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Forma integrada da equação de Michaelis- Menten
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Forma integrada da equação de Michaelis- Mentenw3.ualg.pt/~pmartel/cadeiras/enzimologia/aula9.pdfIntegração da equação de Michaelis-Menten A forma integrada da equação de Michaelis-Menten

Feb 11, 2020

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Forma integrada da equação de Michaelis-

Menten

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Integração da equação de Michaelis-Menten

Existem situações experimentais em que a estimativa das velocidades

iniciais é pouco fiável, sendo necessário recorrer à forma integrada da

equação de Michaelis-Menten para poder extrair parâmetros cinéticos de

uma curva de progressão de produto.

max 00

m 0

max

m

[P]

([A] [P])[P][A] [A] [P]

([A] [P])[A]

[A]

dv

dtVd

dt KV

vK

=

−= − ⇒ =

+ − =

+

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Integração da equação de Michaelis-Menten

Esta equação pode ser integrada por separação das variáveis:

m 0max

0

[A] [P][P]

[A] [P]

Kd V dt

+ −=

−∫ ∫

m 0 maxln([A] [P]) [P]K V t α− − + = +

Usando a condição inicial [P]=0 quando t=0, fica α=-Km , e rearranjando vem:

0max m

0

[A][P] ln

[A] [P]V t K

= + −

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Integração da equação de Michaelis-Menten

A forma integrada da equação de Michaelis-Menten é muitas vezes escrita:

app app 0max m

0

[A][P] ln

[A] [P]V t K

= + −

O uso das grandezas aparentes realça o facto de que esta equação é muito

mais geral do que o caso a partir do qual foi deduzida.

Vmax(app) e Km(app) podem diferir muito de Km e Vmax , podendo até ser

negativos!

No entanto, a seguinte relação é sempre válida:

app

max 00 app

m 0

[A]

[A]

Vv

K=

+

e permite estimar v0 se os valores de Vmax(app) e Km(app) forem

conhecidos.

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app app 0max m

0

[A][P] ln

[A] [P]V t K

= + −

Integração da equação de Michaelis-Menten

A equação integrada,

pode ser rearranjada para a seguinte forma:

( ) ( )

app

m

app app

0 0 max 0 0 max

1 [P]

ln [A] / ([A] [P]) ln [A] / ([A] [P])

Kt

V V

= +

− −

Portanto um gráfico de ( )0 0ln [A] /([A] [P])

t

−em função de

( )0 0

[P]

ln [A] /([A] [P])−

produz uma recta de declive app

max1/V e ordenada na origem app app

m max/K V

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( )0 0ln [A] /([A] [P])

t

( )0 0

[P]

ln [A] /([A] [P])−0[A]

0 0[A] / v

app app

m max/K V

app

max1/V

m max/K V

max1/V

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Competição de substratos e especificidade

enzimática

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Competição de substratos e especificidade enzimática

A eficiência catalítica kA = kcat/Km também se designa por constante de especificidade.

A razão torna-se clara se considerarmos uma situação de competição entre dois

substratos A e A´, pelo centro activo de um mesmo enzima E:

12

1

E + A EA E + Pk k

k−

→ →←

12

1

E + A EA E + Pk k

k−

′ ′

′→′ ′ ′→←

A partir deste esquema podem deduzir-se o seguinte par de equações de velocidade:

2 0

m m

[E] [A][P]

(1 [A ] ) [A]

kdv

dt K K

= =′′+ +

2 0

m m

[E] [A ][P ]

(1 [A] ) [A ]

kdv

dt K K

′ ′′′ = =

′ ′+ +

Cada um dos substratos se comporta como um inibidor competitivo relativamente ao

outro, sendo a constante de inibição igual ao Km do substrato em competição.

