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EPP 2007 pour Epidémies concentrées Groupe de travail ONUSIDA/OMS sur la surveillance mondiale du VIH/SIDA et des IST El El é é ments ments de base de base
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Sep 10, 2018

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EPP 2007 pour Epidémies concentrées

Groupe de travail ONUSIDA/OMS sur la surveillance mondiale du VIH/SIDA et des IST

ElEléémentsments de basede base

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Epidémie nationale concentrée en EPP 2007

Introduction et survol

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Etapes pour le modEtapes pour le modèèle dle d’’une une éépidpidéémie nationalemie nationale

Choisir le pays et nommer cette tentative de projections nationales (Ensemble)

Décider qui sont les groupes–clés dans l’épidémie et sa répartition géographique

Définir les caractéristiques de la population– Aspects démographiques

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Etapes pour le modEtapes pour le modèèle dle d’’une une éépidpidéémie nationalemie nationale

Entrer les données de prévalence VIH et tailles d’échantillon pour chaque sous-population ou sous-épidémie régionaleY ajuster le modèle du Groupe de RéférenceAjuster votre prévalence en plus ou en moins pour correspondre aux données d’enquête à grande échelle éventuellement disponiblesExaminer les résultats sur écran

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EPP 2007 EPP 2007 –– vous fait parcourir les vous fait parcourir les éétapestapesChaque Chaque éétape sur une page ou un onglet difftape sur une page ou un onglet difféérent rent –– commence commence

par par ““EnsembleEnsemble””

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Page EnsemblePage Ensemble

Qu’est-ce qu’un Ensemble ?– Epidémie nationale composée d’épidémies plus petites au sein de

diverses sous-populations et/ou zones géographiques

Que puis-je faire sur cette page ?– Charger un fichier existant– Créer un nouveau fichier, choisir un pays, entrer des notes– Créer un nouveau gabarit

Epidémies généralisées ou concentrées– Celle que vous choisirez changera les pages qui apparaissent

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CrCrééer un nouveau gabariter un nouveau gabarit

Qu’est-ce qu’un gabarit ?– Un format prédéfini pour une épidémie nationale

Comment mettre en place un gabarit ?– En appuyant sur le bouton “créer” (page Ensemble)

Quelles sont les possibilités lors de la création d’un gabarit ?– Choisir son nom et le type d’épidémie– On peut associer un pays à un gabarit– Chaque sous-population peut avoir ses propres caractéristiques

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CrCrééer une nouvelle image de gabariter une nouvelle image de gabarit

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Page EpidPage Epidéémie mie –– DDééfinir votre finir votre éépidpidéémiemie

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Page EpidPage Epidéémiemie

Sous-populations et sous-épidémies– Sous-population : épidémie dans un groupe spécifique de

personnes• Termes associés : Taille de population et données VIH

– Sous-épidémie : épidémie faite de multiples épidémies dans des sous-populations et/ou autres sous-épidémies

Que puis-je faire sur cette page ?– Définir la structure souhaitée pour l’épidémie– Choisir les caractéristiques d’une sous-population

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Construction dConstruction d’é’épidpidéémies complexesmies complexes

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Construction dConstruction d’é’épidpidéémies complexesmies complexes

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Page Pops (populations)Page Pops (populations)

Pages différentes pour épidémies généralisée ou concentrée, donc veillez à créer fichier “généralisé”

Que puis-je faire sur cette page ? – Fixer la population nationale générale et l’année de base de

la population– Définir la taille des populations– Définir les paramètres démographiques– Afficher les populations sans épidémie à VIH

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Page Pops Page Pops –– ggéénnééralisralisééeses

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Page Pops Page Pops –– concentrconcentrééeses

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Page Pops Page Pops –– concentrconcentréée CDIe CDI

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Page DonnPage Donnééeses

Qu’entrer ici – prévalence VIH et tailles d’échantillons

Pourquoi les tailles d’échantillons pour EPP 2007 ?– Recours à vraisemblance et la taille d’échantillon sert à pondérer

