ISOLASI DAN KARAKTERISASI JAMUR ENDOFIT AKAR Rhizophora stylosa DARI HUTAN MANGROVE WANATIRTA KULON PROGO DAN UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERINYA TERHADAP Staphylococcus aureus DAN Salmonella typhosa SKRIPSI Untuk memenuhi sebagian persyaratan mencapai derajat Sarjana S-1 Program Studi Biologi Disusun oleh: Aina Azizah 15640036 PROGRAM STUDI BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA 2019
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
ISOLASI DAN KARAKTERISASI JAMUR ENDOFIT
AKAR Rhizophora stylosa
DARI HUTAN MANGROVE WANATIRTA KULON PROGO
DAN UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERINYA TERHADAP
Staphylococcus aureus DAN Salmonella typhosa
SKRIPSI
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
mencapai derajat Sarjana S-1
Program Studi Biologi
Disusun oleh:
Aina Azizah
15640036
PROGRAM STUDI BIOLOGI
FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SUNAN KALIJAGA
YOGYAKARTA
2019
ii
iii
iv
v
HALAMAN PERSEMBAHAN
Skripsi ini Penulis persembahkan untuk keluarga dan almamater
tercinta Program Studi Fakultas Sains dan Teknologi Biologi UIN
Sunan Kalijaga.
vi
MOTTO
“Do the best god the rest, hidup bermanfat buat banyak orang, sabar,
ikhlas, istiqomahkan yang baik-baik”
vii
KATA PENGANTAR
Segala puji dan syukur Penulis panjatkan ke hadirat Allah
SWT atas berkah dan rahmat-Nya sehingga skripsi ini dapat
diselesaikan dengan baik. Sholawat serta salam Penulis haturkan
kepada Nabi Muhammad SAW, keluarga, serta para sahabat yang
telah membimbing umatnya menuju jalan yang diridhai Allah.
Atas berkat rahmat Allah SWT skripsi yang berjudul “Isolasi
dan Karakterisasi Jamur Endofit Akar Rhizophora stylosa dari Hutan
Mangrove Wanatirta Kulon Progo dan Uji Aktivitas Antibakterinya
terhadap Staphylococcus aureus dan Salmonella typhosa” ini dapat
diselesaikan dengan baik. Penulis menyadari bahwa penulisan skripsi
ini masih jauh dari kata sempurna karena keterbatasan yang dimiliki.
Oleh karena itu saran dan kritik yang membangun sangat diharapkan.
Penulisan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak.
Oleh karena itu Penulis ucapkan terima kasih kepada pihak-pihak
yang telah membantu penyelesaian skripsi ini, diantaranya kepada:
1. Dr. Murtono, M. Si., selaku Dekan Fakultas Sains dan Teknologi
Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga Yogyakarta.
2. Erny Qurotul Ainy, M. Si., selaku Ketua Program Studi Biologi
Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Sunan
Kalijaga Yogyakarta dan selaku dosen pembimbing yang selalu
bersedia meluangkan waktu untuk membimbing, mengarahkan,
serta memberikan saran kepada Penulis.
viii
3. Ethik Susiawati S. Si., selaku pendamping laboratorium yang
selalu bersedia membantu proses penelitian.
4. Kedua orang tua Penulis, Bapak Muhlasin dan Ibu Rokhiyah yang
tidak ada lelahnya memberi semangat dan do’a.
5. Adek Penulis Aji Saifullah yang ikut memberi semangat dan
mendoakan selalu.
6. Teman-teman asrama tahfidz 3 Pondok Pesantren Wahid Hasyim
Dasilah, Nabila, Atika, Shofi, dan Ummu.
7. Tita, Hanim, Tunjung, Dwi Khalimah, Fitri, Baru yang telah
banyak mebantu dan menyemangati Penulis
8. Teman-teman Biologi 15 yang selalu menyemangati Penulis
Terima kasih Penulis ucapkan kepada semua pihak yang telah
membantu penyelesaian skripsi ini, serta pihak-pihak yang tidak bisa
dituliskan satu per satu. Semoga Allah senantiasa melimpahkan
rahmat-Nya kepada kita semua. Aamiin.
