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PACES-L2 UE Bases Moléculaires et Cellulaires des Pathologies 18 Octobre 2012 Cycle, sénescence et mort cellulaires Comment tout intégrer ? Morgane Le Bras U944-UMR7212-Institut Universitaire d’Hématologie Hôpital Saint-Louis [email protected]
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Feb 11, 2022

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Page 1: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

PACES-L2 UE Bases Moléculaires et Cellulaires des Pathologies

18 Octobre 2012

Cycle, sénescence et mort cellulaires Comment tout intégrer ?

Morgane Le Bras

U944-UMR7212-Institut Universitaire d’Hématologie Hôpital Saint-Louis

[email protected]

Page 2: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncogénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

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Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncongénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

Page 4: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Intervention des molécules cycliques dans l’évolution du cycle

M

DC

S

G2

G1

G0

START

Métaphase/anaphase

E/cdk2 (SPF)

B/cdk1 (MPF) A/cdk 2

A/cdk 1

D/cdk 4

D /cdk 6

4

6 complexes interviennent dans le cycle

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Sécrétion des complexes au cours du cycle

Cyclines cdk Rôle dans le cycle

A Cdk2 S

B Cdk1 G2M / M

C Cdk8 Transcription

D Cdk4 / Cdk6 G0G1 / G1

E Cdk2 G1S

H Cdk7 Tout le cycle

SPF

MPF

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Fonctionnement des cdk

• Les Cdk (cyclin dependant kinase) sont des sérine thréonine kinases enzymes catalysant la phosphorylation de séquences consensus (type : ser/thr-pro-X-arg/lys) de protéines cibles par transfert du groupement γ-phosphate de l’ATP sur des sérine ou thréonine.

• Les cyclines permettent aux cdk d’être actives, mais ne possèdent pas elles-mêmes d’activité enzymatique.

Protéine activée

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Rôles des cdk

• Avancée dans le cycle : » Entrée en G1, exécution de G1

» Passage en S

» En G2

» Passage en mitose, exécution de la mitose

• Cibles : » Protéines d’avancée dans le cycle (tubulines…)

» Protéine Rb

• Mode d’action : » Phosphorylations activatrices

» Phosphorylations inhibitrices

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Exple de mode d’action des complexes cycline-cdk : les protéines Rb et E2F

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Régulation de l’activité cdk

• Les cyclines exprimées de façon cyclique,

• Des protéines déphosphorylant et activant les Cdk : cdc 25

• Des protéines phophorylant les Cdk : • activatrices : CAK (Cdk Activating Kinase(=Cycline H/Cdk7))

Polo K

• inhibitrices : kinase Wee1 (phosphorylation inhibitrice Cdk1) (=Mik1)

• Des protéines inhibitrices : • CKI (Cdk Inhibitor) :

• Famille KIP/CIP : p16, p21, p27

• Famille des INK4

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Régulation de l’activité cdk

Cycline A

Cdk 2

Cycline A

Cdk 1

Cycline D

Cdk 4

SPF :Cycline E/Cdk 2

Cycline D

Cdk 6

S

G2

M

G1

MPF : Cycline B/Cdk 1

P21

P21

P16

Wee1 Cdc25

Cdc25

Cycline H Cdk 7 CAK

Polo K

Activations Inhibitions

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Mutations des régulateurs G1/S dans

les cancers humains

Activité cdk et cancers

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Les mitogènes

• Unicellulaires: division en fonction de la disponibilité en nutriments

• Pluricellulaires: coordination intercellulaire par mitogènes

– Une cinquantaine sont connus

– Spécificité variable (plusieurs types de cellules)

– Action proliférative ou inhibitrice selon cellule/ contexte

– e.g.: PDGF fibroblastes, muscles lisses, glie

Erythopoiétine précurseurs de GR

TGF-beta: mesenchyme, astrocytes

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Phase G0

• Démantèlement de la machinerie du cycle (Cdk, ...) • Différentiation terminale: neurones - irréversible • réversibilité: e.g., foie <=> régénération possible

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Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncogénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

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Sénescence

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Sénescence

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• Sénescence cellulaire

• Sénescence tissulaire

• Sénescence de l’organe

• Sénescence de l’organisme

Sénescence

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Sénescence cellulaire

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• Mécanisme de réponse au stress – Hayflick & Moorhead (1961) – Important dans un environnement tumoral

• Blocage de la prolifération cellulaire – Insensibilité aux facteurs de croissance – Activité métabolique maintenue – Changements morphologiques