Signification des sites – utiliser ceux dont vous disposez

Que puis-je faire ici ?– Changer les modalités d’affichage– Ajouter/supprimer des sites– Copier/coller

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Page DonnPage Donnééeses

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Page DonnPage Donnééeses –– %VIH seulement%VIH seulementUtile pour copier/coller Utile pour copier/coller àà partir dpartir d’’Excel Excel

ou dou d’’un vieux dossier EPPun vieux dossier EPP

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Page ProjeterPage Projeter

Des choix à n’en savoir que faire– A quoi ajuster ?– Comment ajuster – que modifier, que laisser de côté ?

Ajustements de niveau (Sites multiples)

Comment savoir si mon ajustement est meilleur que les autres ?– LL = log likelihood (vraisemblance logarithmique)

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Page ProjeterPage Projeter

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Page Projeter Page Projeter –– ajustement sans niveauxajustement sans niveaux

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Utiliser la page ProjeterUtiliser la page Projeter

Cliquer sur “Poser des estimations initiales”

Examiner les produits de ces estimations initiales –– Soit accepter le meilleur ajustement proposé en cliquant

“Utiliser meilleur ajustement EPP”, soit…– Générer d’autres valeurs pour r, f0, t0 et phi sur la page de

Projeter

D’après cette estimation initiale, affiner l’ajustement

Quand vous tapez STOP les valeurs de l’ajustement en cours seront chargées

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Page CalibrerPage Calibrer

Lien entre les données de surveillance et les résultats nationaux de l’épidémie– Permet d’ajuster la prévalence en plus ou en moins pour

l’apparier aux données d’enquêtes à grande échelle ou aux biais majorants/minorants dans les données

Deux types – généralisées et concentrées

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Page Calibrer Page Calibrer –– GGéénnééralisralisééeses

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Page Calibrer Page Calibrer –– ConcentrConcentrééeses

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Page RPage Réésultatssultats

Que puis-je y voir ?– Prévalence (% et nombre d’infections) & population – Choisir ce que l’on affichera

Le trésor caché – le bouton “Résultats/Produits”– Créer un dossier Spectrum– Sauvegarder les détails pour examen plus tard (*.csv)

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Page RPage Réésultats sultats –– prpréévalence (%)valence (%)

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Page RPage Réésultats sultats –– prpréévalence (#)valence (#)

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Page RPage Réésultats sultats –– PopulationsPopulations

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Page Page PrPrééfsfs (pr(prééfféérences)rences)

Quelles sont les préférences d’usager et en quoi importent-elles?

Que puis-je changer sur cette page ?– Langage– Paramètres VIH– Paramètres de population (par défaut)– Tailles d’échantillons (par défaut)

Différence entre changer les paramètres de population ici ou sur la Page Projeter ? Ici, le changement affecte l’Ensemble et TOUTES les sous-populations

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Page Page PrPrééfsfs

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Aspects pertinents pour les épidémies concentrées avec renouvellement

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200 entrée

EPP 2007 tient compte du renouvellement EPP 2007 tient compte du renouvellement des populationsdes populations

Clients des prof. sexe(1000 H, durée 5 ans) 200 sortie

Décès

Population M générale

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Page Pops (populations) Page Pops (populations) -- ConcentrConcentrééeses

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Page Calibrer Page Calibrer -- ConcentrConcentrééeses

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Pourquoi assigner la prPourquoi assigner la préévalence ici ?valence ici ?

