ImageJ-Makro BatchMergeChannels · ImageJ-Makro BatchMergeChannels.ijm Dustin Schweitzberger Mirko Wolff Berlin , 09.09.2016

ImageJ-MakroBatchMergeChannels.ijm

Dustin SchweitzbergerMirko Wolff

Berlin , 09.09.2016

2

Agenda

Motivation

- -ImageJ Built in Funktion

.BatchMergeChannels ijm

3

MotivationZusammensetzen der Farbkanäle ...

Beispielbilder ImageJ

nucleus microtubles phalloidin

zusammensetzen

4

ImageJ Built-In FunctionÖffnen der Bilddateien ...

5

ImageJ Built-In FunctionZuverarbeitende Bilddateien ...

6

ImageJ Built-In FunctionMerge Channels ...

7

ImageJ Built-In FunctionZusammensetzen der Farbkanäle ...

8

ImageJ Built-In FunctionAuswählen des Ausgabeverzeichnis undspeichern der Komposit-Bilddateien ...

9

MotivationBuil-In-Funktion Merge Channels ...

3 Bilddateien

1Komposit

≈ 60 sec

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MotivationWas macht man …?

Was macht man,wenn man

180 Bilddateienverarbeiten muss?

11

MotivationWas macht man …?

Man nutzt das MakroBatch Merge Channels!

12

BatchMergeChannels.ijmStart ...

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BatchMergeChannels.ijmAuswählen der Eingabe- und Ausgabeverzeichnisse ....

14

BatchMergeChannels.ijmEinstellungen ...

Such-Strings

Schärfen

Makro-Steuerung

Komposit-Bilddatei

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BatchMergeChannels.ijmFertig ...

16

BatchMergeChannels.ijmErgebnisse überprüfen ...

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MotivationBatch Merge Channels ...

180 Bilddateien

60 Komposits

< 1 min*

* inklusive manueller Eingaben und bei aktueller PC-Hardware mittlerer Ausstattung z.B. Intel I5 und SSD ...

Impressum

Dustin SchweitzbergerDipl.-Ing. Mirko Wolff

+49 176 609 187 [email protected]

Anton-Saefkow-Platz 1410369 Berlin