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Integrity 初級編 (概要、検索方法) Clarivate Analytics Webinar ライフサイエンス ソリューション ソリューション スペシャリスト 本多 栄治
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Integrity - クラリベイト・アナリティクス · 2020-01-03 · 各国の特許庁(WO, US, EP, JP, CN, KR, IN)からの特許情報 1,500誌の学術雑誌...

Aug 13, 2020

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Integrity

初級編 (概要、検索方法)

Clarivate Analytics Webinar

ライフサイエンスソリューションソリューション スペシャリスト

本多 栄治

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内容

1. Integrityとはどのようなデータベースなのか

2. 検索の基本的な操作について

3. Advanced SearchとQuick Searchの違いについて

4. 検索のコツ

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内容

1. Integrityとはどのようなデータベースなのか

2. 検索の基本的な操作について

3. Quick SearchとAdvanced Searchの違いについて

4. 検索のコツ

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生理活性物質について

Integrityとは?

Integrity =生理活性物質とその関連する情報の統合データベースです

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生理活性物質とは

Integrityとは?

Integrity =生理活性物質とその関連する情報の統合データベースです

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生理活性物質

低分子化合物

ペプチド

抗体

核酸

細胞

KymriahHuman autologous T cells transduced

with a replication-deficient lentiviral vector comprising the CTL019 transgene encoding a second-generation chimeric antigen receptor (CAR) consisting of a single chain variable fragment (scFv) targeting CD19 fused to 4-1BB costimulatory domain and CD3 zeta signaling domain; under the control of the EF-1 alpha promoter

世界中の製薬企業や研究機関等で現在、及び過去に研究開発されている何らかの活性を有する物質です。

様々なModalityを含みます

1. Integrityとは?

特許や論文で公知~臨床開発、上市まで開発段階を問いません。

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Integrityとは?

その関連する情報とはIntegrity =生理活性物質とその関連する情報の統合データベースです

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関連する情報

2018.06現在、件数は概数

Knowledge Area 件数 内容 (indexの例)

Drugs & Biologics 53.9万医薬品/臨床開発品:医薬品名、構造、作用機序、対象疾患、開発段階、開発企業等の情報を提供。93%のレコードに化学構造式が存在。

Targets & Pathways 5,719 標的・パスウェイ:生理活性物質の標的となるタンパク質や遺伝子の情報を提供。

Genomics 45,500 遺伝子:遺伝子に関連した研究情報をvariantやstudy type、疾患で分類し提供。

Biomarkers 38,700 バイオマーカー:roleやvalidityを付与したバイオマーカー情報を提供。(要追加契約)

Organic Synthesis 33,100 合成スキーム:生理活性物質の合成スキームと反応中間体/試薬情報を提供。

Experimental Pharmacology 237.1万 薬理実験:生理活性物質を用いたin vitro, in vivoの実験結果を数値で収載。

生理活性物質に関連する情報は、創薬ターゲットや薬理実験結果、薬物動態など13のカテゴリーに分類しています。Integrityでは、このカテゴリーをKnowledge Area (知識分野)と呼びます。各データは特徴ある索引付け(index)を行いデータベースに収録します。

Knowledge Area の種類および収録件数

Experimental Models 99,600 動物モデル:薬理実験で使用する動物モデル(種, 遺伝子改変, 等)に関する情報を提供。

Pharmacokinetics/Metabolism 92.0万 薬物動態/ 代謝データ:薬物動態の各種パラメーターを数値で収載。

Clinical Studies 34.8万 臨床試験:臨床試験中・上市済薬剤の臨床試験レポートに関する情報を提供。

Disease Briefings 159 疾病の解説:患者数・疾患要因・予防方法・診断方法・治療方法に関する情報を提供。

Companies & Research Inst. 27,500 企業/研究機関:医薬品の研究開発を行っている企業/研究機関に関する情報を提供。

Literature 243.8万 学術雑誌等の書誌事項とオリジナル文献へのリンクを提供。

Patents 40.2万 特許の書誌事項を提供。明細書のPDFダウンロードが可能です。

1. Integrityとは?

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関連する情報:データの収録と情報源

弊社の専門性の高いeditorがマニュアルキュレーションによりデータを収載します。情報源は主に5種類あります。

主な情報源

▪各国の特許庁(WO, US, EP, JP, CN, KR, IN)からの特許情報

▪ 1,500誌の学術雑誌

▪毎年400以上の科学や医薬の学術会議

▪製薬企業、バイオ技術系企業のプレスリリースや会社情報

▪規制文書 (FDA, EMA)

1. Integrityとは?

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その関連する情報の統合データベースとは

Integrityとは?