Yogyakarta, 26 Agustus 2019
Penulis
ix
ISOLASI DAN KARAKTERISASI JAMUR ENDOFIT AKAR
Rhizophora stylosa DARI HUTAN MANGROVE WANATIRTA
KULON PROGO DAN UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERINYA
TERHADAP Staphylococcus aureus DAN Salmonella typhosa
Aina Azizah
15640036
Abstrak
Penggunaan antibiotik sintetik secara berlebihan dalam
penanggulangan penyakit infeksi menimbulkan efek resistensi
patogen terhadap antibiotik. Oleh karena itu perlu dilakukan
penelitian untuk menemukan antibiotik alternatif dari bahan alam.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi antibakteri isolat
jamur endofit dari akar mangrove Rhizophora stylosa terhadap
bakteri Staphylococcus aureus dan Salmonella typhosa dan
mengetahui isolat jamur endofit yang paling efektif
penghambatannya. Penelitian ini dilakukan melalui tahap-tahap
isolasi dan purifikasi jamur endofit dari akar mangrove Rhizophora
stylosa, uji aktivitas antibakteri isolat jamur endofit terhadap bakteri
Staphylococcus aureus dan Salmonella typhosa, kemudian uji
efektivitas antibakteri ekstrak isolat jamur potensial pada konsentrasi
25%, 50% dan 75%. Terdapat empat jenis isolat jamur endofit akar
R.stylosa yaitu isolat AA, AB, AC dan AD. Pada uji aktivitas
antibakteri, masing-masing isolat jamur endofit menghasilkan zona
bening dengan ukuran diameter yang berbeda-beda. Isolat jamur
endofit AA yang positif menghambat pertumbuhan kedua jenis
bakteri uji kemudian diuji efektifitasnya. Ekstrak isolat AA pada
konsentrasi 75% paling efektif menghambat pertumbuhan bakteri
Staphylococcus aureus dan Salmonella typhosa dengan terbentuknya
zona bening berdiameter masing-masing sebesar 0,2 cm dan 0,8 cm.
Kata kunci: Jamur endofit, Rhizophora stylosa, Salmonella typhosa,
Staphylococcus aureus
x
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ........................................................................... i
SURAT PERSETUJUAN SKRIPSI/TUGAS AKHIR ....................... ii
SURAT PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI ............................. iii
HALAMAN PENGESAHAN ........................................................... iv
HALAMAN PERSEMBAHAN ......................................................... v
MOTTO ............................................................................................. vi
KATA PENGANTAR ...................................................................... vii
ABSTRAK ......................................................................................... ix
DAFTAR ISI ...................................................................................... x
DAFTAR TABEL ............................................................................ xii
DAFTAR GAMBAR ....................................................................... xiii
BAB I PENDAHULUAN ............................................................... 1
A. Latar Belakang ........................................................................ 1
B. Rumusan Masalah ................................................................... 5
C. Tujuan ..................................................................................... 5
D. Manfaat ................................................................................... 5
BAB II TINJAUAN PUSTAKA ..................................................... 7
A. Mikroba Endofit...................................................................... 7
B. Rhizophora stylosa ................................................................ 8
C. Hutan Mangrove Wanatirta Kulon Progo ............................. 10
D. Staphylococcus aureus ......................................................... 11
E. Salmonella typhosa ............................................................... 13
F. Jamur..................................................................................... 15
BAB III METODE PENELITIAN .............................................. 17
A. Waktu dan Tempat Penelitian ............................................... 17
B. Alat dan Bahan ..................................................................... 18
C. Prosedur Kerja ...................................................................... 18
xi
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ...................................... 25
A. Hasil ...................................................................................... 25
B. Pembahasan .......................................................................... 32
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ...................................... 41
A. Kesimpulan ........................................................................... 41
B. Saran ..................................................................................... 41
DAFTAR PUSTAKA ....................................................................... 43
CURRICULUM VITAE
xii
DAFTAR TABEL
Tabel 1 Tahapan memperoleh konsentrasi ekstrak ....................... 23
Tabel 2 Karakteristik makroskopis jamur endofit dari akar