• Processus cellulaires impliqués:

– Raccourcissement des télomères – Upregulation du locus CDNKN2A – Accumulation de dommages de l’ADN

Sénescence cellulaire

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Sénescence cellulaire

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Sénescence cellulaire

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Sénescence réplicative et télomères

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Sénescence cellulaire

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Sénescence cellulaire

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Sénescence réplicative et télomères

Page 27: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sénescence cellulaire et dommages de l’ADN

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Sénescence cellulaire

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Sénescence cellulaire

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Sénescence et cellules souches

Page 31: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Sénescence cellulaire

• Sénescence tissulaire

• Sénescence de l’organe

• Sénescence de l’organisme

Sénescence

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Sénescence tissulaire

Page 33: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Progeria

• Anomalies de la réparation de l’ADN

• Trisomie 21

Accélération du vieillissement

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Progeria

Page 35: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Syndrome de Werner

Page 36: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Maladie d’Alzheimer

• Maladie de Parkinson

• Hypertension artérielle

• Dyslipidémies

• Athérosclérose

• Diabète type 2

• Syndrome métabolique

• Cancer

Maladies associées au vieillissement

Page 37: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Sénescence réplicative vs sénescence induite par des oncogènes

– HRASG12V : importance des 2 suppresseurs de tumeurs INK4A et ARF

– Surtout activation de la voie Raf-Mek en aval de Ras

Lien sénescence et cancer

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HrasG12V low ->hyperproliferation HrasG12V high ->senescence

Lien sénescence et cancer La voie Raf-Mek

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Prostate neoplasia

Senescence dans le rein Induction p27

Lien sénescence et cancer La voie Pi3K-Akt

Page 40: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Sénescence réplicative vs sénescence induite par des oncogènes – HRASG12V : importance des 2 suppresseurs de tumeurs INK4A

et ARF

– Surtout activation de la voie Raf-Mek en aval de Ras

• In vivo, sénescence dans les lésions pré-malignes (souris et homme) – Pancreas, poumon, melanocytiques nevi

– Explique leur faible taux de croissance et leur faible degré de malignité

Lien sénescence et cancer

Page 41: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Evidences in vivo chez la souris

Page 42: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Evidences in vivo chez l’Homme

Page 43: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sénescence tumorale

Page 44: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Senescence Associated Secretory Phenotype (SASP)

Page 45: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Senescence-messaging secretome: SMS-ing cellular stress Thomas Kuilman1 & Daniel S. Peeper

Senescence Associated Secretory Phenotype (SASP)

Page 46: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Senescence-messaging secretome: SMS-ing cellular stress Thomas Kuilman1 & Daniel S. Peeper

Senescence Associated Secretory Phenotype (SASP)

Page 47: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncongénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

Page 48: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Aspects historiques

Carl Vogt

Principe d’apoptose (1842).

(système nerveux en développement et

métamorphose chez les amphibiens)

Page 49: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Walter Flemming

Mort cellulaire programmée (1885).

Aspects historiques

Page 50: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

John Kerr

Distinction entre apoptose et mort traumatique (1965).

Aspects historiques

Page 51: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Brenner, Horvitz & Buston

Prix Nobel (2002).

Aspects historiques

Page 52: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cell death mechanisms

Death by suicide Death by injury

Page 53: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

APOPTOSIS NECROSIS

NATURAL YES NO

EFFECTS BENEFICIAL DETRIMENTAL

Physiological or

pathological

Always pathological

Single cells Sheets of cells

Energy dependent Energy independent

Cell shrinkage Cell swelling

Membrane integrity

maintained

Membrane integrity lost

Page 54: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Deux voies principales induisent l’apoptose

Voie extrinsèque (type I)

Via récepteurs membranaires: Récepteurs de la famille TNF et Fas

Récepteurs de mort membranaires

Stimuli extrinsèques

Voie intrinsèque (type II)

Via organites cellulaires: Réticulum endoplasmique, mitochondrie,

lysosomes

Mitochondrie Stimuli intrinsèques

Page 55: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Caspases initiatrices (caspases 8)

APOPTOSE

Caspases effectrices (caspases 3-6-9)

DNases

Récepteurs de mort membranaires

Stimuli extrinsèques

Effecteurs indépendants des caspases

(EndoG, Smac/DIABLO)

Apoptosome (cytochrome c)

