Top Banner
LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ Erdinç ATABEK Veteriner Hekim Spiroket Hastalıkları Teşhis Laboratuarı Şefi Tarım ve Orman Bakanlığı Etlik Veteriner Kontrol Merkez Araştırma Enstitüsü ANKARA
42

LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Oct 26, 2019

Download

Documents

dariahiddleston
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI

YÖNTEMLERİ

Erdinç ATABEK

Veteriner HekimSpiroket Hastalıkları Teşhis Laboratuarı Şefi

Tarım ve Orman Bakanlığı

Etlik Veteriner Kontrol Merkez Araştırma Enstitüsü ANKARA

Page 2: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri

Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı

Tanı yöntemlerinin duyarlılık ve özgünlük düzeyleri

Pozitif/Negatif Sonuçlar nasıl yorumlanmalı

Tanıda güçlükler

Sağlık Bakanlığı tanı kriterleri (şüpheli, olası, kesin vb.)

Diğer

Page 3: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

LABORATUVAR TANISI

DİREKT TANI

İNDİREKT TANI

Page 4: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

DİREKT TANI

Kan, idrar, BOS, karaciğer ve böbrekkaranlık saha ve floresan mikroskobi

Giemsa, Floresan Antikor, Gümüşleme,İmmunperoksidaz, İmmunogold gibiboyama metotları

Page 5: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

DİREKT TANI

Moleküler metotlar

Kültür

Deney hayvanlarına inokulasyon ileyapılır

Page 6: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Şüpheli materyal önce 1000 daha sonra 3000devirde santrifüj edilir ve dipteki tortusulandırılarak karanlık saha mikroskopta incelenir(Natif yöntem)

Natif yöntemde hücresel atık ve fibriller nedeniyleyanılmalar olabilir. Bu nedenle boyama teşhisteyardımcıdır

Floresan mikroskopta inceleyebilmek içinserotiplere özgü konjugat kullanılmalıdır

Page 7: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

BOYAMA METOTLARI

GİEMSA BOYAMA

Froti hazırlanır

Kurutulur

Metil alkol ile tespit

Giemsa ile boyama

100 X büyütmede bakılır

Page 8: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Kültür-Giemsa Boyama

Page 9: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

GÜMÜŞLEME (LEVADİTİ,FONTANA,WARTHİN-

STARRY)

Fikze edilmiş dokular için uygulananbir boyama metodudur

Boyamanın esası spiroketleringümüşe affiniteleridir

Page 10: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Böbrek, Levaditi boyama

Page 11: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

İMMUN BOYAMALAR

İmmunofloresan

İmmunohistokimyasal boyamalar

İmmunoperoksidaz

İmmunofosfataz

İmmunogold

Page 12: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

İmmunofloresan

Page 13: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık
Page 14: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Dalak, Avidin-Biotin İmmunoperoksidaz

Page 15: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

MOLEKÜLER METOTLARLA TANI

DNA Hibridizasyonu

Dot-blotting

In situ hibridizasyon

PCR, RT-PCR

Page 16: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

KÜLTÜR METOTLARI Kültür için antibiyotik tedavisine başlanmamış

olmalıdır

Ateş devam ediyorsa ilk 10 gün içinde kandan,

İkinci haftadan itibaren idrardan,

Ölüm gerçekleşmiş ise çeşitli dokulardan en geç4 saat içinde kültür yapılabilir

Hemen kültür yapılamıyorsa kan heparin veyasodyum okzalat içine, idrar ise %1’lik sığır serumalbuminin 1/10’ luk dilüsyonu içine alınmalı veher ikisi de 5-20ºC’da saklanarak en geç 1 haftaiçinde kültür yapılmalıdır

Page 17: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

DENEME HAYVANLARINA İNOKULASYON

Hamster (4-6 haftalık)

Kobay (150-175 gr)

0.5-1.0 ml kan ve/veya idrarintraperitoneal yolla verilir

İnokulasyondan 3 gün sonra periton sıvısıtoplanır, karanlık saha mikroskoptaincelenir. Ölüm oluştuysa karaciğer veyaböbrek kültür için kullanılabilir

