Introdução à Bioinformática Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Luciano C. da Maia Engenheiro Agrônomo Professor Dep. de Fitotecnia FAEM/UFPel
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Introdução à Bioinformática Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA.
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Introdução à Bioinformática
Universidade Federal de PelotasFaculdade de Agronomia Eliseu Maciel
Programa de Pós-Graduação em AgronomiaCENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
Luciano C. da MaiaEngenheiro AgrônomoProfessor Dep. de FitotecniaFAEM/UFPel
> alvos para silenciamento, super-expressao (plantas)novos cultivares
> alvos para drogas (medicamentos/farmacos)saúde/doenças....
1) NÃO TECNOLOGICO - CIÊNCIA BÁSICA - natureza da biologia molecular-que informação está contida nos genomas -como se faz para sequencia-como se faz para montar um genoma/anotar-gerar conhecimento-responder perguntas de “ciência pura”-etc...
• Manutenção e gerenciamento das informações obtidas em seqüenciamentos
Qualidade das seqüências
Armazenamento das seqüências
Alinhamento/Montagem
Disponibilização
Análises
…
1) DURANTE O SEQUENCIAMENTO...
Bioinformática: Seqüenciamento...
– Montagem de fragmentos
– Predição de genes
– Anotação de genomas
– Análise de dados de expressão gênica
– Previsão de estruturas de proteínas
– Análise de interação entre genes
– Estudo do sistema de transdução de sinais (fatores trans- e/ou cis-)
2) PÓS seqüenciamento
1) Aplicação: GENOMA
Tratamento inicial de seqüências
base-calling / trimming / assembly
Aplicações da Bioinformática
1)PRIMEIRA GERAÇÃO: Grande Escala::: Base-callerPHRED