Integrity =生理活性物質とその関連する情報の統合データベースです

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統合データベース

各々のKnowledge Areaの情報は相互にリンクしているので、関連情報を簡単に入手できます。

生理活性物質

合成経路

薬物動態 薬理実験結果

特許

例えば、ある生理活性物質を検索すると、関連する情報を簡単に入手できます。

1. Integrityとは?

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Integrityとは?

生理活性物質:世界中の製薬企業や研究機関等で現在、及び過去に研究開発何らかの活性を有する物質

Integrity =生理活性物質とその関連する情報の統合データベース

関連する情報:13の Knowledge Area (知識分野)に分類特徴ある索引付け(index)を行い収載

統合データベース:各々のKnowledge Areaの情報は相互にリンク関連情報を簡単に入手可能

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Integrity活用シーン

新規Project提案-ターゲット分子の調査-競合情報の調査(MoA)

Lead generation-他社化合物のSAR-特許の調査(新規性)

In vivo PoC-動物モデルの調査- tool化合物の同定 (PK, etc)

Lead optimization-類縁体の合成法調査-類縁体の代謝情報

HTS-類似化合物の調査

In vitro assay-実験結果の調査-アッセイ系の調査

疾患の調査-概要を理解

- genetic evidence

Project Start Preclinical INDDrug Discovery

予測モデル構築のためのトレーニングセットを得る

-競合情報の調査(疾患), -特定の競合情報をウォッチングBio

log

y, P

ha

rma

co

log

y

Me

dic

ina

l C

he

mis

try

Info

rma

tics

Str

ate

gy

導入化合物の調査

安全性、薬効、毒性をbiomarkerで評価

ヒトで利用例のあるbiomarkerを調査

創薬研究を幅広くカバーするコンテンツにより、

創薬研究の各段階でご活用いただけます。

1. Integrityとは?

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内容

1. Integrityとはどのようなデータベースなのか

2. 検索の基本的な操作について

3. Advanced SearchとQuick Searchの違いについて

4. 検索のコツ

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特定の作用機序を有する生理活性物質を検索します。

検索例

特定の生理活性物質を検索し、内容を確認します。

2. 検索の基本的な操作

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検索例

特定の生理活性物質を検索し、内容を確認します。

2. 検索の基本的な操作

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Advanced Search のPoint

興味のあるKnowledge Area をクリックします。

(今回は生理活性物質を検索するので、Drug & Biologicsをクリックします。)

2. 検索の基本的な操作

例として、”Spinraza”を検索します。

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Advanced Search のPoint

Productのsectionの

検索したいfield nameをクリックします。

(今回はDrug Nameをクリックします。)

”Select Value” をマウスオーバーし、

2. 検索の基本的な操作

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Advanced Search のPoint

”Index” をクリックします。

検索したいDrug nameの一部を入力し、

Lookupをクリックします。

検索語をクリックして選択し、

OKをクリックします。

2. 検索の基本的な操作

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Advanced Search のPoint

Drug Nameが、“Spinraza”という、生理活性物質を検索する、

Startをクリックして検索します。

という検索式が作成されました。

2. 検索の基本的な操作

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Demoで動作を確認します。

2. 検索の基本的な操作

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デモ: Advanced Search

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2. 検索の基本的な操作Drug Report Pageの情報について

レコードの登録に関する情報です

Highest Phaseは関連する全ての研究開発の中で最も高い段階を表示します。

UPDATESをクリックすると、 レコードの更新履歴が確認できます。

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Drug Report Pageの情報について

生理活性物質の同定に関する情報です。

配列 (核酸やペプチド)低分子化合物は化学構造

化合物名や開発コード名、一般名、医薬品名

2. 検索の基本的な操作

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Drug Report Pageの情報について

生理活性物質の性質に関する情報です

作用機序や、物質としてのカテゴリー、治療領域、処方/疾患のタイプ

2. 検索の基本的な操作

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Drug Report Pageの情報について

研究開発機関 (生理活性物質の創出機関には(Originator)がつきます)

サマリー(作用機序や臨床開発、ライセンスなどの情報)

疾患ごとの臨床開発のまとめ

臨床開発、マイルストーン、規制当局の情報が確認できます。

2. 検索の基本的な操作

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Drug Report Pageの情報について

関連する他のKnowledge Area の情報

2. 検索の基本的な操作

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特定の作用機序を有する生理活性物質を検索します。

検索例

特定の生理活性物質を検索し、内容を確認します。

2. 検索の基本的な操作

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検索例

特定の作用機序を有する生理活性物質を検索します。

2. 検索の基本的な操作

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Mechanism of Action (MoA)を指定して検索