Page 18: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

İNDİREKT TANI

Bakteriyoskopi ile kesin sonuca gidilememesi

Kültür sonuçlarının çok zaman alması nedeniyle

dolaşımdaki spesifik antikorların serolojikyöntemlerle ortaya konulması ile yapılır

MAT, CF, ELISA, IFAT, IHA, LEPTO dipstick assayv.b)

Page 19: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

MİKROSKOPİK AGLÜTİNASYON TEST (MAT)

Standart, referans testtir

Serotiplere ait canlı antijenler kullanılır

Serumlarda inaktivasyona gerek yoktur

Formollü antijende lizis oluşmaz

Kronik taşıyıcıları belirlemede ve aşıantikor titresi ile enfeksiyon antikortitresini belirlemede zayıf kalmaktadır

Page 20: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

TESTİN YAPILIŞI

Serumların seri dilüsyonu yapılır

Aynı miktarda antijen ile karıştırılır

2-4 saat 30ºC’ da inkube edilir

Karanlık sahada son sulandırmadanbaşlayarak bakılır

Kontrol ile karşılaştırılarak % 50aglütinasyon görülen veya % 50 serbestleptospira bulunan son sulandırma, serumtitresi olarak belirlenir

Page 21: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Normal Kontrol

Page 22: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Aglutinasyon

Page 23: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Lizis Reaksiyonları

Page 24: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

ENZYME LINKED IMMUNO SORBENT ASSAY (ELISA)

MAT’ a alternatif olarak kullanılmaktadır

Enfeksiyon daha erken dönemde saptanabilir

Ig M spesifik ve Ig G spesifik ELISA ile akutleptospirosisin kronik leptospirosistenayrılmasında önemlidir

ELISA’da da MAT’da olduğu gibi aşı titresinienfeksiyon titresinden ayırmak mümkün değildir

Sensitivite MAT’a göre daha yüksek, spesifite isedaha düşüktür

Page 25: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Hangi örnekte, hangi tanı yöntemleri, ne zaman

kullanılmalı? KAN

Hastalığın başlangıcında (1-10 gün)

Ateş devam ederken

PCR, Etken İzolasyonu

Page 26: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Hangi örnekte, hangi tanı yöntemleri, ne zaman

kullanılmalı? Kan Serumu

Enfeksiyonun başlangıcından 7-9 gün sonra

MAT, ELISA, PCR, MSAT (Makroskobik Slayt Aglutinasyon Testi)

Page 27: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Hangi örnekte, hangi tanı yöntemleri, ne zaman

kullanılmalı? İdrar

2. haftadan itibaren

Kültür, IFAT, PCR

Kronik taşıyıcıların belirlenmesi

Page 28: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Hangi örnekte, hangi tanı yöntemleri, ne zaman

kullanılmalı? CSF/BOS

İlk 8-10 günde

Kültür, ELISA, PCR, Mikroskobi

Page 29: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Hangi örnekte, hangi tanı yöntemleri, ne zaman

kullanılmalı? Doku Örnekleri

Karaciğer, Dalak, Böbrek

İlk 8-10 günde – Post mortem

Kültür, PCR

Page 30: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanı Yöntemlerinin Duyarlılık ve Özgünlük Düzeyleri

IgM antikorların, IgG antikorlarına nazaran aglutinasyonoluşturma kabiliyetleri daha yüksek olduğundan, enfeksiyonun akut döneminde MAT ile yapılan serolojik incelemelerde, ileri dönemde yapılan incelemelere nazaran daha yüksek oranda aglutinasyon titreleri elde edilmektedir.

Ancak, bu dönemde enfeksiyondan sorumlu olmayan serovarlarla kros-reaksiyon oluşma riski de yüksek olmaktadır. Enfeksiyonun ileri dönemlerinde yapılan incelemelerde ise antikor yanıtının serovar spesifikliğinindaha yüksek olduğu bildirilmiştir.

Page 31: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanı Yöntemlerinin Duyarlılık ve Özgünlük Düzeyleri

Levett’e göre ise; MAT yaygın inancın aksine serogrup-spesifiktir ve akut-faz serumlarında serogruplar arasında kros-reaksiyon oluşma riski yüksektir.

