Estructura de proteínas-fullufq.unq.edu.ar/Docencia-Virtual/BioquimicaI/Teorias/...Plegamiento de proteínas Para describir la posición de un átomo en el espacio uno necesita definir

Estructura de proteínas

Jerarquías estructurales

Estructura primaria

Experimento de Anfinsen

Variabilidad Secuencial

Enlace peptídico

Diagrama de Ramachandran

Estructura Secundaria: hélice alfa

Momento dipolar

NH2 terminal

COOH terminal

Estructura Secundaria: hoja beta plegada

Período: 7 A

Período: 6.5 A

Conexiones entre elementos de estructura secundaria

Loops

Bends

(beta turns, reverse turns or hairpin)

Estructura terciaria

Motivos estructurales

Dominios

Estructura cuaternaria

Alfa globina

Beta globina

Hemoglobina

Mioglobina: MB + O2 MBO2

Superficies y cavidades

Superficies

O2 ?

Superficie

(amarillo)

Surcos

(fucsia)

Los surcos conducen a cavidades...

Plegamiento de proteínas

Para describir la posición de un átomo en el espacio uno necesitadefinir 3 coordenadas

Para una proteína de 100 aminoácidos necesitamos 6000 coordenadas (consideramos que un AA contiene en promedio 20

átomos)

Si cada una de esas coordendas puede tomar al menos 2 valoresdistintos tendríamos que el espacio conformacional de la proteína

sería de 26000

Si cada transición entre cada una de éstas conformaciones distintasrequiere de un tiempo de por ejemplo 110-13 segundos….

…plegar una proteína requeriría

25987 segundos!!!

Relación Estructura Función

E. Fischer, 1894

D. Koshland, 1958

Mirsky and Pauling 1936

C. Anfinsen (1960-)

Relación Estructura Función

Monod, Wyman and Changeux, 1965

Fred Karush, 1950

Proteínas desestructuradas