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Competição de substratos e especificidade enzimática

O verdadeiro significado da constante kA emerge se considerarmos o quociente v/v’ :

Tendo em conta que kA=k2 / Km e kA’ = k2’ / Km’ :

2 0 2 m 0

2 m 0m m m m

2 0 2 m 0 2 m 0

m m m m

[E] [A] ( / )[E] [A]

( / )[E] [A](1 [A ] ) [A] 1 [A ] [A]/

[E] [A ] ( / )[E] [A ] ( / )[E] [A ]

(1 [A] ) [A ] 1 [A] [A ] /

k k K

k KK K K Kv

v k k K k K

K K K K

′ ′′ ′+ + + += = =′ ′ ′ ′ ′ ′′ ′ ′

′ ′′ ′+ + + +

Numa mistura equimolar de substratos competindo para o mesmo centro activo de um

enzima E, a razão entre as velocidades de catálise de dois substratos é igual à razão

entre as constantes de especificidade do enzima para cada substrato.

2 m 0 A

2 m 0 A

( / )[E] [A] [A]

( / )[E] [A ] [A ]

k K kv

v k K k

= =′ ′ ′ ′′ ′

e quando [A]=[A´] A

A

kv

v k

=′ ′

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Competição de substratos e especificidade enzimática

Substrate kcat (s-1) Km(mM) “Ki”(mM) kcat/Km(s-1mM-1)

Fluorofumarato 2700 0.027 - 100000

Fumarato 800 0.005 - 160000

Clorofumarato 20 0.11 0.10 180

Bromofumarato 2.8 0.11 0.15 25

Iodofumarato 0.043 0.12 0.10 0.36

Mesaconato 0.023 0.51 0.49 0.047

L-tartarato 0.93 1.3 1.0 0.72

Parâmetros cinéticos para diferentes substratos da fumarase:

Exemplo: numa mistura equimolar dos substratos fumarato e fluorofumarato o enzima

fumarase catalisa a decomposição do fumarato 60% mais rápido:

A

A

160000

1000001.60

kv

v k

= = =′ ′

O fumarato é o substrato

mais específico

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Teste de competição de substratos

Quando se verifica a transformação de dois substratos na presença de um extracto

enzimático, podem verificar-se duas situações:

a) O dois substratos competem para o centro activo de um mesmo enzima

b) Os dois substratos são catalizados por enzimas distintos presentes no extracto

Para distinguir entre estas duas situações podemos recorrer a um teste de

competição.

A soma das velocidades v e v’ para dois substratos em competição é:

max m max mtot

m m

( / )[A] ( / )[A ]

1 [A ] [A]/

V K V Kv v v

K K

′ ′ ′+′= + =

′′+ +

Determinando experimentalmente duas concentrações de referência [A]=[A]0 e

[A’]=[A]0’ tais que:

max 0 max 00

m 0 m 0

[A] [A ]

[A] [A ]

V Vv

K K

′= =

′+ +

Estas são assim concentrações de [A] e [A’] que conduzem a uma mesma velocidade

de catálise observada para cada substrato.

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Teste de competição de substratos

Preparando uma série de soluções contendo uma mistura dos dois substratos tais que

as suas concentrações são interpoladas entre zero e [A]0 e [A’]0 :

0

0

[A] (1 )[A][0,1]

[A ] [A ]

rr

r

= − ∈′ ′=

0

0

[A] 0.75[A]

[A ]

0.2

0.25[A ]

5r

=

′ ′=

=

0

0

[A] 0.5[A]

[A ]=0.5[A

0 5

]

.r =

=

′ ′0

0

[A] 0.25[A]

[A ]=0.75[A ]

0.75r =

=

′ ′0[A] [A]

[

0

A ] 0

r

=

′ =

=0

[A] 0

[A ]

1

[A ]

r

=

′ ′=

=

Exemplo com 5 soluções:

Para cada uma destas soluções, vtot será a soma das velocidades observadas para a

catálise de A e A’ .

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Teste de competição de substratos

A expressão de vtot assume a seguinte forma:

max m 0 max m 0tot

0 m 0 m

0 0 m 0 m0

0 m 0 m

( / )(1 )[A] ( / ) [A ]

1 (1 )[A] / [A ] /

[(1 )(1 [A] / ) (1 [A ] / )]

(1 )(1 [A] / ) (1 [A ] / )

V K V Kv

K K

v K K

r r

r r

r rv

K

r

K

r

′ ′ ′− +=

′ ′+ − +

′ ′− + + += =

′ ′− + + +

Conclusão: se os dois substratos competirem para o mesmo centro activo, a

velocidade total observada será a mesma em todas as misturas (vo).

hexocinase hexocinase +galactocinase