MAT, diğer hiçbir serolojik metotta gözlenemeyen yüksek diagnostik spesifiteye sahiptir. Bu nedenle MAT, bir çok araştırıcı tarafından leptospirozisin serolojisinde “altınstandart” olarak kabul edilmektedir

Page 32: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanı Yöntemlerinin Duyarlılık ve Özgünlük Düzeyleri

ELISA’nın sensitivitesinin MAT’ınkine nazaran daha yüksek fakat spesifitesinin düşük olduğu bildirilmiştir

ELISA’nın en önemli avantajı IgM- ve IgG-spesifik ELISA ile akut leptospirozisin kronik leptospirozisten ayırt edilebilmesidir

Page 33: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanı Yöntemlerinin Duyarlılık ve Özgünlük Düzeyleri

PCR

Yüksek Sensitivite

Kısa sürede tespit

Hastalığın her döneminde çalışmaz

Serotip ayrımı yapılamıyor.

Page 34: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanı Yöntemlerinin Duyarlılık ve Özgünlük Düzeyleri

RT-PCR

Yüksek Sensitivite

Kısa sürede tespit

Hastalığın her döneminde çalışmaz

Serotip ayrımı.

Page 35: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Pozitif / Negatif Sonuçlar Nasıl Yorumlanmalı

MAT:

Bazı bölgelerde belli aralıklarla alınmış çift serum örneklerinde 4 katlı titre artışı ile,

Bazı bölgelerde ise tek serum örneğinin en düşük sulandırmada (1/50 veya 1/100) %50 aglutinasyon vermesi yeterli kabul edilmektedir

Page 36: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Pozitif / Negatif Sonuçlar Nasıl Yorumlanmalı

Çift serum örnekleri ile test uygulanacaksa:

leptospirozis semptomlarının açıkça gözlendiği dönemde 3-5 gün

enfeksiyonun başlangıç zamanı bilinmiyorsa ve semptomlar gözlenemiyorsa 10-14 gün

serokonversiyonun uzun zaman aldığı bireylerde daha uzun aralıklarla serum örnekleri alınmalı ve test edilmelidir.

Page 37: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanıda Güçlükler

MAT

Her yerde çalışılmaması

Antibiyotik kullanımı

Akut dönemde teşhis şansı az

Personel kaynaklı hatalar

Serotip spesifik

Page 38: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanıda Güçlükler

ELISA

Her serotip için ayrı kit gerekli

Spesivitesi MAT’a göre düşük

Çapraz reaksiyonlar daha fazla

Page 39: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Tanıda Güçlükler

PCR

Etken doku veya kanda bulunmayabilir.

Patojenik / non-patojenik ayrımı.

Page 40: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Sağlık Bakanlığı Tanı Kriterleri

Tanı için laboratuar kriterleri

Kan veya diğer klinik örneklerin kültüründen patojen leptospiraların izolasyonu (ve tiplendirilmesi),

Bölgesel suşlarda sıklıkla temsil edilen antijenleri taşıyan Leptospira kökenlerinin kullanıldığı tercihen MAT ile pozitif seroloji (tek serum örneğinde ≥1/200 titre veya çift serum örneğinde ≥4 kat titre artışı).

Klinik örneklerde leptospiranın DFA veya başka bir yöntemle gösterilmesi.

Page 41: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

Sağlık Bakanlığı Tanı Kriterleri

Zoonotik Hastalıklar Hizmetiçi Eğitim Modülü

Zoonotik Hastalıklar

T.C. Sağlık Bakanlığı

Temel Sağlık Hizmetleri Genel Müdürlüğü

Zoonotik Hastalıklar Daire Başkanlığı

Ankara, 2011

ISBN : 978-975-590-328-6

Sağlık Bakanlığı Yayın No : 799

Page 42: LEPTOSPIROZİS’İN MİKROBİYOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ · Mikrobiyolojik Tanı Yöntemleri Hangi örnekte hangi tanı yöntemleri, ne zaman kullanılmalı Tanı yöntemlerinin duyarlılık

TEŞEKKÜRLER

Erdinç ATABEK

[email protected]

[email protected]

Spiroket Hastalıkları Teşhis Laboratuvarı

Etlik Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü

Ahmet Şefik Kolaylı Cad. No:21 Esertepe

Keçiören – ANKARA

Tel: 0 312 326 00 90 / 143