Knowledge Area のDrug & Biologicsをクリックします。

例として、作用機序が”Prostanoid EP2 Receptor Antagonists”の生理活性物質を検索します。

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

Productのsectionの

field nameからMechanism of Actionをクリックします。

”Select Value” をマウスオーバーし、

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

”Index” をクリックします。

検索したいMoAの一部を入力し、

Lookupをクリックします。

作用機序が階層構造で登録されています。

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

他の検索結果を確認します。

“ep2”を含むMoAが6種類登録されています。

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

Order Alphabeticallyをクリックするとリストに切り変わります。

検索語をクリックしてOKをクリックするか、

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

Order by Hierarchyをクリックすると階層表示に切り変わります。

2. 検索の基本的な操作

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MoAの指定

Order Alphabeticallyをクリックするとリストに切り変わります。

検索語をクリックして選択します。

2. 検索の基本的な操作

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MoAを指定して検索

MoAが、"Prostanoid EP2 Receptor Antagonists“の、

生理活性物質を検索する、

Startをクリックして検索します。

という検索式が作成されました。

2. 検索の基本的な操作

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Demoで動作を確認します。

2. 検索の基本的な操作

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デモ: MoAを指定して検索

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内容

1. Integrityとはどのようなデータベースなのか

2. 検索の基本的な操作について

3. Advanced SearchとQuick Searchの違いについて

4. 検索のコツ

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検索の入り口 3. Advanced SearchとQuick Search

Advanced Search Quick Search

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例としてBortezomibについて、Advanced SearchとQuick Searchの検索結果の違いを確認します。

Advanced Searchの検索 3. Advanced SearchとQuick Search

Advanced Search

Drug name = Bortezomibを検索します。

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Advanced Searchの結果 3. Advanced SearchとQuick Search

Bortezomib

Liposomal bortezomib

Drug Name (Code Name, Generic Name, Brand Nameのいずれか)にBortezomibを含む生理活性物質が2件ヒットしました。

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生理活性物質が20件ヒットしました。

Quick Searchの検索 3. Advanced SearchとQuick Search

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Bortezomib以外の生理活性物質のレコードを確認すると、

Quick Searchの結果 3. Advanced SearchとQuick Search

Product SummaryにBortezomibの記載がありました。

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Advanced SearchとQuick Searchの違い 3. Advanced SearchとQuick Search

検索 Advanced Search Quick Search

検索語 Indexから選択 手入力

検索語の索引 有り 無し

検索の種類索引検索指定したindexのみを検索

フリーテキストサーチレコード全体を検索

検索結果ノイズが少ない(焦点を当て検索)

少しでも関連のある結果を幅広く得る

他のKnowledge

Area

指定したKnowledge Areaの検索結果が分かる

全てのKnowledge Areaの検索結果が分かる

特徴Integrityに収載された統制語を確実に指定できる

検索語を自由に指定できる

スペルミスやIntegrityの統制語にない検索語の場合、意図した結果が得られないことがあります。

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内容

1. Integrityとはどのようなデータベースなのか

2. 検索の基本的な操作について

3. Advanced SearchとQuick Searchの違いについて

4. 検索のコツ

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検索語に類義語が多い場合や、綴りに自信が無い場合など、ワイルドカードが利用できます。

* (アタリスク): 0文字以上の任意の文字列? (クエスチョンマーク): 1文字

例) Nanopart*、 CCR?,

Indexを探す 4. 検索のコツ

調べたい検索語がIntegrityに収載されているか不明

例) Nanoparticleに関連する生理活性物質を調べたい→Quick searchの結果から、検索語がどこに登場するか調べる。

Quick Searchで検索

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Indexを探す 4. 検索のコツ

Browserの検索機能で検索語を検索

Generic NameやProduct Categoryに”Nanoparticles”が登場

注) 画面はChromeを使用

興味のあるKnowledge Area の結果を表示

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Indexを探す 4. 検索のコツ

個別のレコード内に検索語がある場合もあります。

注) 画面はChromeを使用

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Indexを探す 4. 検索のコツ

Nanoparticleは、以下に索引付けされていることが分かりました。

- Generic Name- Product Category- Formulation

検索例

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Indexを探す 4. 検索のコツ

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検索のコツ まとめ

通常の検索:Index →検索語を指定

Index不明な場合:検索語→ indexを探す

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Integrity初級編 (概要、検索方法)は以上となります。

ご清聴ありがとうございました。

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