GENETIKA FORENSIK DAN DILENIASI POPULASI HIU DAN PARI DI INDONESIA: IMPLIKASI PADA PENGELOLAAN DAN KONSERVASI Hawis Madduppa, Sutanto Hadi, Nurlita Putri Anggraini, Djumadi Parluhutan, Budi Raharjo, Nurmila Anwar, Fitrian Dwi Cahyo, Dani Dasa Permana, Yunita, Effin Muttaqin, Benaya M. Simeon, Muhammad Ichsan, Abraham Sinaipar, Toufan Phardana, Beginer Subhan
27
Embed
GENETIKA FORENSIK DAN DILENIASI POPULASI …srs-indonesia.org/uploads/publikasi/Panel2/Ruang1/127_IPB...GENETIKA FORENSIK DAN DILENIASI POPULASI HIU DAN PARI DI INDONESIA: IMPLIKASI
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
GENETIKA FORENSIK DAN DILENIASI POPULASI HIU DAN PARI DI INDONESIA: IMPLIKASI PADA PENGELOLAAN DAN KONSERVASI
Konektivitas Antar Populasi Manta alfredi Manta alfredi COI JQ765532.1(Ningaloo Reef)
Manta alfredi COI JQ765531.1(Ningaloo Reef)
2516654 ITK RAM MA 30 R12516653 ITK RAM MA 29 R12516648 ITK RAM MA 23 R12516642 ITK RAM MA 15 R1
2516638 ITK RAM MA 11 R1
2516633 ITK RAM MA 04 R1
2516632 ITK RAM M
A 03 R1
2516629 ITK NPN
MA 30 R
1
2516628 ITK N
PN M
A 29 R
1
2516626 ITK N
PN
MA 27 R
1
2516619 ITK N
PN
MA 20 R
1
2516617 IT
K N
PN
MA
18 R
1
2516616 IT
K N
PN
MA
17 R
1
2516615 IT
K N
PN
MA
16 R
1
2516612 IT
K N
PN
MA
13 R
1
2516611 IT
K N
PN
MA
12 R
1
2516610 IT
K N
PN
MA
11 R
1
25
16
60
9 IT
K N
PN
MA
10
R1
25
16
60
7 IT
K N
PN
MA
08
R1
2516604 IT
K N
PN
MA
05 R
12516600 IT
K N
PN
MA
01 R
1
2516599 IT
K K
OM
MA
24 R
1
2516598 IT
K K
OM
MA
23 R
1
2516597 IT
K K
OM
MA
22 R
1
2516592 IT
K K
OM
MA
17 R
1
2516590 ITK
KO
M M
A 15 R
1
2516585 ITK K
OM
MA 10 R
1
2516583 ITK K
OM
MA 08 R
1
2516579 ITK KOM
MA 04 R
1
2516578 ITK KOM
MA 03 R1
2516577 ITK KOM MA 01 R1
65
2516652 ITK RAM MA 28 R1
1
2516651 ITK RAM MA 26 R1
2516580 ITK KOM MA 05 R1
2516581 ITK KOM MA 06 R1
2516584 ITK KOM MA 09 R1
2516586 ITK KOM MA 11 R1
2516587 ITK KOM MA 12 R12516588 ITK KOM MA 13 R1
2516591 ITK KOM MA 16 R1
2516593 ITK KOM MA 18 R1
2516594 ITK KOM MA 19 R1
2516595 ITK KOM MA 20 R1
2516596 ITK KOM MA 21 R1
2516601 ITK NPN MA 02 R1
2516602 ITK NPN MA 03 R1
2516603 ITK NPN
MA 04 R
1
2516608 ITK N
PN M
A 09 R1
2516613 ITK N
PN
MA 14 R
1
2516614 ITK N
PN
MA 15 R
1
2516618 IT
K N
PN
MA
19 R
1
2516620 IT
K N
PN
MA
21 R
1
2516621 IT
K N
PN
MA
22 R
1
0
2516622 IT
K N
PN
MA
23 R
1
0
2516623 IT
K N
PN
MA
24 R
1
0
2516625 IT
K N
PN
MA
26 R
1
0
25
16
62
7 IT
K N
PN
MA
28
R1
0
25
16
63
0 IT
K R
AM
MA
05
R1
0
25
16
63
1 IT
K R
AM
MA
06
R1
0
2516634 IT
K R
AM
MA
07 R
1
0
2516635 IT
K R
AM
MA
08 R
1
0
2516636 IT
K R
AM
MA
09 R
10
2516637 IT
K R
AM
MA
10 R
1
0
2516639 IT
K R
AM
MA
12 R
1
0
2516640 ITK
RAM
MA
13 R1
0
2516641 ITK R
AM
MA 14 R
1
0
2516643 ITK R
AM
MA 16 R
1
0
2516644 ITK RAM
MA 17 R
1
0
2516645 ITK RAM M
A 19 R1
0
2516647 ITK RAM MA 22 R1
0
2516649 ITK RAM MA 24 R1
1
2516650 ITK RAM MA 25 R1
Manta birostris COI JF493866.1
Fst 0.035 (p=0.17009)
Kesimpulan• Deteksi spesies menggunakan pendekatan
molekular berdasarkan marka mtDNA lokus COI.
• Hasil genetika forensik secara keseluruhan mencapai tingkat deteksi 99-100%.
• Spesies yang terdeteksi, seperti C. falciformis, S. Lewini, A. pelagicus, Carcharhinus sorrah, dan C. amblyrhynchoides, serta # spesius lainnya.
• Pada spesies penting dideteksi terdapat struktur populasi yang tinggi dan signifikan (C. falciformis: FST = 0,733, S. Lewini: FST = 0,356; P = 0).
Rekomendasi
• Kegiatan pengelolaan dapat dilakukan secara terpadu dan berdasarkan karakteristik dari lokasi tersebut.
• Metode ini dapat digunakan untuk deteksi cepat ikan hiu dan pari yang dijual dipasaran, serta
• Karakteristik genetik dapat dipakai untuk mengetahui daerah “hotspot” untuk setiap jenis hiu dan pari
Publikasi hiu dan pariMadduppa H, Ayuningtyas RU, Subhan B, Arafat D. 2016. Exploited
but unevaluated: DNA barcoding reveals skates and stingrays(Chordata, Chondrichthyes) species landed in the Indonesian fishmarket. ILMU KELAUTAN: Indonesian Journal of MarineSciences. 21(2): 77-84.
Prehadi P, Sembiring A, Kurniasih EM, Rahmad R, Arafat D, Subhan B,Madduppa H. 2015. DNA barcoding and phylogeneticreconstruction of shark species landed in Muncar fisherieslanding site in comparison with Southern Java fishingport. Biodiversitas Journal of Biological Diversity. 16(1).
Sembiring A. Pertiwi NPD, Mahardini A, Wulandari R, Kurniasih EM,Kuncoro AW, Cahyani ND, Anggoro AW, Ulfa M, Madduppa H,Carpenter KE. 2015. DNA barcoding reveals targeted fisheries forendangered sharks in Indonesia. Fisheries Research. 164: 130-134.
Toha AH, Widodo N, Subhan B, Himawan MR, Tania C, Noor BA,Stewart BS, Madduppa H. 2016. Close genetic relatedness ofwhale sharks, Rhincodon typus in the Indo-Pacificregion. Aquaculture, Aquarium, Conservation & Legislation-International Journal of the Bioflux Society (AACL Bioflux). 9(3).