Mitochondrie

Stimuli intrinsèques

DNases

Page 56: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

La voie extrinsèque: Cascade d’activation des caspases

ACTIVE CASPASE-8

Caspase 6

Caspase 7

Caspase 3

XIAP

DED p10

p20

p10

p20

PRO-DOMAIN

FLIP PROTEINS p10

p20 PRO-CASPASE-8

PARP Lamins

DNA fragmentation

APOPTOSE

Page 57: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Caspases initiatrices (caspases 8)

APOPTOSE

Caspases effectrices (caspases 3-6-9)

DNases

Récepteurs de mort membranaires

Stimuli extrinsèques

Effecteurs indépendants des caspases

(EndoG, Smac/DIABLO)

Apoptosome (cytochrome c)

Mitochondrie

Stimuli intrinsèques

DNases

La voie intrinsèque

Page 58: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

1-Intégration

2-Initiation 3-Dégradation

Céramide, GD3, palmitate

Ca2+

Petites molécules: Atractyloside, Pro-oxydants

NAD(P)H ROS, NO

p53 Protéines virales:

(Vpr, Hbx, M11L,vMIA)

Kinases: PKCe, HK, JNK

Famille Bcl-2

p53

La mitochondrie: un intégrateur central

Page 59: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Les facteurs apoptogéniques

Cyt c

Cyt c

Apaf-1

Apaf-1

dATP

Pro Caspase-9

Pro Caspase-9

APOPTOSOME

Caspase cascade 3, 6 & 7

Caspase-9

APOPTOSE

DNA fragmentation

Cyt c

DM

Bcl-2

AIF, Endo G

Caspase cascade 3, 6 & 7

Smac/Diablo

XIAP

Page 60: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Deux fonctions distinctes:

1/ En conditions physiologiques: ouverture transitoire et dynamique

Régulation du flux de Ca2+, du potentiel redox, du pH matriciel …

2/ En conditions apoptotiques: ouverture continue = pore létal

Passage de petites molécules, d’ions, H2O, et relargage de facteurs apoptogéniques

+ + + - - -

Cyto c

MM<1500 Da

CL

Ca2+

OM

IM

CyD ANT

HK PBR

CK

VDAC

Le Pore de Transition de Perméabilité (PTP)

Page 61: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

TROP: Atrophie tissulaire

TROP PEU: Hyperplasie

Neurodegeneration

SIDA

Etc…

Cancer

Artherosclerose

Maladies autoimmunes

Etc…

Apoptose et pathologies humaines

Page 62: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Aging --> both too much and too little apoptosis

(evidence for both)

Too much (accumulated oxidative damage?) ---> tissue degeneration

Too little (defective sensors, signals? ---> dysfunctional cells accumulate hyperplasia (precancerous lesions)

Apoptose et pathologies humaines Vieillissement

Page 63: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Quel système pour quelle fonction?

Dégradation spécifique: protéasome

- concerne les protéines à durée de vie courte

- spécificité déterminée par:

- acide aminé N-terminal

- séquences d’acides aminés spécifiques (ex: PEST)

- modification post-traductionnelle (ex: ubiquitine)

Dégradation non spécifique: autophagie

- concerne les protéines à durée de vie longue

- pas de spécificité apparente connue

Protéolyse & Autophagie

Page 64: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Niveau basal => renouvellement du contenu cytoplasmique (homéostasie

cytoplasmique: protéines , ARN, organites). Situation de carence nutritionnelle => favorise la dégradation protéique et fournit des acides aminés

essentiels.

Situation de stress => élimination des macromolécules et structures cellulaires altérées

(ex: protéines oxydées, mitochondries endommagées). Persistance => mort cellulaire.

Dégradation lysosomale ou autophagie

Page 65: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Carence alimentaire ou en acides aminés

• Carence en facteurs de croissance ou hormones

• Stress intracellulaire (dommage ADN)

• Drogues ou agents chimiothérapeutiques

• Infections virales

• Choc thermique

• Radiations UV ou γ Induction maintenue

et importante

=> la mort cellulaire

Inducteurs :

Mort cellulaire par autophagie

Page 66: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Autophagolysosome

Amphisome

Endosomes

Lysosome

Membrane ou Phagophore

Autophagosome

Réticulum Endoplasmique

Golgi/TGN

Membrane plasmique

acides aminés libres

Mort cellulaire par autophagie

Page 67: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Phagophore

MAP1-LC3 (Atg8)

Atg12-Atg5

Autophagosome

Autophagolysosome

Amphisome

Endosomes

Lysosome

Class III PI3K/Beclin 1 (Atg6)

Prot - FYVE

Implication des Atg dans la formation de l’autophagosome

acides aminés libres

Mort cellulaire par autophagie

Page 68: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Autophagie induite par la carence = processus auto-régulé

hormone

PI3Kinase

mTOR activé

Autophagie basale

Synthèse protéique importante

Forte [aa]

hormone

PI3Kinase

mTOR désactivé

Faible [aa]

Autophagie forte

Synthèse protéique réduite

Autophagie=>survie ou mort cellulaire?

