Top Banner
Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
56

Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Jan 02, 2016

Download

Documents

Cole Lynch

Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus. Citrátsynthasa. Citrátsynthasa katalyzuje kondenzaci acetylCoA s oxaloacetátem. Dvousubstrátová reakce s uspořáddaným mechanismem – první se váže na enzym oxaloacetát. Uplatňuje se enolforma acetylCoA !. AKONITASA. - PowerPoint PPT Presentation
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus,

Krebsův cyklus.

Page 2: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 3: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 4: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 5: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 6: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 7: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 8: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 9: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 10: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 11: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 12: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 13: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 14: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 15: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 16: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 17: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 18: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 19: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 20: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 21: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 22: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Citrátsynthasa

• Citrátsynthasa katalyzuje kondenzaci acetylCoA s oxaloacetátem.

• Dvousubstrátová reakce s uspořáddaným mechanismem – první se váže na enzym oxaloacetát.

• Uplatňuje se enolforma acetylCoA !

Page 23: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 24: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 25: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 26: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

AKONITASA

• Akonitasa katalyzuje reversibilní izomeraci citrátu na isocitrát.

• Meziproduktem je cis-akonitát. • Akonitasa obsahuje komplex [4Fe-

4S] podílející se na odštěpení OH skupiny z citrátu.

Page 27: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 28: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

NAD+ dependentní isocitrátdehydrogenasa.

• Enzym katalyzuje oxidadivní dekarboxylaci isocitrátu na

-oxoglutarát. • Oxid uhličitý se odštěpuje z

původní molekuly oxaloacetátu, ne z acetylCoA.

• Produkuje se NADH + H+.

• Koenzymy jsou Mg nebo Mg ionty.

Page 29: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 30: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 31: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 32: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

-Oxoglutarátdehydrogenasa.

• Katalyzuje oxidativní dekarboxylaci -oxoglutarátu za tvorby druhé molekuly CO2 a NADH.

• Analogická reakce s pyruvátdehydrogenasovým komplexem. Molekula CO2 má také původ

v oxaloacetátu.

Page 33: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 34: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

SukcinylCoAsynthetasa (sukcinátthiokinasa)

• Katalyzuje štěpení vazby s vysokou energií (sukcinylCoA) spojené se syntézou GTP.

• Savčí enzym katalyzuje tvorbu GTP, rostlinné a bakteriální enzymy ATP.

• Meziproduktem je sukcinylfosfát.

Page 35: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 36: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 37: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 38: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Sukcinátdehydrogenasa (SD).

• Enzym katalyzuje stereospecifickou dehydrogenaci sukcinátu na fumarát.

• Enzym je kompetitivně inhibován malonátem,…..

• Na enzym je kovalentně vázán přes His FAD – prosthetická skupina.

• Produkuje se FADH2 – který musí být rychle reoxidován. Elektrony se přenáší do mitochondriálního elektronového transportního řetězce.

• SD je jediný enzym CC vázaný na membránu. Ostatních sedm je volně v matrix mitochondrie.

Page 39: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 40: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 41: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 42: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Fumarasa

• Fumarasa katalyzuje hydrataci dvojné vazby fumarátu za tvorby malátu.

• Hydratace probíhá přes karbanion jako přechodový stav.

• Nejdříve se aduje OH- a poté H+.

Page 43: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 44: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Malátdehydrogenasa.

• Enzym katalyzuje koncovou reakci CC – regeneraci oxaloacetátu.

• Přenos hydridového aniontu na NAD+ probíhá analogicky jako u laktátdehydrogenasy a alkoholdehydrogenasy.

• Změna standardní volné energie této rekce je + 29, 7 kJ/mol. Z toho důvodu je koncentrace oxaloacetátu v buňce velmi nízká vzhledem k malátu. Další reakce katalyzovaná citrátsynthasou je silně exergonní (-31, 5 kJ/mol).

Page 45: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 46: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 47: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 48: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 49: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 50: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 51: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 52: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 53: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.

Glyoxylátový cyklus. • Rostliny, bakterie a plísně mají enyzmy, které katalyzují

převod acetylCoA na oxaloacetát a tím do glukoneogeneze.

• Isocitrátlyasa a malátsynthasa. • Cyklus probíhá zčásti v mitochondrii a zčásti

v glyoxysomech (na mebránu vázané organely).• Výsledkem cyklu je převod dvou acetylCoA na sukcinát

v glyoxysomu, který je převeden na malát v mitochondrii a využit ke glukoneogenezi.

• Glyoxysomy nemají akonitasu – převedení citrátu na isocitrát probíhá pravděpodobně v cytosolu.

• Malát je transportován do cytosolu, kde je malátdehydrogenasou převeden na oxaloacetát a dále vstupuje do glukoneogeneze.

Page 54: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 55: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.
Page 56: Cyklus trikarboxylových kyselin, citrátový cyklus, Krebsův cyklus.