A Stahl$ 'P :lark# /01/# Brock Biology of
Microorganisms# 16th (dition# !enjamin :ummings# !oston# P 7;1
Pres%ott 5M$ 9P