Top Banner
Kinetika reaksi enzimatis Shinta Rosalia Dewi, M.Sc
23

Kinetika reaksi · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Jan 31, 2018

Download

Documents

lenhu
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Kinetika reaksienzimatis

Shinta Rosalia Dewi, M.Sc

Page 2: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Enzim : protein yg mengkatalisis prosesbiokimia dalam sel hayati yang spesifikproduksi biomassa atau metabolit, produkpangan, pakan, dll

• Reaksi enzimatis :

Sistem homogen atau heterogen

Satu substrat atau lebih

Page 3: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Dasar kinetika reaksi enzimatis

• Michaelis –Mentenlaju awal reaksienzimatis dapat ditentukan berdasarkanfungsi terhadap konsentrasi substrat danparameter yg berpengaruh dalam enzim

• Henri pembentukan kompleks enzimsubstrat reversibel selama reaksipembentukan produk dari substrat lajureaksi berbanding lurus dengan konsentrasikompleks

Page 4: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Reaksi reversibelk k

kE S ES E P

d[S]v k [E][S] k [ES]

dt

d[ES]v k [E][S] [k k ][ES]

dt

laju pembentukan (kekanan) = laju penguraian (kekiri)

k [E][S] [k k ][ES]

k [E][S] [k k ][ES]

k k[E][S] [ES]

k

1 2

1

1 1

1 1 2

1 1 2

1 1 2

1 2

1

0

k kKm

k

1 2

1

Page 5: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

T

T

T

T

T

T

max T

max

[E][S] [ES]Km

[E ] [E] [ES]

[E ] [ES] [S] [ES]Km

[E ][S] [ES][S] [ES]Km

[E ][S] [ES] Km [S]

[E ][S][ES]

Km [S]

[E ][S]v k [ES] k

Km [S]

v k [E ]

v [S]v

Km [S]

2 2

2

Page 6: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Kinetika reaksi Michaelis-Menten :

maxv [S]v

Km [S]

Page 7: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Kinetika reaksi homogen : penentuan Km

• Persamaan Lineweaver dan Burk

max

max max max

max max

v [S]v

Km [S]

Km [S] Km [S]

v v [S] v [S] v [S]

Km

v v [S] V

1

1 1 1

Page 8: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Persamaan Eadie Hofstee

max

max

max

max

max

v [S]v

Km [S]

v Kmv sehingga v =v

Km [S]

[S]

vv = Km v

[S]

vv Km v

[S]

1

1

Page 9: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Persamaan Hanes

max

max max

max max

max max

v [S]v

Km [S]

Km(Lineweaver Burk)

v v [S] v

Km[S] [S] [S]

v v [S] v

[S] Km[S]

v v v

1 1 1

1 1 1

1

Page 10: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi

• Kompetitif : inhibitor berkompetisi dengansubstrat untuk berinteraksi dengan sisi aktifenzim

• uncompetitive: inhibitor menghambat kerjaenzim di sisi yg berbeda dari interaksisubstrat-enzim terikat pada ES

• Non- kompetitif : inhibitor menghambat di sisiberbeda, tidak menghasilkan produkterikat pada E atau ES

Page 11: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi

• Oleh produk produk yang dihasilkan dapatmenghambat kerja enzim kompetitif atautidak kompetitif

• Oleh substrat substrat menghambat kerjaenzim (konsentrasi substrat terlalu tinggi) membentuk kompleks tidak kompetitif

Page 12: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi kompetitif

Page 13: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi kompetitifk k

k

ki

max

max max

E S ES E P

E I EI

[ET] [ES] [E] [EI]

v [S]v

[I]Km [S]

Ki

Km [I]

v v v Ki [S]

[I]K 'm Km

Ki

1 2

1

1

1 1 11

1

Page 14: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi uncompetitive

Page 15: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi uncompetitive

k k i

k

max

E S I ES I ESI

ES E P

[ET] [ES] [E] [ESI]

v[S]

[I]

Kiv

Km[S]

[I]

Ki

1 1

1

1

1

max max

Km [I]

v v [S] v Ki

KmK 'm

[I]

Ki

1 1 11

1

Page 16: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi non-kompetitif

Page 17: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Inhibisi non-kompetitif

k k

k

ki

ki

max

max max

E S ES E P

E I EI

ES I ESI

[ET] [ES] [E] [ESI]

v [S]v

[I]Km [S]

Ki

Km [I]

v v [S] v Ki

1 2

1

1

1

1 1 11

Page 18: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Faktor yang mempengaruhi reaksienzimatis

• pH perubahan struktur, ionisasi, pengikatanenzim

pH mempengaruhi muatan

Muatan mempengaruhi struktur enzim

Selanjutnya akan mempengaruhi reaksi ES

Page 19: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Suhu

k=Ae-E/RT

• Pereaksi kimia

Page 20: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Penentuan aktivitas enzim

• pH Stat pengukuran jumlah asam (H+) yang ditambahkan ke cairan pereaksi volume asam/basa terhadap waktu

• Spektrofotometri pengukuran enzimdengan spektrofotometer pada panjanggelombang tertentu

Page 21: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

Contoh soal

• Kinetika enzim glukoamilase ditentukan padasuatu reaktor tertutup pada suhu 40oC berdasarkan glukosa yang terbentuk (µmol/L). Bila volume cairan dalam reaktor 500 ml danlarutan enzim yang digunakan 500 µL mengandung 4g/L.

Page 22: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• Bagaimana bentuk kinetika hidrolisis maltosaoleh enzim glukoamilase?

• Glukosa sebagai produk juga berfungsi sebagaiinhibitor. Kinetika penghambatannya ditunjukkanpd tabel di bawah. Tentukan model kinetikapenghambatan

Waktu(menit)

Konsentrasi awal maltosa (mM)

50 100 150 200

2 95 110 130 140

5 230 290 320 340

10 440 570 640 670

15 700 860 960 1.000

30 1.400 1.700 1.900 2.000

Page 23: Kinetika reaksi  · PDF file•Michaelis –Menten laju awal reaksi ... Contoh soal •Kinetika enzim glukoamilase ditentukan pada ... Tentukan model kinetika penghambatan Waktu

• TRK meeting 5.xlsx

Glukosa(mM)

Konsentrasi substrat maltosa (mM)

50 100 150 200

0 5,8 7,2 8 8,4

2,5 5,2 6,9 7.6 8,1

5 4,8 6,4 7,3 7,9

10 4,1 5,8 6,7 7,4