Top Banner
Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008) Magnetotaktické bakterie G- bakterie, objeveny v 60.l. 20.stol. koky, bacily, vibria, spirily; pohyb bičíky obligátně mikroaerofilní nebo anaerobní – negativní aerotaxe výskyt: svrchní sedimenty ve vodě magnetotaxe – v přírodě výhoda 3D navigace Magnetozomy Bakteriální magnetické částice (BMP) anorganické magnetické krystaly (magnetit – Fe 3 O 4 nebo greigit Fe 3 S 4 ) ve fosfolipidové dvojvrstvě 25 nm 0,5 μm Magnetospirillum gryphiwaldense Magnetobacterium bavaricum 1 μm
15

Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Feb 27, 2019

Download

Documents

truongdang
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Magnetotaktické bakterieG- bakterie, objeveny v 60.l. 20.stol.koky, bacily, vibria, spirily; pohyb bičíkyobligátně mikroaerofilní nebo anaerobní –

negativní aerotaxevýskyt: svrchní sedimenty ve voděmagnetotaxe – v přírodě výhoda 3D navigace

MagnetozomyBakteriální magnetické částice (BMP)

anorganické magnetické krystaly (magnetit –Fe3O4 nebo greigit Fe3S4) ve fosfolipidovédvojvrstvě

25 nm

0,5 μm

Magnetospirillum gryphiwaldense

Magnetobacteriumbavaricum

1 μm

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 2: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Magnetotaxe

Poděkování: Mgr. Z. Šafránková (DP S. Fruhwirtová, 2007)

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 3: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Model biomineralizace železa (Magnetospirillum)

Magnetozomy uspořádány v řetízcíchIzolované magnetozomyM. gryphiwaldenseMembrána (3-4 nm)

25 nm50 nm

Regulační mechanismybiomineralizace- koncentrace Fe- nukleace krystalů- redox potenciál- pH

Kompartmentarizacev magnetozomechumožní biochemickoukontrolu těchto procesů.

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 4: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Vznik magnetozomů

1/ Invaginace cytoplazmatické membrány• GTPasy

2/ Příjem Fe iontů z externího prostředí, transport do vzniklých vezikulů• Fe3+ konvertovány na Fe2+

• využití trans-membránových kanálů, H+/Fe2+ antiport (sekvenční homologie s Na+/H+ antiportem), transport díky protonovému gradientu• kanály v cytoplazmatické i magnetozomální membráně

3/ Nukleace magnetitových krystalů• trans-membránové proteiny Mms6• homogenní krystaly (tvar, velikost)

v řetízcích – vazba na cytoskelet

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 5: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)Nature 440, 110-114 (2 March 2006)

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 6: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Kryoelektronová tomografie magnetotaktické bakterie: 3-D rekonstrukce interiéru buňky Magnetospirillum gryphiwaldense

modrá – plazmatická membrána, červená – krystaly magnetozomů, žlutá – vezikuly, zelená - cytoskeletMax Planck Institute for Biochemistry

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 7: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

octahedraloctahedral dodecahedraldodecahedral cubiccubicprismaticprismatic

Krystaly v magnetozomechRozměry 35-120 nmDruhově specifická morfologie krystalůPodobná velikost

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 8: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Kultivace

Aktivované charcoal médium (ACAM)definovaná atmosféra:• 5-7%O2, 8-10 % CO2-anaerobní podm.• < 1%O2Látalův anaerobní systém (LAS)

• pevné médium• redukující látky:(1,4 dithiothreitol -DTT)• zdroj Fe: citrát železitý

- anaerobní podmínky- zdroj Fe

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 9: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

+ jiná média ....

Standard flask medium - FSM(Heyen and Schuller 2003)tekuté médiumzdroj Fe – citrát železitý

• Magnetospirillum medium -380 (DSMZ) • MSMG medium (ATCC)• source Fe: ferric quinate• trace element mixture• vitamins solution• prepared under the N2 atmosphere• reducens agens – Na thioglycolate

(added before inoculation of bacteria)• addition N2 or O2 through cultivation• succinate solution – to maintain pH

Médium 512source Fe:ferric quinatereducent agens:Na – thioglycolate

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 10: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Tvary magnetických částic (Dirk)

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 11: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

500 nm 500 nm

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 12: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Flies(2005 )

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 13: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

11.32 µm

5.66 µm

0 µm

11.32 µm

5.66 µm

0 µm

497.41 nm

248.71 nm

0 nm

AFM

Magnetospirillumgryphiwaldense

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 14: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

Biotechnologické aplikace

Výhody bakteriálních magnetozomů- stejnoměrný tvar a velikost- biologická membrána (umožňuje připojení bioaktivních látek)

Praktické využití• Určení jižního magnetického pólu meteoritů a hornin obsahujících jemnozrnné magnetické minerály • Separace buněk - magnetotaktické bakterie fagocytované granulocyty a monocyty• Imobilizace enzymů• Tvorba magnetických protilátek• Kvantifikace IgG• Detekce a odstranění buněk E. coli pomocí FITC-konjugovaných monoklonálníchprotilátek imobilizovaných na magnetotaktických BMP• Transformace buněk (magnetozomy potaženy DNA a „vstřeleny“ do buněk)

Problémy rozšíření využití BMP• Kultivace čistých kultur• Vnesení a exprese genů zodpovědných za tvorbu magnetozomů v dobře kultivovatelných druzích bakterií, např. E. coli

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz

Page 15: Magnetotaktické bakterie Magnetospirillumgryphiwaldenseold.botany.upol.cz/.../sedlarova/MB_magnetotakticke_bakterie_t.pdf · Magnetotaktické bakterie G-bakterie, objeveny v 60.l.

Z. Šafránková, M. Sedlářová (2008)

BMP v terapii nádorových buněk

PDF vytvořeno zkušební verzí pdfFactory Pro www.fineprint.cz