Modèle EPP 2007 inclut renouvellement de la population– Nombreux ex-membres VIH+ de populations à risque p.ex. ex-profess. du sexe

VIH+ ou ex-CDI VIH+

Ces personnes VIH+ sont parfois reprises par d’autres populations soumises à surveillance– P. ex. ex-professionnelles du sexe dans les CPN

On peut aussi les perdre de vue– P. ex. ex-CDI, à cause des limitations de la surveillance chez les hommes

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Ajustements aux donnAjustements aux donnéées CDI, res CDI, réégion centrale, Thagion centrale, ThaïïlandelandeModifications dModifications d’’ajustementajustement

05

1015202530354045

1980

1983

1986

1989

1992

1995

1998

2001

2004

2007

Non renouvDur 10 ansData

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ExEx--CDI survivant aprCDI survivant aprèès 10 ans s 10 ans ThaThaïïlandelande

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

1980

1983

1986

1989

1992

1995

1998

2001

2004

2007

Survie 10 ans

Pic maximum5.4% de la prévalenceadulte M

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Comment effectuer la rComment effectuer la réépartition des VIH+ partition des VIH+ parmi les catparmi les catéégories gories ““exex”” ??

Choisir la population d’origine des VIH+– Ici, uniquement les populations à renouvellement

Choisir où les VIH+ vont après avoir quitté le groupe– Ici, uniquement les populations sans renouvellement

(fermées)

Décider d’ajouter ou de remplacer la prévalence

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QuQu’’entendentend--on par on par ““ajouterajouter”” & & ““remplacerremplacer””la prla préévalence ?valence ?

Ajouter la prévalence– On ajoute les ex-membres du groupe qui sont VIH+ aux membres VIH+

de la population-cible– Ce qui veut dire que la surveillance dans cette population ne les a pas

capturés

Remplacer la prévalence– On forme l’hypothèse que certaines personnes VIH+ de la population-

cible proviennent du groupe des membres auparavant soumis au risque– On calcule le reste des infections survenues “au sein du groupe”

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OOùù en voiten voit--on les effets ?on les effets ?

Sur les graphiques de la page Résultats

En appuyant sur le bouton “Réallocation” de la page Résultats

Exemple– Professionnelles du sexe et F de la population générale à

Mumbai

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Page RPage Réésultats sultats –– concentrconcentrééeses

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Tableau de rTableau de rééassignationassignation

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Page de vPage de véérification auditrification audit

Uniquement les épidémies concentrées

Que vérifie-t-on ?– Taille des populations à risque : HSH; CDI; Prof F sexe,

Clientèle– Ratio d’infection, population à faible risque ou risque élevé– Ratio des cas de SIDA au cours du temps

• Entrée additionnelle de données par les utilisateurs

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Page de vPage de véérification auditrification audit

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Remarques finales et avertissementsRemarques finales et avertissements

Ne jamais projeter à plus de 5 ans : même là, prudence !

Une interface et un modèle plus séduisants ne remplacent pas la qualité des données– ODOD (ordure dedans, ordure dehors), même si c’est plus joli…– Très peu de pays peuvent en faire usage pour des projections nationales

complètes

Toujours veiller à la cohérence interne, surtout pour les épidémies concentrées avec renouvellement

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Annexe – ajustements de niveaux

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Pourquoi des niveaux ? Ajouter de nouveaux sites Pourquoi des niveaux ? Ajouter de nouveaux sites de surveillance peut abaisser la courbede surveillance peut abaisser la courbe

1%

2%

3%

4%

5%

6%

7%

8%

9%

1984 1989 1994 1999 2004

Année

Prév

alen

ceV

IH

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Page Projeter Page Projeter –– Ajustement de niveauxAjustement de niveaux

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Deux approches pour ajouter des sitesDeux approches pour ajouter des sites

Ajuster tous les sites de façon autonome– Entrer chaque site avec une proportion

adéquate de la population nationale

Hypothèse d’une “trajectoire unique” pour tous les sites, i.e., la forme de la courbe est constante– pit = λi pt– n-1 paramètres suppl. pour n sites– Ajuster λi avec les paramètres modèles

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%

35%

1985 1990 1995 2000 2005 2010

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Utilisation de paramUtilisation de paramèètre de tre de niveaux:niveaux: rréésultatsultat

0%

1%

2%

3%

4%

5%

6%

7%

8%

9%

10%

1984 1989 1994 1999 2004

Année

Prév

alen

ceV

IH

Alternative approachCurrent approach