Page 69: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncongénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

Métabolisme

Page 70: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cycle cellulaire, sénescence, apoptose et métabolisme énergétique

• Mitochondries: effecteurs centraux de

– Métabolisme énergétique

– Espèces réactives de l’oxygène (ERO): -> génération & détoxification

– Apoptose

• Voies de signalisation des facteurs de croissance:

– accroissent le métabolisme -> cycle cellulaire

– favorisent fréquemment la survie

• Protéines de l’apoptose: régulent souvent le métabolisme énergétique

Page 71: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Exemple Akt:

– captage de nutriments - GLUT1 / glucose ‘fuel’

– phosphorylation de l’hexokinase et phosphofructokoinase

glycolyse

– Enzyme de la glycolyse = Hexokinase • Dégradation du glucose

• Activité apoptotique via VDAC

si activité, apoptose via PTP

– Phosphorylation inactivatrice de Bad

si Akt (ou Ras/MAPK), déphosphorylation et apoptose

si glycolyse, Dcomplexe hexokinase/glucokinase/Bad

déphosphorylation et apoptose

Facteurs de croissance et métabolisme énergétique,

Page 72: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

• Sirt1: histone acétylase NADH-dépendante (cf. Glycolyse)

• p53

• KU-70 (partenaire de Bax)

• FOXO (cibles: p21, p27, FAS/CD95)

• mTOR: kinase régulant notamment la traduction de mRNA

– des protéines ribosomiales

– Du cycle cellulaire

– De la matrice extracellulaire et de la motilité

– Inhibition par < AMP ou < glucose

– Activation par Akt et Ras

– Si inhibition soutenue: autophagie

Senseurs de l’état énergétique

Page 73: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Energie ou

taux d’AMP/ATP

m TOR

Atg1

Apport Nutritionnel

ou Amino acides

Membrane (Phagophore)

Autophagosome

Régulation Hormonale

PI3K Classe I

Synthèse protéique

Croissance cellulaire

Page 74: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sénescence cellulaire et métabolisme

Page 75: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sénescence et radicaux libres

Page 76: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sénescence et radicaux libres

Page 77: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Détoxification des radicaux libres

Page 78: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Ralentissement de la sénescence

Page 79: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Anti-oxydants

Page 80: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Huiles de poissons

Page 81: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Restriction calorique

Page 82: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Cycle cellulaire • Régulation • Mitogènes

Senescence • Réplicative • Oncongénique • SASP

Mort cellulaire • Apoptose • Autophagie

p53 et métabolisme

Page 83: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

p53 monomérique

p53 tétramérique

WAF 1 GADD45 14-3-3-

G 1 S

G 2 M

STOP

STOP

Arrêt du cycle cellulaire

Apoptose

BAX PIG3 NOXA PUMA

PIDD

FAS Killer/DR5

p53AIP

BTG2

P53, un facteur de transcription

Page 84: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Bensaad et al, Cell 2006

P53 et métabolisme

Page 85: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

p53 et métabolisme (2)

Bensaad et al, Cell 2006

p53

APOPTOSE

GSH

ROS

TIGAR = TP53-Induced Glycolysis and Apoptosis Regulator

Page 86: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sablina et al, Nat Med 2005

Gènes anti-oxydants

Gènes pro-oxydants

++ + -

++ + -

P53, mitochondrie et stress oxydant

Page 87: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Sablina et al, Nat Med 2005; Bensaad & Vousden Nat Med 2005

P53, mitochondrie et stress oxydant

Page 88: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

Métabolisme, p53 et sénescence

Page 89: Cycle, sénescence et mort cellulaires - Weebly

P53 et métabolisme

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PACES-L2 UE Bases Moléculaires et Cellulaires des Pathologies

18 Octobre 2012

Cycle, sénescence et mort cellulaires Comment tout intégrer ?

Morgane Le Bras

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