Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? Kristin Sæbø Pettersen PhD student Seksjon for Mattrygghet og Nye Helsetrusler Veterinærinstituttet
Hvordan påvirkes Listeria
monocytogenes av synlig lys?
Kristin Sæbø Pettersen PhD student
Seksjon for Mattrygghet og Nye Helsetrusler
Veterinærinstituttet
Hvorfor skal L. monocytogenes prioritere å reagere på lys – og hvorfor skal vi bry oss om det?
http://www.nature.com/ng/journal/v48/n3/full/ng.3515.html
https://ing.dk/sites/ing/files/topillustration/2017/09/fordampningenergi1.jpg
Initielt eksperiment
https://www.slideshare.net/VaniJhaveri/vision-in-animals
http://www.faculty.virginia.edu/rwoclass/astr1230/im/human-eye-crossec.jpg
https://web.mst.edu/~microbio/BIO221_2010/L_monocytogenes.html
Hvorfor ser vi dette? Hvilke gener bruker de når de utsettes for lys? (Transkriptomanalyse)
http://www.nature.com/scitable/content/ne0000/ne0000/ne0000/ne0000/105292327/44350_36a.jpg
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/2BKP
https://images.finncdn.no/dynamic/1280w/2017/8/vertical-5/30/6/103/375/_1447457110.jpg
https://www.spaniaidag.no/wp-content/uploads/2016/08/paella3-700x350.jpg
2 409 signifikant regulerte gener, ca 80 %
Listeria monocytogenes
Hvordan finner vi hvilke gener bakterien uttrykker når den eksponeres for synlig lys?
Bearbeiding av sekvenser og sammenlikning med et referanse-genom
Sekvensering
Opptelling av antall sekvenser og statistisk analyse
Pathway function analysis
https://www.digikey.com/-/media/Images/Article%20Library/TechZone%20Articles/2017/July/Ultraviolet%20Radiation%20Attributes%20and%20Benefits/article-2017july-ultraviolet-radiation-fig1.jpg?ts=b76e4e6c-519f-45ce-a190-ffd45c8dc431&la=en-US
20 min = ca 8 s 180 min = ca 60 s
https://www.hegnar.no/var/hegnar/storage/images/8/3/1/2/1842138-1-nor-NO/55254_binary_12390_full_article.jpg
Konklusjon
• Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning for
• Utvikling av nye bekjempelses-strategier for å
kontrollere L. monocytogenes i matindustrien • Tydelige responser – vi tror dette kan la seg utnytte • Vi jobber videre med å undersøke den praktiske nytteverdien
• Eksperimentell design – synlig lys er en vanskelig faktor å kontrollere, og den er ofte ikke tenkt på – potensiell bias! • Resultatene vi baserer oss på kan være påvirket av dette
Acknowledgement
• Prosjektgruppen i Pathogens in the Food Chain, NFR 221663 –F40
• Medforfattere på «Shining Light on L. monocytogenes – a transcriptome analysis»
• Arvind YM Sundaram*, Taran Skjerdal **, Yngvild Wasteson ***, Toril Lindbäck ***, Anne Kijewski ***, Marina Aspholm ***
• *Norwegian Sequencing Centre, Department of Medical Genetics, Oslo University Hospital, Norway
• **Norwegian Veterinary Institute, Ullevålsveien 68, N-0450 Oslo, Norway
• ***Norwegian University of Life Sciences, Campus Adamstuen, Ullevålsveien 72, 0454 Oslo, Norway
• Terje Christensen, Statens Strålevern
• Ellen Christensen, Veterinærinstituttet
Food Micro, Berlin, September 2018; Posterpris på dette arbeidet